Random regression test-day models to describe milk production and fatty acid traits in first lactation Walloon Holstein cows.

We investigated the use of different Legendre polynomial orders to estimate genetic parameters for milk production and fatty acid (FA) traits in the first lactation Walloon Holstein cows. The data set comprised 302,684 test-day records of milk yield, fat and protein contents, and FAs generated by mid-infrared (MIR) spectroscopy, C16:0 (palmitic acid), C18:1 cis-9 (oleic acid), LCFAs (long-chain FAs), SFAs (saturated FAs) and UFAs (unsaturated FAs) were studied. The models included random regression coefficients for herd-year of calving (h), additive genetic (a) and permanent environment (p) effects. The selection of the best random regression model (RRM) was based on the deviance information criterion (DIC), and genetic parameters were estimated via a Bayesian approach. For all analysed random effects, DIC values decreased as the order of the Legendre polynomials increased. Best-fit models had fifth-order (degree 4) for the p effect and ranged from second- to fifth-order (degree 1-4) for the a and h effects (LEGhap: LEG555 for milk yield and protein content; LEG335 for fat content and SFA; LEG545 for C16:0 and UFA; and LEG535 for C18:1 cis-9 and LCFA). Based on the best-fit models, an effect of overcorrection was observed in early lactation (5-35 days in milk [DIM]). On the contrary, third-order (LEG333; degree 2) models showed flat residual trajectories throughout lactation. In general, the estimates of genetic variance tended to increase over DIM, for all traits. Heritabilities for milk production traits ranged from 0.11 to 0.58. Milk FA heritabilities ranged from low-to-high magnitude (0.03-0.56). High Spearman correlations (>0.90 for all bulls and >0.97 for top 100) were found among breeding values for 155 and 305 DIM between the best RRM and LEG333 model. Therefore, third-order Legendre polynomials seem to be most parsimonious and sufficient to describe milk production and FA traits in Walloon Holstein cows.

Genetic parameters for ultrasound-evaluated carcass and body traits in Anglo-Nubian goats / Parámetros genéticos para las características de la canal y del cuerpo evaluadas por ultrasonido en cabras Anglo-Nubianas / Parâmetros genéticos para características da carcaça avaliadas por ultrassom e corporais em caprinos Anglo-Nubianos

Abstract Background: Meat goat breeding programs should prioritize the identification and selection of genetically superior animals for traits related to meat quality and carcass yield in order to increase the value of the final product. Objective: To estimate (co)variance components and genetic parameters for ultrasound-measured carcass traits, body size and body weight in Anglo- Nubian breed goats raised in the Mid-North region of Brazil. Methods: (Co)variance components and genetic parameters were estimated using the single and two-trait animal model analyses via Bayesian inference for loin eye dimensions (area, length, and depth), sternal fat thickness, rump height, chest circumference and depth, leg perimeter, and body weight. Results: Heritability estimates were higher when two-trait analyses were used. This finding implies that it is possible to recover part of the additive genetic variance included in the residual variance due to the correlation between traits. Genetic correlations between carcass and body size traits showed different magnitudes. On the other hand, genetic correlations between the traits related to muscularity showed high magnitudes. Conclusions: Body weight was not a good indicator of muscularity; therefore, it is not recommended as a criterion for indirect selection to improve carcass traits of Anglo-Nubian goats. Leg perimeter and chest circumference may be important to construct selection indexes in meat goat breeding programs.

Resumen Antecedentes: los programas de mejoramiento de caprinos de carne deben priorizar la identificación y selección de animales genéticamente superiores para características relacionadas con la calidad de la carne y rendimiento de la canal, con el fin de agregar valor al producto final. Objetivo: estimar los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para características de canal obtenidas por ultrasonografía, características de tamaño y peso corporal en caprinos de la raza Anglonubiana, criados en la región medio-norte de Brasil. Métodos: los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos fueron estimados mediante un modelo animal usando análisis uni y bi-carácter vía metodología Bayesiana para las dimensiones del ojo de lomo (área, profundidad y longitud), grosor de la grasa esternal, altura de la grupa, circunferencia y profundidad torácica, perímetro de la pierna y peso corporal. Resultados: las estimativas de heredabilidad obtenidas a partir del análisis bi-carácteristico fueron mayores que las obtenidas a partir del análisis uni-carácteristico. Este supuesto implica que es posible recuperar parte de la variancia genética aditiva incluida en la variancia residual, debido a la correlación entre las características. Las correlaciones genéticas entre las características de canal y las medidas corporales presentaron diferentes magnitudes. Por otro lado, las correlaciones genéticas entre las características relacionadas con musculatura presentaron alta magnitud. Conclusiones: el peso corporal no fue un buen indicador de musculatura; por eso no es recomendado como criterio de selección indirecta para mejorar la canal de caprinos Anglonubianos. El perímetro de la pierna y la circunferencia del pecho pueden ser importantes para la construcción de índices de selección en programas de mejoramiento de carne caprina.

