ABSTRACT
The agricultural industry and regulatory organizations define strategies and build tools and products for plant protection against pests. To identify different plants and their related pests and avoid inconsistencies between such organizations, an agreed and shared classification is necessary. In this regard, the European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO) has been working on defining and maintaining a harmonized coding system (EPPO codes). EPPO codes are an easy way of referring to a specific organism by means of short 5 or 6 letter codes instead of long scientific names or ambiguous common names. EPPO codes are freely available in different formats through the EPPO Global Database platform and are implemented as a worldwide standard and used among scientists and experts in both industry and regulatory organizations. One of the large companies that adopted such codes is BASF, which uses them mainly in research and development to build their crop protection and seeds products. However, extracting the information is limited by fixed API calls or files that require additional processing steps. Facing these issues makes it difficult to use the available information flexibly, infer new data connections, or enrich it with external data sources. To overcome such limitations, BASF has developed an internal EPPO ontology to represent the list of codes provided by the EPPO Global Database as well as the regulatory categorization and relationship among them. This paper presents the development process of this ontology along with its enrichment process, which allows the reuse of relevant information available in an external knowledge source such as the NCBI Taxon. In addition, this paper describes the use and adoption of the EPPO ontology within the BASF's Agricultural Solutions division and the lessons learned during this work.
ABSTRACT
El Santuario de la Naturaleza Carlos Anwandter (Valdivia, Chile) incluye el cauce del río Cruces, varios tributarios de él y zonas aledañas de inundación permanente (bañados). En dicho humedal existía una rica flora acuática y palustre, que albergaba una variada fauna, especialmente aves. En octubre de 2004 se denunció la muerte de algunos Cisnes de cuello negro y la migración de la mayoría de ellos, por escasez de alimento, constituido principalmente por el macrófito sumergido y arraigado al sustrato, Egeria densa, que había desaparecido de los bañados, pero se conservaba sumergido en los cauces. Los Cisnes de cuello negro sumergían cuerpo y cabeza tironeando las plantas, arrancándolas y ayudando así a su desaparición. La causa de la muerte en los bañados y profundización de Egeria densa en los cauces, es aún una incógnita, aunque se ha señalado como culpable a una industria de celulosa ubicada a orillas del río Cruces unos 30 km aguas arriba del humedal, que empezó sus actividades productivas en febrero de 2004. Se supone una contaminación con hierro, presente en los sedimentos y liberados por los riles de la industria. Las características de la posible contaminación del humedal no son típicas de una actividad industrial, que tampoco podría haberse presentado en tan corto plazo. La presencia de los mismos síndromes observados en el Santuario del río Cruces, en las lagunas (Grande y Chica) de San Pedro de la Paz en Concepción, 400 km más al Norte, indican una causa más generalizada. La sobrevivencia de plantas sumergidas, indican un factor atmosférico que se atenúa en profundidad. Ante estas y otras evidencias se hipotetiza que la causa de la muerte de Egeria densa sería la alta radiación UV-B en la región, aumentada por el paulatino adelgazamiento de la capa de ozono. Esta hipótesis deberá ser comprobada en la próxima primavera, época en que aumenta la radiación.
