ABSTRACT
Abstract Introduction: Most successful cases of COVID-19 pandemic mitigation and handling have relied on extensive reverse-transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). However, many emerging economies have struggled with current molecular testing demands due to economic, technical and technological constraints. Objective: To define a potential diagnostic protocol to increase testing capacity in current and post-pandemic conditions. Methods: We reviewed the literature, patents and commercial applications, for alternatives. Results: We found a good potential in saliva samples, viral inactivation and quick RNA extraction by heating; the use of an isothermal technology such as loop mediated isothermal amplification (LAMP) and naked eye test-result visualization by in-tube colorimetry or turbidity. Conclusions: Saliva samples with quick RNA extraction by heating and colorimetric LAMP are promising options for countries with economic and infrastructure limitations.
Resumen Introducción: La mayoría de los casos exitosos de mitigación y manejo de la pandemia de COVID-19 se han dado mediante pruebas basadas en la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (RT-qPCR por sus siglas en inglés). Sin embargo, muchas economías emergentes han tenido problemas con las demandas actuales de pruebas moleculares debido a limitaciones económicas, técnicas y tecnológicas. Objetivo: Definir un protocolo de diagnóstico potencial para aumentar la capacidad de prueba en las condiciones actuales y posteriores a la pandemia. Métodos: Revisamos la literatura, las patentes y las aplicaciones comerciales, en busca de alternativas. Resultados: Encontramos un buen potencial en muestras de saliva, inactivación viral y extracción rápida de ARN por calentamiento; el uso de una tecnología isotérmica como la amplificación isotérmica mediada por horquillas (LAMP, por sus siglas en inglés) y la visualización del resultado de la prueba a simple vista mediante colorimetría o turbidez en el tubo. Conclusiones: Las muestras de saliva con extracción rápida de ARN por calentamiento y LAMP colorimétrico son opciones prometedoras para países con limitaciones económicas y de infraestructura.
Subject(s)
Humans , Molecular Diagnostic Techniques/methods , COVID-19 Serological Testing , COVID-19ABSTRACT
INTRODUCCIÓN El concepto de "Una sola Salud", es un principio establecido para reducir los riesgos de las enfermedades infecciosas en la interfaz salud de las personas, salud de los animales y del ambiente. Este principio promueve que las zoonosis se traten con un enfoque integrado. El control de las zoonosis es importante para evitar daños en la salud y la economía (1). Unas de las zoonosis más relevantes de región Patagónica Sur es la Hidatidosis causada por el estadio larvario del parasitario Echinococcus granulosus sensu lato (s.l.) que es trasmitida por los perros infectados. El objetivo general del presente proyecto fue contribuir a la mejora de los programas de control de las zonas endémicas de Hidatidosis, implementando el uso de métodos moleculares de alta sensibilidad y especificidad diagnóstica. El propósito es estimar y comparar la prevalencia de infección canina por E. granulosus s.l. en la zona norte de Santa Cruz y zona sur de Chubut, estableciendo las áreas de riesgo de contraer Hidatidosis, a través de métodos convencionales y de la implementación de la técnica molecular de amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) para la copro-detección de E. granulosus s.l. en zona endémica, utilizando equipamiento básico de laboratorio. MÉTODOS Las zonas seleccionas fueron zona sur de Chubut, dicha provincia se encuentra bajo un programa de control y la zona norte de Santa Cruz en las que se desarrollan actividades preventivas esporádicas. Se recolectaron 246 muestras de materia fecal canina de ambas, a las que se les realizó una selección de las mismas por microscopia óptica en busca de huevos de la familia Taeniidae. Se analizo un 25% de las muestras totales por la metodología molecular amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) propuesta para la identificación de E. granulosus s.l. RESULTADOS El 16% de las muestras totales analizadas resultaron positivas para huevos de tenia (familia Taeniidae), mientras que un 10 % de las seleccionadas por MO fueron positivas para E. granulosus s.l. mediante LAMP Egsl. DISCUSIÓN Durante el transcurso de esta beca se ha logrado implementar el diagnóstico molecular de equinococosis canina y ambiental en un laboratorio de baja complejidad. Este trabajo permitió conocer la circulación de E. granulosus s.s en el Norte de Santa Cruz y corroborar lo mismo en Chubut
