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1.
Semina ciênc. agrar ; 37(4): 2365-2374, 2016.
Article in English | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1500409

ABSTRACT

The genetic diversity of Piaractus mesopotamicus (pacu) and Leporinus elongatus (piapara) broodstocks used in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema is analyzed. One hundred and twenty specimens (two broodstocks of each species) from fish ponds in Palotina PR Brazil and in Salto Grande SP Brazil were assessed. Ten primers produced 96 fragments, comprising 68 (70.83%) and 94 (97.92%) polymorphic fragments for P. mesopotamicus and L. elongatus broodstocks, respectively. Differences (p 0.05) in the frequency of 15 and 27 fragments were detected for each species, without exclusive fragments. Shannon Index (0.347 - 0.572) and the percentage of polymorphic fragments (57.3% - 94.8%) revealed high intra-population genetic variability for all broodstocks. Results of molecular variance analyses (AMOVA) showed that most variations do not lie between the broodstocks but within each broodstock (89%). Genetic (0.088 and 0.142) and identity (0.916 and 0.868) distance rates demonstrated similarity between the broodstocks of each species, corroborated by Fst (0.1023 and 010.27) and Nm (4.18 and 4.33) rates, with a slight genetic difference due to genic flux. High intrapopulation genetic variability and similarity between the broodstocks of each species was also detected, proving a common ancestry.


O objetivo da pesquisa foi analisar a diversidade genética de estoques de Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piapara (Leporinus elongatus) utilizados em programas de repovoamento dos rios Paraná e Paranapanema. Foram analisados 120 exemplares (dois estoques de cada espécie) de pisciculturas das cidades de Palotina (Paraná) e da cidade de Salto Grande (São Paulo). Os 10 iniciadores produziram 96 fragmentos, dos quais 68 (70,83%) e 94 (97,92%) foram polimórficos para os estoques de P. mesopotamicus e L. elongatus, respectivamente. Foram observadas diferenças (P 0,05) na frequência de 15 e 27 fragmentos para cada espécie, sem a presença de fragmentos exclusivos. Os valores do índice de Shannon (0,347 a 0,572) e da porcentagem de fragmentos polimórficos (57,3% a 94,8%) mostraram uma alta variabilidade genética intra-populacional para todos os estoques. Os resultados das análises de variância molecular (AMOVA) mostraram que a maior parte da variação está dentro de cada estoque (89%) e não entre os estoques. Os valores da distância (0,088 e 0,142) e identidade (0,916 e 0,868) genética demonstraram que existe similaridade entre os estoques de cada espécie, sendo corroborado pelos valores de Fst (0,1023 e 010,27) e Nm (4,18 e 4,33) que mostraram uma moderada diferenciação genética com presença de fluxo gênico. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional e similarida

2.
Semina ciênc. agrar ; 37(4): 2375-2386, 2016.
Article in English | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1500431

ABSTRACT

In recent years, the genetic monitoring of broodstocks in fish farming has been greatly highlighted due to its importance in the management and improvement of their production and conservation. Current study evaluates the genetic diversity of four Tambaqui broodstocks (Colossoma macropomum) in the state of Rondônia (Brazil) and discusses activities towards the species´s correct production management and conservation. Nine primers were employed to analyze 94 specimens from four fish farms in the municipalities of Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Médici (PM) and Rolim de Moura (RM). Differences in the frequency of 38 fragments, with an exclusive fragment in JP and OP, were reported. High polymorphism (52.40 to 64.60%) and Shannon Index (0.313 to 0.382) rates were observed. The analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that most variation is within each stock. The identity and genetic distance between the groups ranged between 0.927 and 0.954 and between 0.047 and 0.076 respectively, with shortest distance between the OPxPM and JPxRM groups. Genetic differentiation ranged from moderate to high (Fst = 0.081 to 0.179) and the number of migrants per generation was moderate (Nm = 3.83 to 6.24). As a rule, stocks showed high genetic variability and moderate / high differentiation and genetic distance between them. The results allowed direct conservation pr


