Application of Global Burden of Animal Diseases methods at country level: experiences of the Ethiopia case study.

Animals play a central role in human livelihoods and welfare. Animal diseases have a great impact on the benefits humans derive from animals and can also pose a risk to human health. Better control of animal diseases generates wider societal benefits, including reducing the climate and ecological impacts of livestock and improving animal welfare. To better understand the scale of investment justified for the control and prevention of animal disease, the wide-ranging impacts of disease on animal production and health must be measured. The Global Burden of Animal Diseases (GBADs) programme is quantifying animal disease burden from the local to global levels. The GBADs programme includes country case studies for national- and local-level analysis. Ethiopia is the first case study country in which GBADs methods have been applied. GBADs'Ethiopia case study consists of three activity areas: i) stakeholder engagement; ii) livestock disease burden estimation, including data collection, analytics, evidence generation and communication; and iii) capacity building in animal health economics. At the start of the case study, various stakeholder communication platforms were used to familiarise stakeholders with GBADs and engage their support in various ways, including data access, and, through this engagement, to ensure the programme tools and outputs were relevant and useful to their needs. Existing data were retrieved from multiple sources and used to estimate disease burden. This process involved multiple steps, including estimation of biomass and economic value, the Animal Health Loss Envelope (farm-level disease burden), wider economic impacts and attribution of the disease burden to different levels of causes. This was carried out for major livestock species (cattle, sheep, goats and poultry) in Ethiopia. Capacity building on animal health economics was carried out for GBADs end users to increase competence in utilising animal health economic evidence, including GBADs outputs. This article documents experiences of the implementation of these activities in the GBADs Ethiopia case study.

Les animaux représentent une part substantielle des moyens de subsistance et contribuent de manière essentielle au bien-être humain. Les bénéfices que l'humanité peut retirer des animaux sont toutefois compromis par les maladies animales, qui font aussi peser un risque sur la santé publique. Les avantages sociétaux d'un meilleur contrôle des maladies animales dépassent la portée strictement sanitaire et recouvrent notamment l'atténuation de l'impact climatique et environnemental des animaux d'élevage et l'amélioration du bien-être animal. Pour mieux appréhender l'échelle des investissements requis pour contrôler et prévenir les maladies animales, il convient de mesurer les impacts très divers de ces maladies sur la production et la santé animales. Le programme " Impact mondial des maladies animales " (GBADs) procède actuellement à la quantification de la charge des maladies animales, du niveau local au niveau mondial. Il comprend aussi des études de cas conduites dans des pays choisis pour une analyse à l'échelle nationale, voire locale. L'Ethiopie est le premier pays à avoir fait l'objet d'une étude de cas nationale reprenant les méthodes du GBADs. L'étude comportait trois volets d'activités : i) la mobilisation des parties prenantes ; ii) l'estimation de la charge des maladies chez les animaux d'élevage, notamment la collecte de données, leur analyse, l'apport d'éléments probants et la communication ; et iii) le renforcement des capacités en économie de la santé animale. Au lancement de l'étude, plusieurs plateformes de communication professionnelles ont été utilisées pour mieux faire connaître le GBADs aux différents acteurs et solliciter leur soutien de diverses manières, en particulier en termes d'accès aux données, et pour s'assurer, grâce à cette mobilisation, que les outils et les résultats du programme étaient pertinents pour eux et répondaient à leurs besoins. Les données existantes ont été recueillies auprès de multiples sources et ont permis d'estimer la charge sanitaire. Ce processus comportait plusieurs étapes, dont l'estimation de la biomasse et de la valeur économique, la définition de l'enveloppe des pertes sanitaires animales (charge sanitaire à l'échelle des exploitations), l'appréciation des effets économiques au sens large et la répartition de la charge sanitaire en fonction des niveaux des causes attribuées. Les analyses portaient sur les principales espèces d'animaux d'élevage (bovins, ovins, caprins et volailles) en Ethiopie. Des activités de renforcement des capacités en économie de la santé animale ont été proposées aux utilisateurs finaux du GBADs afin de les former à l'utilisation des preuves économiques en santé animale. Les auteurs expliquent comment s'est déroulée la mise en oeuvre de ces activités lors de l'étude du GBADs conduite en Ethiopie.

Los animales desempeñan un papel fundamental en los medios de subsistencia y el bienestar humanos. En este sentido, las enfermedades animales tienen un gran impacto en los beneficios que los humanos obtienen de los animales y también pueden suponer un riesgo para la salud humana. Un mejor control de las enfermedades animales genera beneficios sociales más amplios, como la reducción del impacto climático y ecológico de la ganadería y la mejora del bienestar animal. Para comprender mejor la magnitud de la inversión justificada para el control y la prevención de las enfermedades animales, es preciso medir las amplias repercusiones de las enfermedades en la producción y la sanidad animal. El programa sobre el impacto global de las enfermedades animales (GBADs) cuantifica el impacto de las enfermedades animales desde el nivel local hasta el mundial. El programa GBADs incluye estudios de casos por países a fin de realizar un análisis a escala nacional y local. Etiopía es el primer país en el que se han aplicado los métodos del GBADs. El estudio de caso del GBADs en dicho país se divide en tres áreas de actividad: i) la participación de las partes interesadas; ii) la estimación del impacto de las enfermedades del ganado, incluida la recopilación de datos, el análisis, la generación de pruebas y la comunicación; y iii) el desarrollo de capacidades en el ámbito de la economía de la sanidad animal. Al inicio del estudio de caso, se utilizaron diversas plataformas de comunicación con las partes interesadas para familiarizarlas con el GBADs y recabar su apoyo a través de diversas vías, entre las que se incluía el acceso a los datos, y, mediante esta colaboración, garantizar que las herramientas y los resultados del programa fueran pertinentes y útiles para sus necesidades. Se obtuvieron datos de diversas fuentes que se utilizaron para estimar el impacto de las enfermedades. Este proceso implicó múltiples pasos, incluida la estimación de la biomasa y el valor económico, la cartera de pérdidas en sanidad animal (impacto de las enfermedades a nivel de explotación), los impactos económicos más amplios y la atribución del impacto de las enfermedades a diferentes categorías de causas. Esto se llevó a cabo para las principales especies ganaderas (bovinos, ovinos, caprinos y aves de corral) en Etiopía. Se realizaron actividades de capacitación en economía de la sanidad animal para los usuarios finales con el fin de aumentar su competencia en la utilización de los datos económicos sobre sanidad animal, incluidos los resultados del GBADs. Este artículo documenta las experiencias de la puesta en práctica de estas actividades en el estudio de caso del GBADs en Etiopía.

Burden assessment of antimicrobial use and resistance in livestock in data-scarce contexts.

Misuse and overuse of antimicrobials in livestock production are identified as drivers for antimicrobial resistance (AMR). To improve decision-making concerning livestock health, it is important to understand the impact of AMR in livestock and aquaculture, within and beyond farm level, as well as expenditure on antimicrobial use (AMU). Such understanding provides grounds for systematic disease prioritisation and establishes a baseline for understanding the value of different strategies to mitigate animal health problems and for the monitoring and evaluation of the impact of those strategies. Yet limited data availability and quality surrounding AMU and AMR create barriers to furthering the knowledge of such impact. These data constraints are also more prevalent in contexts that lack the necessary resources to develop and maintain systematic and centralised data collection and collation systems. Even in regions with robust AMU and AMR monitoring systems in place, data limitations remain, such that the expenditure on antimicrobials and impacts of AMR remain unclear. Additionally, the current research funding strategies have been less focused on primary data collection, adding further barriers to filling the data void and reducing the global AMU/AMR knowledge gap. To work around the data scarcity and leverage previous and ongoing research efforts, it is vital to gain comprehensive knowledge of the people, projects and research consortia dedicated to the topic of AMU/AMR.

