ABSTRACT
From a total of 187 fecal samples from children with ages between 0 and 5 years, collected in the Hospital Universitário -USP, Brazil, from 1994 to 1996, 54 (28.9%) were positive for rotavirus. Positive samples were characterized by electropherotyping, subgrouping, G serotype and genotype and P genotype. Rotavirus electropherotypes were characterized in four different long genome patterns (38.9%), one short genome pattern (34.0%) and 18.0% were characterized as an unusual pattern. Subgroup I was found in 38.9% strains, subgroup II in 50.0% and 7.7% was subgroup nonI-nonII. For G serotypes, G2 was found in 59.3%, G1 was identified in 33.3% of strains, two samples showed mixtures of G1+G2 and one sample was G1+G3. Ten samples characterized as serotype G2 showed a long eletropherotype. Genotype G2 was the most frequently and was found in 37 (44.0%) samples (23 samples as a single genotype and 14 as mixtures of genotypes). G1 was found in 15 samples. G3 and G4 was detected mainly in mixtures of genotypes and G5, G6 and G9 were identified only in mixtures. A total of 20 (38.5%) samples were characterized as G genotype mixtures and P mixtures were found in 16 (29.6%) samples. P[4] was found in 55.6% of samples, P[8] in 51.9% and P[6-M37 like] in 22.3% of cases. P[6-Gottfried like] and P[11] were detected only in mixtures. One sample with G6 specificity, mixed with a G2 rotavirus and a P[11] strain, mixed with P[4] and P[8]strain was described for the first time in Latin America.
De um total de 187 amostras fecais de crianças com idades entre 0 e 5 anos, coletadas no Hospital Universitário -USP, Brasil, de 1994 a 1996, 54 (28.9%) foram positivas para rotavírus. As amostras positivas foram caracterizadas quanto ao eletroferótipo, subgrupo, sorotipo G e genotipo G e P. Foram identificados quatro diferentes eletroferótipo longos em 38.9% das amostras, um eletroferótipo curto (34,0%) e 18,0% foram caracterizadas como um eletroferótipo não usual. O subgrupo I foi encontrado em 38,9% amostras, o subgrupo II em 50,0% e nãoI-nãoII em 7,7%. O sorotipo G2 foi encontrado em 59,3% e G1 em 33,3%. Duas amostras apresentaram misturas de G1+G2 e outra amostra G1+G3. Dez amostras caracterizadas como sorotipo G2 mostraram perfil eletroferótico longo. O genotipo G2 foi o mais freqüente, encontrado em 37 amostras (23 como único genotipo e 14 associados a outro genotipo). G1 foi encontrado em 15 amostras; G3 e G4 foram detectados principalmente em misturas e G5, G6 e G9, identificados somente em misturas. Um total de 20 (38,5%) amostras foram identificadas como misturas de genotipo G e foram encontradas 16 (29,6%) amostras com misturas de genotipo P. P[4] foi encontrado em 55,6% das amostras, P[8] em 51,9% e P[6-M37 like], em 5,5% das amostras. P[6-Gottfried like] e P[11] foram detectados somente em misturas. Uma amostra com especificidade G6, associada ao genotipo G2 e outra P[11] misturada com P[4] e de P[8] foram identificadas pela primeira vez na América Latina.
ABSTRACT
Rotavirus was detected by the enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) in the faeces of a diarrheic dog. Virus particles with morphology typical of rotavirus were visualized by direct electron microscopy. This sample was subsequently tested for the four main human serotypes (G1-G4), by ELISA with monoclonal antibodies. G genotyping was attempted by RT-PCR using G1-G6 and G8-G11 primers but no positive results could be yielded. Also using RT-PCR it was possible to characterize this canine strain as belonging to P[ 3] genotype. This is the first canine rotavirus detected in Brazil.
Rotavírus foi detectado pela técnica imunoenzimática (ELISA) nas fezes de um cachorro que apresentava diarréia. Partículas virais com morfologia típica de rotavírus foram visualizadas por microscopia eletrônica direta. Essa amostra foi posteriormente testada para os quatro principais sorotipos humanos de rotavírus (G1-G4) por ELISA utilizando anticorpos monoclonais. Genotipagem para G foi realizada por RT-PCR usando "primers" específicos para G1-G6 e G8-G11. Nenhum resultado positivo foi obtido. Também utilizando RT-PCR, foi possível caracterizar essa amostra canina como genotipo P [ 3] . Este é o primeiro rotavirus canino descrito no Brazil.