De vuelta a la clínica. Métodos I. Diseños de investigación. Mayor calidad de información, mayor certeza a la respuesta.

Research designs refer to the way information is obtained and are limited by ethical, economic and temporal viability. Research designs are standardized strategies to reduce biases, which in the architectural model of research are identified in the baseline state, the maneuver and the outcome; hence, there are no specific designs for each question. The design with the lowest probability of bias is the clinical trial, followed by cohort and case-control studies and, finally, by cross-sectional surveys. Among the main characteristics that give merit to research designs are the following: population inquiry, which refers to the situation of the population in relation to the clinical course/natural history of the disease; the maneuver, or action that is expected to modify the baseline state, which can be observational or experimental; follow-up, or documented monitoring that is given to each subject, which can be longitudinal or cross-sectional; and directionality, which can prolective or retrolective and refers to the timing of data collection for research purposes. It will always be better having a valuable question, even when answered with a design with higher risk of bias, than a question that is irrelevant or has no applicability.

Los diseños de investigación se refieren a la forma como se obtiene la información y están limitados por viabilidad ética, económica y temporal. Son estrategias estandarizadas para disminuir los sesgos que en el modelo arquitectónico de la investigación se identifican en el estado basal, maniobra y desenlace; de ahí que no hay diseños específicos para cada pregunta. El diseño con menor probabilidad de sesgos es el ensayo clínico, seguido de la cohorte, el estudio de casos y controles y, finalmente, la encuesta transversal. Entre las principales características que dan mérito a los diseños están las siguientes: la pesquisa de la población, que se refiere a la ubicación de la población en relación con el curso clínico o historia natural de la enfermedad; la maniobra, o acción que se espera modifique la condición basal, que puede ser observacional o experimental; el seguimiento, o monitoreo documentado que se le da a cada sujeto, que puede ser longitudinal o transversal; y la direccionalidad, prolectiva o retrolectiva, que alude al tiempo de recopilación de la información con fines de investigación. Siempre será mejor tener una pregunta valiosa, incluso cuando se responda con un diseño con mayor riesgo de sesgos, que una pregunta irrelevante o sin aplicabilidad.

De vuelta a la clínica. Métodos I. Diseños de investigación. Mayor calidad de información, mayor certeza a la respuesta / Back to the clinic. Methods I. Research designs. Higher quality of information, greater certainty to the answer

Resumen Los diseños de investigación se refieren a la forma como se obtiene la información y están limitados por viabilidad ética, económica y temporal. Son estrategias estandarizadas para disminuir los sesgos que en el modelo arquitectónico de la investigación se identifican en el estado basal, maniobra y desenlace; de ahí que no hay diseños específicos para cada pregunta. El diseño con menor probabilidad de sesgos es el ensayo clínico, seguido de la cohorte, el estudio de casos y controles y, finalmente, la encuesta transversal. Entre las principales características que dan mérito a los diseños están las siguientes: la pesquisa de la población, que se refiere a la ubicación de la población en relación con el curso clínico o historia natural de la enfermedad; la maniobra, o acción que se espera modifique la condición basal, que puede ser observacional o experimental; el seguimiento, o monitoreo documentado que se le da a cada sujeto, que puede ser longitudinal o transversal; y la direccionalidad, prolectiva o retrolectiva, que alude al tiempo de recopilación de la información con fines de investigación. Siempre será mejor tener una pregunta valiosa, incluso cuando se responda con un diseño con mayor riesgo de sesgos, que una pregunta irrelevante o sin aplicabilidad.

Abstract Research designs refer to the way information is obtained and are limited by ethical, economic and temporal viability. Research designs are standardized strategies to reduce biases, which in the architectural model of research are identified in the baseline state, the maneuver and the outcome; hence, there are no specific designs for each question. The design with the lowest probability of bias is the clinical trial, followed by cohort and case-control studies and, finally, by cross-sectional surveys. Among the main characteristics that give merit to research designs are the following: population inquiry, which refers to the situation of the population in relation to the clinical course/natural history of the disease; the maneuver, or action that is expected to modify the baseline state, which can be observational or experimental; follow-up, or documented monitoring that is given to each subject, which can be longitudinal or cross-sectional; and directionality, which can prolective or retrolective and refers to the timing of data collection for research purposes. It will always be better having a valuable question, even when answered with a design with higher risk of bias, than a question that is irrelevant or has no applicability.