Les utilisations incorrecte et excessive d'agents antimicrobiens dans la production animale figurent parmi les facteurs connus de développement de résistances aux agents antimicrobiens (RAM). Pour améliorer la prise de décision relative à la santé des cheptels, il est essentiel de comprendre l'impact de la RAM chez les animaux d'élevage terrestres et aquatiques, aussi bien au niveau des élevages qu'au-delà, et de pouvoir quantifier les dépenses consacrées à l'utilisation d'agents antimicrobiens (UAM). Cette compréhension apporte les éléments d'information pour la priorisation systématique des maladies et établit un cadre de référence pour comprendre la valeur respective des différentes stratégies d'atténuation des problèmes de santé animale et pour assurer le suivi et l'évaluation d'impact de ces stratégies. Cependant, la disponibilité et la qualité limitées des données relatives à l'UAM et à la RAM font obstacle à une connaissance plus poussée de cet impact. Ces contraintes liées aux données sont plus répandues dans les contextes dépourvus des ressources nécessaires pour élaborer et entretenir des systèmes de collecte de données systématiques et centralisés. Même dans les régions où des systèmes robustes de suivi de l'UAM et de la RAM sont en place, le problème de l'insuffisance de données reste posé de sorte que la réalité des coûts induits par les agents antimicrobiens et l'impact de la RAM demeurent incertains. De plus, les stratégies actuelles de financement de la recherche ont été moins axées sur la collecte de données primaires, ce qui ajoute des obstacles supplémentaires pour l'obtention des données manquantes et compromet les efforts visant à réduire les écarts de connaissances sur l'UAM et la RAM à l'échelle mondiale. Afin de remédier à la pénurie de données et de mettre à profit les recherches antérieures et en cours, il est indispensable de savoir quels sont les acteurs, les projets et les consortiums de recherche qui travaillent sur l'UAM et la RAM.

El uso incorrecto y excesivo de antimicrobianos en la producción ganadera se considera un impulsor de la resistencia a los antimicrobianos (RAM). Para mejorar la toma de decisiones relativas a la sanidad del ganado, es importante comprender el impacto de la RAM en la ganadería y la acuicultura, a nivel de las granjas y más allá, así como el coste con el uso de antimicrobianos (UAM). Tal comprensión permite una priorización sistemática de enfermedades y establece una línea base para comprender el valor de las distintas estrategias destinadas a mitigar los problemas de sanidad animal, así como para supervisar y evaluar el impacto de esas estrategias. Sin embargo, la limitada disponibilidad y calidad de los datos en torno al UAM y a la RAM crean barreras que impiden ampliar la comprensión de dicho impacto. Estas limitaciones de datos también son más frecuentes en contextos que carecen de los recursos necesarios para desarrollar y mantener sistemas sistemáticos y centralizados de recopilación y cotejo de datos. Incluso en las regiones que cuentan con sistemas sólidos de seguimiento del UAM y la RAM, los datos siguen siendo limitados, de modo que los costes con antimicrobianos y las repercusiones de la resistencia a estos siguen sin estar claros. Además, las actuales estrategias de financiación de la investigación se han centrado menos en la recopilación de datos primarios, lo que añade más obstáculos a la hora de llenar el vacío de datos y reducir la brecha mundial de conocimientos sobre el UAM y la RAM. Para superar la escasez de datos y aprovechar las iniciativas de investigación previas y en curso, es fundamental adquirir un conocimiento detallado de las personas, los proyectos y los consorcios de investigación dedicados al tema del uso de antimicrobianos y la resistencia a estos.

Global Burden of Animal Diseases informatics strategy, data quality and model interoperability.

The estimation of the global burden of animal diseases requires the integration of multidisciplinary models: economic, statistical, mathematical and conceptual. The output of one model often serves as input for another; therefore, consistency of the model components is critical. The Global Burden of Animal Diseases (GBADs) Informatics team aims to strengthen the scientific foundations of modelling by creating tools that address challenges related to reproducibility, as well as model, data and metadata interoperability. Aligning with these aims, several tools are under development: a) GBADs'Trusted Animal Information Portal (TAIL) is a data acquisition platform that enhances the discoverability of data and literature and improves the user experience of acquiring data. TAIL leverages advanced semantic enrichment techniques (natural language processing and ontologies) and graph databases to provide users with a comprehensive repository of livestock data and literature resources. b) The interoperability of GBADs'models is being improved through the development of an R-based modelling package and standardisation of parameter formats. This initiative aims to foster reproducibility, facilitate data sharing and enable seamless collaboration among stakeholders. c) The GBADs Knowledge Engine is being built to foster an inclusive and dynamic user community by offering data in multiple formats and providing user-friendly mechanisms to garner feedback from the community. These initiatives are critical in addressing complex challenges in animal health and underscore the importance of combining scientific rigour with user-friendly interfaces to empower global efforts in safeguarding animal populations and public health.

L'estimation de l'impact mondial des maladies animales nécessite l'utilisation intégrée de modèles issus de diverses disciplines : économiques, statistiques, mathématiques et conceptuels. Les données de sortie d'un modèle constituent souvent celles d'entrée d'un autre modèle ; la cohérence des composantes des différents modèles est donc primordiale. L'équipe informatique du programme " Impact mondial des maladies animales " (GBADs) s'efforce de consolider les bases scientifiques de l'utilisation des modèles en mettant au point des outils permettant de résoudre les problèmes de reproductibilité et d'améliorer l'interopérabilité entre les différents modèles, données et métadonnées. En phase avec ces objectifs, plusieurs outils sont en cours de développement : a) le Portail du GBADs " Trusted Animal Information Portal " (TAIL) est une plateforme d'acquisition de données qui facilite l'accès aux données et à la littérature, tout en améliorant l'expérience utilisateur lors de l'acquisition des données. Le portail TAIL s'appuie sur des techniques avancées d'enrichissement sémantique (traitement du langage naturel et ontologies) et sur des bases de données graphiques pour apporter aux utilisateurs un référentiel complet des données et des ressources documentaires relatives aux animaux d'élevage ; b) l'interopérabilité des modèles du GBADs est en voie d'amélioration grâce à la mise au point d'un progiciel de modélisation fondé sur R et à la normalisation des formats de paramètres. Cette initiative vise à favoriser la reproductibilité, à faciliter le partage de données et à permettre une collaboration transparente entre les parties prenantes ; c) le moteur de connaissances du GBADs, en cours de construction, vise à encourager une communauté d'utilisateurs inclusive et dynamique en proposant des données dans une multiplicité de formats ainsi que des mécanismes conviviaux pour recueillir les commentaires de la communauté. Ces initiatives se révéleront indispensables pour relever les défis complexes de la santé animale et soulignent l'importance d'associer une grande rigueur scientifique à la convivialité des interfaces, afin de donner encore plus d'élan aux efforts déployés dans le monde pour protéger les populations animales et la santé publique.

La estimación del impacto global de las enfermedades animales requiere la integración de modelos multidisciplinarios: económicos, estadísticos, matemáticos y conceptuales. El resultado de un modelo a menudo sirve de entrada para otro; por lo tanto, la coherencia entre los distintos componentes es fundamental. El equipo de informática del programa sobre el Impacto Global de las Enfermedades Animales (GBADs) tiene como objetivo fortalecer los fundamentos científicos de la modelización mediante la creación de herramientas que aborden los retos relacionados con la reproducibilidad, así como con la interoperabilidad de los modelos, datos y metadatos. En consonancia con estos objetivos, se están desarrollando varias herramientas: a) El Portal del GBADs "Trusted Animal Information Portal" (TAIL) es una plataforma de adquisición de datos que mejora tanto la descubribilidad de datos y bibliografía como la experiencia del usuario a la hora de obtener datos. El portal TAIL utiliza técnicas avanzadas de enriquecimiento semántico (procesamiento del lenguaje natural y ontologías), así como bases de datos de grafos, para ofrecer a los usuarios un repositorio completo de datos sobre ganadería y recursos bibliográficos. b) Se está mejorando la interoperabilidad de los modelos del GBADs mediante el desarrollo de un paquete de modelización en R y la normalización de los formatos de los parámetros. Esta iniciativa pretende fomentar la reproducibilidad, facilitar el intercambio de datos y permitir una colaboración fluida entre las partes interesadas. c) El Motor de Conocimiento del GBADs se está construyendo con el objetivo de fomentar una comunidad de usuarios inclusiva y dinámica, ofreciendo datos en diferentes formatos y proporcionando mecanismos fáciles de usar para recopilar comentarios de la comunidad. Estas iniciativas son fundamentales para hacer frente a los complejos retos en el ámbito de la sanidad animal y subrayan la importancia de combinar el rigor científico con interfaces fáciles de usar para potenciar los esfuerzos mundiales encaminados a proteger a las poblaciones animales y la salud pública.

Ontologies related to livestock for the Global Burden of Animal Diseases programme: a review.