Resumo Antecedentes: programas de melhoramento de caprinos de corte devem priorizar a identificação e seleção de animais geneticamente superiores para características relacionadas à qualidade da carne e rendimento de carcaça, para aumentar o valor ao produto final. Objetivo: estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia, características de tamanho e peso corporal em caprinos da raça Anglo-Nubiana criados na região Meio-Norte do Brasil. Métodos: os componentes de (co)variância e parâmetros genéticos foram estimados usando análises uni e bicaracterísticas de um modelo animal via metodologia Bayesiana para área, profundidade e comprimento de olho de lombo, espessura da gordura esternal, altura da garupa, circunferência e profundidade torácica, perímetro da perna e peso corporal. Resultados: as estimativas de herdabilidade obtidas a partir das análises bicaracterísticas foram maiores que as obtidas a partir das análises unicaracterísticas. Esse resultado implica que é possível recuperar parte da variância genética aditiva incluída na variância residual devido à correlação entre as características. As correlações genéticas entre as características de carcaça e as medidas corporais apresentaram magnitudes variáveis. Por outro lado, as correlações genéticas entre as características relacionadas à musculosidade apresentaram altas magnitudes. Conclusões: o peso corporal não se mostrou um bom indicador de muscularidade, de modo que não é recomendado como critério de seleção indireta para melhorar a carcaça de caprinos Anglo-Nubiano. O perímetro de perna e a circunferência torácica podem ser importantes para a construção de índices de seleção em programas de melhoramento de carne caprina.

Genetic parameters for marbling and body score in Anglonubian goats using Bayesian inference via threshold and linear models.

OBJECTIVE: The aim of this study was to estimate (co) variance components and genetic parameters for categorical carcass traits using Bayesian inference via mixed linear and threshold animal models in Anglonubian goats. METHODS: Data were obtained from Anglonubian goats reared in the Brazilian Mid-North region. The traits in study were body condition score, marbling in the rib eye, ribeye area, fat thickness of the sternum, hip height, leg perimeter, and body weight. The numerator relationship matrix contained information from 793 animals. The single- and two-trait analyses were performed to estimate (co) variance components and genetic parameters via linear and threshold animal models. For estimation of genetic parameters, chains with 2 and 4 million cycles were tested. An 1,000,000-cycle initial burn-in was considered with values taken every 250 cycles, in a total of 4,000 samples. Convergence was monitored by Geweke criteria and Monte Carlo error chain. RESULTS: Threshold model best fits categorical data since it is more efficient to detect genetic variability. In two-trait analysis the contribution of the increase in information and the correlations between traits contributed to increase the estimated values for (co) variance components and heritability, in comparison to single-trait analysis. Heritability estimates for the study traits were from low to moderate magnitude. CONCLUSION: Direct selection of the continuous distribution of traits such as thickness sternal fat and hip height allows obtaining the indirect selection for marbling of ribeye.

Evaluation of a new syringe presentation of reduced-antigen content diphtheria, tetanus, and acellular pertussis vaccine in healthy adolescents--A single blind randomized trial.

