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1.
Vitae (Medellín) ; 31(1): 1-11, 2024-05-03. Ilustraciones
Article in English | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1553606

ABSTRACT

Background: Mild Colombian coffees are recognized worldwide for their high-quality coffee cup. However, there have been some failures in post-harvest practices, such as coffee grain fermentation. These failures could occasionally lead to defects and inconsistencies in quality products and economic losses for coffee farmers. In Colombia, one of the fermentation methods most used by coffee growers is wet fermentation, conducted by submerging the de-pulped coffee beans for enough time in water tanks to remove the mucilage. Objectives: We evaluated the effect of the water (g)/de-pulped coffee (g) ratio (I: 0/25, II: 10/25, III: 20/25) and final fermentation time (24, 48, and 72 hours) on the total number of microbial groups. We also identified microorganisms of interest as starter cultures. Methods: We used a completely randomized experimental design with two factors; the effect of the water (g)/de-pulped coffee (g) ratio (I: 0/25, II: 10/25, III: 20/25) and final fermentation time (24, 48, and 72 hours), for 9 treatments with two replicates. During the coffee fermentation (1,950 g), the pH and °Brix were monitored. Total counts of different microbial groups (mesophiles, coliforms, lactic-acid bacteria, acetic-acid bacteria, and yeasts) were performed. Various isolates of microorganisms of interest as starter cultures (lactic-acid bacteria and yeasts) were identified using molecular sequencing techniques. Results: 21 lactic-acid bacteria (LAB) isolates and 22 yeasts were obtained from the different mini-batch fermentation systems. The most abundant lactic-acid bacteria species found were Lactiplantibacillus plantarum (46%) and Levilactobacillus brevis (31%). Pichia kluivery (39%) and Torulaspora delbrueckii (22%) were the most abundant yeast species. Conclusion The studied factors did not have effect over the microorganism's development. The identified bacterial and yeasts species have potential as starter cultures for better-quality coffees and in fermentation-related applications.


Antecedentes: Los cafés suaves lavados colombianos son reconocidos a nivel mundial por su buena puntuación sensorial; sin embargo, se han detectado fallas en las prácticas de postcosecha, como lo es la fermentación de los granos de café. Dichas fallas pueden causar defectos y carecer de consistencia en la calidad del producto, ocasionando pérdidas económicas para los caficultores. En Colombia, uno de los métodos más usados por los caficultores es la fermentación húmeda, la cual consiste en sumergir los granos de café despulpado en tanques con agua por un período de tiempo que permita la remoción del mucílago. Objetivos: La presente investigación evaluó la incidencia que tienen la proporción agua/granos despulpados de café (I: 0/25, II: 10/25, III: 20/25) y el tiempo final de fermentación (24, 48 y 72 horas) en el recuento final de grupos microbianos. Por otra parte, se identificaron taxonómicamente microorganismos de interés para su uso como cultivos iniciadores. Métodos: Mini-lotes consistieron en café despulpado (1950 g) puesto en recipientes de plástico abiertos y sumergidos en agua. Se aplicó un diseño experimental completamente aleatorizado de dos factores (proporción agua/ granos de café despulpado y tiempo) a tres niveles, para un total de nueve tratamientos con dos replicas. Durante las fermentaciones de café (1,950 g), el pH y los grados ºBrix, fueron monitoreados. Se realizaron los recuentos totales de los diferentes grupos microbianos: mesófilos, coliformes, bacterias ácido-lácticas, bacterias ácido-acéticas y levaduras. Se identificaron molecularmente diferentes aislados con potencial para ser usados como cultivos iniciadores (bacterias ácido-lácticas y levaduras). Resultados: Los resultados obtenidos mostraron que no hubo diferencia estádisticamente significativa entre los tratamientos aplicados y el recuento final de microorganismos. Un total de 21 aislados de bacterias ácido-lácticas (BAL) y 22 levaduras lograron obtenerse a partir de los diferentes sistemas de fermentación en mini-lote. Las especies de bacterias ácido-lácticas con mayor porcentaje acorde a su identificación taxonómica, corresponden a Lactiplantibacillus plantarum (46%), Levilactobacillus brevis (31%). Las especies de levaduras con mayor porcentaje acorde a su identificación taxonómica corresponden a Pichia kluivery (39%) y Torulaspora delbrueckii (22%). Conclusión Los factores estudiados no afectaron el crecimiento de ninguno de los grupos microbianos presentes en la fermentacion del café. Las especies de microorganismos identificados tienen potencial para se usados como cultivos starter o en aplicaciones dentro de las ciencias de fermentación.


Subject(s)
Humans , Fermentation , Yeasts , Microbiological Techniques , Coffea , Lactobacillales
2.
Antonie Van Leeuwenhoek ; 117(1): 43, 2024 Feb 27.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-38413427

ABSTRACT

As part of a long-term study aiming to isolate and identify yeast species that inhabit the surface of leaves and fruits of native fine-aroma cacao in the department of Amazonas, Peru, we obtained multiple isolates of Hannaella species. Yeasts of the genus Hannaella are common inhabitants of the phyllosphere of natural and crop plants. On the basis of morphological, and physiological characteristics, and sequence analysis of the D1/D2 domains of the large subunit rRNA gene (LSU) and the internal transcribed spacer region (ITS), we identified five species of Hannaella from the phyllosphere of Peruvian cacao. Four have been previously described: H. phyllophila (isolates KLG-073, KLG-091), H. pagnoccae (KLG-076), H. sinensis (KLG-121), and H. taiwanensis (KLG-021). A fifth, represented by eight isolates (KLG-034, KLG-063, KLG-074, KLG-078, KLG-79, KLG-082, KLG-084, KLG-085), is not conspecific with any previously described Hannaella species, and forms the sister clade to H. surugaensis in the phylogenetic analysis. It has 2.6-3.9% (18-27 substitutions, 2-4 deletions, and 1-3 insertions in 610-938 bp-long alignments), and 9.8-10.0% nucleotide differences (37 substitutions and 14 insertions in 511-520 bp-long alignments) in the LSU and ITS regions, respectively, to H. surugaensis type strain, CBS 9426. Herein, the new species Hannaella theobromatis sp. nov. is described and characterised. The species epithet refers to its epiphytic ecology on its host Theobroma cacao.