Diferencia espacial de la incidencia de fiebre hemorrágica argentina y la composición y abundancia de roedores en el ensamble / Spatial difference in the incidence of Argentine Hemorrhagic Fever and composition and abundance of rodents in the assemblage

Resumen La fiebre hemorrágica argentina (FHA) es una enfermedad zoonótica endémica en una amplia zona de la pampa húmeda de Argentina. El agente etiológico es el virus Junin que es mantenido en la naturaleza por el roedor Calomys musculinus y transmitido, principalmente, al humano a través de aerosoles generados de las secreciones y excreciones. Objetivos: Caracterizar la composición y diversidad de los ensambles de pequeños roedores, determinar la abundancia del hospedador C. musculinus y la prevalencia del virus de la FHA en las zonas epidémica, histórica y no endémica de dicha enfermedad en Argentina. Métodos: Para el muestreo de roedores en cada una de las zonas se demarcaron un área central y dos periféricas para 18 localidades de la región central de Argentina (incluyendo las provincias de Córdoba, Buenos Aires y Santa Fe) muestreadas en dos años. Se comparó la abundancia de C. musculinus entre zonas y entre las áreas dentro de cada zona y áreas cercanas entre zonas, utilizando modelos de análisis de varianza anidados. Resultados. Dentro de cada zona, el ensamble de roedores mostró diferencia espacial en la composición específica, diversidad y abundancia de C. musculinus. La zona epidémica registró mayor número de especies y mayor abundancia del hospedador. En zona histórica se capturó el menor número de especies (de roedores) y Akodon azarae fue la más abundante. En zona no endémica la composición del ensamble y la abundancia de C. musculinus variaron entre los dos años. Sólo se detectó infección por virus Junin en C. musculinus correspondientes a la zona epidémica con una prevalencia de 2,7 y 1,1% para los años 2007 y 2008, respectivamente. Conclusión: En este sistema, la abundancia del hospedador estaría afectando la dinámica espacial de este virus, más que la diversidad del ensamble o la presencia de A. azarae.

Background. The Argentine Hemorrhagic Fever (AHF) is a zoonotic disease endemic in a wide area of the humid pampa of Argentina. The etiologic agent is the Junin virus that is maintained in the wild by the rodent Calomys musculinus and transmitted to humans, mainly, through aerosols generated from secretions and excretions. Aims: To characterize and compare the assemblages of small rodent composition and diversity inside the epidemic, historic and non-endemic zone of AHF and to register C. musculinus abundance in each zone and in each area within each zone, registering the prevalence of infection in rodent populations. Method: One central and two peripheral areas were delimited to sample rodents in each zone with different incidence of AHF. Thus, 18 localities were selected to do the sampling in two years. Host abundance between zones and among areas inside each zone and among nearby areas between zones were compared applying nested ANOVA's. Results: In each zone, the rodent assemblage showed differences in composition, diversity and numeric representation of C. musculinus. The epidemic zone was the richest of the three, registering also great host abundance; meanwhile in the historic zone, A. azarae was the dominant numeric species with less number of other species. Regarding the non-endemic zone, the assemblage composition and C. musculinus abundance varied respect the sampled year. Junin virus infection was only detected in C. musculinus individuals corresponding to the epidemic zone, with a prevalence of 2.7 and 1.1% for the years 2007 and 2008, respectively. Conclusion: In this system, the abundance of C. musculinus could be impacting over the pathogen dynamic, rather than the assemblage diversity or the A. azarae presence.

¿Influyen las aves migratorias neárticas en el patrón estacional de aves de los humedales costeros? / Do influence Nearctic migratory birds in the seasonal pattern of coastal wetlands birds?

