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1.
Forensic Sci Int Genet ; 26: 91-95, 2017 01.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-27816851

ABSTRACT

Currently, autosomal Short Tandem Repeat (STR) markers represent the method of election in forensic human identification. Commercial kits of most common use nowadays -e.g. PowerPlex®Fusion, Promega Corp.; AmpFlSTR GlobalFiler, Thermofisher scientific; Investigator 24Plex QS,Qiagen-, allow the co-amplification of 23 highly polymorphic STR loci providing a high discrimination power in human identity testing. However, in complex kinship analysis and familial database searches involving distant relationships, additional DNA typing is often required in order to achieve well-founded conclusions. The recently developed kit Investigator® HDplex (Qiagen) co-amplify twelve autosomal STRs markers (D7S1517, D3S1744, D12S391, D2S1360, D6S474, D4S2366, D8S1132, D5S2500, D18S51, D21S2055, D10S2325, SE33), nine of which are not present in the above mentioned kits, providing a set of efficient supplementary markers for human identification purposes. In this study we genotyped a sample of 980 individuals from urban areas of ten Argentinean provinces using the Investigator® HDplex kit, aiming to provide forensic estimates for use in forensic casework and parentage testing in Argentina. We report reference allelic frequency databases for each of the provinces studied as well as for the combined samples. No deviation of Hardy-Weinberg equilibrium was observed. A reasonable discrimination capacity and power of exclusion was estimated which allowed predicting an acceptable forensic behavior of this kit, either to be used as the main STR panel for simple cases or as an auxiliary tool in complex cases. Additionally, population comparison tests showed that the studied samples are relatively homogeneous across the country for these STR set.


Subject(s)
DNA Fingerprinting , Databases, Nucleic Acid , Genetics, Population , Microsatellite Repeats , Argentina , Gene Frequency , Genotype , Humans
2.
Acta gastroenterol. latinoam ; 28(1): 27-31, mar. 1998. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-209254

ABSTRACT

En trabajos previos hemos relatado el reconocimiento de la presencia de ADN del HPV en casos de hepatitis gigantocelular neonatal idiopática (HGNI) y atresia de vías biliares (AVB) en material de archivo usando la técnica de PCR. A fin de investigar una posible transmisión vertical estudiamos la presencia de ADN del HPV en hisopados cervicales de madres así como un tejido hepático fijado en formol e incluído en parafina, de 3 lactantes con HGNI y 4 con AVB mediante la técnica de nested-PCR. En dos casos los extendidos cervicales presentaron coilocitos, compatibles con infección por HPV. Excepto en uno el parto fué por vía vaginal en todos. Todos los lactantes eran del sexo masculino. En todos los casos se demostró amplificación del ADN del HPV, siendo concordante los tipos en los lactantes y sus madres. Aunque este es un grupo pequeño los hallazgos están de acuerdo con nuestros datos previos. La presencia del mismo tipo de HPV en el hígado de los lactantes y en hisopados de sus madres es otro argumento que apoya la posibilidad de una transmisión vertical del virus.


Subject(s)
Female , Humans , Infant , Infant, Newborn , Biliary Atresia/etiology , DNA, Viral/analysis , Giant Cells , Hepatitis/congenital , Papillomaviridae/isolation & purification , Birth Weight , Hepatitis/etiology , Infectious Disease Transmission, Vertical , Liver/pathology , Liver/virology , Papillomaviridae/genetics , Papillomavirus Infections/complications , Papillomavirus Infections/transmission , Sequence Analysis, DNA
3.
Acta gastroenterol. latinoam ; 28(1): 27-31, mar. 1998. ilus, tab
Article in Spanish | BINACIS | ID: bin-19324

ABSTRACT

En trabajos previos hemos relatado el reconocimiento de la presencia de ADN del HPV en casos de hepatitis gigantocelular neonatal idiopática (HGNI) y atresia de vías biliares (AVB) en material de archivo usando la técnica de PCR. A fin de investigar una posible transmisión vertical estudiamos la presencia de ADN del HPV en hisopados cervicales de madres así como un tejido hepático fijado en formol e incluído en parafina, de 3 lactantes con HGNI y 4 con AVB mediante la técnica de nested-PCR. En dos casos los extendidos cervicales presentaron coilocitos, compatibles con infección por HPV. Excepto en uno el parto fué por vía vaginal en todos. Todos los lactantes eran del sexo masculino. En todos los casos se demostró amplificación del ADN del HPV, siendo concordante los tipos en los lactantes y sus madres. Aunque este es un grupo pequeño los hallazgos están de acuerdo con nuestros datos previos. La presencia del mismo tipo de HPV en el hígado de los lactantes y en hisopados de sus madres es otro argumento que apoya la posibilidad de una transmisión vertical del virus. (AU)


Subject(s)
Female , Humans , Infant , Infant, Newborn , Human Papillomavirus Viruses/isolation & purification , Hepatitis/congenital , Biliary Atresia/etiology , DNA, Viral/analysis , Giant Cells , Liver/pathology , Liver/virology , Human Papillomavirus Viruses/genetics , Hepatitis/etiology , Sequence Analysis, DNA , Birth Weight , Infectious Disease Transmission, Vertical , /complications , /transmission
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