The Global Burden of Animal Diseases (GBADs) programme aims to assess the impact of animal health on agricultural animals, livestock production systems and associated communities worldwide. As part of the objectives of GBADs'Animal Health Ontology theme, the programme reviewed conceptual frameworks, ontologies and classification systems in biomedical science. The focus was on data requirements in animal health and the connections between animal health and human and environmental health. In May 2023, the team conducted searches of recognised repositories of biomedical ontologies, including BioPortal, Open Biological and Biomedical Ontology Foundry, and Ontology Lookup Service, to identify animal and livestock ontologies and those containing relevant concepts. Sixteen ontologies were found, covering topics such as surveillance, anatomy and genetics. Notable examples include the Animal Trait Ontology for Livestock, the Animal Health Surveillance Ontology, the National Center for Biotechnology Information Taxonomy and the Uberon Multi-Species Anatomy Ontology. However, some ontologies lacked class definitions for a significant portion of their classes. The review highlights the need for domain evidence to support proposed models, critical appraisal of external ontologies before reuse, and external expert reviews along with statistical tests of agreements. The findings from this review informed the structural framework, concepts and rationales of the animal health ontology for GBADs. This animal health ontology aims to increase the interoperability and transparency of GBADs data, thereby enabling estimates of the impacts of animal diseases on agriculture, livestock production systems and associated communities globally.

Le programme " Impact mondial des maladies animales " (GBADs) vise à évaluer l'impact de la santé animale sur les animaux d'élevage, les systèmes de production animale et les communautés liées à ce secteur d'activités dans le monde. Afin de définir une ontologie de la santé animale répondant aux objectifs du GBADs, le programme a procédé à un examen des cadres conceptuels, des ontologies et des systèmes de classification actuellement appliqués en sciences biomédicales. Il s'agissait de définir les besoins en données dans le domaine de la santé animale ainsi que les connexions entre la santé animale, la santé publique et la santé environnementale. En mai 2023, l'équipe a procédé à des recherches dans des référentiels reconnus d'ontologies biomédicales, notamment BioPortal, Open Biological and Biomedical Ontology Foundry et Ontology Lookup Service, afin de recenser les ontologies relatives aux animaux et au bétail ainsi que celles contenant des concepts pertinents. Seize ontologies ont été relevées, couvrant des thèmes tels que la surveillance, l'anatomie et la génétique. Parmi les exemples notables on peut citer : Animal Trait Ontology for Livestock (ontologie dédiée aux caractères phénotypiques des animaux d'élevage), Animal Health Surveillance Ontology (ontologie dédiée à la surveillance de la santé animale), National Center for Biotechnology Information Taxonomy (la base de données Taxonomie du Centre américain pour les informations biotechnologiques), et Uberon Multi-Species Anatomy Ontology (ontologie anatomique représentant diverses espèces animales). Il a cependant été constaté que certaines ontologies ne disposent pas de définitions de classes pour une grande partie des classes qui les composent. L'examen a souligné l'importance d'étayer les modèles proposés par des données issues des spécialités en question, de procéder à une évaluation critique des ontologies externes avant de les réutiliser et de faire effectuer des examens complémentaires par des experts externes ainsi que des tests statistiques de concordance. Les résultats de cette étude ont apporté des éléments permettant de définir le cadre structurel, les concepts et les principes de l'ontologie relative à la santé animale destinée au GBADs. Cette ontologie de la santé animale vise à accroître l'interopérabilité et la transparence des données du GBADs, ce qui permet d'effectuer des estimations de l'impact des maladies animales sur l'agriculture, les systèmes de production animale et les communautés associées à ce secteur d'activités à l'échelle mondiale.

El programa sobre el impacto global de las enfermedades animales (GBADs) tiene como objetivo evaluar el impacto de la sanidad animal en los animales de granja, los sistemas de producción ganadera y las comunidades conexas en todo el mundo. Como parte de los objetivos en torno al tema de la ontología de la sanidad animal del GBADs, el programa revisó marcos conceptuales, ontologías y sistemas de clasificación en el ámbito de la ciencia biomédica. Se hizo hincapié en los requisitos de datos sobre la sanidad animal y en las conexiones entre la sanidad animal y la salud humana y ambiental. En mayo de 2023, el equipo realizó búsquedas en repositorios reconocidos de ontologías biomédicas, como BioPortal, Open Biological and Biomedical Ontology Foundry y Ontology Lookup Service, para identificar no solo ontologías animales y ganaderas, sino también aquellas que incluyeran conceptos relevantes. En este sentido, se encontraron dieciséis ontologías, que abarcan temas como vigilancia, anatomía y genética. Entre los ejemplos más destacados figuran Animal Trait Ontology for Livestock (Ontología de Características Animales para el Ganado), Animal Health Surveillance Ontology (Ontología de Vigilancia de la Sanidad Animal), National Center for Biotechnology Information Taxonomy (la base de datos Taxonomía del Centro Nacional para la Información Biotecnológica) y Uberon Multi-Species Anatomy Ontology (Ontología Anatómica de Especies Múltiples). Sin embargo, algunas ontologías carecían de definiciones para una parte significativa de sus clases. La revisión pone de relieve la necesidad de contar con datos probatorios del ámbito en cuestión que respalden los modelos propuestos, una evaluación crítica de las ontologías externas antes de su reutilización y revisiones de expertos externos junto con pruebas estadísticas de los acuerdos. Los resultados de esta revisión han servido de base para el marco estructural, los conceptos y los fundamentos de la ontología de la sanidad animal para el GBADs. Esta ontología pretende aumentar la interoperabilidad y la transparencia de los datos del GBADs, permitiendo así estimar el impacto de las enfermedades animales en la agricultura, los sistemas de producción ganadera y las comunidades conexas en todo el mundo.

Estimating livestock biomass across diverse populations and data ecosystems.

Estimates of livestock biomass can be used as denominators in disease burden estimates, in addition to informing assessments of resource use and environmental impacts. This article explores the challenges of accurately estimating biomass across different scales and data ecosystems, with a particular focus on the use of biomass in the Global Burden of Animal Diseases programme. The greatest of these challenges is a lack of subgroup (breed, age, sex)-specific data on populations and liveweights at national and subnational level. This can be overcome by using global datasets and generic estimates of liveweight for each species, though this approach fails to account for the diversity of livestock systems.

Les estimations de la biomasse du bétail peuvent servir de dénominateurs lors des estimations de l'impact des maladies, en plus d'apporter des éléments d'appréciation pour évaluer l'utilisation des ressources et les impacts sur l'environnement. Les auteurs analysent les difficultés qui se posent lorsqu'il s'agit d'obtenir une estimation précise de la biomasse à différentes échelles et en utilisant divers écosystèmes de données, et se penchent plus particulièrement sur l'utilisation de la biomasse dans le programme " Impact mondial des maladies animales ". La difficulté majeure est l'absence de données spécifiques aux sous-groupes (en fonction de la race, de l'âge, du sexe) dans les populations et par poids vif à l'échelle nationale et infranationale. Ce problème pourrait être résolu en recourant à des jeux de données mondiaux et à des estimations génériques du poids vif par espèce, mais cette approche ne parvient pas à rendre compte de la diversité des systèmes d'élevage.

Las estimaciones de la biomasa del ganado pueden utilizarse como denominadores en las estimaciones del impacto de las enfermedades, además de servir de base para evaluar el uso de los recursos y los efectos ambientales. En este artículo se analizan los desafíos que plantea la estimación precisa de la biomasa en diferentes escalas y ecosistemas de datos, prestando especial atención al uso de la biomasa en el programa sobre el Impacto Global de las Enfermedades Animales. El mayor de estos desafíos radica en la falta de datos específicos por subgrupos (raza, edad, sexo) sobre poblaciones y pesos vivos a escala nacional y subnacional. Esta dificultad se puede resolver utilizando conjuntos de datos globales y estimaciones genéricas del peso vivo para cada especie, aunque este enfoque no tiene en cuenta la diversidad de los sistemas pecuarios.

Economic losses due to foot-and-mouth disease (FMD) in Ethiopian cattle.