Si la llegada en primavera-verano de las aves limícolas migratorias neárticas influye en el incremento de la riqueza y abundancia de los ensambles de aves en los humedales costeros entonces, tanto la riqueza como la abundancia de este grupo de aves disminuirán hacia el otoño. Para comprobarlo se usó como modelo de estudio al Manglar San Pedro de Vice donde se estableció que la disminución de la riqueza de aves en otoño podría deberse al retorno de las especies migratorias neárticas hacia el hemisferio norte. Por tanto, el objetivo fue determinar la disminución de la riqueza y abundancia de aves limícolas migratorias neárticas. Se realizaron 10 muestreos quincenales entre diciembre del 2010 y abril del 2011, recorriendo una distancia de 4.5 km desde el norte del canal de marea preferentemente cuando la marea estaba bajando. La disminución de la riqueza se analizó con una regresión de Poisson, la disminución de la abundancia se hizo a través de los promedios de abundancias con un modelo lineal generalizado. Se registraron 19 especies de aves limícolas consideradas como migratorias neárticas. La riqueza de especies y la abundancia mostraron una disminución estadísticamente significativa de acuerdo a los intervalos de confianza de las pendientes respectivas. Se concluye que las aves limícolas migratorias neárticas sí influyen en los patrones estacionales de los ensambles de aves en los humedales costeros en Perú

If the spring-summer arrival of migratory Nearctic waders influences the increase in richness and abundance of bird assemblages in coastal wetlands then both the richness and abundance of this group of birds will decline by the fall. To verify this, the San Pedro de Vice mangrove was used as a model of study where it was established that the fall in bird species in autumn could be due to the return of migratory species to the northern hemisphere. Therefore, the objective was to determine the decrease in richness and abundance of migratory Nearctic waders. Ten biweekly surveys were conducted between December 2010 and April 2011, covering a distance of 4.5 km from the north of the tidal channel, preferably when the tide was descending. The decrease in richness was analyzed with a Poisson regression, the decrease in abundance was done through the abundance mean with a generalized linear model. There were 19 species of waders considered as migratory Nearctic. Species richness and abundance showed a statistically significant decrease according to the confidence intervals of the respective slopes. It is concluded that migratory Nearctic wader influence the seasonal patterns of bird assemblages in coastal wetlands in Peru.

Habitat conditions drive phylogenetic structure of dominant bacterial phyla of microbialite communities from several locations in Mexico / Las condiciones del hábitat determinan la estructura filogenética de filos (phyla) bacterianos dominantes de comunidades de microbialitos de diferentes regiones en México

Abstract:Community structure and composition are dictated by evolutionary and ecological assembly processes which are manifested in signals of, species diversity, species abundance and species relatedness. Analysis of species coexisting relatedness, has received attention as a tool to identify the processes that influence the composition of a community within a particular habitat. In this study, we tested if microbialite genetic composition is dependent on random events versus biological/abiotical factors. This study was based on a large genetic data set of two hypervariable regions (V5 and V6) from previously generated barcoded 16S rRNA amplicons from nine microbialite communities distributed in Northeastern, Central and Southeastern Mexico collected in May and June of 2009. Genetic data of the most abundant phyla (Proteobacteria, Planctomycetes, Verrucomicrobia, Bacteroidetes, and Cyanobacteria) were investigated in order to state the phylogenetic structure of the complete communities as well as each phylum. For the complete dataset, Webb NTI index showed positive and significant values in the nine communities analysed, where values ranged from 31.5 in Pozas Azules I to 57.2 in Bacalar Pirate Channel; meanwhile, NRI index were positive and significant in six of the nine communities analysed with values ranging from 18.1 in Pozas Azules I to 45.1 in Río Mesquites. On the other hand, when comparing each individual phylum, NTI index were positive and significant in all groups, except in Cyanobacteria for which positive and significant values were only found in three localities; finally, NRI index was significant in only a few of the comparisons performed. The results suggest that habitat filtering is the main process that drives phylogenetic structure in bacterial communities associated to microbialites with the exception of Cyanobacteria where different lineages can contribute to microbialite formation and growth. Rev. Biol. Trop. 64 (3): 10571065. Epub 2016 September 01.

