The role of pregnant women with rash in the Zika virus sentinel surveillance.

INTRODUCTION: The state of São Paulo has been monitoring cases of microcephaly and pregnant women presenting with acute rash, through CeVeSP. METHODS: This was a descriptive study focusing on pregnant women with rash and the outcome of their pregnancy, based on the notifications through the CeVeSP. RESULTS: During 2016, 2,209 cases of pregnant women with rash were reported and investigated. Of these, 36.6% were confirmed. Of the pregnant women who tested positive for ZIKV, 6.4% did not have a favorable outcome. CONCLUSIONS: Our results allowed the characterization of pregnant women exposed to ZIKV and the outcome of pregnancy.

The role of pregnant women with rash in the Zika virus sentinel surveillance

INTRODUCTION: The state of São Paulo has been monitoring cases of microcephaly and pregnant women presenting with acute rash, through CeVeSP. METHODS: This was a descriptive study focusing on pregnant women with rash and the outcome of their pregnancy, based on the notifications through the CeVeSP. RESULTS: During 2016, 2,209 cases of pregnant women with rash were reported and investigated. Of these, 36.6% were confirmed. Of the pregnant women who tested positive for ZIKV, 6.4% did not have a favorable outcome. CONCLUSIONS Our results allowed the characterization of pregnant women exposed to ZIKV and the outcome of pregnancy.

The role of pregnant women with rash in the Zika virus sentinel surveillance

Abstract INTRODUCTION: The state of São Paulo has been monitoring cases of microcephaly and pregnant women presenting with acute rash, through CeVeSP. METHODS: This was a descriptive study focusing on pregnant women with rash and the outcome of their pregnancy, based on the notifications through the CeVeSP. RESULTS: During 2016, 2,209 cases of pregnant women with rash were reported and investigated. Of these, 36.6% were confirmed. Of the pregnant women who tested positive for ZIKV, 6.4% did not have a favorable outcome. CONCLUSIONS Our results allowed the characterization of pregnant women exposed to ZIKV and the outcome of pregnancy.

Simple protocol for population (Sanger) sequencing for Zika virus genomic regions

BACKGROUND A number of Zika virus (ZIKV) sequences were obtained using Next-generation sequencing (NGS), a methodology widely applied in genetic diversity studies and virome discovery. However Sanger method is still a robust, affordable, rapid and specific tool to obtain valuable sequences. OBJECTIVE The aim of this study was to develop a simple and robust Sanger sequencing protocol targeting ZIKV relevant genetic regions, as envelope protein and nonstructural protein 5 (NS5). In addition, phylogenetic analysis of the ZIKV strains obtained using the present protocol and their comparison with previously published NGS sequences were also carried out. METHODS Six Vero cells isolates from serum and one urine sample were available to develop the procedure. Primer sets were designed in order to conduct a nested RT-PCR and a Sanger sequencing protocols. Bayesian analysis was used to infer phylogenetic relationships. FINDINGS Seven complete ZIKV envelope protein (1,571 kb) and six partial NS5 (0,798 Kb) were obtained using the protocol, with no amplification of NS5 gene from urine sample. Two NS5 sequences presented ambiguities at positions 495 and 196. Nucleotide analysis of a Sanger sequence and consensus sequence of previously NGS study revealed 100% identity. ZIKV strains described here clustered within the Asian lineage. MAIN CONCLUSIONS The present study provided a simple and low-cost Sanger protocol to sequence relevant genes of the ZIKV genome. The identity of Sanger generated sequences with published consensus NGS support the use of Sanger method for ZIKV population studies. The regions evaluated were able to provide robust phylogenetic signals and may be used to conduct molecular epidemiological studies and monitor viral evolution.

Simple protocol for population (Sanger) sequencing for Zika virus genomic regions.

BACKGROUND: A number of Zika virus (ZIKV) sequences were obtained using Next-generation sequencing (NGS), a methodology widely applied in genetic diversity studies and virome discovery. However Sanger method is still a robust, affordable, rapid and specific tool to obtain valuable sequences. OBJECTIVE: The aim of this study was to develop a simple and robust Sanger sequencing protocol targeting ZIKV relevant genetic regions, as envelope protein and nonstructural protein 5 (NS5). In addition, phylogenetic analysis of the ZIKV strains obtained using the present protocol and their comparison with previously published NGS sequences were also carried out. METHODS: Six Vero cells isolates from serum and one urine sample were available to develop the procedure. Primer sets were designed in order to conduct a nested RT-PCR and a Sanger sequencing protocols. Bayesian analysis was used to infer phylogenetic relationships. FINDINGS: Seven complete ZIKV envelope protein (1,571 kb) and six partial NS5 (0,798 Kb) were obtained using the protocol, with no amplification of NS5 gene from urine sample. Two NS5 sequences presented ambiguities at positions 495 and 196. Nucleotide analysis of a Sanger sequence and consensus sequence of previously NGS study revealed 100% identity. ZIKV strains described here clustered within the Asian lineage. MAIN CONCLUSIONS: The present study provided a simple and low-cost Sanger protocol to sequence relevant genes of the ZIKV genome. The identity of Sanger generated sequences with published consensus NGS support the use of Sanger method for ZIKV population studies. The regions evaluated were able to provide robust phylogenetic signals and may be used to conduct molecular epidemiological studies and monitor viral evolution.

