Surveillance of avian influenza and Newcastle disease viruses in backyard poultry raised near migratory bird sites in Mato Grosso state, Brazil.

The Pantanal and Cerrado biomes in the state of Mato Grosso contain migratory bird sites in the municipalities of Cáceres and Araguaiana, respectively. The levels of avian influenza (AI) and Newcastle disease (ND) viral activity in backyard poultry at these sites are unknown owing to a lack of studies. Considering the risk of introduction of AI and ND to Brazil from migratory birds, as well as the importance of active surveillance in the detection and prevention of diseases for official control, monitoring in these poultry populations is faster, more practical and cheaper for official service veterinarians. The objective of this study was to verify the presence of AI and ND viral activity in backyard poultry reared near these migratory bird sites in the years 2016 and 2019. Serum samples and cloacal and tracheal swab samples collected from chickens, turkeys, quails, ducks and geese were evaluated by indirect diagnostic methods including enzyme-linked immunosorbent assay and haemagglutination inhibition tests and direct detection of viral sequences using quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR). No positive samples were detected by qRT-PCR.The frequencies of birds seropositive for AI and ND were 0.7% and 19.6% in 2016 and 0.5% and 17.2% in 2019, respectively, in Araguaiana and 0.8% and 32.3% in 2016 and 7.0% and 38.1% in 2019, respectively, in Cáceres. Antibodies belonging to AI subtypes H1, H4, H6 and H14 were identified in Cáceres in 2019. Spatial analysis showed an agglomeration of farms with seropositive poultry within the urban area of Cáceres, suggesting AI and ND virus activity in this area. This study showed no circulation of the notifiable AI subtypes H5 and H7 or the ND virus in backyard poultry raised around migratory bird sites in the state of Mato Grosso. The results of the present study support evidence indicating that the circulation of strains with low pathogenicity in urban areas enables backyard poultry to serve as a source of infection for other birds; thus, increased surveillance is necessary in this population.

Les biomes du Pantanal et du Cerrado dans l'état du Mato Grosso contiennent deux sites accueillant des oiseaux migrateurs, situés respectivement dans les comtés de Cáceres et d'Araguaiana. Faute d'études de terrain, le niveau d'activité virale de l'influenza aviaire et de la maladie de Newcastle chez les volailles de basse-cour de ces deux sites était jusqu'à présent inconnu. Compte tenu du risque d'introduction au Brésil de l'influenza aviaire et de la maladie de Newcastle par les oiseaux migrateurs, et de l'importance de la surveillance active pour détecter et prévenir ces maladies dans le cadre des activités de lutte conduites par les Services vétérinaires, il est plus pratique, moins onéreux et plus rapide pour les vétérinaires des services officiels d'axer la surveillance sur les populations de volailles de basse-cour. Les auteurs présentent les résultats d'une étude conduite en 2016 et en 2019 pour déterminer le niveau de circulation des virus de l'influenza aviaire et de la maladie de Newcastle chez les volailles de basse-cour élevées à proximité des sites d'oiseaux migrateurs. Des échantillons sériques et des écouvillons cloacaux et trachéaux prélevés sur des poulets, des dindes, des cailles, des canards et des oies ont été soumis à des méthodes de diagnostic indirectes telles que les épreuves immuno-enzymatique et d'inhibition de l'hémagglutination, et à une méthode de détection directe des séquences virales par amplification en chaîne par polymérase quantitative en temps réel couplée à une transcription inverse (qRT-PCR). Aucun échantillon positif n'a été détecté par qRT-PCR. Les taux de séropositivité respectivement à l'influenza aviaire et à la maladie de Newcastle étaient, chez les volailles prélevées à Araguaiana, de 0,7 % et 19,6 % en 2016, et de 0,5 % et 17,2 % en 2019 ; chez les volailles prélevées à Cáceres, ils étaient de 0,8 % et 32,3 % en 2016, et de 7,0 % et 38,1 % en 2019. Les anticorps détectés à Cáceres en 2019 appartenaient aux sous-types H1, H4, H6 et H14 du virus de l'influenza aviaire. L'analyse spatiale a révélé une concentration importante d'élevages ayant des volailles séropositives dans la zone urbaine de Cáceres, indiquant une activité des virus de l'influenza aviaire et de la maladie de Newcastle dans cette région. Aucune circulation des sous-types H5 et H7 à déclaration obligatoire du virus de l'influenza aviaire ni du virus de la maladie de Newcastle n'a été mise en évidence chez les volailles de basse-cour élevées autour des sites d'oiseaux migrateurs dans l'état du Mato Grosso. Les résultats de cette étude étayent les données d'après lesquelles les volailles de basse-cour des zones urbaines deviennent des sources d'infection pour d'autres espèces d'oiseaux à la faveur d'une circulation de souches faiblement pathogènes ; il est donc nécessaire de renforcer la surveillance dans cette population.

