Desarrollo de un sistema de codificación automática para recuperar y analizar textos diagnósticos de los registros de servicios de urgencias hospitalarios / Development of an automated coding system to retrieve and analyze diagnostic information stored in hospital emergency department records

Objetivos: Desarrollar un codificador automático para recuperar información de los registros de urgencias hospitalarios y evaluar su desempeño. Método: Se utilizaron los textos diagnósticos de los urgenciólogos de 27 hospitales durante2010 y 2011: los textos de 3.042.695 registros de 2010 para desarrollar el codificador automático y los de 3.072.861 registros de 2011 para comprobar su funcionamiento. Para su evaluación, se seleccionó una muestra al eatoria de los registros de2011 que fue doblemente codificada por el codificador automático y por un experto en codificación clínica. Se calcularon la precisión, el recall y la F-score del codificador. Resultados: Contenían información potencialmente codificable 2.936.842 registros de2011 (95,6% del total). En ellos, el codificador automático identificó 3.516.384 textos diferentes (1,2 por registro) de los que codificó 3.087.243 (87,8%) y proporcionó códigos a 2.639.427 (89,9% de 2.936.842). La precisión fue 0,976 (CI 95% = 0,957-0.990),su recall 0,878 (CI 95% = 0,844-0,910) y su F-score 0,925 (CI 95% = 0,903-0,943).Conclusiones: Este codificador se adapta eficientemente al entorno de urgencias y permite la codificación de millones de registros en pocas horas, haciendo operativa la información diagnóstica que contienen. El codificador podría mejorar su recall si incorporara un motor probabilístico (AU)

Objectives: To develop an automated coding system to retrieve information from hospital emergency department (ED)records and to evaluate the performance of the system. Methods: Diagnostic reports written by ED physicians in 27 hospitals of the Andalusian public health service in 2010and 2011 were used. The automated coder was developed based on texts from 3 042 695 records for 2010; the coding system’s performance was tested in texts from 3 072 861 records for 2011. For evaluation, a set of randomly selected records from 2011 were coded by the automated system and by an expert clinical coder. The system’s precision, recall, and F-score were calculated. Results: A total of 2 936 842 records for 2011 contained potentially codifiable information (95.6% of the records). The automated coder identified 3 516 384 different diagnostic texts (1.2 per record) and coded 3 087 243 (87.8%) of them; codes were entered for 2 639 427 records (89.9% of the 2 936 842 with potentially codifiable information). The system’s precision was 0.9760 (95% CI, 0.957-0.990), recall was 0.8784 (95% CI, 0.84-0.910), and the F-score was0.925 (95% CI, 0.903–0.943).Conclusions: This system adapts efficiently to the ED setting, coding millions of records in a few hours and making the diagnostic information available for use. Incorporating probabilistic methods would improve the system’s recall (AU)

Tabaquismo en pacientes hospitalizados / Smoking of in-patients

Objetivo: Este estudio investiga los conocimientos y las actitudes respecto al hábito de fumar en pacientes hospitalizados. Se pretende así identificar aquellas actuaciones sanitarias que podrían ayudarnos a reducir la prevalencia del hábito tabáquico. Material y métodos: Estudio transversal de una muestra aleatoria simple de 395 pacientes, del Hospital Universitario Virgen Macarena de Sevilla, de los que 345 (89 por ciento) aceptaron participar en esta investigación. El cuestionario sobre hábito tabáquico, administrado por un sólo encuestador, se complementó con información sobre características epidemiológicas y clínicas de los pacientes Resultados: Un 60 por ciento de pacientes son fumadores actuales ò ex-fumadores, con diferencias estadísticamente significativas en la distribución del hábito de fumar según edad, género, educación, nivel socioeconómico y diagnóstico de ingreso. Más del 90 por ciento de los pacientes conoce la relación causal entre tabaco y cáncer de pulmón o enfermedad pulmonar obstructiva crónica, pero esta proporción es menor para las localizaciones oncológicas de laringe (86 por ciento), esófago (86 por ciento) y cavidad oral (81 por ciento), cardiopatía coronaria (82 por ciento) y recién nacidos de bajo peso (78 por ciento) sin que existan diferencias significativas entre fumadores, ex fumadores y no fumadores. El 45 por ciento de los fumadores actuales tenían menos de 15 años cuando comenzaron a fumar y un 40 por ciento adicional entre 15 y 19 años. El 46 por ciento de los fumadores han intentado, sin éxito, dejar este hábito, a pesar de recibir recomendaciones, en este sentido, del personal sanitario (61 por ciento), familiares y amigos (60 por ciento). Conclusiones: La actuaciones sanitarias contra el tabaquismo deben contemplar, el apoyo farmacológico y psicoterapéutico a los fumadores actuales ya que una proporción importante de los mismos aunque desean abandonar el tabaquismo, no lo consiguen (AU)