A public health risk assessment for yellow fever vaccination: a model exemplified by an outbreak in the state of São Paulo, Brazil.

We propose a method to analyse the 2009 outbreak in the region of Botucatu in the state of São Paulo (SP), Brazil, when 28 yellow fever (YF) cases were confirmed, including 11 deaths. At the time of the outbreak, the Secretary of Health of the State of São Paulo vaccinated one million people, causing the death of five individuals, an unprecedented number of YF vaccine-induced fatalities. We apply a mathematical model described previously to optimise the proportion of people who should be vaccinated to minimise the total number of deaths. The model was used to calculate the optimum proportion that should be vaccinated in the remaining, vaccine-free regions of SP, considering the risk of vaccine-induced fatalities and the risk of YF outbreaks in these regions.

Febre amarela silvestre: reemergência de transmissão no estado de São Paulo, Brasil, 2009* / Yellow fever: reemerging in the state of São Paulo, Brazil, 2009

Descrever a investigação do surto de febre amarela silvestre e as principais medidas de controle realizadas no estado de São Paulo. MÉTODOS: Estudo descritivo do surto de febre amarela silvestre na região sudoeste do estado, entre fevereiro e abril de 2009. Foram avaliados casos suspeitos e confirmados em humanos e primatas não humanos. A investigação entomológica, em ambiente silvestre, envolveu captura em solo e copa de árvore para identificação das espécies e detecção de infecção natural. Foram realizadas ações de controle de Aedes aegypti em áreas urbanas. A vacinação foi direcionada para residentes dos municípios com confirmação de circulação viral e nos municípios contíguos, conforme recomendação nacional. RESULTADOS: Foram confirmados 28 casos humanos (letalidade 39,3%) em áreas rurais de Sarutaiá, Piraju, Tejupá, Avaré e Buri. Foram notificadas 56 mortes de primatas não humanos, 91,4% do gênero Alouatta sp. A epizootia foi confirmada laboratorialmente em dois primatas não humanos, sendo um em Buri e outro em Itapetininga. Foram coletados 1.782 mosquitos, entre eles Haemagogus leucocelaenus, Hg. janthinomys/capricornii, Sabethes chloropterus, Sa. purpureus e Sa. undosus. O vírus da febre amarela foi isolado de um lote de Hg. leucocelaenus procedente de Buri. A vacinação foi realizada em 49 municípios, com 1.018.705 doses aplicadas e o registro de nove eventos adversos graves pós-vacinação. CONCLUSÕES: Os casos humanos ocorreram entre fevereiro e abril de 2009 em áreas sem registro de circulação do vírus da febre amarela há mais de 60 anos. A região encontrava-se fora da área com recomendação de vacinação, com alto percentual da população suscetível. A adoção oportuna de medidas de controle permitiu a interrupção da transmissão humana em um mês, assim como a confirmação da circulação viral em humanos, primatas não humanos e mosquitos. Os isolamentos facilitaram a identificação das áreas de circulação viral, mas são importantes novos estudos para esclarecer a dinâmica de transmissão da doença...

A public health risk assessment for yellow fever vaccination: a model exemplified by an outbreak in the state of São Paulo, Brazil

We propose a method to analyse the 2009 outbreak in the region of Botucatu in the state of São Paulo (SP), Brazil, when 28 yellow fever (YF) cases were confirmed, including 11 deaths. At the time of the outbreak, the Secretary of Health of the State of São Paulo vaccinated one million people, causing the death of five individuals, an unprecedented number of YF vaccine-induced fatalities. We apply a mathematical model described previously to optimise the proportion of people who should be vaccinated to minimise the total number of deaths. The model was used to calculate the optimum proportion that should be vaccinated in the remaining, vaccine-free regions of SP, considering the risk of vaccine-induced fatalities and the risk of YF outbreaks in these regions.