ResumenLa estructura y composición de las comunidades son determinadas por procesos evolutivos y ecológicos que se manifiestan en señales de diversidad, abundancia y la relación de especies. El análisis de la relación de especies que coexisten ha recibido atención como una herramienta para identificar los procesos que influyen en la composición de una comunidad dentro de un hábitat particular. En este estudio, evaluamos si la composición genética de bacterias microbialíticas depende de acontecimientos al azar vs factores biológicos/ abióticos. Este estudio se basa en un conjunto de datos genéticos de dos regiones hipervariables (V5 y V6) de gen 16S rRNA generados previamente de nueve comunidades de microbialitos distribuidos en el Noreste, Centro y Sureste de México, recolectados en mayo y junio 2009. Los datos genéticos de los filos más abundantes (Proteobacteria, Planctomycetes, Verrucomicrobia, Bacteroidetes y Cyanobacteria) fueron analizados para determinar la estructura filogenética de la comunidad y de cada filo por separado. Para el análisis conjunto, el índice NTI de Webb mostró valores positivos y significativos en las nueve comunidades analizadas, en donde los valores oscilaron entre 31.5 en Pozas Azules I y 57.2 en el Canal Pirata en Bacalar; en contraste, los valores del índice NRI fueron positivos y significativos en seis de las nueve comunidades analizadas con valores oscilando desde 18.1 en Pozas Azules I hasta 45.1 en Río Mezquites. Por otro lado, en la comparación de cada filo individual, el índice NTI fue positivo y significativo en todos los grupos excepto en Cyanobacteria, en donde valores positivos y significativos fueron encontrados sólo en tres localidades; finalmente, el índice NRI fue significativo sólo en unas cuantas de las comparaciones realizadas. Los resultados sugieren que el filtrado del hábitat es el proceso principal que determina la estructura filogenética de las comunidades bacterianas asociadas a microbialitos con la excepción de las cianobacterias en donde diferentes linajes pueden contribuir a la formación y crecimiento del microbialito.

Sobre ensambles y ensamblajes ecológicos - respuesta a Monge-Nájera / Ecological ensembles and assemblages - a reply to Monge-Nájera

ResumenEvaluar críticamente la terminología que usamos en ecología es importante para evitar el uso de palabras que no ayudan a facilitar la comunicación científica. En este trabajo contestamos el comentario de Monge-Najera sobre el uso de los términos ensamble y ensamblaje, argumentando que estas palabras son válidas y útiles en el idioma español.Además, ambos términos tienen su lugar en la ecología, por lo que proveemos información para usarlos en un contexto ecológico apropiado.

AbstractCritical evaluation of terminology use in ecology is important to avoid using jargon that helps little to facilitate communication. Here we reply to Monge-Najera’s comment on the use of the terms ensemble and assemblage, we argue for the use of the words ensamble and ensamblaje in Spanish. In addition, both terms have a proper place in ecology and we provide a case for their use in proper ecological context. Rev. Biol. Trop. 64 (2): 817-819. Epub 2016 June 01.

Comunidades de equinodermos en la región de Tunantal, Golfo de Cariaco, Venezuela / Echinoderms communities in the Tunantal area, Gulf of Cariaco, Venezuela