Reduced-antigen-content diphtheria-tetanus-acellular pertussis (dTpa) vaccine, Boostrix™, is indicated for booster vaccination of children, adolescents and adults. The original prefilled disposable dTpa syringe presentation was recently replaced by another prefilled-syringe presentation with latex-free tip-caps and plunger-stoppers. 671 healthy adolescents aged 10-15 years who had previously received 5 or 6 previous DT(P)/dT(pa) vaccine doses, were randomized (1:1) to receive dTpa booster, injected using the new (dTpa-new) or previous syringe (dTpa-previous) presentations. Immunogenicity was assessed before and 1-month post-booster vaccination; safety/reactogenicity were assessed during 31-days post-vaccination. Non-inferiority of dTpa-new versus dTpa-previous was demonstrated for all antigens (ULs 95% CIs for GMC ratios ranged between 1.03-1.13). 1-month post-booster, immune responses were in similar ranges for all antigens with both syringe presentations. dTpa delivered using either syringe presentation was well-tolerated. These clinical results complement the technical data and support the use of the new syringe presentation to deliver the dTpa vaccine.

Effect of age of dam on weight of calf in the genetic assessment of Zebu cattle in random regression models / Efeito da idade da vaca à pesagem da progênie na avaliação genética de bovinos Guzerá em modelos de regressão aleatória

Current analysis estimated co-variance components and genetic parameters for growth traits by random regression models taking into consideration the cows age on the weight of calves. Genealogical data and records on weights of male and female Zebu cattle, born between 1993 and 2011, were provided by the National Association of Breeders and Researchers (ANCP). Different models were compared by Akaike and Bayesian criteria. Legendres orthogonal polynomials were used to model the direct and maternal genetic effects of maternal and animal permanent environmental effects. Joint modeling of cow age at the moment their progenies were weighed resulted in more accurate estimates of co-variance components and genetics parameters. Co-variance functions of the cow age retrieved the dam effect on real performance of the progenies, reduced biases, improved parameter estimates and predicted breeding rates.

Objetivou-se com o presente trabalho estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos de características de crescimento por meio de modelos de regressão aleatória considerando a idade da vaca no momento da pesagem de sua respectiva progênie. As informações foram utilizadas de genealogia e registros de pesagem de bovinos machos e fêmeas da raça Guzerá, provenientes da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), nascidos entre 1993 e 2011. Os diferentes modelos foram comparados pelo critério de informação de Akaike e o critério de informação Bayesiano de Schwarz. Utilizaram-se polinômios ortogonais de Legendre para modelar os efeitos genéticos aditivos diretos e maternal, de ambiente permanente do animal e maternal. A modelagem conjunta do efeito da idade do animal e idade da vaca no momento em que suas progênies foram pesadas resultou em estimativas de componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos mais precisos. A função de (co)variâncias da idade da vaca permitiu capturar o efeito que a idade da vaca apresenta sobre o desempenho fenotípico de sua progênie, reduzindo o viés e auxiliando na estimação de parâmetros e predições de valores genéticos mais confiáveis.

Effect of age of dam on weight of calf in the genetic assessment of Zebu cattle in random regression models / Efeito da idade da vaca à pesagem da progênie na avaliação genética de bovinos Guzerá em modelos de regressão aleatória

Current analysis estimated co-variance components and genetic parameters for growth traits by random regression models taking into consideration the cows age on the weight of calves. Genealogical data and records on weights of male and female Zebu cattle, born between 1993 and 2011, were provided by the National Association of Breeders and Researchers (ANCP). Different models were compared by Akaike and Bayesian criteria. Legendres orthogonal polynomials were used to model the direct and maternal genetic effects of maternal and animal permanent environmental effects. Joint modeling of cow age at the moment their progenies were weighed resulted in more accurate estimates of co-variance components and genetics parameters. Co-variance functions of the cow age retrieved the dam effect on real performance of the progenies, reduced biases, improved parameter estimates and predicted breeding rates.(AU)

Objetivou-se com o presente trabalho estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos de características de crescimento por meio de modelos de regressão aleatória considerando a idade da vaca no momento da pesagem de sua respectiva progênie. As informações foram utilizadas de genealogia e registros de pesagem de bovinos machos e fêmeas da raça Guzerá, provenientes da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), nascidos entre 1993 e 2011. Os diferentes modelos foram comparados pelo critério de informação de Akaike e o critério de informação Bayesiano de Schwarz. Utilizaram-se polinômios ortogonais de Legendre para modelar os efeitos genéticos aditivos diretos e maternal, de ambiente permanente do animal e maternal. A modelagem conjunta do efeito da idade do animal e idade da vaca no momento em que suas progênies foram pesadas resultou em estimativas de componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos mais precisos. A função de (co)variâncias da idade da vaca permitiu capturar o efeito que a idade da vaca apresenta sobre o desempenho fenotípico de sua progênie, reduzindo o viés e auxiliando na estimação de parâmetros e predições de valores genéticos mais confiáveis.(AU)

The influence of animals from embryo transfer on the genetic evaluation of growth in Simmental beef cattle by using multi-trait models.