Febre amarela silvestre: reemergencia de transmissao no estado de Sao Paulo, Brasil, 2009 / Fiebre amarilla silvestre: re emergencia de transmision en el estado de Sao Paulo, Brasil, 2009 / Yellow fever: reemerging in the state of Sao Paulo, Brazil, 2009

OBJETIVO Descrever a investigação do surto de febre amarela silvestre e as principais medidas de controle realizadas no estado de São Paulo. MÉTODOS Estudo descritivo do surto de febre amarela silvestre na região sudoeste do estado, entre fevereiro e abril de 2009. Foram avaliados casos suspeitos e confirmados em humanos e primatas não humanos. A investigação entomológica, em ambiente silvestre, envolveu captura em solo e copa de árvore para identificação das espécies e detecção de infecção natural. Foram realizadas ações de controle de Aedes aegypti em áreas urbanas. A vacinação foi direcionada para residentes dos municípios com confirmação de circulação viral e nos municípios contíguos, conforme recomendação nacional. RESULTADOS Foram confirmados 28 casos humanos (letalidade 39,3%) em áreas rurais de Sarutaiá, Piraju, Tejupá, Avaré e Buri. Foram notificadas 56 mortes de primatas não humanos, 91,4% do gênero Alouatta sp . A epizootia foi confirmada laboratorialmente em dois primatas não humanos, sendo um em Buri e outro em Itapetininga. Foram coletados 1.782 mosquitos, entre eles Haemagogus leucocelaenus , Hg. janthinomys/capricornii , Sabethes chloropterus , Sa. purpureus e Sa. undosus . O vírus da febre amarela foi isolado de um lote de Hg. leucocelaenus procedente de Buri. A vacinação foi realizada em 49 municípios, com 1.018.705 doses aplicadas e o registro de nove eventos adversos graves pós-vacinação. CONCLUSÕES Os casos humanos ocorreram entre fevereiro e abril de 2009 em áreas sem registro de circulação do vírus da febre amarela há mais de 60 anos. A região encontrava-se fora da área com recomendação de vacinação, com alto percentual da p...

OBJETIVO Describir la investigación de brote de fiebre amarilla silvestre y las principales medidas de control realizadas en el estado de Sao Paulo. MÉTODOS Estudio descriptivo del brote de fiebre amarilla silvestre en la región suroeste del Estado, entre febrero y abril de 2009. Se evaluaron casos sospechosos y confirmados en humanos y primates no humanos. La investigación entomológica, en ambiente silvestre, involucró capturo en suelo y copa de árboles para identificación de las especies y detección de infección natural. Se realizaron acciones de control de Aedes aegypti en áreas urbanas. La vacunación fue direccionada a residentes de los municipios con confirmación de circulación viral y en los municipios contiguos, siguiendo recomendación nacional. RESULTADOS Se confirmaron 28 casos en humanos (letalidad 39,3%) en áreas rurales de Sarutaiá, Pirajú, Tejupá, Avaré y Buri. Se notificaron 56 muertes de primates no humanos, 91,4% del género Allouatta sp. La epizootia fue confirmada laboratorialmente en dos primates no humanos siendo uno de Buri y el otro de Itapetininga. Se colectaron 1.782 mosquitos, entre ellos Haemagogus leucocelaenus, Hg. janthinomys/capricornii, y Sabethes chloropterus, Sa. purpureus y Sa. undosus. El virus de la fiebre amarilla fue aislado de un lote de Hg. leucocelaenus procedente de Buri. La vacunación fue realizada en 49 municipios, con 1.018.705 dosis aplicadas y el registro de nueve eventos adversos graves post-vacunación. CONCLUSIONES Los casos humanos ocurrieron entre febrero a abril de 2009 en áreas sin registro de circulación del virus de la fiebre amarilla por más de 60 años. La región se encontraba fuera del área de recomendación de vacunación, con alto porcentaje de población susceptible. La adopción oportuna de medidas de control permitió ...

