Caracterización molecular de Escherichia coli diarreogénica proveniente de población pediátrica ambulatoria con diarrea, atendida en dos hospitales de Buenos Aires, Argentina / Molecular characterization of diarrheagenic Escherichia coli from an outpatient pediatric population with diarrhea attended in two hospitals from Buenos Aires, Argentina

Resumen Escherichia coli diarreogénica abarca un grupo heterogéneo de patotipos o variantes patogénicas que comparten características fenotípicas con marcadas diferencias en genes de virulencia, sitios de colonización, patogenia, presentación clínica y epidemiología de la infección. Los patotipos más estudiados son E.coli productora de toxina Shiga (STEC), E.coli enterotoxigénica (ETEC), E.coli enteropatogénica (EPEC), E.coli enteroagregativa (EAEC) y E.coli enteroinvasiva (EIEC). El objetivo del estudio fue caracterizar los aislamientos de E.coli diarreogénica provenientes de población pediátrica ambulatoria con diarrea, atendida en dos hospitales públicos de Buenos Aires, Argentina. Los patotipos de E.coli diarreogénica se investigaron mediante la amplificación de fragmentos de genes de virulencia característicos: intimina (eae), toxina termolábil (lt), toxinas termoestables (stp, sth), antígeno plasmídico de invasiónH (ipaH), activador transcripcional R (aggR) y toxinas Shiga (stx1, stx2). La subtipificación molecular de aislamientos se realizó mediante PFGE (XbaI). E.coli diarreogénica fue detectada en el 14% (84/601) de los casos. El patotipo EAEC fue prevalente, mientras que ETEC, STEC, EPEC y EIEC fueron hallados en menor proporción. Los aislamientos de EAEC presentaron un alto grado de diversidad genética. Todos los patotipos fueron hallados en niños menores de 5años, mientras que solamente EAEC, EIEC y ETEC fueron detectados en población de mayor edad. Futuros estudios que incluyan la caracterización de aislamientos a partir de un mayor número de genes y población de otras áreas geográficas serán necesarios para determinar la relevancia de E.coli diarreogénica en Argentina.

Abstract Diarrheagenic Escherichia coli comprises a heterogeneous group of pathotypes or pathogenic variants that share phenotypic characteristics with marked differences in virulence genes, colonization sites, pathogenesis, clinical presentation, and epidemiology of infection. The most studied pathotypes are Shiga toxin-producing E.coli (STEC), enterotoxigenic E.coli (ETEC), enteropathogenic E.coli (EPEC), enteroaggregative E.coli (EAEC), and enteroinvasive E.coli (EIEC). The objective of the study was to characterize the isolates of diarrheagenic E.coli from an outpatient pediatric population with diarrhea attended in two public hospitals from Buenos Aires, Argentina. Diarrheagenic E.coli pathotypes were investigated by amplifying characteristic virulence gene fragments: intimin (eae), heat-labile toxin (lt), heat-stable toxins (stp, sth), invasion plasmid antigen H (ipaH), transcriptional activator R (aggR) and Shiga toxins (stx1, stx2). Molecular subtyping of isolates was performed using PFGE (XbaI). Diarrheagenic E.coli was detected in 14% (84/601) of cases. The EAEC pathotype was prevalent, while ETEC, STEC, EPEC and EIEC were found in a lower proportion. EAEC isolates exhibited a high degree of genetic diversity. All pathotypes were found in children under 5years of age, while only EAEC, EIEC and ETEC were detected in the older population. Future studies that include the characterization of isolates from a greater number of genes and populations from other geographical areas will be necessary to determine the relevance of diarrheagenic E.coli in Argentina.

[Molecular characterization of diarrheagenic Escherichia coli from an outpatient pediatric population with diarrhea attended in two hospitals from Buenos Aires, Argentina]. / Caracterización molecular de Escherichia coli diarreogénica proveniente de población pediátrica ambulatoria con diarrea, atendida en dos hospitales de Buenos Aires, Argentina.