Nos últimos anos, o monitoramento genético de estoques na piscicultura tem recebido grande destaque devido a sua importância no gerenciamento e melhora da sua produção e conservação. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de quatro estoques de reprodutores Tambaqui (Colossoma macropomum) do estado de Rondônia (Brasil) e através dela, discutir ações que contribuam com o correto manejo produtivo e conservação dessa espécie. Utilizaram-se nove iniciadores para analisar 94 indivíduos de quatro pisciculturas dos municípios Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Medici (PM) e Rolim de Moura (RM). Foram encontradas diferenças nas frequências de 38 fragmentos, com um fragmento exclusivo em JP e OP. Altos valores de polimorfismo (52,40 a 64,60%) e índice de Shannon (0,313 a 0,382) foram observados. A análise de variância molecular (AMOVA) demostrou que a maior parte da variação está dentro de cada estoque. A identidade e distância genética entre os agrupamentos variou de 0,927 a 0,954 e 0,047 a 0,076, respectivamente, com menor distância entre os agrupamentos OPxPM e JPxRM. A diferenciação genética variou de moderada a alta (Fst = 0,081 a 0,179) e o número de migrantes por geração foi moderado (Nm = 3,83 a 6,24). De forma geral, os estoques apresentaram alta variabilidade genética e moderada/alta diferenciação e distancia g

3.
Semina ciênc. agrar ; 37(4): 2427-2436, 2016.
Article in English | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1500441

ABSTRACT

Most of the electricity used in Brazil comes from hydroelectric plants, mainly due to the great availability of its water resources. However, the construction of these plants denotes serious problems related to migration of native fish and the genetic conservation of stocks. Current study evaluates two wild population of Leporinus elongatus (piapara) located downstream (Population A - PopA) and upstream (Population B - PopB) of the Cachoeira Branca before the construction of the São Domingos hydroelectric plant (HPP) in the Mato Grosso do Sul State, Brazil. Thirty samples from caudal fins were collected and analyzed for each population. Eighty-nine fragments, including 72 polymorphic ones (80.9%), were analyzed. Low fragments (less than 0.100) in both populations (PopA = 2 and PopB = 3) were identified. Nine fixed fragments (frequency 1.000) (PopA = 3 and PopB = 6), and four exclusive fragments (PopA = 3 and PopB = 1) were also reported. The genetic variability within populations, calculated by Shannon Index and by percentage of polymorphic fragments, indicated high rates of intrapopulation variability (PopA = 0.309 and 61.80% and PopB = 0.392 and 71.90%, respectively). Genetic distance and identity rates (0.089 and 0.915, respectively) were different between populations, whilst AMOVA showed that most variations lie within the populations and not between them. Fst and Nm rates


A maior parte da energia elétrica utilizada no Brasil provém de usinas hidrelétricas, devido principalmente à grande disponibilidade de recursos hídricos. Contudo, a construção dessas usinas pode representar graves problemas relacionados com a migração de peixes nativos e com a conservação genética dessas populações. O objetivo do presente trabalho foi avaliar duas populações naturais de Piapara (Leporinus elongatus) localizadas à jusante (População A - PopA) e montante (População B - PopB) da Cachoeira Branca no período anterior à construção da usina hidrelétrica (UHE) São Domingos, Mato Grosso do Sul - Brasil. Trinta amostras de nadadeira caudal foram coletadas e analisadas para cada população. No total, foram observados 89 fragmentos dos quais 72 foram polimórficos (80,9%). Foram identificados fragmentos de baixa frequência (menor que 0,100) em ambas as populações (PopA = 2 e PopB = 3). Nove fragmentos fixados (frequência de 1,000) (PopA = 6 e PopB = 3) e quatro fragmentos exclusivos (PopA = 3 e PopB = 1) também foram observados. A variabilidade genética dentro das populações, calculada através do índice de Shannon e pela porcentagem de fragmentos polimórficos mostrou altos valores de variabilidade intra-populacional (PopA= 0,309 e 61,80% e PopB = 0,392 e 71,90%, respectivamente). Os valores de distância e a identidade genética (0,089 e 0,915, respectivamente) mostraram dife