OBJECTIVE To describe the investigation of a sylvatic yellow fever outbreak in the state of Sao Paulo and the main control measures undertaken. METHODS This is a descriptive study of a sylvatic yellow fever outbreak in the Southwestern region of the state from February to April 2009. Suspected and confirmed cases in humans and in non-human primates were evaluated. Entomological investigation in sylvatic environment involved capture at ground level and in the tree canopy to identify species and detect natural infections. Control measures were performed in urban areas to control Aedes aegypti . Vaccination was directed at residents living in areas with confirmed viral circulation and also at nearby cities according to national recommendation. RESULTS Twenty-eight human cases were confirmed (39.3% case fatality rate) in rural areas of Sarutaiá, Piraju, Tejupá, Avaré and Buri. The deaths of 56 non-human primates were also reported, 91.4% were Allouatta sp. Epizootics was confirmed in two non-human primates in the cities of Itapetininga and Buri. A total of 1,782 mosquitoes were collected, including Haemagogus leucocelaenus , Hg. janthinomys/capricornii , and Sabethes chloropterus, Sa. purpureus and Sa. undosus . Yellow fever virus was isolated from a group of Hg. Leucocelaenus from Buri. Vaccination was carried out in 49 cities, with a total of 1,018,705 doses. Nine serious post-vaccination adverse events were reported. CONCLUSIONS The cases occurred between February and April 2009 in areas with no recorded yellow fever virus circulation in over 60 years. The outbreak region occurred outside the original recommended vaccination area with a high percentage of susceptible population. The fast adoption of control measures interrupted the human transmission within a month and the confirmation of viral circulation in humans, monkeys and mosquitoes. The results allowed the identification of new areas of viral circulation but ...

Yellow fever epizootics in non-human primates, São Paulo state, Brazil, 2008-2009 / Epizootias de febre amarela em primatas não humanos no estado de São Paulo, Brasil, 2008-2009

Since 2000, the expansion of Sylvatic Yellow Fever (YF) has been observed in the southeast of Brazil, being detected in areas considered silent for decades. Epizootics in non-human primates (NHPs) are considered sentinel events for the detection of human cases. It is important to report epizootic events that could have impact on the conservation status of susceptible species. We describe the epizootics in NHPs, notified in state of São Paulo, Brazil, between September 2008 to August 2009. Ninety-one epizootic events, involving 147 animals, were reported in 36 counties. Samples were obtained from 65 animals (44.2%). Most of the epizootics (46.6%) were reported between March and April, the same period during which human cases of YF occurred in the state. Biological samples were collected from animals found dead and were sent to Instituto Adolfo Lutz, in São Paulo. Two samples, collected in two counties without an indication for YF vaccination, were positive for the virus. Another 48 animals were associated with YF by clinical-epidemiological linkage with laboratory confirmed cases. Because the disease in human and NHPs occurred in the same period, the detection of the virus in NHPs did not work as sentinel, but aided in the delineation of new areas of risk.

Desde 2000, vem sendo observada a expansão da febre amarela (FA) no Sudeste do Brasil, sendo detectados casos em áreas consideradas silenciosas por décadas. Epizootias em primatas não humanos (NHPs) são considerados eventos sentinela para a detecção de casos humanos. É importante relatar eventos epizoóticos que podem ter impacto sobre o estado de conservação de espécies sensíveis. Descrevemos as epizootias, notificadas em NHPs no estado de São Paulo, Brasil, entre setembro de 2008 a agosto de 2009. Noventa e um eventos epizoóticos, envolvendo 147 animais, foram notificados em 36 municípios. As amostras foram obtidas a partir de 65 animais (44,2%). A maioria das epizootias (46,6%) foram registradas entre março e abril, no mesmo período no qual YF em que casos humanos ocorreram no estado. As amostras biológicas foram coletadas de animais encontrados mortos e enviadas ao Instituto Adolfo Lutz, em São Paulo. Duas amostras, coletadas em dois municípios, sem indicação para a vacinação de febre amarela, foram positivos para o vírus. Outros 48 animais foram associados com FA por vínculo clínico-epidemiológico com casos confirmados laboratorialmente. Devido a doença em humanos e NHPs terem ocorrido no mesmo período, a detecção do vírus em NHPs não funcionou como sentinela, mas ajudou no processo de delimitação de novas áreas de risco.

Yellow fever epizootics in non-human primates, São Paulo state, Brazil, 2008-2009.

Since 2000, the expansion of Sylvatic Yellow Fever (YF) has been observed in the southeast of Brazil, being detected in areas considered silent for decades. Epizootics in non-human primates (NHPs) are considered sentinel events for the detection of human cases. It is important to report epizootic events that could have impact on the conservation status of susceptible species. We describe the epizootics in NHPs, notified in state of São Paulo, Brazil, between September 2008 to August 2009. Ninety-one epizootic events, involving 147 animals, were reported in 36 counties. Samples were obtained from 65 animals (44.2%). Most of the epizootics (46.6%) were reported between March and April, the same period during which human cases of YF occurred in the state. Biological samples were collected from animals found dead and were sent to Instituto Adolfo Lutz, in São Paulo. Two samples, collected in two counties without an indication for YF vaccination, were positive for the virus. Another 48 animals were associated with YF by clinical-epidemiological linkage with laboratory confirmed cases. Because the disease in human and NHPs occurred in the same period, the detection of the virus in NHPs did not work as sentinel, but aided in the delineation of new areas of risk.

