ABSTRACT
Detection of mutations by multiplex real-time RT-PCR is a widely used method for the screening of SARS-CoV-2 variants, but this method has several limitations. We describe three cases in which a Mu strain containing the mutation K417N was initially misclassified as the Beta variant. We recommend the detection of P681H to distinguish between these two variants. Our experience highlights the importance of keeping track of new variants and mutations in order to adapt the current workflows.
Subject(s)
COVID-19 , SARS-CoV-2 , COVID-19/diagnosis , Humans , Multiplex Polymerase Chain Reaction , Mutation , SARS-CoV-2/geneticsABSTRACT
Despite social distancing measures implemented in Madrid to prevent the propagation of SARS-CoV-2, a significant increase (57.1%; 28.5 to 38.5 cases/month) in cases of lymphogranuloma venereum was detected during the COVID-19 pandemic. This unusual scenario might have accelerated a shift in Chlamydia trachomatis (CT) epidemiology towards a higher proportion of L genotypes compared with non-L genotypes in CT-positive samples. Our data underscore the importance of surveillance of sexually transmitted infections during the pandemic, in particular among vulnerable populations.
Subject(s)
COVID-19 , Lymphogranuloma Venereum , Chlamydia trachomatis/genetics , Homosexuality, Male , Humans , Lymphogranuloma Venereum/diagnosis , Lymphogranuloma Venereum/epidemiology , Male , Pandemics , SARS-CoV-2 , Spain/epidemiologyABSTRACT
Antimicrobial resistance in complex models of continuous infection is a current issue. The update 2017 course addresses about microbiological, epidemiological and clinical aspects useful for a current approach to infectious disease. During the last year, nosocomial pneumonia approach guides, recommendations for management of yeast and filamentous fungal infections, review papers on the empirical approach to peritonitis and extensive guidelines on stewardship have been published. HIV infection is being treated before and more intensively. The implementation of molecular biology, spectrometry and inmunology to traditional techniques of staining and culture achieve a better and faster microbiological diagnosis. Finally, the infection is increasingly integrated, assessing non-antibiotic aspects in the treatment (AU)
La resistencia a los antimicrobianos en modelos cada vez más complejos de infección continúa siendo actualidad. El curso de actualización de este año 2017 trata aspectos microbiológicos, epidemiológicos y clínicos útiles para un abordaje actual de la patología infecciosa. Durante el último año se han publicado guías de aproximación a la neumonía nosocomial, recomendaciones sobre el manejo de la infección fúngica por levaduras y filamentosos, documentos de revisión sobre el abordaje empírico de la peritonitis y una extensas guías sobre stewardship. En la infección por el VIH, cada vez se trata antes y más intensamente. La implementación de la biología molecular, la espectrometría y la inmunología a las técnicas tradicionales de tinción y cultivo consiguen un diagnóstico microbiológico mejor y más rápido. Por último, la infección se aborda de forma cada vez más integral, valorando aspectos no antibióticos en el tratamiento (AU)
Subject(s)
Humans , Communicable Diseases/drug therapy , Communicable Diseases/epidemiology , Anti-Infective Agents/administration & dosage , HIV , Bacteriology/organization & administration , Bacteriology/standards , Mycology/organization & administration , Mycology/standardsABSTRACT