Ethiopia's cattle population is among the largest in Africa and is burdened by frequent foot-and-mouth disease (FMD) outbreaks. FMD is caused by several distinct and highly contagious viral strains that can result in acute disease in cattle, causing losses in productivity and impeding international trade. This economic simulation study considered four main sources of losses due to FMD in cattle: reduced milk yield, draft power yield, fertility, and increased mortality. Economic losses were estimated per case across age-sex strata in 89 Ethiopian administrative zones for the years 2010-2021 using a wide range of data to estimate distributions for 30 input variables in a series of Monte Carlo simulations. It was estimated that an average case of FMD in Ethiopian cattle results in losses (mean values reported followed 95 % confidence intervals in brackets) of US dollars (USD) 11 (USD 7-USD 16) per case. Losses resulting from an average outbreak were estimated to be USD 2300 (USD 1400-USD 3300), while national annual losses were estimated to be USD 0.9 Mil. (USD 0.2 Mil.-USD 2.3 Mil.). Per cow-year, based on a national cow population of approximately 39 Mil. head, these estimated annual losses are equivalent to losses of only USD 0.02 (USD 0.01-USD 0.06). Nationally, these losses were significantly less than previously estimated in the literature, with currently estimated losses more accurately reflecting the economic burden of FMD in Ethiopian cattle over the past decade. The relatively small estimated losses suggest that control efforts based on widespread vaccination in countries with primarily extensive cattle production systems, such as Ethiopia, are unlikely to be economically sound. Sensitivity analyses suggested losses would be far greater in intensive systems, and that certainty surrounding incidence rates is paramount to the formulation of economically sound animal healthpolicy in regions with endemic FMD.

Farm level bio-economic modelling of aquatic animal disease and health interventions.

A farm level bio-economic model, for aquatic animal production, of the relationships between inputs (e.g. purchased animals), outputs (e.g. harvested animals) and gross margin (GM) was developed to assess ex-ante the economics of disease and animal health interventions. Feed costs were calculated from estimates of food conversion ratio (FCR), animals harvested and mortality. The model was applied to a typical grow-out rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) farm on Lake Titicaca, Peru and a typical shrimp (Paenus vannamei) farm in the Mekong Delta, Vietnam. The model was used in two analyses. Firstly, an approach to assess the burden of disease developed by the Global Burden of Animal Diseases (GBADs) project was adopted. Output under conditions of 'ideal health' was estimated by reducing mortality to zero and removing health costs. GM in both systems increased by approximately 25% when production was kept constant (and stocking rates reduced) and more than doubled if production was allowed to rise (and initial stocking increased). The increase in GM under conditions of ideal compared with current production provided an estimate of the maximum possible benefit from improved health management. Secondly, break-even analysis was used to assess the economics of vaccination against infectious pancreatic necrosis (IPN) vaccine (rainbow trout - RBT) and probiotics (shrimp). If initial stocking was kept constant, and production allowed to rise, break-even points for the intervention (when GM was the same with and without the intervention) were achieved when mortality was reduced by 16% in RBT fry and juvenile and 28% in shrimp. If production was kept constant and benefit realised by reduced initial stocking, the break-even point was achieved for i) vaccination of RBT when mortality in fry and juveniles was reduced by 39%, and ii) probiotics in shrimp production when there was a 15% reduction in mortality (nursery and grow-out), 10% increase in shrimp weight at harvest and 10% improvement in FCR. The results demonstrate how relatively simple models, parameterised with basic farm production data, can assess the burden of disease and quantify ex-ante the potential benefit of interventions. In the absence of trial data, these analyses support decision-making by farmers. The models can be adapted for many aquaculture systems. Farm level results can be extrapolated to estimate disease burden, and benefits of interventions, at regional or national level and thus support informed decision-making and allocation of resources to health management.

Informatics progress of the Global Burden of Animal Diseases programme towards data for One Health.

The Global Burden of Animal Diseases (GBADs) programme will provide data-driven evidence that policy-makers can use to evaluate options, inform decisions, and measure the success of animal health and welfare interventions. The GBADs' Informatics team is developing a transparent process for identifying, analysing, visualising and sharing data to calculate livestock disease burdens and drive models and dashboards. These data can be combined with data on other global burdens (human health, crop loss, foodborne diseases) to provide a comprehensive range of information on One Health, required to address such issues as antimicrobial resistance and climate change. The programme began by gathering open data from international organisations (which are undergoing their own digital transformations). Efforts to achieve an accurate estimate of livestock numbers revealed problems in finding, accessing and reconciling data from different sources over time. Ontologies and graph databases are being developed to bridge data silos and improve the findability and interoperability of data. Dashboards, data stories, a documentation website and a Data Governance Handbook explain GBADs data, now available through an application programming interface. Sharing data quality assessments builds trust in such data, encouraging their application to livestock and One Health issues. Animal welfare data present a particular challenge, as much of this information is held privately and discussions continue regarding which data are the most relevant. Accurate livestock numbers are an essential input for calculating biomass, which subsequently feeds into calculations of antimicrobial use and climate change. The GBADs data are also essential to at least eight of the United Nations Sustainable Development Goals.

Le programme " Impact mondial des maladies animales " (GBADs) a pour but de réunir des éléments probants axés sur des données, qui soient exploitables par les décideurs politiques pour évaluer les solutions envisagées, fonder leurs décisions et mesurer le succès des interventions dans les domaines de la santé et du bien-être des animaux. L'équipe informatique du GBADs a conçu un processus transparent pour l'identification, l'analyse, la visualisation et le partage des données, grâce auquel il sera possible d'estimer l'impact des maladies du bétail et de réaliser des modèles et des tableaux de bord sur le sujet. Les données ainsi réunies peuvent être combinées avec celles couvrant d'autres problématiques ayant un impact mondial (santé humaine, pertes de récoltes, maladies d'origine alimentaire) afin de fournir l'éventail complet d'informations Une seule santé requis pour faire face à des enjeux tels que la résistance aux agents antimicrobiens ou le changement climatique. La première phase du programme a consisté à recueillir des données ouvertes auprès de diverses organisations internationales (qui procèdent également à leur propre transformation numérique). Les efforts déployés pour parvenir à une estimation précise des effectifs des cheptels ont mis en lumière les difficultés à trouver les données détenues par différentes sources, à y accéder et à les recouper au fil du temps. Des ontologies et des bases de données graphiques sont en cours d'élaboration pour résoudre le problème des silos de données et pour améliorer la facilité de recherche et l'interopérabilité des données. Les données du GBADs sont désormais expliquées sous forme de tableaux de bord, de récits construits à partir des données, ainsi que dans un site web documentaire et un Manuel de gouvernance des données, tous disponibles via une interface de programmation d'applications. Le partage des évaluations de la qualité des données renforce la confiance dans ces dernières et encourage à les appliquer pour traiter les problématiques affectant l'élevage ou relevant de l'approche Une seule santé. Les données relatives au bien-être animal présentent une difficulté particulière : elles sont, pour l'essentiel, détenues à titre privé et la question de savoir quelles sont les données les plus pertinentes est toujours en discussion. Les effectifs des cheptels doivent avoir été déterminés de manière précise afin de calculer la biomasse animale, élément qui entre par la suite dans le calcul des quantités d'agents antimicrobiens utilisés et des indicateurs du changement climatique. Les données du programme GBADs sont également essentielles au regard d'au moins huit des objectifs de développement durable des Nations Unies.

El programa sobre el Impacto Global de las Enfermedades Animales (GBADs) proporcionará información contrastada y basada en el uso de datos de la que luego puedan servirse los planificadores de políticas para valorar distintas opciones, decidir con conocimiento de causa y medir la eficacia de una u otra intervención en materia de sanidad y bienestar animales. El equipo informático encargado del GBADs está preparando un proceso transparente destinado a seleccionar, analizar, visualizar y poner en común datos que ayuden a calcular la carga de enfermedades del ganado y a guiar la elaboración de modelos y paneles de control. Estos datos pueden ser combinados con datos referidos a otros grandes problemas planetarios (salud humana, pérdida de cultivos, enfermedades de transmisión alimentaria) para obtener el repertorio completo de información en clave de Una sola salud que se necesita para abordar problemáticas como la resistencia a los antimicrobianos o el cambio climático. El programa empezó por reunir datos abiertos procedentes de organizaciones internacionales (inmersas, por otra parte, en su propio proceso de transformación digital). La labor emprendida para estimar con exactitud las cifras de ejemplares del mundo pecuario reveló ciertos problemas a la hora de encontrar, obtener y conciliar datos de distintas fuentes a lo largo del tiempo. Ahora se están elaborando ontologías y bases de datos gráficos para crear conexiones entre los "silos de datos" y lograr que los datos sean a la vez más compatibles entre sí y más fáciles de localizar. Paneles de control, interpretaciones narrativas de los datos ("data stories"), un sitio web de documentación y un manual de gestión de datos ayudan a explicar y aprehender los datos del GBADs, accesibles ahora por medio de una interfaz de programación de aplicaciones. El hecho de poner en común las evaluaciones de la calidad de los datos genera mayor confianza en esta información, promoviendo con ello su aplicación en temas de ganadería y de Una sola salud. Los datos de bienestar animal plantean una particular dificultad, pues gran parte de esta información está en manos privadas y todavía no está claro cuáles son los datos de mayor interés. Disponer de cifras exactas sobre el número de cabezas de ganado es fundamental para efectuar los cálculos de biomasa que después se utilizan para hacer otros cómputos referidos al uso de antimicrobianos y al cambio climático. Los datos del GBADs son asimismo esenciales para al menos ocho de los Objetivos de Desarrollo Sostenible de las Naciones Unidas.