Subject(s)
Basidiomycota , Cacao , Cacao/genetics , Phylogeny , Peru , DNA, Ribosomal Spacer/genetics , Fruit , Plant Leaves , Basidiomycota/genetics , DNA, Fungal/genetics , Sequence Analysis, DNA , Mycological Typing Techniques , Thailand
3.
Rev. peru. biol. (Impr.) ; 30(4)oct. 2023.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1530342

ABSTRACT

El Pisco es el destilado del Perú, elaborado a partir de mostos recientemente fermentados con uvas criollas denominadas "pisqueras". Las levaduras son los microorganismos clave en la fermentación y el uso de cepas nativas seleccionadas presenta ventajas competitivas para la tipicidad del producto, así como también para la estandarización del producto y el control microbiológico del proceso. El objetivo fue identificar y seleccionar las cepas de levaduras nativas para la producción del Pisco de uva Quebranta aisladas de procesos productivos de Pisco en el valle de Ica. Para ello, se emplearon técnicas microbiológicas y moleculares mediante el análisis de ITS1-5.8S-ITS2 PCR-RFLP para la identidad taxonómica. La evaluación de las cepas para producir Pisco consistió en el análisis fisicoquímico y organoléptico del destilado obtenido con las cepas seleccionadas. Se evaluaron 3 aislados para la producción de Pisco identificados como Saccharomyces cerevisiae: UNA SC - 25, UNA SC - 49 y UNA SC - 54, de los cuales la cepa UNA SC-49 destacó por mostrar aptitudes enológicas diferentes a las otras cepas. Este trabajo constituye el primer registro de levaduras nativas del Perú para mostos procedentes de uva Quebranta.


El Pisco stands as Peru's distilled spirit, crafted from recently fermented musts derived from native grape varieties known as "pisqueras". Yeasts serve as decisive microorganisms in the fermentation process, and the utilization of selected native strains confers competitive advantages for product typicity, standardization, and microbiological control within the production process. The aim was to identify and select native yeast strains for Quebranta grape Pisco production, isolated from Pisco production processes in the Ica Valley. Microbiological and molecular techniques were employed, utilizing ITS1-5.8S-ITS2 PCR-RFLP analysis for taxonomic identification. The assessment of yeast strains for Pisco production involved the physicochemical and organoleptic analysis of the distilled product obtained using the selected strains. Three isolates were evaluated for Pisco production, identified as Saccharomyces cerevisiae: UNA SC - 25, UNA SC - 49, and UNA SC - 54. Among these, the UNA SC-49 strain stood out due to displaying oenological characteristics distinct from the other strains. This work is the first documentation of native yeasts in Peru for musts derived from Quebranta grapes.

4.
Arq. Ciênc. Vet. Zool. UNIPAR (Online) ; 26(1cont): 152-166, jan.-jun. 2023.
Article in Portuguese | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1437898

ABSTRACT

As leveduras são fungos de importância à medicina veterinária por causarem doenças infecciosas em diferentes hospedeiros animais. A presente revisão de literatura teve como objetivo relatar os principais testes bioquímicos capazes de auxiliar na identificação de fungos leveduriformes de interesse veterinário e zoonótico. Para o levantamento bibliográfico, foram consideradas 48 publicações científicas selecionadas na área e indexadas nas principais bases de dados, entre os anos de 1988 e 2020. Como resultados, observou-se que oito provas são as mais empregadas na rotina micológica. Devido à baixa variabilidade morfológica das espécies leveduriformes, testes bioquímicos complementares são fundamentais na rotina laboratorial. A análise do perfil bioquímico de leveduras contribui na determinação taxonômica dos fungos a partir de reações químicas, visto que o metabolismo varia de acordo com a espécie, resultando em metabólitos distintos, os quais podem ser avaliados por diferentes provas. Conclui-se que a identificação fenotípica das leveduras é imprescindível no diagnóstico, prognóstico, tratamento e controle de doenças fúngicas e contribui para a manutenção da saúde animal.(AU)


Yeasts are fungi of importance to veterinary medicine because they cause infectious diseases in different animal hosts. This literature review aimed to report the main biochemical tests capable of assisting in the identification of yeast-like fungi of veterinary and zoonotic interest. For the bibliographical survey, 48 selected scientific publications in the area and indexed in the main databases, between the years 1988 and 2020, were considered. As a result, it was observed that eight tests are the most used in the mycological routine. Due to the low morphological variability of yeast species, complementary biochemical tests are fundamental in the laboratory routine. The analysis of the biochemical profile of yeast contributes to the taxonomic determination of fungi based on chemical reactions, since the metabolism varies according to the species, resulting in different metabolites, which can be evaluated by different tests. It is concluded that the phenotypic identification of yeasts is essential in the diagnosis, prognosis, treatment and control of fungal diseases and contributes to the maintenance of animal health.(AU)


Las levaduras son hongos de importancia para la medicina veterinaria porque causan enfermedades infecciosas en diferentes animales huéspedes. Esta revisión de la literatura tuvo como objetivo informar las principales pruebas bioquímicas capaces de ayudar en la identificación de hongos tipo levadura de interés veterinario y zoonótico. Para el levantamiento bibliográfico se consideraron 48 publicaciones científicas seleccionadas en el área e indexadas en las principales bases de datos, entre los años 1988 y 2020. Como resultado se observó que ocho pruebas son las más utilizadas en la rutina micológica. Debido a la baja variabilidad morfológica de las especies de levaduras, las pruebas bioquímicas complementarias son fundamentales en la rutina del laboratorio. El análisis del perfil bioquímico de la levadura contribuye a la determinación taxonómica de los hongos en base a reacciones químicas, ya que el metabolismo varía según la especie, dando como resultado diferentes metabolitos, los cuales pueden ser evaluados mediante diferentes pruebas. Se concluye que la identificación fenotípica de levaduras es fundamental en el diagnóstico, pronóstico, tratamiento y control de enfermedades fúngicas y contribuye al mantenimiento de la salud animal.(AU)