Diarrheagenic Escherichia coli comprises a heterogeneous group of pathotypes or pathogenic variants that share phenotypic characteristics with marked differences in virulence genes, colonization sites, pathogenesis, clinical presentation, and epidemiology of infection. The most studied pathotypes are Shiga toxin-producing E.coli (STEC), enterotoxigenic E.coli (ETEC), enteropathogenic E.coli (EPEC), enteroaggregative E.coli (EAEC), and enteroinvasive E.coli (EIEC). The objective of the study was to characterize the isolates of diarrheagenic E.coli from an outpatient pediatric population with diarrhea attended in two public hospitals from Buenos Aires, Argentina. Diarrheagenic E.coli pathotypes were investigated by amplifying characteristic virulence gene fragments: intimin (eae), heat-labile toxin (lt), heat-stable toxins (stp, sth), invasion plasmid antigen H (ipaH), transcriptional activator R (aggR) and Shiga toxins (stx1, stx2). Molecular subtyping of isolates was performed using PFGE (XbaI). Diarrheagenic E.coli was detected in 14% (84/601) of cases. The EAEC pathotype was prevalent, while ETEC, STEC, EPEC and EIEC were found in a lower proportion. EAEC isolates exhibited a high degree of genetic diversity. All pathotypes were found in children under 5years of age, while only EAEC, EIEC and ETEC were detected in the older population. Future studies that include the characterization of isolates from a greater number of genes and populations from other geographical areas will be necessary to determine the relevance of diarrheagenic E.coli in Argentina.

Primer reporte de Escherichia coli diarreogénica en población pediátrica ambulatoria con diarrea atendida en la ciudad de La Plata, Argentina / First report of diarrheagenic Escherichia coli in pediatric outpatient population with diarrhea in La Plata, Argentina

Resumen Escherichia coli diarreogénica comprende un grupo heterogéneo de cepas que presentan diversos factores de virulencia y causan diferentes síndromes diarreicos. Los patotipos más estudiados son Escherichia coli enteropatogénica (EPEC), Escherichia coli enterotoxigé-nica (ETEC), Escherichia coli enteroagregativa (EAEC), Escherichia coli enteroinvasiva (EIEC) y Escherichia coli productora de toxina Shiga (STEC). El objetivo de este estudio fue estimar la frecuencia de infección de los diversos patotipos de E. coli diarreogénica en una población pediátrica ambulatoria con diarrea, atendida en el Hospital Sor María Ludovica de La Plata, Argentina, durante el período mayo-octubre de 2017. Los patotipos fueron detectados mediante la amplificación molecular de ocho genes de virulencia característicos. Se estudiaron las heces de 211 ninos (76% menores de 5 años). Se detectó infección con E. coli diarreogénica en el 12,3% (n = 26/211) de los niños con diarrea. Los patotipos identificados fueron EAEC, ETEC (todos lt positivos), EPEC y STEC (stx2 y eae positivos). El patotipo EAEC fue prevalente en todos los grupos etarios, mientras que los patotipos ETEC, EPEC y STEC solamente se observaron en niñnos menores de 5 anños. Este estudio constituye el primer reporte de detección por técnicas de amplificación molecular de Escherichia coli diarreogénica en una población pediátrica ambulatoria con diarrea, de la zona de La Plata. Se necesitan estudios más amplios que incluyan la caracterización de los aislamientos abarcando un mayor número de genes, controles asintomáticos, distintas épocas del ano y población de diversas áreas geográficas para esclarecer la relevancia de la infección por E. coli diarreogénica en niños de Argentina.

Abstract Diarrheagenic Escherichia coli is a heterogeneous group of strains that presents various virulence factors and causes different diarrheal syndromes. The most studied pat-hotypes are enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC), enteroaggregative Escherichia coli (EAEC), enteroinvasive Escherichia coli (EIEC) and Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC). The objective was to estimate the frequency of infec-tion of diarrheagenic E. coli pathotypes in children with diarrhea, attended at the Sor María Ludovica Hospital in La Plata, Argentina, during the period May-October 2017. E. coli pathotypes were detected by molecular amplification of eight characteristic virulence genes. The feces of 211 children (76% under 5 years) were studied. Infection with diarrheagenic E. coli was detected in 12.3% of the samples. The pathotypes were EAEC (10.43%), ETEC (1.42%, all of them positive for thermolabile toxin), EPEC (0.95%) and STEC (0.47%, positive for Shiga toxin 2). The EAEC pathotype was prevalent in children of all age groups, while ETEC, EPEC and STEC were only observed in children under 5 years of age. This study constitutes the first report of diarrheagenic Escherichia coli detection in an outpatient pediatric population with diarrhea from La Plata, using molecular amplification techniques. Broader future studies, including the charac-terization of the isolates with the largest number of genes, asymptomatic controls, different times of the year and population from different geographic areas will be necessary to clarify the relevance of diarrheagenic E. coli infection in children from Argentina.