Filogeografia da febre amarela na América do Sul / Phylogeography of the Yellow Fever in South America

Os Flavivírus são vírus de 40 50 nm de diâmetro, com formas esféricas e RNA de fita simples, com sentido positivo e aproximadamente 11 kb de comprimento. O Vírus da Febre Amarela, protótipo do grupo, é o agente causador da Febre Amarela, uma antiga doença que causou epidemias generalizadas na África, Américas do Norte e do Sul e Europa do século XVII ao início do século XX, e depois ressurgiu nas últimas décadas na África sub- saariana e América do Sul tropical. O presente trabalho busca a reconstrução da transmissão da Febre Amarela na América do Sul, no tempo e espaço, em especial, considerando a provável influência das populações humanas, primatas não humanos e mosquitos, na evolução e distribuição das linhagens genéticas de Febre Amarela, aplicando modelos de inferência Bayesiana para análises filogenéticas e filogeográficas e testando hipóteses de distribuição geográfica com modelagem de nicho ecológico. Os dados dão poucas evidências de que as estratégias de vacinação vigentes tenham efetivamente colaborado para a diminuição da ocorrência de Febre Amarela, indicando possíveis erros na estratégia de vacinação. A partir da análise Coalescente da população viral de Febre Amarela, a população viral apresentou um decréscimo importante iniciado em meados dos anos 90. A análise filogeográfica sugere um padrão geral de transmissibilidade Source-Sink destacando a região amazônica como fonte de diversidade para as outras áreas estudadas, com uma estrutura filogeográfica secundária em ondas. Assim, as introduções do vírus em áreas fora da amazônia tem ocorrência aleatória e podem ser ligadas temporalmente e geograficamente ao norte da America do Sul. Os modelos de distribuição geográfica corroboram esse padrão e indicam uma área possível para circulação da Febre Amarela ampla, englobando diversos ecótonos. Os resultados indicam um possível efeito em longo prazo da vacinação atuando diretamente sobre a evolução e dinâmica filogenética da Febre Amarela e sugere que monitorar a evolução do vírus da Febre Amarela é uma estratégia válida para compreender sua distribuição geográfica e evidenciar mecanismos complexos de transmissão e introdução. Por sua vez, os modelos de Nicho Ecológico mostraram ser ferramentas adequadas para calcular o risco da doença em determinadas áreas, sem sua ocorrência prévia, contribuindo como um modelo preditivos para orgãos de Vigilância prepararem suas estratégias de prevenção e controle no caso de possível introdução de patógenos.

Evaluation of dengue NS1 antigen detection for diagnosis in public health laboratories, São Paulo State, 2009.

The present work evaluated the diagnostic accuracy of detection of Dengue NS1 antigen employing two NS1 assays, an immunochromatographic assay and ELISA, in the diagnostic routine of Public Health laboratories. The results obtained with NS1 assay were compared with virus isolation and, in a subpopulation of cases, they were compared with the IgM-ELISA results obtained with convalescent samples. A total of 2,321 sera samples were analyzed by one of two NS1 techniques from March to October 2009. The samples were divided into five groups: groups I, II and III included samples tested by NS1 and virus isolation, and groups IV and V included patients with a first sample tested by NS1 and a second sample tested by IgM-ELISA. Sensitivity, specificity, positive and negative predictive values, Kappa Index and Kappa Concordance were calculated. The results showed that NS1 testing in groups I, II and III had high sensitivity (98.0%, 99.5% and 99.3%), and predictive values and Kappa index between 0.9 - 1.0. Groups IV and V only had Kappa Concordance calculated, since the samples were analyzed according to the presence of NS1 antigen or IgM antibody. Concordance of 92.1% was observed when comparing the results of NS1-negative samples with IgM-ELISA. Based on the findings, it is possible to suggest that the tests for NS1 detection may be important tools for monitoring the introduction and spread of Dengue serotypes.

