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1.
J Hered ; 106 Suppl 1: 448-58, 2015.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-26245780

ABSTRACT

Previous investigations of the population genetics of the scalloped hammerhead sharks (Sphyrna lewini) in the Eastern Tropical Pacific have lacked information about nursery areas. Such areas are key to promoting conservation initiatives that can protect young sharks from threats such as overfishing. Here, we investigated the genetic diversity, phylogeography, and connectivity of S. lewini found in 3 areas of Colombia's Pacific coast: around Malpelo Island and in 2 National Natural Parks on the Colombian Pacific mainland (Sanquianga and Ensenada de Utría). We analyzed mtDNA control region (CR) sequences and genotyped 15 microsatellite loci in 137 samples of adults and juveniles. The mtDNA analyses showed haplotypes shared between the Colombian Pacific individuals sampled in this investigation and other areas in the Eastern Tropical Pacific, the Indo-Pacific, and with sequences previously reported in Colombia (Buenaventura Port), as well as 4 unique haplotypes. Population assignment and paternity analyses detected 3 parent-offspring pairs between Malpelo and Sanquianga and 1 between Malpelo and Utría. These results indicate high genetic connectivity between Malpelo Island and the Colombian Pacific coast, suggesting that these 2 areas are nurseries for S. lewini. This is, to our knowledge, the first evidence of nursery areas identified for the scalloped hammerhead shark anywhere in the world. Additional conservation planning may be required to protect these nursery habitats of this endangered shark species.


Subject(s)
Genetic Variation , Genetics, Population , Sharks/genetics , Animals , Colombia , Conservation of Natural Resources , DNA, Mitochondrial/genetics , Endangered Species , Genetic Markers , Genotype , Haplotypes , Microsatellite Repeats , Phylogeography , Sequence Analysis, DNA
2.
NOVA publ. cient ; 5(7): 25-30, jun. 2007. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-474698

ABSTRACT

El objetivo de este trabajo fue determinar las frecuencias alélicas del sistema HLA-A*,B* y DRB1* en una muestra de 981 individuos de la población colombiana. El tamaño de la muestra fue depurado a partir de la base de datos del la Red Colombiana de Trasplantes de donde se tomaron finalmente 981 individuos a los cuales se les realizó el análisis estadístico por medio del programa ARLEQUIN versión 2000. Se encontró una diversidad total de 66 alelos que representan el 87/100 de la diversidad alélica mundial a nivel de los loci A*, B* y DRB1*. Se hallaron 19 alelos para el locus HLA-A*, 33 para el locus HLA-B* y 14 para el DRB1*. Los alelos HLA-A*02 y HLA-A*24 presentaron una frecuencia de 0,2696 y 0,2706 respectivamente, que corresponden al 54/100 de la muestra analizada. Los alelos HLA-B*35 y HLA-B*51 fueron los más frecuentes del loci B*: 0,1926 y 0,1314, respectivamente. Para los DRB1*, únicamente el DRB1*04 presenta una alta frecuencia: 0.238. Los restantes alelos muestran frecuencias inferiores al 12/100. Los resultados de este trabajo confirman, a nivel molecular, la diversidad genética de la población estudiada, dado que Colombia posee el 87/100 de los polimorfismos HLA (loci A*, B* y DRB1*) encontrados en el mundo.


Subject(s)
Alleles , Gene Frequency , Haplotypes , Histocompatibility , Major Histocompatibility Complex , Polymorphism, Genetic , Colombia
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