Global Burden of Animal Diseases: a novel approach to understanding and managing disease in livestock and aquaculture.

Investments in animal health and Veterinary Services can have a measurable impact on the health of people and the environment. These investments require a baseline metric that describes the burden of animal health and welfare in order to justify and prioritise resource allocation and from which to measure the impact of interventions. This paper is part of a process of scientific enquiry in which problems are identified and solutions sought in an inclusive way. It poses the broad question: what should a system to measure the animal disease burden on society look like and what value would it add? Moreover, it aims to do this in such a way as to be accessible by a wide audience, who are encouraged to engage in this debate. Given that farmed animals, including those raised by poor smallholders, are an economic entity, this system should be based on economic principles. These poor farmers are negatively impacted by disparities in animal health technology, which can be addressed through a mixture of supply-led and demand-driven interventions, reinforcing the relevance of targeted financial support from government and non-governmental organisations. The Global Burden of Animal Diseases (GBADs) Programme will glean existing data to measure animal health losses within carefully characterised production systems. Consistent and transparent attribution of animal health losses will enable meaningful comparisons of the animal disease burden to be made between diseases, production systems and countries, and will show how it is apportioned by people's socio-economic status and gender. The GBADs Programme will produce a cloud-based knowledge engine and data portal, through which users will access burden metrics and associated visualisations, support for decisionmaking in the form of future animal health scenarios, and the outputs of wider economic modelling. The vision of GBADs, strengthening the food system for the benefit of society and the environment, is an example of One Health thinking in action.

Les investissements réalisés en santé animale et dans les Services vétérinaires ont un impact mesurable sur la santé des personnes et de l'environnement. Le système de mesure appliqué à ces investissements doit reposer sur un référentiel de base décrivant l'impact de la santé et du bien-être animal de manière à justifier et classer par priorités les ressources allouées et à mesurer les effets des interventions. Les auteurs présentent une étude conduite dans le cadre d'une enquête scientifique destinée à identifier les problèmes et à rechercher des solutions de manière inclusive. L'étude pose la question de savoir à quoi devrait ressembler un système conçu pour mesurer l'impact sur la société des maladies animales, et quelle serait sa valeur ajoutée. En outre, l'étude est conduite de manière à être accessible à une large audience afin d'encourager cette dernière à participer aux discussions. Étant donné que les animaux d'élevage constituent une entité économique, y compris les animaux appartenant à des éleveurs pauvres, le système de mesure doit reposer sur des principes économiques. Les exploitants pratiquant une agriculture de subsistance subissent les effets négatifs des disparités entre les différentes technologies applicables à la santé animale, disparités auxquelles il est possible de remédier par le biais d'interventions associant des mesures dictées par l'offre et par la demande et en renforçant l'efficacité du soutien financier ciblé apporté par les organisations gouvernementales et non gouvernementales. Le Programme « L'impact mondial des maladies animales ¼ (GBADs) aura pour tâche de glaner les données existantes afin de mesurer les pertes associées à la santé animale au sein de systèmes de production qui auront été soigneusement caractérisés au préalable. Grâce à l'élucidation cohérente et transparente des pertes imputables à chaque problème de santé animale, des comparaisons pertinentes pourront être effectuées concernant l'impact des maladies animales par maladies, par systèmes de production et par pays, et la répartition de cet impact dans les populations concernées suivant le statut socio-économique et le genre des intéressés sera mieux comprise. Le Programme GBADs entend créer un moteur de recherche et un portail de données qui seront disponibles sur le Cloud et donneront aux utilisateurs l'accès à des outils de mesure de l'impact des maladies et à d'autres informations présentées sous forme graphique, ainsi qu'à des outils d'aide à la décision sous forme de scénarios prospectifs sur la santé animale et aux résultats d'études plus larges de modélisation économique. La vision du GBADs, renforcer le système de production de denrées alimentaires au profit de la société et de l'environnement, est un exemple de mise en oeuvre du concept Une seule santé.

Las inversiones en sanidad animal y en los Servicios Veterinarios pueden tener un efecto mensurable en la salud de las personas y el medio ambiente. Para efectuar estas inversiones se precisan parámetros que describan y cuantifiquen la situación de partida y el impacto de los problemas de sanidad y bienestar animales, a fin de poder, a partir de ahí, justificar y jerarquizar la asignación de recursos y medir los efectos de las intervenciones. Este artículo, inscrito en un proceso de indagación científica encaminado a detectar problemas y buscar soluciones de forma incluyente, plantea la cuestión general de cómo debería ser y qué valor añadido aportaría un sistema destinado a medir el impacto que imponen a la sociedad las enfermedades animales. Los autores, además, tratan de exponer la cuestión de manera que sea accesible a un público amplio, al que se alienta a participar en este debate. Dado que los animales de granja (incluidos los de pequeñas explotaciones) constituyen una entidad económica, tal sistema debería estar basado en principios económicos. Los productores que trabajan en régimen de subsistencia se ven negativamente afectados por las disparidades existentes en materia de tecnología zoosanitaria, disparidad que cabe corregir con una combinación de intervenciones marcadas por la oferta y otras marcadas por la demanda, dirigiendo así más selectivamente el apoyo económico de entidades gubernamentales y organizaciones no gubernamentales. El programa GBADs (El impacto global de las enfermedades animales) servirá para compilar datos ya existentes con el fin de medir las pérdidas zoosanitarias dentro de sistemas productivos cuidadosamente caracterizados. La atribución coherente y transparente de estas pérdidas zoosanitarias permitirá efectuar comparaciones significativas del impacto que representan las enfermedades animales en el caso de diferentes dolencias, sistemas productivos o países y pondrá de relieve cómo se distribuye este impacto en función del género y la condición socioeconómica de las personas. Por medio del programa GBADs se creará un motor de conocimiento y portal de datos ubicado en la nube que permita al usuario acceder a mediciones del impacto de enfermedades y representaciones gráficas conexas, a herramientas de apoyo a la adopción de decisiones, en forma de hipotéticas situaciones zoosanitarias futuras, y a los resultados de modelizaciones económicas más generales. La aspiración del programa GBADs ­ reforzar el sistema alimentario en beneficio de la sociedad y el medio ambiente ­ constituye un ejemplo de aplicación en la práctica del pensamiento en clave de Una sola salud.

Enhancing the value of meat inspection records for broiler health and welfare surveillance: longitudinal detection of relational patterns.

BACKGROUND: Abattoir data are under-used for surveillance. Nationwide surveillance could benefit from using data on meat inspection findings, but several limitations need to be overcome. At the producer level, interpretation of meat inspection findings is a notable opportunity for surveillance with relevance to animal health and welfare. In this study, we propose that discovery and monitoring of relational patterns between condemnation conditions co-present in broiler batches at meat inspection can provide valuable information for surveillance of farmed animal health and welfare. RESULTS: Great Britain (GB)-based integrator meat inspection records for 14,045 broiler batches slaughtered in nine, four monthly intervals were assessed for the presence of surveillance indicators relevant to broiler health and welfare. K-means and correlation-based hierarchical clustering, and association rules analyses were performed to identify relational patterns in the data. Incidence of condemnation showed seasonal and temporal variation, which was detected by association rules analysis. Syndrome-related and non-specific relational patterns were detected in some months of meat inspection records. A potentially syndromic cluster was identified in May 2016 consisting of infection-related conditions: pericarditis, perihepatitis, peritonitis, and abnormal colour. Non-specific trends were identified in some months as an unusual combination of condemnation reasons in broiler batches. CONCLUSIONS: We conclude that the detection of relational patterns in meat inspection records could provide producer-level surveillance indicators with relevance to broiler chicken health and welfare.