Introduction. The prevalence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Spain is approximately 20- 30%. However, resistance to linezolid is rare, and the main reports are from nosocomial outbreaks. The objective of the present study was to compare the in vitro susceptibility of linezolid with that of tedizolid against MRSA isolates and methicillin- and linezolid-resistant isolates (MLRSA) mediated by the cfr gene. Material and methods. The in vitro susceptibility of linezolid and tedizolid was determined using the E-test with 18 MRSA strains and 18 cfr-mediated MLRSA strains obtained from clinical isolates in the microbiology service of a tertiary university hospital. Results. All MRSA strains were susceptible to both antibiotics. Analysis of the MRSA isolates revealed that the MIC50 and MIC90 of linezolid were 1.5 and 2 mg/L, respectively; those of tedizolid were 0.25 and 0.4 mg/L. The MIC50 and MIC90 of tedizolid remained at 0.75 and 1 mg/L against the MLRSA strains (MIC90 ≥ 8 mg/L). Conclusions. Both for MRSA and for MLRSA, the MICs obtained for tedizolid were at least 2 dilutions lower than those of linezolid, thus demonstrating between 2 and 4 times greater activity in vitro than linezolid (AU)
Introducción. La prevalencia de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (SARM) se sitúa en España en torno al 20 y el 30%. Sin embargo, la resistencia a linezolid se reporta de forma excepcional, salvo en algunos brotes nosocomiales. El objetivo de nuestro estudio fue realizar un análisis comparativo de la sensibilidad in vitro de linezolid y tedizolid frente a aislados de SARM, así como frente a otros también resistentes a linezolid (SARLM) mediados por el gen cfr. Material y métodos. Se determinó la sensibilidad in vitro a linezolid y tedizolid mediante la técnica de E-test a 18 cepas SARM y a otras 18 que además presentaban resistencia a linezolid (SARLM) mediadas por el gen cfr, procedentes de aislados clínicos en el Servicio de Microbiología de un Hospital terciario Universitario. Resultados. Todas las cepas de SARM fueron sensibles a ambos antibióticos. Analizando los aislados clínicos de SARM, las CMI50-CMI90 de linezolid fueron 1,5 y 2 mg/L respectivamente y en el caso de tedizolid de 0,25 y 0,4 mg/L. Frente a las cepas de SARLM (CMI90 ≥ 8 mg/L) las CMI50-CMI90 de tedizolid se mantuvieron en 0,75 y 1 mg/L. Conclusiones. Tanto en el caso de las SARM como en el de las SARLM, las CMI obtenidas con tedizolid resultaron ser de al menos dos diluciones más bajas, demostrando entre 2 y 4 veces mayor actividad in vitro que linezolid (AU)
Subject(s)
Humans , Linezolid/pharmacokinetics , Anti-Bacterial Agents/pharmacokinetics , Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus , Staphylococcal Infections/drug therapy , Microbial Sensitivity Tests/methods , Drug Resistance, MicrobialABSTRACT
La resistencia a los antimicrobianos incrementa su impacto sanitario, social y económico. A todos los niveles (estatal, autonómico y local) surgen iniciativas para poder contener el problema de las resistencias. La actualización de este año 2016, estudia aspectos microbiológicos, epidemiológicos y clínicos de las bacterias multirresistentes, así como los recursos para su abordaje terapéutico, desde los fármacos antiguos hasta los modernos, desde las combinaciones terapéuticas hasta la optimización con programas de stewarship. Desde el punto de vista de la infección fúngica se plantean escenarios con nuevas especies de levaduras o nuevos contextos clínicos en hongos filamentosos. En el ámbito pediátrico se analizan homologías y diferencias con la Infección fúngica invasiva del adulto. Por último, en el ámbito de la parasitología, se revisa el tratamiento de la malaria grave importada o el de aquella resistente a antipalúdicos (AU)
Antimicrobial resistance increases it health, social and economic impact. in all areas (state, regional and local), initiatives to try to contain the problem of resistance arise. In the update of this year 2016, we study microbiological, epidemiological and clinical aspects of multi-resistant bacteria, as well as resources for therapeutic approach, from ancient to modern drugs from therapeutic combinations to optimization Stewardship programs. In the case of fungal infection, we analyze clinical scenarios with different species in yeast or new clinical settings in filamentous fungi. Taking paediatric population, homologies and differences with adults in invasive fungal infection were compared. Finally in the field of parasitology, treatment of severe malaria imported or that resistant to antimalarial drugs were reviewed (AU)