Subject(s)
Yeasts/classification , Biochemical Phenomena , Biomarkers/analysis
5.
Biomédica (Bogotá) ; 43(Supl. 1): 77-88, 2023. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1533901

ABSTRACT

Introducción. El 65 % de las infecciones humanas son producidas por bacterias o levaduras, cuya capacidad de formar biopelículas las hace más resistentes a los antimicrobianos y antifúngicos. Objetivo. Determinar la capacidad de formación de biopelículas en aislamientos bacterianos y fúngicos por medio de los métodos cuantitativo de microtitulación con cristal violeta y cualitativo de cultivo en agar con rojo Congo. Materiales y métodos. Con el método cuantitativo, se utilizaron los medios de cultivo infusión cerebro-corazón, tripticasa de soya y Müeller-Hinton para aislamientos bacterianos; para levaduras, se usaron caldo infusión cerebro-corazón y Sabouraud dextrosa. Para el método cualitativo de cultivo en agar, se utilizaron los mismos medios de cultivo más una solución con 3 % de rojo Congo y 10 % de dextrosa. Cómo método de referencia, se utilizó la propuesta de Stepanovic et al. Resultados. Se evaluaron 103 aislamientos bacterianos y 108 de levaduras. No es recomendable sustituir el caldo infusión cerebro-corazón por los caldos tripticasa de soya y Müeller-Hinton en el método cuantitativo, para evaluar la formación de biopelículas en los aislamientos bacterianos. El medio Sabouraud dextrosa, en caldo y agar, puede sustituir al de infusión de cerebro-corazón para evaluar la formación de biopelículas en levaduras, tanto por el método cuantitativo como por el cualitativo. Conclusión. El estudio de las biopelículas en el laboratorio de microbiología, a partir del método cualitativo de cultivo en agar con rojo Congo, es un procedimiento sencillo, rápido y de bajo costo, que proporciona información útil para el diagnóstico y la terapéutica de infecciones persistentes causadas por bacterias y levaduras.


Introduction. Sixty-five percent of human infections are caused by bacteria or yeasts able to form biofilms. This feature makes them more resistant to antimicrobials and antifungals. Objective. To determine biofilm formation capacity of bacterial and fungal isolates by quantitative crystal violet microtiter and qualitative Congo red agar methods. Materials and methods. Brain-heart infusion, trypticase soy broth and Müeller-Hinton culture media were used in bacterial isolates for the quantitative method; brain-heart infusion broth and Sabouraud dextrose were used for yeasts. The same culture media plus 3% Congo red and 10% dextrose were used to apply the qualitative method in agar. The proposal by Stepanovic, et al. was used as a reference method. Results. We evaluated 103 bacterial isolates and 108 yeasts isolates. We did not recommend substitute brain-heart infusion broth for trypticase soy and Müeller-Hinton broths for biofilm formation assessment in bacterial isolates using the quantitative method. Sabouraud dextrose medium, both broth and agar, can replace brain-heart infusion to assess biofilm formation in yeasts, quantitatively and qualitatively. Conclusion. The study of biofilms in the microbiology laboratory, using Congo red agar qualitative method, is a simple, fast, and inexpensive procedure that provides precise information for the diagnosis and treatment of persistent infections caused by bacteria and yeasts.


Subject(s)
Gram-Negative Bacteria , Gram-Positive Bacteria , Yeasts , Biofilms , Congo Red
6.
MedUNAB ; 25(3): [441-450], 01-12-2022.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1437186

ABSTRACT

Introducción. Los billetes son un potencial medio de transmisión de microorganismos capaces de producir enfermedades. Es el caso del Staphylococcus aureus, una bacteria distribuida por toda América Latina, causante de infecciones y resistente a antibióticos de uso común. El objetivo del estudio es realizar una caracterización bacteriana y fúngica de billetes circulantes en la ciudad de Bucaramanga, y en especial identificar algunos que puedan relacionarse con problemas de salud pública. Metodología. Estudio observacional y cuantitativo, con una muestra de 50 billetes (5 diferentes denominaciones de 2 fechas de emisión). Se identificaron y cuantificaron los microorganismos mediante siembra en caldo peptona, posteriormente en agar Reasoner´s 2A (R2A), nutritivos y selectivos, además del uso de técnicas de índice analítico de perfil (API) y microscopia óptica. Se realizó un análisis estadístico de correlación de variables mediante el software Statistical Package for the Social Sciences (SPSS). Resultados. Se identificaron 21 géneros y 12 especies de bacterias, así como 3 géneros y 2 especies de hongos filamentosos, entre ellos algunos que pueden ocasionar infecciones como Klesiella, Enterobacter, Listeria, Staphylococcus, Cryptococcus y Aspergillus. Discusión. En relación con estudios internacionales, en este trabajo se identificaron menos tipologías de microorganismos, lo cual se explica en razón a las limitaciones propias de las técn icas utilizadas y del nivel de contaminación local. Conclusión. Se pudo establecer que el grado de contaminación microbiana no depende significativa o consistentemente de la fecha de emisión ni de la denominación; pero la identificación de patógenos sugiere plantear medidas para limitar su transmisión por esta vía.


