ABSTRACT
The canine circovirus (CanCV) is a single-stranded DNA virus that has become an important emerging virus associated with gastroenteritis in dogs worldwide. In the present study, the CanCV was detected by PCR in 15% (22/147) of dogs from animal shelters in Belém, between 2019 and 2020. We observed an association between the CanCV infection and the presence of diarrhea in animals younger than one year of age (p > 0.01). The Brazilian strains were grouped in Chinese genotypes, with 99.54 to 100% nucleotilde homology. The GMRF Bayesian Skyride used the molecular clock model, which was the best suited technique to plot the dataset. The most recent common ancestor (TMRCA) was estimated in 2017, with the evolution rate of 1.6 x 10-3 s/s/y. The viral family diversity was also investigated, with emphasis on the families of the enteric pathogenic viruses Parvoviridae, Picornaviridae and Astroviridae, which were detected in the CanCV positive pooled samples. This study highlights the importance of the CanCV as an emergent virus that causes diarrhea in Brazilian dogs. The results found herein contribute to the understanding of the role of CanCV in enteric diseases and in the evolutionary molecular characterization of the circulating genotypes. Furthermore, we increased the understanding of the fecal virome in dogs with diarrhea, providing data for the monitoring and prevention viral gastroenteric diseases in domestic animals.
O circovírus canino (CanCV) é um vírus de DNA de fita simples que se tornou um importante vírus emergente associado à gastroenterite em cães em todo o mundo. No presente estudo, o CanCV foi detectado por PCR em 15% (22/147) dos cães de abrigos de animais em Belém, entre 2019 e 2020. Observamos uma associação entre a infecção pelo CanCV e a presença de diarreia em animais menores de um ano de idade (p > 0,01). As linhagens brasileiras foram agrupadas em genótipos chineses, com 99,54 a 100% de homologia nucleotídica. O GMRF Bayesian Skyride foi o modelo de relógio molecular utilizado, sendo o método mais adequado para o conjunto de dados. O ancestral comum mais recente (TMRCA) foi estimado em 2017, com taxa de evolução de 1,6 x 10-3 s/s/ano. A diversidade de famílias virais também foi investigada, com destaque para as famílias dos vírus patogênicos entéricos Parvoviridae, Picornaviridae e Astroviridae, que foram detectadas nos pools de amostras positivas para CanCV. Este estudo destaca a importância do CanCV como um vírus emergente que causa diarreia em cães brasileiros. Os resultados aqui encontrados contribuem para a compreensão do papel do CanCV nas doenças entéricas e na caracterização molecular evolutiva dos genótipos circulantes. Além disso, aumentamos a compreensão do viroma fecal em cães com diarreia, fornecendo dados para o monitoramento e prevenção de doenças gastroentéricas virais em animais domésticos.