The weight records from Simmental beef cattle were used in a genetic evaluation of growth with or without the inclusion of animals obtained by embryo transfer. A multi-trait model in which embryo transfer individuals were excluded (MTM1) contained 29,510 records from 10,659 animals, while another model without exclusion of these animals (MTM2) contained 62,895 weight records from 23,160 animals. The weight records were adjusted for ages of 100, 205, 365, 450, 550 and 730 days. The (co)variance components and genetic parameters were estimated by the restricted maximum likelihood method. The (co)variance components were similar in both models, except for maternal permanent environment variance. Direct heritabilities (h(2) d) in MTM1 were 0.04, 0.11, 0.20, 0.27, 0.31 and 0.42, while in MTM2 they were 0.11, 0.11, 0.17, 0.21, 0.22 and 0.26 for 100, 205, 365, 450, 550 and 730 days of age, respectively. Estimates of h(2) d in MTM1 were higher than in MTM2 for the weight at 365 days of age. Genetic correlations between weights in both models ranged from moderate to high, suggesting that these traits may be determined mainly by the same genes. Animals from embryo transfer may be included in the genetic evaluation of Simmental beef cattle in Brazil; this inclusion may provide potential gains in accuracy and genetic gains by reducing the interval between generations.

Proposta de análise genética de curvas de crescimento de bovinos por meio do algoritmo SAEM / Proposal for genetic analysis of growth curves of cattle through the SAEM algorithm

Compararam-se duas diferentes metodologias na avaliação genética de curvas de crescimento de animais Nelore: o algoritmo SAEM e o método Two-step. Para a implementação dessas metodologias, foram utilizados o modelo de crescimento de Brody modificado e o modelo touro. A diferença entre o SAEM e o Two-step é que o algoritmo SAEM estima simultaneamente parâmetros do modelo e efeitos genéticos e ambientais, e o método Two-step faz esse processo de estimação em duas etapas distintas. Mais ainda, o algoritmo SAEM utiliza o método de máxima verossimilhança, e o do Two-step o de máxima verossimilhança restrita. Foram obtidos, com base nas metodologias testadas, além das estimativas de efeitos fixos e parâmetros genéticos, os valores genéticos preditos para os touros avaliados. A partir dos valores genéticos preditos, foram obtidas as curvas genéticas para os touros. O algoritmo SAEM mostrou-se consistente na estimação dos efeitos fixos e na predição dos efeitos aleatórios, apresentando-se como uma alternativa viável para avaliação genética de animais Nelore.

Two methodologies in genetic evaluation of growth curves of Nellore cattle were compared: the SAEM algorithm and the Two Step method. To implement these methodologies the Brody modified growth curve and the sire model were used. The difference between the SAEM and the Two Step is that SAEM estimates jointly the parameters of the model and genetics and environmental effects and the Two Step method does this process in two independent steps. Estimates of the fixed effects and genetics parameters, and prediction breeding values for the sires were obtained from the methodologies. From the breeding values genetic curves were obtained for the sires. The SAEM algorithm proved consistent in the estimation of fixed effects and prediction of random effects.

Heterogeneous genetic (co)variances in simulated closed herds under selection / (Co)variâncias genéticas heterogêneas em rebanhos simulados fechados sob seleção

Assuming that selection in closed herds can promote reduction in additive genetic variance, multiple regression models were used to estimate this change in additive genetic (co)variance component, over the years when the selection was done. Weights at 550 days (W550) were studied using simulated data of herds submitted to 20 years of selection. (Co)variance components were estimated assuming that the weight at 550 days was a new trait every five years, by multiple-trait analyses involving four traits in the animal model. Three multiple regression equations were fitted­RMI, RMM, RMF­estimating thus the additive genetic (co)variance components for the 20 years of selection and eight years prior to the selection process. The initial years of each generation of selection were used as a covariate in the RMI. In the RMM, intermediate years were used, and the final years were considered in the RMF. The equations showed high coefficients of determination. However, there was no difference in the adjustment between the models. It was observed that the multiple regression models can be used in the estimation of genetic (co)variance components, when heteroscedasticity is assumed over time due to the selection process.