Evaluation of dengue NS1 antigen detection for diagnosis in public health laboratories, São Paulo State, 2009 / Avaliação da detecção do antígeno NS1 para diagnóstico de dengue nos Laboratórios de Saúde Pública, Estado de São Paulo, 2009

The present work evaluated the diagnostic accuracy of detection of Dengue NS1 antigen employing two NS1 assays, an immunochromatographic assay and ELISA, in the diagnostic routine of Public Health laboratories. The results obtained with NS1 assay were compared with virus isolation and, in a subpopulation of cases, they were compared with the IgM-ELISA results obtained with convalescent samples. A total of 2,321 sera samples were analyzed by one of two NS1 techniques from March to October 2009. The samples were divided into five groups: groups I, II and III included samples tested by NS1 and virus isolation, and groups IV and V included patients with a first sample tested by NS1 and a second sample tested by IgM-ELISA. Sensitivity, specificity, positive and negative predictive values, Kappa Index and Kappa Concordance were calculated. The results showed that NS1 testing in groups I, II and III had high sensitivity (98.0 percent, 99.5 percent and 99.3 percent), and predictive values and Kappa index between 0.9 - 1.0. Groups IV and V only had Kappa Concordance calculated, since the samples were analyzed according to the presence of NS1 antigen or IgM antibody. Concordance of 92.1 percent was observed when comparing the results of NS1-negative samples with IgM-ELISA. Based on the findings, it is possible to suggest that the tests for NS1 detection may be important tools for monitoring the introduction and spread of Dengue serotypes.

Esse estudo avaliou a acurácia do diagnóstico por detecção do antígeno NS1 do vírus Dengue empregando-se ensaios em dois formatos, imunocromatográfico e ELISA, na rotina diagnóstica dos laboratórios de Saúde Pública. Compararam-se os resultados de NS1 com os resultados de isolamento viral e, em parte dos casos, foi feita a comparação com os resultados de IgM-ELISA, obtidos nas segundas amostras. Um total de 2.321 amostras de soros, obtidas no período de março a outubro de 2009, foram analisadas por uma das duas técnicas NS1. As amostras foram divididas em cinco grupos: I, II e III, que incluíram amostras analisadas por testes NS1 e por isolamento de vírus. Os grupos IV e V incluíram pacientes com a primeira amostra processada por NS1 e segunda por IgM-ELISA. Foram analisadas sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e negativo, concordância e índice Kappa. Os resultados mostraram que os grupos I, II e III apresentaram alta sensibilidade (98,0 por cento, 99,5 por cento e 99,3 por cento), valores preditivos e índice Kappa entre 0,9 - 1,0. Nos grupos IV e V, apenas concordância foi calculada, dado que as amostras foram analisadas quanto à presença de antígeno NS1 ou de anticorpos IgM. Comparando-se os resultados negativos de NS1 com IgM-ELISA houve 92,1 por cento de concordância. Com base nas constatações feitas, é possível sugerir que a detecção de NS1 pode ser importante ferramenta para monitorar a introdução e disseminação dos sorotipos de Dengue.

Reemergence of yellow fever: detection of transmission in the State of São Paulo, Brazil, 2008.

INTRODUCTION: Following yellow fever virus (YFV) isolation in monkeys from the São José do Rio Preto region and two fatal human autochthonous cases from the Ribeirão Preto region, State of São Paulo, Brazil, two expeditions for entomological research and eco-epidemiological evaluation were conducted. METHODS: A total of 577 samples from humans, 108 from monkeys and 3,049 mosquitoes were analyzed by one or more methods: virus isolation, ELISA-IgM, RT-PCR, histopathology and immunohistochemical. RESULTS: Of the 577 human samples, 531 were tested by ELISA-IgM, with 3 positives, and 235 were inoculated into mice and 199 in cell culture, resulting in one virus isolation. One sample was positive by histopathology and immunohistochemical. Using RT-PCR, 25 samples were processed with 4 positive reactions. A total of 108 specimens of monkeys were examined, 108 were inoculated into mice and 45 in cell culture. Four virus strains were isolated from Alouatta caraya. A total of 931 mosquitoes were captured in Sao Jose do Rio Preto and 2,118 in Ribeirão Preto and separated into batches. A single isolation of YFV was derived from a batch of 9 mosquitoes Psorophora ferox, collected in Urupês, Ribeirão Preto region. A serological survey was conducted with 128 samples from the municipalities of São Carlos, Rincão and Ribeirão Preto and 10 samples from contacts of patients from Ribeirão Preto. All samples were negative by ELISA-IgM for YFV. CONCLUSIONS: The results confirm the circulation of yellow fever, even though sporadic, in the Sao Paulo State and reinforce the importance of vaccination against yellow fever in areas considered at risk.

Isolation of yellow fever virus (YFV) from naturally infected Haemagogus (Conopostegus) leucocelaenus (diptera, cukicudae) in São Paulo State, Brazil, 2009.