Review: Mitigating the risks posed by intensification in livestock production: the examples of antimicrobial resistance and zoonoses.

Major shifts in how animals are bred, raised and slaughtered are involved in the intensification of livestock systems. Globally, these changes have produced major increases in access to protein-rich foods with high levels of micronutrients. Yet the intensification of livestock systems generates numerous externalities including environmental degradation, zoonotic disease transmission and the emergence of antimicrobial resistance (AMR) genes. Where the process of intensification is most advanced, the expertise, institutions and regulations required to manage these externalities have developed over time, often in response to hard lessons, crises and challenges to public health. By exploring the drivers of intensification, the foci of future intensification can be identified. Low- and middle-income (LMICs) countries are likely to experience significant intensification in livestock production in the near future; however, the lessons learned elsewhere are not being transferred rapidly enough to develop risk mitigation capacity in these settings. At present, fragmentary approaches to address these problems present an incomplete picture of livestock populations, antimicrobial use, and disease risks in LMIC settings. A worldwide improvement in evidence-based zoonotic disease and AMR management within intensifying livestock production systems demands better information on the burden of livestock-associated disease, antimicrobial use and resistance and resources allocated to mitigation.

Preparing for animal health emergencies: considerations for economic evaluation.

Livestock production systems and the societies in which they are embedded face a set of risks presented by infectious diseases and natural and human-made disasters which compromise animal health. Within this set, threats are posed by natural, deliberate and accidental actions that can cause sudden changes in animal health status, requiring the allocation of additional resources to manage animal health. Determining the benefit of preparing for such emergencies is a challenge when the total set of risks includes the unknown. Any method for analysing the economic costs and benefits of animal health emergencies must not only accommodate this uncertainty, but make it a central feature of the analysis. Cost-benefit analysis is a key approach to economically evaluating animal health interventions. However, the value of this approach in dealing with uncertainty is often called into question. This paper makes the case that, by restricting the outcomes of an emergency event to specified states of nature, boundaries can be placed on the uncertainty space, allowing cost-benefit analysis to be performed. This method, which merges state-contingent analysis with cost-benefit analysis, is presented here. Further discussion on the economic characteristics of emergency events, and the nature of the threats posed to animal health systems, is also provided.

Les systèmes de production animale et les sociétés dans lesquelles ils s'inscrivent doivent faire face à une série de risques associés à des maladies infectieuses ou à des catastrophes d'origine naturelle ou anthropique, qui représentent une menace pour la santé animale. Parmi ces risques, certaines menaces résultant d'actions naturelles, délibérées ou accidentelles peuvent modifier de manière drastique la situation sanitaire des cheptels et imposer d'allouer des ressources supplémentaires à la gestion de la santé animale. Il est difficile de déterminer à l'avance les bénéfices apportés par la préparation aux urgences dès lors que la série complète des risques à envisager comporte des éléments inconnus. Les méthodes d'analyse des coûts et des bénéfices économiques appliquées aux urgences de santé animale doivent non seulement tenir compte de cette incertitude, mais la placer au cœur de l'analyse. L'analyse coûts-bénéfices est une méthode clé pour évaluer les interventions de santé animale dans une perspective économique. Néanmoins, la capacité de cette méthode à traiter l'incertitude est souvent mise en cause. Les auteurs soutiennent qu'en limitant l'analyse des répercussions d'une situation d'urgence à certains états spécifiques de la nature, il devient possible de poser des bornes à l'étendue de l'incertitude, ce qui permet de réaliser une analyse couts-bénéfices. Ils présentent cette méthode, qui consiste à combiner l'analyse des incertitudes dépendantes d'un état de choses donné (state-contingent analysis), avec une analyse coûts-bénéfices. Ils examinent ensuite les caractéristiques économiques des situations d'urgence ainsi que la nature des menaces que ces dernières font peser sur les systèmes de santé animale.

Los sistemas de producción pecuaria y las sociedades en las que están inscritos afrontan una serie de riesgos derivados de enfermedades infecciosas y de desastres de origen natural y humano que ponen en peligro la sanidad animal. Dentro de esta panoplia de riesgos están las amenazas derivadas de sucesos naturales o actos deliberados o accidentales que puedan inducir un cambio repentino de la situación zoosanitaria y exigir recursos adicionales para gestionarla. La determinación de los beneficios que pueda traer consigo la preparación para tales emergencias no es tarea fácil, cuando «lo desconocido¼ forma parte del conjunto de riesgos que se afrontan. Todo método encaminado a analizar los costos económicos y eventuales beneficios en el ámbito de las emergencias zoosanitarias debe no solo integrar esta incertidumbre, sino hacer de ella el elemento central del análisis. El análisis de la relación costo-beneficio es un procedimiento clave para evaluar económicamente las intervenciones de sanidad animal, aunque a menudo se cuestiona su utilidad o idoneidad para manejar la incertidumbre. Los autores postulan que, restringiendo los resultados de un suceso de emergencia a un conjunto especificado de estados de la naturaleza, es posible delimitar el espacio de incertidumbre y, con ello, efectuar un análisis de costos-beneficios. Los autores presentan este método, que consiste en combinar el análisis de las incertidumbres dependientes de un determinado estado de cosas (state-contingent analysis) y el análisis de la relación costo-beneficio. También se detienen a examinar las características económicas de los sucesos de emergencia y el tipo de amenazas que pesan sobre los sistemas de sanidad animal.

The pros and cons of animal health harmonisation.

It has been argued that the global harmonisation of animal health procedures, regulations and responses will improve animal health and provide economic benefits. Harmonisation of regulations can be driven by trade reform, such as multilateral or bilateral agreements, or as a response to private quality assurance programmes. At an international level, trade reform is currently focused on reducing the costs of trading between countries. To achieve this, bilateral agreements, where possible, are harmonising regulations throughout all sectors of the economy. However, as with any new developments, there are both positive and negative outcomes that should be explored to understand the net effect of these changes on animal health, the economy and society. In this article, the authors debate the economic foundations of harmonisation, explore alternative methods to achieve it, and discuss its pros and cons to more fully understand the opportunity costs from countries adopting the same level of risk to animal health.

Il a souvent été avancé qu'en matière de santé animale, l'harmonisation des procédures, des réglementations et des interventions à l'échelle mondiale améliore la situation zoosanitaire globale tout en apportant des bénéfices économiques aux pays. Une telle harmonisation réglementaire peut être le fruit d'une réforme du commerce, notamment par le biais d'accords multilatéraux ou bilatéraux, ou bien constituer une réponse aux programmes d'assurance qualité privés. Au niveau international, la réforme du commerce est actuellement centrée sur la réduction des coûts qu'il entraîne pour les pays. Dans cette perspective, des accords bilatéraux sont conclus chaque fois que possible afin d'harmoniser les réglementations dans tous les secteurs de l'économie. Néanmoins, comme dans toute évolution nouvelle, il en résulte des retombées aussi bien positives que négatives qu'il convient d'analyser afin de bien comprendre l'incidence nette de ces changements sur la santé animale, l'économie et la société. Après avoir débattu des fondements économiques de l'harmonisation, les auteurs examinent les méthodes alternatives qui permettent d'obtenir le même résultat ; ils font aussi le point sur les avantages et les inconvénients de l'harmonisation afin de mieux comprendre le coût d'opportunité qu'elle induit pour les pays adoptant le même niveau de risque en santé animale.

Se ha postulado que la armonización mundial de los procedimientos, reglamentos y respuestas en materia de sanidad animal redundará en un mejor estado sanitario de los animales y reportará beneficios económicos. El impulso para proceder a una armonización reglamentaria puede tener su origen en una reforma del comercio, a raíz por ejemplo de acuerdos multilaterales o bilaterales, o responder a programas privados de garantía de la calidad. A escala internacional, la reforma de los mecanismos comerciales apunta ahora básicamente a reducir los costos del comercio entre países. Para lograrlo se suscriben acuerdos bilaterales que, cuando es posible, entrañan una armonización reglamentaria en todos los sectores de la economía. Sin embargo, como ocurre con todas las novedades, ello tiene repercusiones positivas y negativas, que conviene analizar para aprehender el efecto neto de estos cambios en la sanidad animal, la economía y la sociedad. Los autores examinan los fundamentos económicos de la armonización, plantean métodos alternativos para llevarla adelante y dan cuenta de sus ventajas e inconvenientes para conocer mejor los costos de oportunidad que trae consigo la adopción de un mismo nivel de riesgo zoosanitario por parte de los países.