Assumindo que a seleção em rebanhos fechados pode promover a redução da variância genética aditiva, foi estudada a possibilidade do uso de um modelo de regressão múltipla para estimar os componentes de (co)variância genética aditiva, ao longo dos anos em que a seleção foi praticada. Foram utilizados dados simulados de peso aos 550 dias em dez rebanhos de bovinos de corte submetidos à seleção por 20 anos. Assumindo que a cada cinco anos o peso aos 550 dias era uma nova característica, por meio de análises multicaráter envolvendo quatro características, em um modelo animal, foram estimados componentes de (co)variância. Foram ajustadas três equações de regressão múltipla, RMI, RMM, RMF, estimando componentes de (co)variância genética aditiva para 20 anos de seleção e para oito anos anteriores à seleção. Na RMI, foram utilizados os anos iniciais de cada geração de seleção, para a RMM os anos intermediários e na RMF os anos finais como covariável. As equações apresentaram altos coeficientes de determinação, no entanto, não houve diferença de ajuste entre os três modelos. Observou-se que os modelos de regressão múltipla podem ser usados na estimação dos componentes de (co)variância genética quando se admite heterocedasticidade ao longo do tempo, causada pela seleção.

Tendência genética para pesos padronizados aos 205, 365 e 550 dias de idade de bovinos Nelore da região norte do Brasil / Genetic trend for adjusted weight at 205, 365 and 550 days of age of Nellore cattle from Northern Brazil

Pesquisas efetivas que avaliam a eficiência dos rebanhos bovinos na região Norte do Brasil são insipientes. Por isso, objetivou-se avaliar as mudanças genéticas aditivas diretas e maternais dos pesos padronizados para 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade, de animais da raça Nelore, criados a pasto, nascidos entre 1997 e 2007 na região Norte do Brasil. As estimativas dos componentes de (co)variâncias utilizadas no cálculo dos valores genéticos foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita livre de derivadas (REML), usando o aplicativo MTDFREML. As tendências genéticas dos efeitos genéticos direto e maternal foram estimadas pela regressão, ponderada, das médias anuais dos valores genéticos dos animais. As estimativas das herdabilidade para P205, P365 e P550 foram 0,33; 0,51 e 0,41, com ganhos genéticos de 0,494, 1,229 e 1,500 kg ano-1, respectivamente. Em virtude da variação genética existente, verificou-se que a seleção do rebanho na região Norte do Brasil tem enfatizado principalmente a seleção para peso pós-desmama, ressaltando-se que a seleção para estes pesos pode gerar ao longo dos anos, aumento nos custos de produção, da idade ao abate e acabamento dos animais, havendo assim, necessidade de seleção mais criteriosa para estas características.

Effective researches assessing the efficiency of cattle herds in Northern Brazil are incipient. This study aimed to evaluate the direct additive and maternal genetic trends of weights adjusted to 205 (P205), 365 (P365) and 550 (550) days of age in Nellore animals raised on pasture, born between 1997 and 2007, from Northern Brazil. Estimative of (co)variance components used in the prediction of breeding values were obtained by derivative-free restricted maximum likelihood method (REML) using the MTDFREML program. The genetic trends of direct and maternal genetic effects were obtained by the regression of the annual average of predicted breeding values. The heritability estimates for P205, P365 and P550 were 0.33, 0.51 and 0.41, with genetic gain of 0.494, 1.229 and 1.500 kg year-1, respectively. The genetic variance evidenced that the selection of cattle herds from Northern Brazil has mainly emphasized the selection for post-weaning. Along years, this selection for these weights can generate increase in production costs, of age at slaughter, and dressing of these animals. Therefore, there are need more judicious selection for these characteristics.

