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1.
Biomedica ; 25(1): 87-100, 2005 Mar.
Article in Spanish | MEDLINE | ID: mdl-15962905

ABSTRACT

INTRODUCTION: The enzyme telomerase regulates telomere length by synthesis of telomeric repeats to compensate for telomeric loss in each DNA replication cycle. Therefore, telomerase is a potential target to block growth of cells with high replication rates. In Plasmodium falciparum, telomerase activity has been documented, but little information on its structure and role. METHODS: Herein, alignment of multiple sequences was undertaken comparing telomerase catalytic subunit sequences as found in existing databases. A consensus sequence was compared with the sequences in the P. falciparum genome project and as a result, a candidate sequence for a portion of the telomerase gene was recovered. Primer sets were designed for DNA and RNA amplifications. RESULTS: DNA fragments corresponding to telomerase conserved domains were amplified by using reverse transcription and PCR of cDNA. With a combination of bioinformatics and sequencing methods, the sequence of telomerase catalytic subunit gene (TERT) in P. falciparum was discovered, and its presence and transcription demonstrated.


Subject(s)
Plasmodium falciparum/enzymology , Telomerase/genetics , Animals , Computational Biology , DNA, Protozoan/genetics , DNA-Binding Proteins , Humans , Plasmodium falciparum/genetics , Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction , Sequence Alignment , Telomerase/analysis
2.
Biomédica (Bogotá) ; 25(1): 87-100, mar. 2005. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-421516

ABSTRACT

Introducción. La enzima telomerasa participa en la regulación de la longitud de los telómeros al sintetizar nuevas repeticiones teloméricas que compensan las pérdidas en cada ronda de replicación del ADN. Por esta razón, el bloqueo de su actividad se plantea como un posible blanco de acción para detener el crecimiento de células con altas tasas de crecimiento. Tal es el caso de Plasmodium falciparum, parásito causante de la forma más grave de paludismo humano, en el cual se sabe que hay actividad de telomerasa pero no se tiene información sobre la enzima misma. Metodología. Para hacer un acercamiento al estudio de la telomerasa en P. falciparum, se realizó un alineamiento múltiple de las secuencias de la subunidad catalítica de la telomerasa disponibles en bases de datos y se obtuvo una secuencia consenso, la cual se comparó con las secuencias generadas en el proyecto de genoma de P. falciparum. Se encontró una secuencia que podría corresponder a parte del gen de la telomerasa de P. falciparum. Para comprobarlo, se diseñaron iniciadores que se utilizaron en ensayos de amplificación sobre el ADN y el ARN del parásito.Resultados. Se amplificaron fragmentos de ADN correspondientes a motivos conservados en las telomerasas y se detectó la presencia del ARNm mediante trascripción reversa y PCR sobre el ADNc generado. De esta manera, al combinar la utilización de herramientas de bioinformática y su posterior comprobación mediante técnicas de biología molecular


Subject(s)
Catalytic Domain , Computational Biology , Plasmodium falciparum/genetics , Telomerase , Telomere
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