Introduction. Banknotes are a potential means of transmission of microorganisms capable of producing diseases. This is the case of Staphylococcus aureus, a bacterium distributed throughout Latin America, which causes infections and is resistant to commonly used antibiotics. The objective of the study is to perform a bacterial and fungal characterization of banknotes circulating in the city of Bucaramanga, and especially to identify some that may be related to public health problems. Methodology. Observational and quantitative study, with a sample of 50 banknotes (5 different denominations of 2 issue dates). Microorganisms were identified and quantified by seeding in peptone broth, then on Reasoner's 2A agar (R2A), nutrient and selective, in addition to the use of analytical profile index (API) and light microscopy techniques. A statistical analysis of correlation of variables was performed using the Statistical Package for the Social Sciences (SPSS) software. Results. Twenty-one genera and 12 species of bacteria were identified, as well as 3 genera and 2 species of filamentous fungi, including some that can cause infections such as Klesiella, Enterobacter, Listeria, Staphylococcus, Cryptococcus, and Aspergillus. Discussion. In comparison with international studies, this study identified fewer types of microorganisms, which is explained by the limitations of the techniques used and the level of local contamination. Conclusion. It was possible to establish that the degree of microbial contamination does not depend significantly or consistently on the date of issue or the denomination; but the identification of pathogens suggests that measures should be taken to limit their transmission by this ro ute.


Introdução. As notas são um meio potencial de transmissão de microrganismos capazes de produzir doenças. É o caso do Staphylococcus aureus, bactéria distribuída por toda a América Latina, causadora de infecções e resistente aos antibióticos comumente utilizados. O objetivo do estudo é realizar uma caracterização bacteriana e fúngica das notas em circulação na cidade de Bucaramanga e, principalmente, identificar algumas que possam estar relacionadas a problemas de saúde pública. Metodologia. Estudo observacional e quantitativo, com uma amostra de 50 notas (5 denominações diferentes de 2 datas de emissão). Os microrganismos foram identificados e quantificados por meio de semeadura em caldo peptonado, depois em ágar Reasoner 2A (R2A), nutritivo e seletivo, além da utilização de índice de perfil analítico (API) e técnicas de microscopia óptica. Foi realizada uma análise estatística de correlação das variáveis por meio do software Statistical Package for the Social Sciences (SPSS). Resultados. Foram identificados 21 gêneros e 12 espécies de bactérias, além de 3 gêneros e 2 espécies de fungos filamentosos, incluido alguns que podem causar infecções como Klesiella, Enterobacter, Listeria, Staphylococcus, Cryptococcus e Aspergillus. Discussão. Em relação aos estudos internacionais, neste trabalho foram identificados menos tipos de microrganismos, o que se explica pelas limitações das técnicas utilizadas e pelo nível de contaminação local. Conclusão. Foi possível estabelecer que o grau de contaminação microbiana não depende de forma significativa ou consistente da data de emissão ou da denominação; mas a identificação de patógenos sugere considerar medidas para limitar sua transmissão por essa via.


Subject(s)
Epidemiology , Bacteria , Yeasts , Cross Infection , Fomites
7.
Medisur ; 20(2)abr. 2022.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1405903

ABSTRACT

RESUMEN Fundamento: en los laboratorios de microbiología, la identificación y conteo de microorganismos es un procedimiento habitual. Aunque existen en el mercado equipos que posibilitan su realización de manera automática o semiautomática, son muy costosos, por lo cual esta tarea, difícil e irritante para los ojos, la siguen realizando los expertos de manera tradicional mediante la observación de las muestras en los microscopios, con la consiguiente variabilidad entre ellos. Objetivo: proponer un nuevo método para el conteo de bacterias y levaduras en imágenes digitales, bajo diferentes magnificaciones, tomadas a bioproductos de origen microbiano obtenidos por fermentación. Métodos: el sensor empleado para la toma de imágenes de las muestras fue una cámara digital modelo HDCE-X, con un sensor CMOS de ½", con una resolución de 2592 píxeles por 1944 píxeles (5 Mp). Se emplearon dos tipos de magnificaciones: magnificación 40x (PL40, 0.65 apertura numérica and 0.17 de distancia de trabajo) y magnificación 100x (HI plan 100/1.25 con inmersión de aceite). El método propuesto se basa en técnicas de procesamiento digital de imágenes, utilizando herramientas como la detección de contornos, operaciones morfológicas y análisis estadístico, y fue desarrollado en lenguaje Python con empleo de la biblioteca OpenCV. Resultados: la detección y conteo de bacterias se logró con una exactitud y precisión aceptable, en ambos casos por encima de 0,95; no en el caso de las levaduras cuya exactitud y precisión fueron menores, alrededor de 0,78 y 0,86 respectivamente. Se proponen flujos de trabajo basados en técnicas de procesamiento digital de imágenes, fundamentalmente en detección de contornos, operaciones morfológicas y análisis estadístico. Conclusiones: el método posee una efectividad aceptable para el contexto y depende de las características que presenten las imágenes.


ABSTRACT Background: In microbiology laboratories, the identification and counting of microorganisms is a common procedure; and although there is a variety of equipment on the market that possibility to carry out these processes automatically or semi-automatically, it is usually expensive to many laboratories. These are some of the reasons why this arduous and difficult task is still performed in many laboratories by experts in the traditional way, through the observation of samples in microscope, consuming a great time and having variations in the results between experts. Objective: The present work aims to propose a new method for counting bacteria and yeasts in digital images, taken under different magnifications, of microbial bioproducts obtained by fermentation. Methods: The sensor used to take images of the samples was a digital camera model HDCE-X, with a ½" CMOS sensor, with a resolution of 2592 pixels by 1944 pixels (5 Mp). Two types of magnifications were used: 40x magnification (PL40, 0.65 numerical aperture and 0.17 working distance) and 100x magnification (HI plan 100/1.25 with oil immersion). The proposed method is based on digital image processing technics, using tools as contour detection, morphological operations and statistical analysis, and was developed in Python language using the OpenCV library. The work also presents a comparison with the results obtained using ImageJ software for the same purpose. Results: the detection and count of bacteria was achieved with an acceptable accuracy and precision, in both cases above 0.95; not in the case of yeasts whose accuracy and precision was lower, around 0.78 for accuracy and 0.86 for precision. Workflows based on digital image processing techniques are proposed, using tools as contour detection, morphological operations and statistical analysis. Conclusions: the method has an acceptable effectiveness for the context and depends on the characteristics presented by the images.