Identification of production chain risk factors for slaughterhouse condemnation of broiler chickens'.

Slaughterhouse condemnation of broiler chickens results from identification of polymorphic pathological conditions during meat inspection from arrival and on the slaughter line. While conditions that result in condemnation are multifactorial, identification of factors that are common for a number of categories could be valuable for developing strategies to reduce total condemnation. This study aimed to identify those condemnation categories that were most common in batches of broiler chickens and to determine and compare associated risk factors. In the first step, retrospective meat inspection records for 55,918 broiler batches from one large broiler integrator for 2015-2017 were used for association rules analysis. Results identified a network of nine associated condemnation categories: whole carcass condemnation for ascites, abnormal colour, perihepatitis, cellulitis, hard breast, tumours and dead on arrival, and liver only and heart only most often associated with hepatitis and pericarditis, respectively. Secondly, a longitudinal study collected data on 109 explanatory variables from broiler parental flocks to slaughterhouse characteristics between January 2015 and December 2017. Condemnation outcome data were obtained from meat inspection records for 539 broiler batches participating in the study. Parental flock-, rearing farm-, shed- and transport-level risk factors were assessed for each outcome using mixed-effects multivariable Poisson regression including shed and farm as random effects. A Poisson regression tree method was used as the first step to identify variables most relevant for analysis and comparison across the outcomes. No single production factor was associated with all nine of the condemnation outcomes investigated in this study, although some were shared across multiple outcomes: age of parental flock at time of lay, flock-level Campylobacter spp. frequency, broiler chick weight at seven days of age, weight at slaughter, type of broiler removal (i.e. thinning, final depopulation), catcher team, number of birds per transport crate, slaughterhouse shift number, and type of slaughterhouse line. Broiler chickens removed during final depopulation were at greatest risk of condemnation. Condemnation rates for cellulitis and tumours were found to be higher in broilers inspected by night shift at the slaughterhouse. Discovery of an apparent protective effect of a higher number of broilers per transport crate was unexpected. These findings provide information for the broiler industry on production chain factors that might be amenable to targeted intervention to improve future efforts for control of condemnation.

World food security, globalisation and animal farming: unlocking dominant paradigms of animal health science.

This paper presents a critical review of intensive animal farming in the light of past and present global crises, reflecting the fragility of its foundations, its unsustainability and its inability to ensure world food security. A central argument of this paper is that intensive animal farming promotes industrial efficiency, commodity production and the availability of cheap food at the expense of farmed animals, the environment and society. This paper begins by briefly examining the history of world food security and explores the role assigned to animal farming, animal health and public health in this context. It then reviews changing perceptions of world food security during various periods of global instability and their implications for animal farming and animal health and welfare. At the same time, the paper seeks to identify what has so far been missing in discourses around world food security and animal farming, and discusses how these gaps shape and are shaped by specific scientific thinking on animal health and well-being. With the recent exponential growth of aquaculture, the authors' objectives are to examine animal health practices in farming and to understand how animal health science could effectively, in the long term, help animal farming, and in particular aquaculture, to contribute to global food security.

Dans cet article, les auteurs procèdent à un examen critique de l'élevage intensif et mettent en évidence, à la lumière de crises présentes et passées, la fragilité, le caractère non durable et l'incapacité de ce modèle agricole à contribuer à la sécurité alimentaire mondiale. L'argument central avancé par les auteurs est que l'élevage intensif favorise la rentabilité de l'industrie agro-alimentaire ainsi que la production et la commercialisation de denrées alimentaires bon marché, au détriment des animaux d'élevage, de l'environnement et de la société. L'article commence par un aperçu historique de la sécurité alimentaire suivi d'une analyse du rôle assigné, dans ce contexte, à l'élevage, aux animaux d'élevage et à la santé publique. L'évolution de la perception de la sécurité alimentaire est analysée au fil de diverses périodes d'instabilité, parallèlement à ses conséquences sur l'élevage, la santé et le bien-être des animaux. Les auteurs tentent ainsi d'explorer ce qui a, jusqu'à présent, manqué dans les discours dominants de la sécurité alimentaire et de l'élevage, et d'expliquer comment ces lacunes ont pu déterminer et être renforcées par les pratiques des sciences de la santé et du bien-être animal. Compte tenu de la croissance exponentielle du secteur de l'aquaculture, le but des auteurs est d'examiner de quelle manière une redéfinition du rôle et de l'intervention des sciences de la santé animale en élevage permettrait à celui-ci, et en particulier à l'aquaculture, de réellement contribuer à la sécurité alimentaire mondiale.

Los autores presentan un estudio crítico de la producción animal intensiva a la luz de una serie de crisis mundiales pasadas y presentes que ponen de relieve sus frágiles fundamentos, su carácter insostenible y la incapacidad de este modelo agrícola para garantizar la seguridad alimentaria del mundo. Uno de los argumentos centrales aquí expuestos es el de que la producción animal intensiva promueve la eficiencia de la industria agro-alimentaria, la producción de artículos básicos y la oferta de alimentos baratos a expensas de los animales de granja, el medio ambiente y la sociedad. Los autores empiezan repasando sucintamente la historia de la seguridad alimentaria mundial y examinando la función atribuida en este ámbito a la producción animal, los animales de granja y la salud pública. Después exponen la evolución de las concepciones relativas a la seguridad alimentaria mundial durante varios periodos de inestabilidad del mundo y las repercusiones que esas distintas formas de verla han tenido en la producción, la salud y el bienestar animales. Al mismo tiempo, tratan de determinar aquello que hasta ahora ha estado ausente del discurso sobre la seguridad alimentaria mundial y la producción animal, y explican cómo estos elementos faltantes influyen en el pensamiento científico sobre salud y bienestar animal y a la vez son influidos por él. En vista del crecimiento exponencial que de un tiempo a esta parte viene experimentando la acuicultura, los autores tienen por doble objetivo examinar las prácticas zoosanitarias de la producción animal y aprehender de qué manera la ciencia de la sanidad animal podría ayudar eficazmente a la producción animal, y particularmente la acuicultura, a consolidar a largo plazo la seguridad alimentaria mundial.

Protein expression of KIT, BRAF, GNA11, GNAQ and RASSF1 in feline diffuse iris melanomas.

Feline iris melanoma, the most common feline intraocular tumour, has a reported metastatic rate of 19-63%. However, there is a lack of knowledge about its molecular biology. Previous studies have reported that feline iris melanomas do not harbour mutations comparable to common mutations found in their human counterpart. Nevertheless, there are differences in the gene expression patterns. The aim of this study was to investigate the protein expression of B-RAF oncogene serine/threonine kinase (BRAF), G protein subunit alpha q (GNAQ) and 11 (GNA11), KIT proto-oncogene receptor tyrosine kinase (KIT), and Ras association family member 1 (RASSF1) in feline iris melanomas. Fifty-seven formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) iris melanomas and 25 FFPE eyes without ocular abnormalities were stained with antibodies against the respective proteins using immunofluorescence. Averaged pixel intensities/µm2 and percentage of stained area from total tissue area were measured and the results were compared. Compared to the control group, iris melanomas showed overexpression of BRAF, GNAQ, GNA11 and KIT. The higher expression of BRAF, GNAQ, GNA11 and KIT in feline iris melanomas suggest that these proteins may play a key role in the development of feline iris melanomas and KIT may present a possible target for future therapies in cats with feline iris melanomas.

Modelling the economic efficiency of using different strategies to control Porcine Reproductive & Respiratory Syndrome at herd level.