Los biomas de Pantanal y Cerrado, situados en el estado de Mato Grosso, albergan espacios frecuentados por aves migratorias en los municipios de Cáceres y Araguaiana, respectivamente. Debido a la falta de estudios al respecto, se desconocen los niveles de actividad de los virus de la influenza aviar (IA) y de la enfermedad de Newcastle (EN) en las aves de corral caseras de estas zonas. Teniendo en cuenta el riesgo de introducción en el Brasil de la IA y la EN por conducto de aves migratorias, así como la importancia de una vigilancia activa para la detección y prevención de enfermedades con fines de control oficial, para los veterinarios de los servicios públicos resulta más rápido, práctico y barato vigilar esas poblaciones de aves de corral. Los autores describen un estudio encaminado a comprobar, en los años 2016 y 2019, la actividad de los virus de la IA y la EN en bandadas caseras de aves de corral criadas cerca de los antedichos espacios de aves migratorias. Tras obtener muestras séricas e hisopados cloacales y traqueales de pollos, pavos, codornices, patos y gansos, se analizaron las muestras con técnicas de diagnóstico indirecto (ensayo inmunoenzimático y prueba de inhibición de la hemaglutinación) y de detección directa de secuencias víricas (retrotranscripción acoplada a reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real: qRT-PCR). No se detectó ninguna muestra positiva por qRT-PCR. En cuanto a las tasas de seropositividad para la IA y la EN, en Araguaiana resultaron positivas el 0,7% y el 19,6%, respectivamente, de las aves analizadas en 2016, por un 0,5% y un 17,2% en 2019, mientras que en Cáceres lo fueron el 0,8% y el 32,3% en 2016 y el 7,0% y el 38,1% en 2019. En 2019 se identificaron en Cáceres anticuerpos correspondientes a los subtipos H1, H4, H6 y H14 del virus de la influenza aviar. El análisis espacial puso de relieve una aglomeración de fincas con aves de corral seropositivas en la zona urbana de Cáceres, hecho indicativo de que en la zona hay actividad de los virus de la IA y la EN. El estudio no evidenció circulación alguna de los subtipos H5 y H7 del virus de la IA, que son de declaración obligatoria, ni del virus de la EN en las aves de corral caseras criadas en los alrededores de los espacios del estado de Mato Grosso que albergan aves migratorias. Los resultados del estudio parecen avalar los datos que indican que la circulación de cepas poco patógenas en zonas urbanas hace de las bandadas caseras una posible fuente de infección para otras aves, razón por cual es tanto más necesario redoblar la vigilancia de estas poblaciones de aves de corral.

Detecting livestock production zones.

Communities are sets of nodes that are related in an important way, most likely sharing common properties and/or playing similar roles within a network. Unraveling a network structure, and hence the trade preferences and pathways, could be useful to a researcher or a decision maker. We implemented a community detection algorithm to find livestock communities, which is consistent with the definition of a livestock production zone, assuming that a community is a group of farm premises in which an animal is more likely to stay during its lifetime than expected by chance. We applied this algorithm to the network of animal movements within the state of Mato Grosso for 2007. This database holds information concerning 87,899 premises and 521,431 movements throughout the year, totaling 15,844,779 animals moved. The community detection algorithm achieved a network partition that shows a clear geographical and commercial pattern, two crucial features for preventive veterinary medicine applications; this algorithm provides also a meaningful interpretation to trade networks where links emerge based on trader node choices.