Resumen Los equinodermos son un grupo importante en la estructura de las comunidades bentónicas, tanto por su diversidad como por su relevancia ecológica, sin embargo los trabajos dirigidos al conocimiento de la presencia, abundancia y distribución espacial de este grupo en venezuela aún son escasos. Se comparó la estructura de las comunidades de equinodermos en diferentes hábitats en la región de Tunantal, Golfo de Cariaco, venezuela. Se realizaron muestreos durante septiembre - octubre de 2010 y febrero - abril 2011 mediante buceos cualitativos y con la utilización de cuadrantes de 1 m2, en zonas someras en ambientes de parches de corales, praderas de Thalassia testudimun, sustrato arenoso, rocoso y la desembocadura del Río Tunantal, identificando y contabilizando los equinodermos presentes. Se determinó la densidad, riqueza y diversidad de Shannon, así como los índices de similitud de Bray-Curtis y Sorensen. Se detectó diferencias en la estructura comunitaria entre los hábitats. La riqueza general de equinodermos se estimó en 40 ± 3.02 especies. Los parches coralinos y sustratos rocosos exhibieron mayor riqueza, abundancia de especies, diversidad de Shannon y equidad que el resto de los hábitats, aunque estos últimos resultaron similares en cuanto a equidad y diversidad de Shannon, se detectaron diferencia en las estructura de las comunidades. En los parches de coral la especie dominante fueron Echinometra viridis, Ophiactis savignyi y Ophiothrix angulata. Mientras que en el ambiente rocoso las especies Echinometra lucunter y Ophiocoma echinata mostraron la mayor frecuencia y abundancia seguido por Ophionereis reticulata. Los otros ambientes de la bahía (praderas de T. testudinum, fondo arenoso y desembocadura del río) mostraron muy baja diversidad y abundancia de equinodermos, en algunos casos con ocurrencias ocasionales. Se propone la heterogeneidad de los sustratos como el principal promotor de las diversidades y estructuración de las comunidades de equinodermos en la zona. Por lo que los corales y sustratos rocosos ofrecen los hábitats a las especies dominantes (E. viridis, E. lucunter y O. echinata), pero las diferencias de los ambientes en cuanto a los sustratos, profundidad y presión por oleaje pueden dar a lugar a estas diferencias en las comunidades. La diversidad general de equinodermos es producto de la presencia de gran variedad de ambientes y de los cambios en composición de especies entre los ambientes.

Abstract Echinoderms are relevant in the structure of marine benthic assemblages, both due their diversity and their ecological niche. However, studies related with occurrence, abundance and patterns of distribution of echinoderms in venezuela are still scarce. In the present study we describe the echinoderms in shallow-waters habitats (corals patches, Thalassia beds, sandy bottom, rocky subtidal shore, and mouth of river) at Tunantal bay, Golfo de Cariaco, venezuela, an area that face threats related with the increase of urban development. Samples were performed during September - October 2010 and February - April 2011, using quantitative (1 m2 plots) and qualitative diving observations. Measurements include density, number of species, evenness, Shannon diversity and similarities between habitats based on Bray-Curtis and Sorensen Indexes. Differences in the structure of echinoderm assemblages were detected between habitats. The overall number of echinoderm species in the area was estimated in 40 ± 3.02. Coral patches and rocky shores showed more species and abundance, evenness and Shannon diversity than others habitats. Although the former habitats are similar in evenness and Shannon diversity, differences in the structure of the assemblages were detected. In coral habitats Echinometra viridis, Ophiactis savignyi and Ophiothrix angulata were the dominants species of the assemblages, meanwhile in rocky shores E. lucunter and Ophiocoma echinata were dominants in abundance followed by Ophionereis reticulata. Other habitats of the bay (Thalassia beds, sandy bottom and mouth of river) showed very low diversity and abundance of echinoderms, in some cases only occasional occurrence. Substrate heterogeneity is proposed as the main driving factor of the diversity and structure of the echinoderms assemblages in the bay. Moreover coral patches and rocky shores offer a substratum to dominant species (E. viridis, E. lucunter and O. echinata), but habitat differences in terms of substratum, depth and wave stress could explain the differences in the echinoderm assemblage. The overall echinoderm diversity is promoted by the differences of habitats in the bay and the changes of species composition between habitats. Rev. Biol. Trop. 63 (Suppl. 2): 195-207. Epub 2015 June 01.