PRRS is among the diseases with the highest economic impact in pig production worldwide. Different strategies have been developed and applied to combat PRRS at farm level. The broad variety of available intervention strategies makes it difficult to decide on the most cost-efficient strategy for a given farm situation, as it depends on many farm-individual factors like disease severity, prices or farm structure. Aim of this study was to create a simulation tool to estimate the cost-efficiency of different control strategies at individual farm level. Baseline is a model that estimates the costs of PRRS, based on changes in health and productivity, in a specific farm setting (e.g. farm type, herd size, type of batch farrowing). The model evaluates different intervention scenarios: depopulation/repopulation (D/R), close & roll-over (C&R), mass vaccination of sows (MS), mass vaccination of sows and vaccination of piglets (MS + piglets), improvements in internal biosecurity (BSM), and combinations of vaccinations with BSM. Data on improvement in health and productivity parameters for each intervention were obtained through literature review and from expert opinions. The economic efficiency of the different strategies was assessed over 5 years through investment appraisals: the resulting expected value (EV) indicated the most cost-effective strategy. Calculations were performed for 5 example scenarios with varying farm type (farrow-to-finish - breeding herd), disease severity (slightly - moderately - severely affected) and PRRSV detection (yes - no). The assumed herd size was 1000 sows with farm and price structure as commonly found in Germany. In a moderately affected (moderate deviations in health and productivity parameters from what could be expected in an average negative herd), unstable farrow-to-finish herd, the most cost-efficient strategies according to their median EV were C&R (€1'126'807) and MS + piglets (€ 1'114'649). In a slightly affected farrow-to-finish herd, no virus detected, the highest median EV was for MS + piglets (€ 721'745) and MS (€ 664'111). Results indicate that the expected benefits of interventions and the most efficient strategy depend on the individual farm situation, e.g. disease severity. The model provides new insights regarding the cost-efficiency of various PRRSV intervention strategies at farm level. It is a valuable tool for farmers and veterinarians to estimate expected economic consequences of an intervention for a specific farm setting and thus enables a better informed decision.

Effects of three blood derived products on equine corneal cells, an in vitro study.

BACKGROUND: Despite advances in therapy of corneal ulcerative diseases in horses, a vast number of cases require surgical intervention, due to poor response to treatment. Topical application of serum has been used for many years, based on its anticollagenolytic properties and the presence of growth factors promoting corneal wound healing. However, although other blood derived products i.e. platelet rich plasma (PRP), plasma rich in growth factors (PRGF) have been widely used in equine orthopaedics and in human ophthalmology, no reports of the effects of these blood derived products exist in equine ophthalmology. OBJECTIVES: To determine in vitro effects of PRGF and PRP on equine corneal cells compared with serum. STUDY DESIGN: Prospective controlled cohort study. METHODS: Blood from 35 healthy horses was used to produce serum, PRGF (Endoret® ), and PRP (E-PET™). Limbal- and stromal cells were isolated from healthy corneas of six horses and treated with 20% serum, 20% PRGF or 20% PRP. Proliferation rates and migration capacity were analysed in single cell cultures as well as co-culture systems. RESULTS: Cell proliferation increased with PRP treatment, remained constant in PRGF treated cells, and declined upon serum treatment over a period of 48 h. Migration capacity was significantly enhanced with PRP treatment, compared with PRGF treatment. Intact leucocytes, mainly eosinophils, were only detected in PRP. MAIN LIMITATIONS: Due to the study design use of autologous blood products on corneal cells was not possible. CONCLUSIONS: The results demonstrate beneficial effects of PRP on proliferation as well as migration capacity of equine corneal cells in vitro. In vivo studies are warranted to determine further beneficial effects of PRP in horses with corneal ulcers.

Economic assessment of an emerging disease: the case of Schmallenberg virus in France.

Schmallenberg virus (SBV) was first detected in 2011 in Germany and then in France in 2012. This study simulates the production of different ruminant systems in France and estimates, through partial budget analyses, the economic cost of SBV at the farm level, under two disease scenarios (a high-impact and low-impact scenario). A partial budget is used to evaluate the financial effect of incremental changes, and includes only resources or production that will be changed. In the high-impact scenario, the estimated impact of SBV ranged from €23 to €43 per cow per year and €19 to €37 per ewe per year. In the low-impact scenario, it was approximately half (for cows) or one-third (for ewes) of this amount. These financial impacts represent 0.6% to 63% of the gross margin, depending on the chosen scenario and the livestock system being considered. The impacts of SBV come mainly from: the extra costs from purchasing and raising replacement heifers and losses in milk production (dairy cows); the losses in calf or lamb production (beef systems and meat sheep); and the losses in milk production and from unsold replacement lambs (dairy sheep). The use of integrated production and economic models enabled the authors to estimate the cost of SBV and to tackle the problem of scarce data, which is a difficulty for most emerging diseases, by their very nature. It also allowed the authors to develop an accurate disease impact assessment for several production systems, over a short time span. Extrapolating from this economic assessment to predict the scenario in coming years depends on the immunity period of the disease and the length of the production cycles.

Le virus de Schmallenberg a été détecté pour la première fois en 2011 en Allemagne, puis en France en 2012. Les auteurs présentent une étude de simulation de plusieurs systèmes de production de ruminants en France, dont l'objectif était d'estimer, à partir d'analyses budgétaires partielles, les coûts économiques du virus de Schmallenberg à l'échelle des exploitations, sous deux scénarios différents (hypothèses d'un fort impact et d'un faible impact de la maladie, respectivement). Une analyse budgétaire partielle sert à évaluer les conséquences financières d'un changement graduel et ne prend en compte que les modifications effectives en termes de ressources et de production. Dans l'hypothèse d'un impact fort de la maladie, l'impact annuel estimé du virus de Schmallenberg variait de 23 à 43 euros par vache et de 19 à 37 euros par brebis. Dans l'hypothèse d'un impact faible, l'impact annuel était deux fois moindre chez les vaches et trois fois moindre chez les brebis que dans la première hypothèse. Ces impacts financiers représentent 0,6 % à 63 % de la marge brute en fonction du scénario choisi et du système de production. Les impacts du virus de Schmallenberg découlent principalement des coûts supplémentaires induits par l'achat et le maintien de génisses de remplacement et d'une baisse de la production de lait (vaches laitières), des pertes de veaux ou d'agneaux (bovins et ovins de boucherie), d'une baisse de la production de lait et du coût des agnelles de remplacement invendues (brebis laitières). L'utilisation de modèles intégrant les aspects économiques et les données de production a permis aux auteurs d'estimer le coût du virus de Schmallenberg malgré la pénurie de données, s'attaquant ainsi à une difficulté inhérente à la plupart des maladies émergentes. Cela leur a également permis d'effectuer une évaluation précise de l'impact sanitaire dans plusieurs systèmes de production, sur une durée courte. La possibilité d'extrapoler à partir de cette évaluation économique un scénario pour les années à venir dépend de la période d'immunité vis-à-vis de la maladie et de la durée des cycles de production.

El virus de Schmallenberg fue detectado por primera vez en 2011 en Alemania y ulteriormente en 2012 en Francia. Los autores describen un estudio en el que se simularon distintos sistemas de producción de rumiantes en Francia y se estimó, con análisis presupuestarios parciales, el coste económico que entrañaría para una explotación el virus de Schmallenberg en dos hipotéticas situaciones sanitarias (una situación con efectos profundos y otra con efectos leves). El análisis presupuestario parcial sirve para evaluar los efectos económicos de cambios graduales, e incluye únicamente aquellos recursos y aspectos de la producción que experimentarán cambios. En la hipótesis de efectos profundos, el impacto estimado de la infección por el virus de Schmallenberg oscilaba entre 23 y 43 euros anuales por vaca y entre 19 y 37 euros anuales por oveja hembra. La hipótesis de efectos leves deparaba importes de aproximadamente la mitad (en el caso de las vacas) o un tercio (en el de las ovejas). Este impacto económico representa del 0,6% al 63% del margen bruto, dependiendo de la hipótesis elegida y del sistema productivo de que se trate. Los efectos de la infección por el virus de Schmallenberg se concretan básicamente en: los costos suplementarios derivados de adquirir y criar vaquillas de sustitución y de obtener una menor producción de leche (vacas lecheras); las pérdidas de terneros o corderos (sistemas de bovino u ovino cárnicos); y los costos derivados de la menor producción de leche y de no vender las corderas de sustitución (ovejas lecheras). El uso de modelos que integran los factores productivos y económicos sirvió a los autores para estimar el costo del virus de Schmallenberg a pesar de la escasez de datos, que, por la propia naturaleza de las enfermedades emergentes, es una dificultad común a la mayoría de ellas. También les permitió evaluar con exactitud el impacto de la enfermedad en distintos sistemas productivos en un breve lapso de tiempo. La realización de extrapolaciones a partir de esta evaluación económica para pronosticar la situación en años venideros depende del periodo de inmunidad respecto de la enfermedad y de la duración de los ciclos productivos.