Situação epidemiológica da brucelose bovina no Estado de Mato Grosso / Epidemiologic situation of bovine brucellosis in the State of Mato Grosso, Brazil

Caracterizou-se a brucelose bovina em Mato Grosso por meio de um estudo transversal realizado em 2003 para auxiliar na implementação do Programa Nacional de Controle e Erradicação da Brucelose e Tuberculose. No Estado, estratificado em quatro circuitos pecuários, foram amostrados 13.684 animais, provenientes de 1.152 rebanhos. O protocolo de testes utilizado foi o da triagem com o teste do antígeno acidificado tamponado e os soros reagentes foram testados pelo 2-mercaptoetanol (ME) e concomitantemente retestados pelo teste de Rosa Bengala para resultado conclusivo. As prevalências de focos e de animais infectados foram: 41,2 por cento [38,0-44,4 por cento] e 10,2 por cento [7,4-13,1 por cento], respectivamente. Nos circuitos produtivos, as prevalências de focos foram 36,9 por cento [29,2-45,2 por cento], 27,2 por cento [22,8-32,1 por cento], 40,4 por cento [38,8-46,2 por cento] e 50,3 por cento [44,5-56,1 por cento]; e as prevalências de animais 7,9 por cento [3,0-12,9 por cento], 4,1 por cento [2,8-5,4 por cento], 8,1 por cento [5,2-11,1 por cento] e 15,3 por cento [9,2-21,3 por cento], respectivamente, para os circuitos 1, 2, 3 e 4. Os fatores de risco (odds ratio, OR) associados à condição de foco no Estado foram: exploração de gado de corte (OR= 1,8 [1,2-2,5]), exploração mista (OR=1,8 [1,2-2,7]), número de fêmeas no rebanho de 11 a 50 (OR=4,8 [1,1-20,8]), número de fêmeas no rebanho acima de 51 (OR=6,8 [1,6-29,0]), ocorrência de aborto (OR=1,7 [1,3-2,2]). A brucelose está homogeneamente distribuída no Estado, o que permite uniformidade de medidas sanitárias. Adicionalmente, sugere-se a intensificação da vacinação de fêmeas para todo o Estado.

A study to characterize bovine brucellosis in the State of Mato Grosso was carried out in 2003 in order to support the implementation of the National Program for the Control and Eradication of Bovine Brucellosis. The State was divided into four productive regions, and 13,684 bovines from 1,152 herds were sampled. The serum samples were screened for antibodies to Brucella spp. by the Rose-Bengal test (RBT) and all RBT-positive sera were re-tested by the 2-mercaptoethanol test (2-ME), and again by RBT for confirmation. The prevalence of infected herds and animals in the State of Mato Grosso were 41.2 percent [38.0-44.4 percent] and 10.2 percent [7.4-13.1 percent], respectively. In the productive regions, the prevalence of infected herds were 36.9 percent [29.2-45.2 percent], 27.2 percent [22.8-32.1 percent], 40.4 percent [38.8-46.2 percent], and 50.3 percent [44.5-56.1 percent], respectively; and the prevalence of infected animals were 7.9 percent [3.0-12.9 percent], 4.1 percent [2.8-5.4 percent], 8.1 percent [5.2-11.1 percent], and 15.3 percent [9.2-21.3 percent], respectively, for regions 1, 2, 3, and 4. The risk factors (odds ratio, OR) associated with the presence of the infection in the State were: beef cattle farming (OR=1.8 [1.2-2.5]), mixed (beef and dairy) cattle farming (OR=1.8 [1.2-2.7]), farms with 11 to 50 females (OR=4.8 [1.1-20.8]), farms with more than 51 females (OR=6.8 [1.6-29.0]), and occurrence of abortion (OR=1.7 [1.3-2.2]). Given that brucellosis is homogeneously distributed in the State, uniform sanitary measures might be adopted. As a homogeneous additional measure for the State, the intensification of female vaccination is suggested.