[First report of diarrheagenic Escherichia coli in pediatric outpatient population with diarrhea in La Plata, Argentina]. / Primer reporte de Escherichia coli diarreogénica en población pediátrica ambulatoria con diarrea atendida en la ciudad de La Plata, Argentina.

Diarrheagenic Escherichia coli is a heterogeneous group of strains that presents various virulence factors and causes different diarrheal syndromes. The most studied pathotypes are enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC), enteroaggregative Escherichia coli (EAEC), enteroinvasive Escherichia coli (EIEC) and Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC). The objective was to estimate the frequency of infection of diarrheagenic E. coli pathotypes in children with diarrhea, attended at the Sor María Ludovica Hospital in La Plata, Argentina, during the period May-October 2017. E. coli pathotypes were detected by molecular amplification of eight characteristic virulence genes. The feces of 211 children (76% under 5 years) were studied. Infection with diarrheagenic E. coli was detected in 12.3% of the samples. The pathotypes were EAEC (10.43%), ETEC (1.42%, all of them positive for thermolabile toxin), EPEC (0.95%) and STEC (0.47%, positive for Shiga toxin 2). The EAEC pathotype was prevalent in children of all age groups, while ETEC, EPEC and STEC were only observed in children under 5 years of age. This study constitutes the first report of diarrheagenic Escherichia coli detection in an outpatient pediatric population with diarrhea from La Plata, using molecular amplification techniques. Broader future studies, including the characterization of the isolates with the largest number of genes, asymptomatic controls, different times of the year and population from different geographic areas will be necessary to clarify the relevance of diarrheagenic E. coli infection in children from Argentina.

Análisis bibliométrico de la literatura científica sobre epidemiología de Giardia en Argentina (1995-2014) / Bibliometric analysis of scientific literature on epidemiology of Giardia in Argentina (1995-2014) / A análise bibliométrica da produção científica sobre epidemiologia da Giardia em Argentina (1995-2014)

Las publicaciones sobre la epidemiología de Giardia en humanos de Argentina se hallan dispersas en numerosas fuentes de información, lo que dificulta su acceso y visibilidad para la comunidad científica. El objetivo de este trabajo fue realizar un análisis bibliométrico cuantitativo de la producción científica sobre Giardia en humanos de Argentina durante el período 1995-2014. El volumen de publicaciones científicas hallado fue igual a 112 (36 artículos, 73 comunicaciones y 3 tesis). La distribución idiomática mostró un predominio del español. Los artículos fueron publicados en 25 revistas de América, Europa y Asia. Este estudio bibliométrico demostró un incremento del volumen de publicaciones sobre Giardia en Argentina durante los últimos 20 años. Los artículos mostraron un índice de colaboración entre investigadores similar a la bibliografía. El índice de institucionalidad fue elevado para instituciones nacionales, e inexistente para la colaboración internacional. La utilización de indicadores bibliométricos permite contar con una herramienta sólida para el diagnóstico y prospección de las actividades de investigación sobre epidemiología de Giardia y contribuye a la difusión y visibilidad de la información relativa a la producción científica desarrollada en Argentina.

The scientific literature on Giardia epidemiology in humans from Argentina is scattered in numerous sources, making it difficult to access them and provide visibility to the scientific community. The aim of this study was to perform a quantitative bibliometric analysis of the scientific production on Giardia in humans from Argentina during the 1995-2014 period. The volume of scientific literature was 112 (36 articles, 73 communications, and 3 theses). The language distribution showed a predominance of Spanish. The articles were published in 25 journals from America, Europe and Asia. This bibliometric study showed an increased volume of publications on Giardia in Argentina during the last 20 years. The articles showed a Collaboration Index between researchers similar to the literature. The institutional Index was elevated for national institutions and non-existent for international collaboration. The use of bibliometric indicators can provide a solid tool for the diagnosis and survey of the research on epidemiology of Giardia, and it contributes to the dissemination and visibility of information on the scientific production developed in Argentina.