8.
Rev. iberoam. micol ; 39(1): 6-15, enero 2022. graf, tab
Article in Spanish | IBECS | ID: ibc-207093

ABSTRACT

AntecedentesLos lípidos obtenidos de microorganismos oleaginosos a partir de hidrolizados de residuos lignocelulósicos son una alternativa para la fabricación de biodiesel.ObjetivosAislar una levadura oleaginosa capaz de producir lípidos a partir de nejayote centrifugado (NC), hidrolizado de sólidos de nejayote (HSN) e hidrolizado de bagazo de caña de azúcar (HBC).MétodosPara identificar los aislamientos recuperados se secuenció el ADN ribosómico 26S. La capacidad metabólica se evaluó mediante tiras API20C AUX. La caracterización nutricional del NC, HSN y HBC se realizó cuantificando azúcares reductores, carbohidratos totales, almidón, proteína y nitrógeno total. La capacidad de producción de biomasa y lípidos de la cepa Clavispora lusitaniae Hi2 se evaluó mediante cinéticas de crecimiento en medios de cultivo formulados a partir de NC, HSN y HBC.ResultadosSe aislaron e identificaron seis cepas de levaduras oleaginosas, siendo C. lusitaniae Hi2 seleccionada para producir lípidos mediante el uso de nejayote. Dicha cepa puede utilizar glucosa, xilosa, arabinosa, galactosa y celobiosa como fuentes de carbono. Los cultivos de C. lusitaniae Hi2 en medio con NC y HSN (en relación 25:75) presentaron la mayor producción de biomasa, 5,6 ± 0,28 g/L; la mayor producción de lípidos, 0,99±0,09 g/L, se obtuvo con una relación 50:50 de estos residuos a las 20 h de incubación.ConclusionesLa utilización de NC, HSN y HBC para el crecimiento de C. lusitaniae Hi2 es una opción para el aprovechamiento de estos residuos y la generación de compuestos de interés biotecnológico. (AU)


BackgroundSingle-cell oils obtained from oleaginous microorganisms by using lignocellulosic waste hydrolysates are an alternative for producing biodiesel.AimsTo isolate a yeast strain able to produce lipids from centrifuged nejayote (CN), hydrolyzed nejayote solids (HNS) and hydrolyzed sugarcane bagasse (HSB).MethodsIn order to identify the yeasts recovered, 26S ribosomal DNA was sequenced. The metabolic profile was assessed by using API20C AUX strips. The nutritional characterization of CN, HNS and HSB was performed by quantifying reducing sugars, total carbohydrates, starch, protein and total nitrogen. The biomass and lipid production ability were evaluated by performing growth kinetics of Clavispora lusitaniae Hi2 in combined culture media.ResultsSix oleaginous yeast strains were isolated and identified, selecting C. lusitaniae Hi2 to study its lipids production by using nejayote. The C. lusitaniae Hi2 strain can use glucose, xylose, arabinose, galactose and cellobiose as carbon sources. Cultures of C. lusitaniae Hi2 presented the best biomass (5.6±0.28 g/L) and lipid production (0.99±0.09 g/L) at 20 h of incubation with the CN:HNS media in the 25:75 and 50:50 ratios, respectively.ConclusionsThe use of CN, HNS and HSB for the growth of C. lusitaniae Hi2 is an option to take advantage of these agro-industrial residues and generate compounds of biotechnological interest. (AU)


Subject(s)
Humans , Cellulose/metabolism , Lipids , Saccharomycetales , Saccharum , Yeasts
9.
Rev Iberoam Micol ; 39(1): 6-15, 2022.
Article in Spanish | MEDLINE | ID: mdl-34857452

ABSTRACT

BACKGROUND: Single-cell oils obtained from oleaginous microorganisms by using lignocellulosic waste hydrolysates are an alternative for producing biodiesel. AIMS: To isolate a yeast strain able to produce lipids from centrifuged nejayote (CN), hydrolyzed nejayote solids (HNS) and hydrolyzed sugarcane bagasse (HSB). METHODS: In order to identify the yeasts recovered, 26S ribosomal DNA was sequenced. The metabolic profile was assessed by using API20C AUX strips. The nutritional characterization of CN, HNS and HSB was performed by quantifying reducing sugars, total carbohydrates, starch, protein and total nitrogen. The biomass and lipid production ability were evaluated by performing growth kinetics of Clavispora lusitaniae Hi2 in combined culture media. RESULTS: Six oleaginous yeast strains were isolated and identified, selecting C. lusitaniae Hi2 to study its lipids production by using nejayote. The C. lusitaniae Hi2 strain can use glucose, xylose, arabinose, galactose and cellobiose as carbon sources. Cultures of C. lusitaniae Hi2 presented the best biomass (5.6±0.28 g/L) and lipid production (0.99±0.09 g/L) at 20 h of incubation with the CN:HNS media in the 25:75 and 50:50 ratios, respectively. CONCLUSIONS: The use of CN, HNS and HSB for the growth of C. lusitaniae Hi2 is an option to take advantage of these agro-industrial residues and generate compounds of biotechnological interest.