Heterogeneous genetic (co)variances in simulated closed herds under selection - 10.4025/actascianimsci.v34i1.10934

Assuming that selection in closed herds can promote reduction in additive genetic variance, multiple regression models were used to estimate this change in additive genetic (co)variance component, over the years when the selection was done. Weights at 550 days (W550) were studied using simulated data of herds submitted to 20 years of selection. (Co)variance components were estimated assuming that the weight at 550 days was a new trait every five years, by multiple-trait analyses involving four traits in the animal model. Three multiple regression equations were fittedRMI, RMM, RMFestimating thus the additive genetic (co)variance components for the 20 years of selection and eight years prior to the selection process. The initial years of each generation of selection were used as a covariate in the RMI. In the RMM, intermediate years were used, and the final years were considered in the RMF. The equations showed high coefficients of determination. However, there was no difference in the adjustment between the models. It was observed that the multiple regression models can be used in the estimation of genetic (co)variance components, when heteroscedasticity is assumed over time due to the selection process.

Genetic trend for adjusted weight at 205, 365 and 550 days of age of Nellore cattle from Northern Brazil - 10.4025/actascianimsci.v34i1.12172 / Tendência genética para pesos padronizados aos 205, 365 e 550 dias de idade de bovinos Nelore da região norte do Brasil - 10.4025/actascianimsci.v34i1.12172

Effective researches assessing the efficiency of cattle herds in Northern Brazil are incipient. This study aimed to evaluate the direct additive and maternal genetic trends of weights adjusted to 205 (P205), 365 (P365) and 550 (550) days of age in Nellore animals raised on pasture, born between 1997 and 2007, from Northern Brazil. Estimative of (co)variance components used in the prediction of breeding values were obtained by derivative-free restricted maximum likelihood method (REML) using the MTDFREML program. The genetic trends of direct and maternal genetic effects were obtained by the regression of the annual average of predicted breeding values. The heritability estimates for P205, P365 and P550 were 0.33, 0.51 and 0.41, with genetic gain of 0.494, 1.229 and 1.500 kg year-1, respectively. The genetic variance evidenced that the selection of cattle herds from Northern Brazil has mainly emphasized the selection for post-weaning. Along years, this selection for these weights can generate increase in production costs, of age at slaughter, and dressing of these animals. Therefore, there are need more judicious selection for these characteristics.

Pesquisas efetivas que avaliam a eficiência dos rebanhos bovinos na região Norte do Brasil são insipientes. Por isso, objetivou-se avaliar as mudanças genéticas aditivas diretas e maternais dos pesos padronizados para 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade, de animais da raça Nelore, criados a pasto, nascidos entre 1997 e 2007 na região Norte do Brasil. As estimativas dos componentes de (co)variâncias utilizadas no cálculo dos valores genéticos foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita livre de derivadas (REML), usando o aplicativo MTDFREML. As tendências genéticas dos efeitos genéticos direto e maternal foram estimadas pela regressão, ponderada, das médias anuais dos valores genéticos dos animais. As estimativas das herdabilidade para P205, P365 e P550 foram 0,33; 0,51 e 0,41, com ganhos genéticos de 0,494, 1,229 e 1,500 kg ano-1, respectivamente. Em virtude da variação genética existente, verificou-se que a seleção do rebanho na região Norte do Brasil tem enfatizado principalmente a seleção para peso pós-desmama, ressaltando-se que a seleção para estes pesos pode gerar ao longo dos anos, aumento nos custos de produção, da idade ao abate e acabamento dos animais, havendo assim, necessidade de seleção mais criteriosa para estas características.

Proposta de análise genética de curvas de crescimento de bovinos por meio do algoritmo SAEM / Proposal for genetic analysis of growth curves of cattle through the SAEM algorithm

Compararam-se duas diferentes metodologias na avaliação genética de curvas de crescimento de animais Nelore: o algoritmo SAEM e o método Two-step. Para a implementação dessas metodologias, foram utilizados o modelo de crescimento de Brody modificado e o modelo touro. A diferença entre o SAEM e o Two-step é que o algoritmo SAEM estima simultaneamente parâmetros do modelo e efeitos genéticos e ambientais, e o método Two-step faz esse processo de estimação em duas etapas distintas. Mais ainda, o algoritmo SAEM utiliza o método de máxima verossimilhança, e o do Two-step o de máxima verossimilhança restrita. Foram obtidos, com base nas metodologias testadas, além das estimativas de efeitos fixos e parâmetros genéticos, os valores genéticos preditos para os touros avaliados. A partir dos valores genéticos preditos, foram obtidas as curvas genéticas para os touros. O algoritmo SAEM mostrou-se consistente na estimação dos efeitos fixos e na predição dos efeitos aleatórios, apresentando-se como uma alternativa viável para avaliação genética de animais Nelore.(AU)

