ABSTRACT
These last 20 years, several techniques have been developed for quantifying DNA methylation, the most studied epigenetic marks in eukaryotes, including the gold standard method, whole-genome bisulphite sequencing (WGBS). WGBS quantifies genome-wide DNA methylation but has several inconveniences rendering it less suitable for population-scale epigenetic studies. The high cost of deep sequencing and the large amounts of data generated prompted us to seek an alternative approach. Restricting studies to parts of the genome would be a satisfactory alternative had there not been a major limitation: the need to select upstream targets corresponding to differentially methylated regions (DMRs) as targets. Given the need to study large numbers of samples, we propose a strategy for investigating DNA methylation variation in natural populations, considering the structural complexity of the genomes with their size and their content in unique as coding regions versus repeated regions as transposable elements. We first identified regions of highly variable DNA methylation in a representative subset of genotypes representative of the biological diversity in the population by WGBS. We then analysed the variations of DNA methylation in these targeted regions at the population level by Sequencing Capture Bisulphite (SeqCapBis). The entire strategy was then validated by applying it to another species. Our strategy was developed as a proof of concept on natural populations of two forest species: Populus nigra and Quercus petraea.
ABSTRACT
Les complications de la trachéotomiesont parmi les complications les plus redoutables enORL.Objectif : Le but de notre travail était d'étudier les complications de la trachéotomie afin d'améliorer la pratique de cette technique dans notre contexte. Méthodologie : Nous avons mené une étude rétrospective sur treize (13) ans de 2005 à 2017 dans le service d'ORL et CCF du CHU Yalgado Ouédraogo de Ouagadougou.Résultats : Notre étude a porté sur 25 cas de complications issues de 133 cas de rachéotomieseffectuées. L'âge moyen était de 37 ans. Notre étude retrouvait 19 hommes (76%) et 6 femmes (24%).Les indications étaient dominées les tumeurs pharyngolaryngées avec 60%. La trachéotomie a été réalisée en urgence dans 56% des cas (14 patients)et programmée dans 44% des cas (11 patients). Les complications étaient peropératoires dans 7 cas,précoces dans 9 cas, secondaires dans 5 cas et tardives dans 4 cas. Les complications les plus fréquentes étaient les obstructions de la canule par un bouchon muqueux 16%, les emphysèmes sous cutanés 12% etles broncho-pneumopathies 12%.Le délai moyen de décannulatin était 17 jours avec des extrêmes de 1 jour et 40 jours. Le taux de mortalité par rapport à l'ensemble des interventions réalisées était de 3,7%. Conclusion : La trachéotomie expose souvent à des complications redoutables dans notre pratique. Sa réalisation par une équipe chirurgicale expérimentée permet de minimiser ses complications. De plus une surveillance et les soins de trachéotomie sont essentiels et en appellent à la surveillance du personnel soignant
