Acinetobacter baumannii extensively drug resistant lineages in Buenos Aires hospitals differ from the international clones I-III.

As a way to contribute to the assessment of Acinetobacter baumannii clinical population structure, multi-locus sequence typing (MLST) was performed in a collection of 93 isolates from Buenos Aires (1983-2012) and Rosario (2006-2009) hospitals. Sequence types (STs) were achieved by Bartual (B) and Institut Pasteur (P) schemes. PFGE typing, antimicrobial susceptibility assays, and the amplification of the OXA carbapenemase genes most prevalent in our region, were also performed. e-Burst clustered the 25 STs(B) (15 novels) into 5 clonal complexes (CC) and 5 singletons, and grouped the 18 STs(P) (12 novels) into 3 CC and 4 singletons. Bartual scheme divided the CC79(P) into two groups. CC113(B)/CC79(P) prevailed in Buenos Aires at least in 1992-2009, being responsible for epidemic and for endemic infections and acquiring the XDR (extensively drug-resistant) pattern throughout the years. While, CC119(B)/CC79(P) was apparently present before the CC113(B)/CC79(P)domain. CC103(B)/CC15(P) was the second most prevalent CC. Interestingly, CC110(B)/ST25(P) apparently increased over the last years. Conversely, CC109(B)/CC1(P) (international clone I) predominated in Rosario, although the presence of CC113(B)/CC79(P), CC103(B)/CC15(P) and CC110(B)/ST25(P) was observed. Nineteen novel STs clustered in CC79(P), CC15(P), CC113(B), CC109(B) and CC103(B), suggesting their clonal expansion during persistence. PFGE typing proved transmission of strains intra- and inter-hospitals in each city. Except for one, all the recent isolates (2007-2012) harboured the blaOXA-23-like. All isolates were susceptible to colistin. Tigecycline MIC(90) was 1mg/L and the rifampicin MIC>512mg/l was found among isolates in three hospitals. In conclusion, the international clone II (CC92(B)/CC2(P)) was not found among our isolates. CC113(B)/CC79(P), CC103(B)/CC15(P), and ST25(P), suggested also as major components in the A. baumannii population together with the international clone I, were present in Buenos Aires and Rosario with different prevalence rate. Their recent isolates showed high distribution of the blaOXA-23-like as well as the XDR pattern.

Vigilancia Epidemiológica de Infecciones Nosocomiales causadas por Bacilos No Fermentadores Multiresistentes en Hospitales Públicos en la Ciudad de Rosario

Conclusiones: Desarrollamos una metodologia de laboratorio sensible y especifica que permite detectar carbapenemasas, tanto como distinguirlas entre metalo-betalactamasas (MBLs) y no MBLs. Aplicamos la metodologia geno- y fenotipica desarrollada en nuestro laboratorio para caracterizar aislamientos de A. baumannii multirresistentes recuperados en distintos Hospitales de nuestra ciudad. Pudieron identificarse clones esporadicos, y clones de elevada diseminacion, portadores de una carbapenemasa (OXA-23), y de alteraciones en el mecanismo de permeabilidad. Se ha avanzado en la caracterizacion molecular y estructural de GOB-18, una metalo-B-lactamasa proveniente de un microorganismo patogeno oportunista de origen clinico, Elizabethkingia meningoseptica. Se ha clonado y secuenciado el gen correspondiente a la MBL vim-11a de un aislamiento clinico de P. aeruginosa. Se pusieron a punto las condiciones de expresion de VIM como fusion a GST y su posterior purificacion. Se observo amplio perfil de sustratos (penicilinas, cefalosporinas y carbapenemes). Presento actividad inhibida por EDTA.

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Conclusiones: La metodología genotípica empleada (OD/PCR) implementada en el laboratorio ha resultado ser una herramienta epidemiológica de enorme utilidad para el estudio de la diseminación clonal de cepas de P. aeruginosa. Este resultado se halla avalado por el número importante de clones que se han detectado, que ratifica el poder discriminatorio de la misma; y por el análisis clonal que surge de la aplicación de dichos marcadores en la construcción del dendrograma. El ensayo microbiológico para la búsqueda de las metaloenzimas resulta de gran utilidad para los laboratorios clínicos. En la actualidad, estamos efectuando transferencia de dicha metodología a diferentes laboratorios de microbiología de nuestra ciudad.