Subject(s)
Cellulose , Saccharum , Cellulose/metabolism , Lipids , Saccharomycetales , Yeasts
10.
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-1341785

ABSTRACT

La levadura metilotrófica Pichia pastoris (clasificada actualmente como Komagataella phaffii) es una de las más importantes para la producción de proteínas heterólogas. En el trabajo se presenta un análisis de las principales características que se ponen de manifiesto en la expresión de proteínas recombinantes expresadas en este microorganismo. Se describen las cepas disponibles para la transformación y producción de proteínas recombinantes expresadas en Pichia pastoris, los principales vectores comerciales para la expresión, los promotores más eficientes, los marcadores seleccionables, la señal de secreción, los métodos usados en las transformaciones genéticas y los patrones de glicosilación que se presentan. Se brindan recomendaciones generales acerca de los parámetros de bioprocesos como la composición del medio, el pH, la temperatura, la velocidad de aireación, la inducción y las estrategias de alimentación para alcanzar altos valores de productividad. Se presentan los resultados de las aplicaciones de Pichia pastoris en la producción de dos vacunas en Cuba, la vacuna contra la hepatitis B y la vacuna para el control de la garrapata(AU)


Pichia pastoris metylotrofic yeast (currently classified as Komagataella phaffii) is one of the most important yeast for the production of heterologous proteins. The work presents an analysis of the main characteristics that are marked in the production of recombinant proteins expressed in Pichia pastoris. It describes the strains available for the transformation and production of recombinant proteins expressed in P. pastoris, the main commercial vectors for expression, the most efficient promoters, selectable markers, the secretion signal, the methods used in genetic transformations and glycosylation patterns that occur. General recommendations are provided on bioprocess parameters such as media composition, pH, temperature, aeration velocity, induction, and feeding strategies to achieve high productivity values. The results of Pichia pastoris applications for the production of two vaccines in Cuba, the hepatitis B vaccine and the tick control vaccine are shown(AU)


Subject(s)
Pichia , Yeasts , Recombinant Proteins , Protein Engineering , Tick Control/methods , Hepatitis B Vaccines/therapeutic use , Cuba
11.
Rev. chil. infectol ; 38(4): 558-561, ago. 2021. ilus
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1388272

ABSTRACT

Resumen Una de las obras, probablemente menos conocidas, de Antoine van Leeuwenhoek (1632-1723) es su Arcana naturae detecta (Secretos detectados de la naturaleza) publicada en su primera edición en 1695. Esta obra es una recopilación de 38 cartas sobre temas científicos y está bellamente ilustrada. Una sección notable de ella es la observación y descripción por primera vez de levaduras de la fermentación y sus experimentos sobre la generación espontánea de microorganismos.


Abstract One of the works, probably less known, of Antoine van Leeuwenhoek (1632-1723) is his Arcana naturae detecta (Detected secrets of nature) published in its first edition in 1695. This work is a compilation of 38 letters on scientific issues and it is beautifully illustrated. A notable section of the work is the observation and description for the first time of fermentation yeasts and his experiments on the spontaneous generation of microorganisms.


Subject(s)
History, 17th Century , Microbiology/history , Yeasts , Fermentation , Microscopy/history
12.
Rev Iberoam Micol ; 38(2): 42-46, 2021.
Article in Spanish | MEDLINE | ID: mdl-34294519

ABSTRACT

Invasive fungal infections have increased over the last decades and the therapeutic choices to treat them are limited. The antifungal agents currently available are useful and have optimal in vitro activity; however, their activity can be lowered due to the development of fungal resistance. The increase in primary or secondary resistance to some antifungal drugs has led to the search of alternatives such as the combination of drugs or the development of new antifungals. In this paper, the activity of the main families of antifungal drugs, polyenes, azoles, echinocandins, 5-fluorocytosine and other new antifungal drugs, are reviewed. The main resistance mechanisms developed by fungi are also described.


Subject(s)
Mycoses , Pharmaceutical Preparations , Antifungal Agents/pharmacology , Antifungal Agents/therapeutic use , Azoles , Echinocandins , Humans , Mycoses/drug therapy
13.
Rev Iberoam Micol ; 38(4): 180-183, 2021.
Article in Spanish | MEDLINE | ID: mdl-34301465

ABSTRACT

BACKGROUND: Although considered an unusual etiological agent, Cyberlindnera(Candida)fabianii has been related to septicemia in several reports in recent years. Its doubtful or uncertain identification when using tests such as CHROMagar Candida, API® Candida, API® ID32C or VITEK® MS, leads to an underestimation of the cases produced by this yeast. AIMS: To report the first isolation of C. fabianii in Chile and its identification. METHODS: The sequencing of the internal transcribed spacer region (ITS) was performed. Antifungal susceptibility profiles were obtained by means of the broth microdilution technique. RESULTS: The identification was only reached by sequencing the ITS regions, which shows the limited usefulness of the conventional techniques in the identification of some yeast species. A dendrogram shows the phylogenetic relationship of the isolated strain with some other yeast species. CONCLUSION: In the identification of fastidious microorganisms or microorganisms whose identification is not completely reliable when using classical or even advanced methodologies, such as mass spectrometry, sequencing techniques are essential.


Subject(s)
Saccharomycetales , Antifungal Agents , Candida , Chile , Phylogeny
14.
Rev Argent Microbiol ; 53(4): 359-377, 2021.
Article in Spanish | MEDLINE | ID: mdl-33674169

ABSTRACT

Yeasts play a crucial role in brewing. During fermentation, besides ethanol and carbon dioxide, yeasts produce a considerable number of organic compounds, which are essential for beer flavor. In particular, Saccharomyces cerevisiae and Saccharomyces pastorianus are traditionally used in the production of ale and lager beers, respectively. Nowadays, the continuous growth of the craft beer market motivates the production of differential and innovative beers; leading specialists and brewers focus on non-conventional yeasts as tools for new product development. In this work, we describe the potential application of non-conventional yeast species such as those of the genera Brettanomyces, Torulaspora, Lachancea, Wickerhamomyces, Pichia and Mrakia in the craft brewing industry, as well as non-traditional brewing yeasts of the Saccharomyces genus. Furthermore, the fermentation conditions of these non-conventional yeasts are discussed, along with their abilities to assimilate and metabolize diverse wort components providing differential characteristics to the final product. In summary, we present a comprehensive review of the state-of-the-art of non-conventional yeasts, which is highly relevant for their application in the production of novel craft beers including flavored beers, non-alcoholic beers, low-calorie beers and functional beers.