A literatura sobre a epidemiologia da Giárdia em seres humanos da Argentina estão espalhados em inúmeras fontes de informação, tornando difícil seu acesso e visibilidade para a comunidade científica. O objetivo deste estudo foi realizar uma análise bibliométrica quantitativa da produção científica sobre Giárdia em seres humanos da Argentina durante o período 1995-2014. O volume de publicações científicas encontrado foi igual a 112 (36 artigos, 73 comunicações e 3 teses). A distribuição idiomática mostrou uma predominância do espanhol. Os artigos foram publicados em 25 revistas da América, Europa e Ásia. Este estudo bibliométrico mostrou um aumento do volume de publicações sobre Giárdia na Argentina durante os últimos 20 anos. Os artigos apresentaram um índice de colaboração entre pesquisadores semelhante à bibliografia. O índice de institucionalidade foi elevado para instituições nacionais, e inexistente para a colaboração internacional. A utilização de indicadores bibliométricos permite contar com uma ferramenta sólida para o diagnóstico e levantamento das atividades de pesquisa sobre epidemiologia da Giárdia e contribui para a divulgação e visibilidade das informações sobre a produção científica desenvolvida na Argentina.

Células RK13: influencia de la concentración de suero fetal bovino en el tiempo de duplicación / RK13 cells: influence of fetal bovine serum concentration on doubling time

El objetivo de este trabajo fue analizar el Tiempo de Duplicación (TD) y la Fase de Latencia (Lag) de una línea celular con 2 concentraciones de Suero Fetal Bovino (SFB) y 2 inóculos celulares iniciales. Se realizaron 4 curvas de crecimiento de células adherentes RK13 (rabbit kidney) en Minimal Essential Medium (MEM) suplementado con glutamina, penicilina, estreptomicina y SFB no inactivado al 5 por ciento y 7 por ciento. Los inóculos iniciales fueron de 3 x 10 y 6,8 x 10 células viables/mL. El TD fue de 24 h para el cultivo con 7 por ciento de SFB con ambos inóculos y de 16,36 h para el cultivo con 5 por ciento de SFB con el mayor inóculo. El cultivo con 5 por ciento de SFB y 3 x 10 viables/mL presentó escaso desarrollo. Se observaron diferencias significativas en el TD (p=0,0055) cuando se utilizó el inóculo de 6,8 x 10 viables/mL y se varió el SFB (5 por ciento y 7 por ciento). La diferencia no fue significativa al utilizar los inóculos de 3 x 10 y 6,8 x 10 viables/mL manteniendo constante la concentración de suero fetal (7 por ciento)

Células RK13: influencia de la concentración de suero fetal bovino en el tiempo de duplicación / RK13 cells: influence of fetal bovine serum concentration on doubling time

El objetivo de este trabajo fue analizar el Tiempo de Duplicación (TD) y la Fase de Latencia (Lag) de una línea celular con 2 concentraciones de Suero Fetal Bovino (SFB) y 2 inóculos celulares iniciales. Se realizaron 4 curvas de crecimiento de células adherentes RK13 (rabbit kidney) en Minimal Essential Medium (MEM) suplementado con glutamina, penicilina, estreptomicina y SFB no inactivado al 5 por ciento y 7 por ciento. Los inóculos iniciales fueron de 3 x 10 y 6,8 x 10 células viables/mL. El TD fue de 24 h para el cultivo con 7 por ciento de SFB con ambos inóculos y de 16,36 h para el cultivo con 5 por ciento de SFB con el mayor inóculo. El cultivo con 5 por ciento de SFB y 3 x 10 viables/mL presentó escaso desarrollo. Se observaron diferencias significativas en el TD (p=0,0055) cuando se utilizó el inóculo de 6,8 x 10 viables/mL y se varió el SFB (5 por ciento y 7 por ciento). La diferencia no fue significativa al utilizar los inóculos de 3 x 10 y 6,8 x 10 viables/mL manteniendo constante la concentración de suero fetal (7 por ciento) (AU)