Two methodologies in genetic evaluation of growth curves of Nellore cattle were compared: the SAEM algorithm and the Two Step method. To implement these methodologies the Brody modified growth curve and the sire model were used. The difference between the SAEM and the Two Step is that SAEM estimates jointly the parameters of the model and genetics and environmental effects and the Two Step method does this process in two independent steps. Estimates of the fixed effects and genetics parameters, and prediction breeding values for the sires were obtained from the methodologies. From the breeding values genetic curves were obtained for the sires. The SAEM algorithm proved consistent in the estimation of fixed effects and prediction of random effects.(AU)

Genetic trend for adjusted weight at 205, 365 and 550 days of age of Nellore cattle from Northern Brazil - 10.4025/actascianimsci.v34i1.12172 / Tendência genética para pesos padronizados aos 205, 365 e 550 dias de idade de bovinos Nelore da região norte do Brasil - 10.4025/actascianimsci.v34i1.12172

Effective researches assessing the efficiency of cattle herds in Northern Brazil are incipient. This study aimed to evaluate the direct additive and maternal genetic trends of weights adjusted to 205 (P205), 365 (P365) and 550 (550) days of age in Nellore animals raised on pasture, born between 1997 and 2007, from Northern Brazil. Estimative of (co)variance components used in the prediction of breeding values were obtained by derivative-free restricted maximum likelihood method (REML) using the MTDFREML program. The genetic trends of direct and maternal genetic effects were obtained by the regression of the annual average of predicted breeding values. The heritability estimates for P205, P365 and P550 were 0.33, 0.51 and 0.41, with genetic gain of 0.494, 1.229 and 1.500 kg year-1, respectively. The genetic variance evidenced that the selection of cattle herds from Northern Brazil has mainly emphasized the selection for post-weaning. Along years, this selection for these weights can generate increase in production costs, of age at slaughter, and dressing of these animals. Therefore, there are need more judicious selection for these characteristics.

Pesquisas efetivas que avaliam a eficiência dos rebanhos bovinos na região Norte do Brasil são insipientes. Por isso, objetivou-se avaliar as mudanças genéticas aditivas diretas e maternais dos pesos padronizados para 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade, de animais da raça Nelore, criados a pasto, nascidos entre 1997 e 2007 na região Norte do Brasil. As estimativas dos componentes de (co)variâncias utilizadas no cálculo dos valores genéticos foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita livre de derivadas (REML), usando o aplicativo MTDFREML. As tendências genéticas dos efeitos genéticos direto e maternal foram estimadas pela regressão, ponderada, das médias anuais dos valores genéticos dos animais. As estimativas das herdabilidade para P205, P365 e P550 foram 0,33; 0,51 e 0,41, com ganhos genéticos de 0,494, 1,229 e 1,500 kg ano-1, respectivamente. Em virtude da variação genética existente, verificou-se que a seleção do rebanho na região Norte do Brasil tem enfatizado principalmente a seleção para peso pós-desmama, ressaltando-se que a seleção para estes pesos pode gerar ao longo dos anos, aumento nos custos de produção, da idade ao abate e acabamento dos animais, havendo assim, necessidade de seleção mais criteriosa para estas características.

Heterogeneous genetic (co)variances in simulated closed herds under selection - 10.4025/actascianimsci.v34i1.10934

Assuming that selection in closed herds can promote reduction in additive genetic variance, multiple regression models were used to estimate this change in additive genetic (co)variance component, over the years when the selection was done. Weights at 550 days (W550) were studied using simulated data of herds submitted to 20 years of selection. (Co)variance components were estimated assuming that the weight at 550 days was a new trait every five years, by multiple-trait analyses involving four traits in the animal model. Three multiple regression equations were fittedRMI, RMM, RMFestimating thus the additive genetic (co)variance components for the 20 years of selection and eight years prior to the selection process. The initial years of each generation of selection were used as a covariate in the RMI. In the RMM, intermediate years were used, and the final years were considered in the RMF. The equations showed high coefficients of determination. However, there was no difference in the adjustment between the models. It was observed that the multiple regression models can be used in the estimation of genetic (co)variance components, when heteroscedasticity is assumed over time due to the selection process.