Composición y estructura de la ictiofauna del Río Ceballos-Saldán (Córdoba, Argentina)

Los ríos presentan un gradiente longitudinal desde su naciente hasta su desembocadura, con los consiguientes cambios en sus características ambientales y en la composición específica. El objetivo de este trabajo fue describir esa variación longitudinal en las características de la fauna de peces del Río Ceballos-Saldán. Los muestreos se realizaron en cinco puntos, ubicados antes y después de las ciudades más importantes, durante un año. Los ensambles de peces fueron descriptos a través de la composición específica, abundancia, riqueza, diversidad y dominancia, atributos que fueron estimados para cada localidad de muestreo. Se aplicaron diferentes modelos especie/abundancia a cada ensamble de peces a lo largo del curso. Se capturaron 1.914 individuos pertenecientes a 17 especies. Once corresponden a primeras citas para este río. El orden más representativo fue el de los Siluriformes y la especie más abundante fue Hypostomus cordovae (Günther, 1880). La abundancia total fue el único atributo que varió significativamente a lo largo del curso, siendo menor antes de la ciudad de Río Ceballos. Los ensambles de peces fueron significativamente descriptos por tres modelos diferentes de abundancia poblacional, a lo largo del río.

Rivers show a longitudinal gradient from upstream to downstream, with consecutive changes in environmental characteristics and community composition. The main goal of this study was to describe the longitudinal variations in the characteristics of the fish fauna of Ceballos-Saldán River. Fish collection was performed at five sites along the river, before and after the main cities. Fish assemblages were described by specific composition, fish abundance, richness, diversity and dominance. These assemblage attributes were estimated for each sampling site. Species/abundance models were applied to each fish assemblage along the river. A total of 1,914 individuals were collected in Ceballos-Saldán River, which correspond to 17 species. Eleven of them were cited for the first time in the basin. The most abundant order was the Siluriformes. The most abundant species was Hypostomus cordovae (Günther, 1880). The only community attribute that significantly changed along Ceballos-Saldán River was total abundance, which presented its minimum value before Río Ceballos city. Three different species abundance models, along the river, described fish assemblages.

Composición y estructura de la ictiofauna del Río Ceballos-Saldán (Córdoba, Argentina)

Los ríos presentan un gradiente longitudinal desde su naciente hasta su desembocadura, con los consiguientes cambios en sus características ambientales y en la composición específica. El objetivo de este trabajo fue describir esa variación longitudinal en las características de la fauna de peces del Río Ceballos-Saldán. Los muestreos se realizaron en cinco puntos, ubicados antes y después de las ciudades más importantes, durante un año. Los ensambles de peces fueron descriptos a través de la composición específica, abundancia, riqueza, diversidad y dominancia, atributos que fueron estimados para cada localidad de muestreo. Se aplicaron diferentes modelos especie/abundancia a cada ensamble de peces a lo largo del curso. Se capturaron 1.914 individuos pertenecientes a 17 especies. Once corresponden a primeras citas para este río. El orden más representativo fue el de los Siluriformes y la especie más abundante fue Hypostomus cordovae (Günther, 1880). La abundancia total fue el único atributo que varió significativamente a lo largo del curso, siendo menor antes de la ciudad de Río Ceballos. Los ensambles de peces fueron significativamente descriptos por tres modelos diferentes de abundancia poblacional, a lo largo del río.

Rivers show a longitudinal gradient from upstream to downstream, with consecutive changes in environmental characteristics and community composition. The main goal of this study was to describe the longitudinal variations in the characteristics of the fish fauna of Ceballos-Saldán River. Fish collection was performed at five sites along the river, before and after the main cities. Fish assemblages were described by specific composition, fish abundance, richness, diversity and dominance. These assemblage attributes were estimated for each sampling site. Species/abundance models were applied to each fish assemblage along the river. A total of 1,914 individuals were collected in Ceballos-Saldán River, which correspond to 17 species. Eleven of them were cited for the first time in the basin. The most abundant order was the Siluriformes. The most abundant species was Hypostomus cordovae (Günther, 1880). The only community attribute that significantly changed along Ceballos-Saldán River was total abundance, which presented its minimum value before Río Ceballos city. Three different species abundance models, along the river, described fish assemblages.