After detecting the death of Howlers monkeys (genus Alouatta) and isolation of yellow fever virus (YFV) in Buri county, São Paulo, Brazil, an entomological research study in the field was started. A YFV strain was isolated from newborn Swiss mice and cultured cells of Aedes albopictus - C6/36, from a pool of six Haemagogus (Conopostegus) leucocelaenus (Hg. leucocelaenus) mosquitoes (Dyar & Shannon) collected at the study site. Virus RNA fragment was amplified by RT-PCR and sequenced. The MCC Tree generated showed that the isolated strain is related to the South American I genotype, in a monophyletic clade containing isolates from recent 2008-2010 epidemics and epizootics in Brazil. Statistical analysis commonly used were calculated to characterize the sample in relation to diversity and dominance and indicated a pattern of dominance of one or a few species. Hg. leucocelaenus was found infected in Rio Grande do Sul State as well. In São Paulo State, this is the first detection of YFV in Hg. leucocelaenus.

Isolation of yellow fever virus (YFV) from naturally infectied Haemagogus (Conopostegus) leucocelaenus (diptera, cukicudae) in São Paulo State, Brazil, 2009 / Isolamento do vírus da Febre Amarela de mosquitos naturalmente infectados Haemagogus (Conopostegus) leucocelaenus (Diptera, Culicidae), São Paulo, Brasil, 2009

After detecting the death of Howlers monkeys (genus Alouatta) and isolation of yellow fever virus (YFV) in Buri county, São Paulo, Brazil, an entomological research study in the field was started. A YFV strain was isolated from newborn Swiss mice and cultured cells of Aedes albopictus - C6/36, from a pool of six Haemagogus (Conopostegus) leucocelaenus (Hg. leucocelaenus) mosquitoes (Dyar & Shannon) collected at the study site. Virus RNA fragment was amplified by RT-PCR and sequenced. The MCC Tree generated showed that the isolated strain is related to the South American I genotype, in a monophyletic clade containing isolates from recent 2008-2010 epidemics and epizootics in Brazil. Statistical analysis commonly used were calculated to characterize the sample in relation to diversity and dominance and indicated a pattern of dominance of one or a few species. Hg. leucocelaenus was found infected in Rio Grande do Sul State as well. In São Paulo State, this is the first detection of YFV in Hg. leucocelaenus.

Após a detecção de morte de macacos Bugios (gênero Alouatta) e isolamento do vírus da Febre Amarela (YFV) no município de Buri, Estado de São Paulo, Brasil, foi iniciada uma investigação entomológica em campo. Uma cepa de YFV foi isolada em camundongos recém-nascidos e cultura de células de Aedes albopictus - C6/36, a partir de um lote de seis mosquitos Haemagogus (Conopostegus) leucocelaenus (Hg leucocelaenus) Dyar & Shannon coletados no local de estudo. RNA do vírus foi amplificado por RT-PCR e seqüenciado. A topologia gerada indica que a cepa isolada está relacionada ao genótipo South American I, em clado monofilético englobando isolados recentes de epidemias e epizootias entre 2008 e 2009. Análises estatísticas geralmente usadas caracterizaram a amostra em relação à diversidade e dominância, indicando dominância relativa de uma ou poucas espécies. Hg. leucocelaenus foi detectado infectado também no Rio Grande do Sul. No Estado de São Paulo trata-se da primeira detecção do YFV em Hg leucocelaenus.

Reemergence of yellow fever: detection of transmission in the State of São Paulo, Brazil, 2008 / Reemergência de febre amarela: detecção de transmissão no Estado de São Paulo, Brasil, 2008

INTRODUCTION: Following yellow fever virus (YFV) isolation in monkeys from the São José do Rio Preto region and two fatal human autochthonous cases from the Ribeirão Preto region, State of São Paulo, Brazil, two expeditions for entomological research and eco-epidemiological evaluation were conducted. METHODS: A total of 577 samples from humans, 108 from monkeys and 3,049 mosquitoes were analyzed by one or more methods: virus isolation, ELISA-IgM, RT-PCR, histopathology and immunohistochemical. RESULTS: Of the 577 human samples, 531 were tested by ELISA-IgM, with 3 positives, and 235 were inoculated into mice and 199 in cell culture, resulting in one virus isolation. One sample was positive by histopathology and immunohistochemical. Using RT-PCR, 25 samples were processed with 4 positive reactions. A total of 108 specimens of monkeys were examined, 108 were inoculated into mice and 45 in cell culture. Four virus strains were isolated from Alouattacaraya. A total of 931 mosquitoes were captured in Sao Jose do Rio Preto and 2,118 in Ribeirão Preto and separated into batches. A single isolation of YFV was derived from a batch of 9 mosquitoes Psorophoraferox, collected in Urupês, Ribeirão Preto region. A serological survey was conducted with 128 samples from the municipalities of São Carlos, Rincão and Ribeirão Preto and 10 samples from contacts of patients from Ribeirão Preto. All samples were negative by ELISA-IgM for YFV. CONCLUSIONS: The results confirm the circulation of yellow fever, even though sporadic, in the Sao Paulo State and reinforce the importance of vaccination against yellow fever in areas considered at risk.