Subject(s)
Beer , Yeasts , Beer/analysis , Fermentation , Flavoring Agents , Pichia , Saccharomyces cerevisiae
15.
Rev. epidemiol. controle infecç ; 10(3): 1-16, jul.-set. 2020. ilus
Article in English | LILACS | ID: biblio-1247638

ABSTRACT

Justificativa e Objetivos: A candidíase oral tem uma ocorrência comum em pacientes imunocomprometidos. No entanto, outras infecções emergentes tornaram-se cada vez mais habituais. O objetivo deste estudo foi investigar a prevalência, os determinantes de virulência e a suscetibilidade a antifúngicos de leveduras que colonizam a mucosa de pacientes imunocomprometidos na região Nordeste do Brasil. Métodos: A amostra foi composta por 60 pacientes HIV positivos atendidos no Serviço de Atendimento Especializado/Hospital Dia do Hospital Universitário Prof. Alberto Antunes, vinculado à Universidade Federal de Alagoas. As amostras foram coletadas em regiões subgengivais e semeadas em CHROMagar para confirmação presuntiva de Candida spp., seguido por PCR e sequenciamento. Além disso, testamos os determinantes de virulência fosfolipase e protease e avaliamos in vitro a concentração inibitória mínima dos antifúngicos anfotericina B e fluconazol. Este projeto foi aprovado pelo Comitê de ética em pesquisa do Centro de Estudos Superiores de Maceió. Resultados: Aproximadamente 63% dos pacientes foram colonizados por leveduras. A espécie C. albicans foi predominante, enquanto as espécies de Candida não-albicans representaram 49% dos isolados, sendo C. dubliniensis e C. parapsilosis as mais comuns. Entretanto, C. intermedia, Bullera penniseticola e Naganishia liquefaciens também foram encontrados. Os determinantes da virulência protease e/ou fosfolipase também foram produzidos por Candida spp. e alguns isolados oportunistas incomuns como Kodamaea ohmeri, N. liquefaciens e Saitozyma podzolica. Além disso, a maioria dos isolados de Candida spp. e algumas espécies oportunistas incomuns apresentaram altos valores de concentração inibitória mínima. Conclusão: Os resultados obtidos indicam que C. albicans continua a ser a espécie predominante na cavidade oral de pacientes imunodeficientes e, juntamente com outras espécies incomuns, pode apresentar alta resistência aos antifúngicos testados.(AU)


Background and Objectives: Oral candidiasis has a common occurrence in immunocompromised patients. However, other emergent infections have become increasingly common. The aim of this study was to investigate the prevalence, virulence determinants and the antifungal susceptibility of yeast colonizing the mucosa of immunocompromised patients in Northeastern Brazil. Methods: Samples from sixty HIV-positive patients seen at the Specialized Service / Hospital Dia - Hospital Universitário Prof. Alberto Antunes from the Federal University of Alagoas were collected from subgingival sites and seeded on CHROMagar for presumptive confirmation of Candida spp. followed by PCR and sequencing. In addition, we tested virulence determinants, phospholipase and protease and evaluated in vitro the Minimum Inhibitory Concentration of antifungals amphotericin B and fluconazole. This project was approved by the Research Ethics Committee of the Center for Higher Studies in Maceió. Results: Approximately 63% of the patients were colonized by yeasts, with C. albicans as the predominant species, while non-Candida albicans species accounted for 49% of the isolates, with C. dubliniensis and C. parapsilosis being the commonest, but C. intermedia, Bullera penniseticola and Naganishia liquefaciens were also found. The virulence determinants protease and/or phospholipase were also produced by Candida spp. and some uncommon opportunistic isolates such as Kodamaea ohmeri, N. liquefaciens and Saitozyma podzolica. Furthermore, most of Candida spp. strains and some uncommon opportunistic species showed high values of minimal inhibitory concentration. Conclusion: Results obtained indicate that C. albicans continues to be the predominant species in oral cavity of immunodeficient patients and along with other unusual species may present high resistance to the antifungals tested.(AU)


Justificación y Objetivos: La candidiasis oral acomete con frecuencia a pacientes inmunocomprometidos. Sin embargo, otras infecciones emergentes se han vuelto cada vez más comunes. El objetivo de este estudio fue investigar la prevalencia, la producción de determinantes de virulencia y la susceptibilidad a antifúngicos de levaduras que colonizan la mucosa de pacientes inmunocomprometidos en la región Nordeste de Brasil. Métodos: Se colectaron muestras de sesenta pacientes VIH positivos atendidos en el Servicio de Atención Especializado/Hospital Día del Hospital Universitario Prof. Alberto Antunes, vinculado a la Universidad Federal de Alagoas. Se colectaron las muestras en las regiones subgingivales y las sembraron en CHROMagar para la presunta confirmación de Candida spp. seguido de PCR y secuenciación. Además, analizamos los determinantes de virulencia fosfolipasa y proteasa y evaluamos in vitro la concentración mínima inhibitoria de los antifúngicos anfotericina B y fluconazol. Este proyecto fue aprobado por el Comité de Ética en Investigación del Centro de Estudios Superiores de Maceió. Resultados: Aproximadamente el 63% de los pacientes fueron colonizados por levaduras, y la C. albicans fue la especie predominante, mientras que las especies de Candida no-albicans representaron el 49% de los aislamientos, de las cuales la C. dubliniensis y la C. parapsilosis fueron las más comunes. Sin embargo, también se encontraron C. intermedia, Bullera penniseticola y Naganishia liquefaciens. Los determinantes de virulencia de proteasa y/o fosfolipasa también fueron producidos por Candida spp. y algunos aislados oportunistas inusuales como Kodamaea ohmeri, N. liquefaciens y Saitozyma podzolica. Además, la mayoría de los asilados de Candida spp. y algunas especies oportunistas inusuales mostraron valores altos de concentración mínima inhibitoria. Conclusión: Los resultados obtenidos indican que C. albicans continúa siendo la especie predominante en la cavidad oral de pacientes inmunodeprimidos y, junto con otras especies poco comunes, puede presentar una alta resistencia a los antifúngicos evaluados.(AU)