4.
Semina Ci. agr. ; 37(4): 2427-2436, 2016.
Article in English | VETINDEX | ID: vti-471700

ABSTRACT

Most of the electricity used in Brazil comes from hydroelectric plants, mainly due to the great availability of its water resources. However, the construction of these plants denotes serious problems related to migration of native fish and the genetic conservation of stocks. Current study evaluates two wild population of Leporinus elongatus (piapara) located downstream (Population A - PopA) and upstream (Population B - PopB) of the Cachoeira Branca before the construction of the São Domingos hydroelectric plant (HPP) in the Mato Grosso do Sul State, Brazil. Thirty samples from caudal fins were collected and analyzed for each population. Eighty-nine fragments, including 72 polymorphic ones (80.9%), were analyzed. Low fragments (less than 0.100) in both populations (PopA = 2 and PopB = 3) were identified. Nine fixed fragments (frequency 1.000) (PopA = 3 and PopB = 6), and four exclusive fragments (PopA = 3 and PopB = 1) were also reported. The genetic variability within populations, calculated by Shannon Index and by percentage of polymorphic fragments, indicated high rates of intrapopulation variability (PopA = 0.309 and 61.80% and PopB = 0.392 and 71.90%, respectively). Genetic distance and identity rates (0.089 and 0.915, respectively) were different between populations, whilst AMOVA showed that most variations lie within the populations and not between them. Fst and Nm rates


A maior parte da energia elétrica utilizada no Brasil provém de usinas hidrelétricas, devido principalmente à grande disponibilidade de recursos hídricos. Contudo, a construção dessas usinas pode representar graves problemas relacionados com a migração de peixes nativos e com a conservação genética dessas populações. O objetivo do presente trabalho foi avaliar duas populações naturais de Piapara (Leporinus elongatus) localizadas à jusante (População A - PopA) e montante (População B - PopB) da Cachoeira Branca no período anterior à construção da usina hidrelétrica (UHE) São Domingos, Mato Grosso do Sul - Brasil. Trinta amostras de nadadeira caudal foram coletadas e analisadas para cada população. No total, foram observados 89 fragmentos dos quais 72 foram polimórficos (80,9%). Foram identificados fragmentos de baixa frequência (menor que 0,100) em ambas as populações (PopA = 2 e PopB = 3). Nove fragmentos fixados (frequência de 1,000) (PopA = 6 e PopB = 3) e quatro fragmentos exclusivos (PopA = 3 e PopB = 1) também foram observados. A variabilidade genética dentro das populações, calculada através do índice de Shannon e pela porcentagem de fragmentos polimórficos mostrou altos valores de variabilidade intra-populacional (PopA= 0,309 e 61,80% e PopB = 0,392 e 71,90%, respectivamente). Os valores de distância e a identidade genética (0,089 e 0,915, respectivamente) mostraram dife

5.
Semina Ci. agr. ; 37(4): 2375-2386, 2016.
Article in English | VETINDEX | ID: vti-471380

ABSTRACT

In recent years, the genetic monitoring of broodstocks in fish farming has been greatly highlighted due to its importance in the management and improvement of their production and conservation. Current study evaluates the genetic diversity of four Tambaqui broodstocks (Colossoma macropomum) in the state of Rondônia (Brazil) and discusses activities towards the species´s correct production management and conservation. Nine primers were employed to analyze 94 specimens from four fish farms in the municipalities of Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Médici (PM) and Rolim de Moura (RM). Differences in the frequency of 38 fragments, with an exclusive fragment in JP and OP, were reported. High polymorphism (52.40 to 64.60%) and Shannon Index (0.313 to 0.382) rates were observed. The analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that most variation is within each stock. The identity and genetic distance between the groups ranged between 0.927 and 0.954 and between 0.047 and 0.076 respectively, with shortest distance between the OPxPM and JPxRM groups. Genetic differentiation ranged from moderate to high (Fst = 0.081 to 0.179) and the number of migrants per generation was moderate (Nm = 3.83 to 6.24). As a rule, stocks showed high genetic variability and moderate / high differentiation and genetic distance between them. The results allowed direct conservation pr