Modelo hierárquico bayesiano aplicado na avaliação genética de curvas de crescimento de bovinos de corte / Bayesian hierarchical model appllied to genetic evaluation of beef cattle growth curves

A estimação dos componentes de (co)variância dos parâmetros de modelos de crescimento pode ser feita por vários métodos. A metodologia bayesiana se apresenta como uma forma alternativa de estimação. Foi realizado um estudo, por meio de dados simulados e de dados reais de animais Nelore, para a estimação dos componentes de (co)variância dos parâmetros do modelo de crescimento de Von Bertalanffy, por meio da metodologia hierárquica bayesiana. Com base nos componentes estimados, foram encontradas as herdabilidades para cada parâmetro do modelo e as correlações genéticas e ambientais entre esses parâmetros. As distribuições marginais a posteriori dos parâmetros a, R, μ, u, G e σ2e foram obtidas por meio do algoritmo Gibbs Sampler e as dos parâmetros b e k por meio do algoritmo Metropolis-Hastings. A metodologia se mostrou eficiente, proporcionando estimativas para os parâmetros próximas aos valores simulados. Os parâmetros a e k dos dados reais apresentaram valores de herdabilidades compatíveis com a realidade, indicando que esses parâmetros poderiam ser usados para fins de seleção.(AU)

The estimation of the (co)variance components for the parameters of the growth models can be evaluated by many methods. The Bayesian approach is an alternative method of the estimation. A study was performed using simulated and real data from Nelore cattle for estimation of the (co)variance components for the parameters of Von Bertalanffy growth curve, using a bayesian hierarchical model. From the estimated components, the heritabilities for each parameter and genetic and environmental correlations between these parameters were determined. The samples of posterior marginal distributions for the parameters a, R, μ , u, G, and σ2e were obtained by using Gibbs Sampler algorithm and for the parameters b e k by using the Metropolis-Hastings algorithm. The efficiency of the bayesian inference methodology was verified since estimated parameters were quite close to the simulated ones. The parameters a and k from real data showed heritabilities compatible with the reality indicating they could be used in selection programs.(AU)

Modelo hierárquico bayesiano aplicado na avaliação genética de curvas de crescimento de bovinos de corte / Bayesian hierarchical model appllied to genetic evaluation of beef cattle growth curves

A estimação dos componentes de (co)variância dos parâmetros de modelos de crescimento pode ser feita por vários métodos. A metodologia bayesiana se apresenta como uma forma alternativa de estimação. Foi realizado um estudo, por meio de dados simulados e de dados reais de animais Nelore, para a estimação dos componentes de (co)variância dos parâmetros do modelo de crescimento de Von Bertalanffy, por meio da metodologia hierárquica bayesiana. Com base nos componentes estimados, foram encontradas as herdabilidades para cada parâmetro do modelo e as correlações genéticas e ambientais entre esses parâmetros. As distribuições marginais a posteriori dos parâmetros a, R, μ, u, G e σ2e foram obtidas por meio do algoritmo Gibbs Sampler e as dos parâmetros b e k por meio do algoritmo Metropolis-Hastings. A metodologia se mostrou eficiente, proporcionando estimativas para os parâmetros próximas aos valores simulados. Os parâmetros a e k dos dados reais apresentaram valores de herdabilidades compatíveis com a realidade, indicando que esses parâmetros poderiam ser usados para fins de seleção.

The estimation of the (co)variance components for the parameters of the growth models can be evaluated by many methods. The Bayesian approach is an alternative method of the estimation. A study was performed using simulated and real data from Nelore cattle for estimation of the (co)variance components for the parameters of Von Bertalanffy growth curve, using a bayesian hierarchical model. From the estimated components, the heritabilities for each parameter and genetic and environmental correlations between these parameters were determined. The samples of posterior marginal distributions for the parameters a, R, μ , u, G, and σ2e were obtained by using Gibbs Sampler algorithm and for the parameters b e k by using the Metropolis-Hastings algorithm. The efficiency of the bayesian inference methodology was verified since estimated parameters were quite close to the simulated ones. The parameters a and k from real data showed heritabilities compatible with the reality indicating they could be used in selection programs.