INTRODUÇÃO: A partir do isolamento do vírus febre amarela (VFA), de macacos, da região de São José do Rio Preto e de dois casos humanos autóctones fatais, da região de Ribeirão Preto, Estado de São Paulo, foram realizadas duas expedições para pesquisa entomológica e avaliação ecoepidemiológica. MÉTODOS: Um total de 577 amostras de humanos, 108 de macacos e 3.049 mosquitos foram analisados por um ou mais métodos: isolamento viral, ELISA-IgM, RT-PCR, histopatologia e imunohistoquímica. RESULTADOS: De 577 amostras humanas, 531 foram testadas por ELISA-IgM, sendo 3 positivas, 235 foram inoculadas em camundongos, 199 em cultura de células, obtendo-se 1 isolamento viral. Uma amostra foi positiva por histopatologia e imunohistoquímica. Por RT-PCR foram processadas 25 amostras com 4 reações positivas. Os 108 espécimes de macacos foram inoculados em camundongos, 45 em cultura de células, obtendo-se 4 isolamentos de VFA, de Alouatta caraya. Um total de 931 mosquitos foram capturados em São José do Rio Preto e 2.118 em Ribeirão Preto e separados em lotes. Um único isolamento de VFA foi derivado de um lote de 9 mosquitos Psorophora ferox, coletados em Urupês, região de Ribeirão Preto. Um inquérito sorológico foi realizado com 128 amostras dos municípios de São Carlos, Rincão e Ribeirão Preto e mais 10 amostras de contactantes de pacientes de Ribeirão Preto. Todas as amostras foram negativas por ELISA-IgM para VFA. CONCLUSÕES: Os resultados confirmam a circulação, mesmo que esporádica, do VFA no Estado de São Paulo e reforça a importância da vacinação antiamarílica nas áreas consideradas de risco.

Estudo longitudinal da prevalência dos vírus Juquitiba e Araraquara em roedores das regiões da Mata Atlântica e do Cerrado do Brasil / Longitudinal study of the prevalence of Juquitiba and Araraquara virus in rodents provenient of the regions of Cerrado and Atlantic Rainforest in Brazil

Com base nos estudos realizados no período de 1993 a 2003, durante a vigilância ecoepidemiológica de hantavírus em regiões de Mata Atlântica e do Cerrado do Brasil, relata-se a prevalência e os fatores relacionados à infecção pelos hantavírus Araraquara e Juquitiba nas populações de Bolomys lasiurus e Oligoryzomys nigripes, respectivamente. Foram realizadas capturas mensais de roedores em diversas localidades do País, nas quais foram detectados casos humanos de síndrome cardiopulmonar por hantavírus. Foram coletadas amostras de sangue para sorologia e detecção de anticorpos específicos para hantavírus e obteve-se de cada roedor dados referentes à espécie, peso, idade, sexo, condições reprodutivas e presença de cicatrizes. As variáveis qualitativas nominais foram organizadas em software de planilha eletrônica e analisadas pelo teste do qui-quadrado, sendo escolhido como critério o nível de significância de 5%. Os resultados mostram, pelas altas prevalências observadas em Bolomys lasiurus e Oligoryzomys nigripes, que estas espécies atuam como reservatório no Cerrado e na Mata Atlântica, respectivamente. Observa-se que a dinâmica ecológica está intimamente relacionada com a transmissão e manutenção de hantavírus na natureza, ficando claro que a atividade reprodutiva é o que mais influencia a ocorrência de roedores soropositivos com cicatrizes, devido às brigas por acasalamento. A prevalência de hantavírus em roedores mostrou-se associada a fatores de idade e sexo, sendo mais comum nos adulto e discretamente mais freqüente nos machos. A sazonalidade da infecção varia de acordo com a espécie de roedor reservatório, sendo que para o Bolomys lasiurus o pico da infecção ocorre no inverno e para Oligoryzomys nigripes, na primavera. Percebeu-se, também, que a prevalência da infecção por hantavírus entre roedores foi maior no Cerrado que na Mata Atlântica, e a sazonalidade dessa prevalência determinou picos na primavera para a Mata Atlântica e no inverno para o Cerrado.