Nos últimos anos, o monitoramento genético de estoques na piscicultura tem recebido grande destaque devido a sua importância no gerenciamento e melhora da sua produção e conservação. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de quatro estoques de reprodutores Tambaqui (Colossoma macropomum) do estado de Rondônia (Brasil) e através dela, discutir ações que contribuam com o correto manejo produtivo e conservação dessa espécie. Utilizaram-se nove iniciadores para analisar 94 indivíduos de quatro pisciculturas dos municípios Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Medici (PM) e Rolim de Moura (RM). Foram encontradas diferenças nas frequências de 38 fragmentos, com um fragmento exclusivo em JP e OP. Altos valores de polimorfismo (52,40 a 64,60%) e índice de Shannon (0,313 a 0,382) foram observados. A análise de variância molecular (AMOVA) demostrou que a maior parte da variação está dentro de cada estoque. A identidade e distância genética entre os agrupamentos variou de 0,927 a 0,954 e 0,047 a 0,076, respectivamente, com menor distância entre os agrupamentos OPxPM e JPxRM. A diferenciação genética variou de moderada a alta (Fst = 0,081 a 0,179) e o número de migrantes por geração foi moderado (Nm = 3,83 a 6,24). De forma geral, os estoques apresentaram alta variabilidade genética e moderada/alta diferenciação e distancia g

6.
Semina Ci. agr. ; 37(4): 2365-2374, 2016.
Article in English | VETINDEX | ID: vti-470650

ABSTRACT

The genetic diversity of Piaractus mesopotamicus (pacu) and Leporinus elongatus (piapara) broodstocks used in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema is analyzed. One hundred and twenty specimens (two broodstocks of each species) from fish ponds in Palotina PR Brazil and in Salto Grande SP Brazil were assessed. Ten primers produced 96 fragments, comprising 68 (70.83%) and 94 (97.92%) polymorphic fragments for P. mesopotamicus and L. elongatus broodstocks, respectively. Differences (p 0.05) in the frequency of 15 and 27 fragments were detected for each species, without exclusive fragments. Shannon Index (0.347 - 0.572) and the percentage of polymorphic fragments (57.3% - 94.8%) revealed high intra-population genetic variability for all broodstocks. Results of molecular variance analyses (AMOVA) showed that most variations do not lie between the broodstocks but within each broodstock (89%). Genetic (0.088 and 0.142) and identity (0.916 and 0.868) distance rates demonstrated similarity between the broodstocks of each species, corroborated by Fst (0.1023 and 010.27) and Nm (4.18 and 4.33) rates, with a slight genetic difference due to genic flux. High intrapopulation genetic variability and similarity between the broodstocks of each species was also detected, proving a common ancestry.


O objetivo da pesquisa foi analisar a diversidade genética de estoques de Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piapara (Leporinus elongatus) utilizados em programas de repovoamento dos rios Paraná e Paranapanema. Foram analisados 120 exemplares (dois estoques de cada espécie) de pisciculturas das cidades de Palotina (Paraná) e da cidade de Salto Grande (São Paulo). Os 10 iniciadores produziram 96 fragmentos, dos quais 68 (70,83%) e 94 (97,92%) foram polimórficos para os estoques de P. mesopotamicus e L. elongatus, respectivamente. Foram observadas diferenças (P 0,05) na frequência de 15 e 27 fragmentos para cada espécie, sem a presença de fragmentos exclusivos. Os valores do índice de Shannon (0,347 a 0,572) e da porcentagem de fragmentos polimórficos (57,3% a 94,8%) mostraram uma alta variabilidade genética intra-populacional para todos os estoques. Os resultados das análises de variância molecular (AMOVA) mostraram que a maior parte da variação está dentro de cada estoque (89%) e não entre os estoques. Os valores da distância (0,088 e 0,142) e identidade (0,916 e 0,868) genética demonstraram que existe similaridade entre os estoques de cada espécie, sendo corroborado pelos valores de Fst (0,1023 e 010,27) e Nm (4,18 e 4,33) que mostraram uma moderada diferenciação genética com presença de fluxo gênico. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional e similarida

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