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Conclusiones: La metodología genotípica empleada (OD/PCR) implementada en el laboratorio ha resultado ser una herramienta epidemiológica de enorme utilidad para el estudio de la diseminación clonal de cepas de P. aeruginosa. Este resultado se halla avalado por el número importante de clones que se han detectado, que ratifica el poder discriminatorio de la misma; y por el análisis clonal que surge de la aplicación de dichos marcadores en la construcción del dendrograma. El ensayo microbiológico para la búsqueda de las metaloenzimas resulta de gran utilidad para los laboratorios clínicos. En la actualidad, estamos efectuando transferencia de dicha metodología a diferentes laboratorios de microbiología de nuestra ciudad.

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Conclusiones: Desarrollamos una metodologia de laboratorio sensible y especifica que permite detectar carbapenemasas, tanto como distinguirlas entre metalo-betalactamasas (MBLs) y no MBLs. Aplicamos la metodologia geno- y fenotipica desarrollada en nuestro laboratorio para caracterizar aislamientos de A. baumannii multirresistentes recuperados en distintos Hospitales de nuestra ciudad. Pudieron identificarse clones esporadicos, y clones de elevada diseminacion, portadores de una carbapenemasa (OXA-23), y de alteraciones en el mecanismo de permeabilidad. Se ha avanzado en la caracterizacion molecular y estructural de GOB-18, una metalo-B-lactamasa proveniente de un microorganismo patogeno oportunista de origen clinico, Elizabethkingia meningoseptica. Se ha clonado y secuenciado el gen correspondiente a la MBL vim-11a de un aislamiento clinico de P. aeruginosa. Se pusieron a punto las condiciones de expresion de VIM como fusion a GST y su posterior purificacion. Se observo amplio perfil de sustratos (penicilinas, cefalosporinas y carbapenemes). Presento actividad inhibida por EDTA.

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Conclusiones: Desarrollamos una metodologia de laboratorio sensible y especifica que permite detectar carbapenemasas, tanto como distinguirlas entre metalo-betalactamasas (MBLs) y no MBLs. Aplicamos la metodologia geno- y fenotipica desarrollada en nuestro laboratorio para caracterizar aislamientos de A. baumannii multirresistentes recuperados en distintos Hospitales de nuestra ciudad. Pudieron identificarse clones esporadicos, y clones de elevada diseminacion, portadores de una carbapenemasa (OXA-23), y de alteraciones en el mecanismo de permeabilidad. Se ha avanzado en la caracterizacion molecular y estructural de GOB-18, una metalo-B-lactamasa proveniente de un microorganismo patogeno oportunista de origen clinico, Elizabethkingia meningoseptica. Se ha clonado y secuenciado el gen correspondiente a la MBL vim-11a de un aislamiento clinico de P. aeruginosa. Se pusieron a punto las condiciones de expresion de VIM como fusion a GST y su posterior purificacion. Se observo amplio perfil de sustratos (penicilinas, cefalosporinas y carbapenemes). Presento actividad inhibida por EDTA.

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Conclusiones: La metodología genotípica empleada (OD/PCR) implementada en el laboratorio ha resultado ser una herramienta epidemiológica de enorme utilidad para el estudio de la diseminación clonal de cepas de P. aeruginosa. Este resultado se halla avalado por el número importante de clones que se han detectado, que ratifica el poder discriminatorio de la misma; y por el análisis clonal que surge de la aplicación de dichos marcadores en la construcción del dendrograma. El ensayo microbiológico para la búsqueda de las metaloenzimas resulta de gran utilidad para los laboratorios clínicos. En la actualidad, estamos efectuando transferencia de dicha metodología a diferentes laboratorios de microbiología de nuestra ciudad.