Objective: To asses the knowledge and attitude about smoking habit of in-patients in order to detect the sanitary activities that could help to decrease the prevalence of smoking. Material and methods: Cross-sectional observational study of random sample (n=395) of in-patients of University Hospital Virgen Macarean, Seville, Spain. Participation rate was 89% (n= 350) and the interviewer-administered questionnaire was completed with epidemiological and clinical additional data. Results: Sixty per cent of in-patients were smokers or former smokers. There were statistically significant differences in smoking distribution by age, gender, education, socio-economic level and admission diagnosis. Etiologic relationships between tobacco smoking and lung cancer or chronic lung disease were known by more than 90% of in-patients but other smoking’s health effects were not so well known: larynx (86%), oesophagus (86%) and oral cavity (81%) cancer, coronary heart disease (82%) and low birthweight (78%). Forty-five per cent of smokers began to smoke before the age of 15 and an additional 40% at 15-19 year. Forty-six per cent of smokers tried to leave this habit without success in spite of receiving medical advice of leaving smoking (61%) and the recommendations of family and friends (60%). Conclusions: Preventive campaigns against tobacco smoking must include pharmacological and psicological treatment for current smokers because an important proportion of them try to leave this habit without success (AU)

Evolución de la mortalidad por melanoma maligno cutáneo en Andalucía / Mortality trends of cutaneous malignant melanoma in Andalucía

Propósito: Investigar la tendencia de la mortalidad por Melanoma cutáneo maligno (MCM) en Andalucía. Material y métodos: Análisis epidemiológico de las tasas crudas, estandarizadas, truncadas y específicas por edad y género a partir de las defunciones por MCM de residentes en Andalucía en 1975-1998. Ajuste de modelos de regresión de Poisson para valorar el riesgo relativo asociado a la edad y al periodo. Resultados: Todos los parámetros epidemiológicos analizados muestran un aumento de la mortalidad por MCM en Andalucía en ambos géneros, a lo largo del intervalo estudiado, que el modelo de Poisson cuantifica en el 6 por ciento promedio anual para varones y el 6,5 por ciento para mujeres. Conclusiones: Mientras que otros países de nuestro entorno han mostrado, a partir de mediados de los 80, una estabilización de la mortalidad por MCM, en Andalucía ésta ha seguido aumentando y se hace necesario insistir en las medidas de prevención tanto primaria como secundaria (AU)

Mortalidad por cáncer de estómago en Andalucía: tendencia y distribución espacial / Mortality due to gastric cancer in Andalusia: trends and geographic distribution

Objetivo. Describir la evolución de la mortalidad por cáncer de estómago en Andalucía y su distribución geográfica actual. Diseño. Estudio descriptivo de base poblacional. Emplazamiento. Andalucía durante el período 1975-1999.Participantes. Residentes en Andalucía. Mediciones. Tasas brutas, ajustadas por edad, truncadas (35-64 años), de años potenciales de vida perdidos (1-70 años) y acumuladas (0-74 años) de mortalidad por cáncer de estómago entre 1975 y 1999. Coeficientes de regresión lineal del modelo que mejor se ajusta a las tasas estandarizadas a lo largo de todo el período. Tasas ajustadas por edad del quinquenio 1995-1999 en los distritos sanitarios de atención primaria. Resultados. Se observa un descenso mantenido de la mortalidad por cáncer de estómago, y las tasas estandarizadas pasan de 15,9 a 5,8 en mujeres y de 33,9 a 14,5 en varones (por 100.000 individuos). Los distritos de las sierras norte de Sevilla, Huelva y Córdoba junto con Guadix, en Granada, presentaron las tasas más altas en el quinquenio 1995-1999 tras ajustar por edad. Los varones mantienen tasas más elevadas de mortalidad a lo largo del intervalo analizado, con razones de masculinidad siempre superiores a 2. Conclusiones. La mortalidad por cáncer de estómago ha descendido notablemente en Andalucía a lo largo del último cuarto del siglo XX, pero la distribución geográfica actual de la misma no es homogénea y se observan distritos de atención primaria con tasas 3 veces superiores a las tasas de los distritos de baja mortalidad. Se necesitan estudios analíticos que aclaren las posibles causas de estas notables diferencias (AU)