Subject(s)
Humans , Virulence , Yeasts/virology , Candida , Candidiasis, Oral , Virulence Factors , Immunologic Deficiency Syndromes , Antifungal Agents , Prevalence , Acquired Immunodeficiency Syndrome
16.
CienciaUAT ; 14(2): 133-145, ene.-jun. 2020. tab, graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1124389

ABSTRACT

Resumen Los probióticos favorecen el desarrollo de microorganismos benéficos en el rumen, lo que incrementa la digestibilidad de los nutrientes y mejora el desempeño productivo de los rumiantes; con esto, se tiene la posibilidad de utilizar ingredientes como el rastrojo de maíz de relativo bajo valor nutritivo, pero altamente disponible en algunos lugares a bajo precio. Convencionalmente, se utilizan como probióticos las levaduras Saccharomyces, aunque existen reportes sobre el uso de cepas autóctonas, como Candida norvegensis. El objetivo de este estudio fue evaluar los efectos del probiótico de Candida norvegensis en la degradabilidad ruminal in situ de rastrojo de maíz y en el comportamiento productivo de ovinos en crecimiento. La levadura Candida norvegensis (cepa Levazoot 15) [0 g (T1) y 5 g (T2)] se usó para determinar la degradación ruminal in situ (DRMS), del rastrojo de maíz, en 3 vacas canuladas ruminalmente por medio de la técnica de la bolsa de poliéster. No hubo efecto de la levadura (P > 0.05) para la fracción (a), (b) y (a+b); pero la degradabilidad efectiva al 1 %/h y 5 %/h de recambio ruminal fue mayor para T2 (P < 0.05). En un segundo experimento, 32 corderos se asignaron al azar a corrales individuales por 105 d para evaluar 4 dietas que difirieron en la proporción de concentrado/ forraje: T1 = 75:25, T2 = 75:25, T3 = 50:50, y T4 = 25:75. A excepción de T1, las dietas fueron suplementadas con Candida norvegensis, a razón de 15 mL/kg de peso vivo, equivalente a 5 g/d de levadura en base seca. Los ovinos en la dieta con 75 % de concentrado más la levadura (T2) presentaron mayor ganancia de peso, y mejor conversión alimenticia (P < 0.05). Se concluye que Candida norvegensis mostró efectos benéficos en la degradabilidad ruminal y en el desarrollo de corderos.


Abstract Probiotics assist in the development of beneficial microorganisms in the rumen that increase digestibility of nutrients and improves the productive performance of ruminants; it also has the possibility of using ingredients as corn stover of relatively low nutritional value, but available in some places at low prices. Saccharomyces yeasts are conventionally used as pro biotics and there are reports that use native strains such as Candida norvegensis. The objective of this study was to evaluate the effects of the probiotic of Candida norvegensis on the in situ ruminal dry matter degradability of corn stover and on the productive performance of growing lambs. In the first experiment, the yeast Candida norvegensis (strain Levazoot 15) [0 g (T1)] and 5 g (T2) was used to determine the in situ ruminal dry matter degradation (RDMD) of the corn stover in 3 cows with cannulas in the rumen, which was determined by the polyester bag technique. There was no effect of yeast (P > 0.05) on fraction (a), (b) and (a+b). However, the effective degradability at 1 %/h and 5 %/h of ruminal turnover was higher in T2 (P < 0.05). In the second experiment, 32 lambs were randomly assigned to individual pens for 105 d to evaluate 4 diets that differed in the proportion of concentrate: forage: T1 = 75: 25, T2 = 75:25; T3 = 50: 50, and T4 = 25: 75. With the exception of T1, the diets were supplemented with Candida norvegensis at 15 mL/kg of live weight, equivalent to 5 g/d of yeast in dry matter basis. The lambs in the diet with 75 % of concentrate plus the yeast (T2) showed greater weight gain and best feed conversion (P < 0.05). It is concluded that Candida norvegensis showed beneficial effects on ruminal degradability and on the growth of lambs.

17.
Rev. colomb. cienc. pecu ; 33(1): 5-15, Jan.-Mar. 2020. tab
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1156299

ABSTRACT

Abstract Background: The yeasts of the genus Malassezia are considered part of the normal skin microbiota in humans and animals. In horses, several species of the genus Malassezia have been reported in different areas of the skin and ear canal. Objective: Isolate, characterize and identify the different species belonging to the genus Malassezia isolated from the ear canal and skin of equine patients with no dermatological lesions that were referred to the large animal clinic of veterinary teaching hospital at the National University of Colombia. Methods: 22 horses were evaluated and sampled. Eighty-two samples were obtained by swabbing either the ear canals (left and right), skin areas of prepuce, mammary gland and inguinal region. The samples were examined by cytological evaluation and were cultured on modified Dixon's agar and phenotypic and molecular identification were performed for yeast colonies. Results: Fourteen yeast isolates were obtained from the 82 samples. Biochemical identification determined that 50% (n=7) were Malassezia spp., 35.7% (n=5) were identified as Candida spp. and 14.3% (n=2) as Cryptococcus spp.. Using molecular tests, the Malassezia species were M. slooffiae (28.6%) and M.nana (57.1%); only one isolate was classified as Trichosporo asahii. Conclusion: M.nana and M. slooffiae were identified as part of the normal ear canal and skin microbiota in the evaluated horses. The observed prevalence of Malassezia spp. was 18.2% (n=4/22) in this study sample.


Resumen Antecedentes: Las levaduras del género Malassezia hacen parte de la microbiota normal cutánea de humanos y animales. En equinos se han reportado diferentes especies de Malassezia aisladas de varias regiones de piel y canal auditivo externo. Objetivo: Aislar, caracterizar e identificar las especies del género Malassezia spp. a partir de canal auditivo externo y piel de equinos sin lesiones dermatológicas, remitidos a la Clínica de Grandes Animales de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia de la Universidad Nacional de Colombia. Metodología: Se evaluaron 22 equinos, a partir de los cuales se obtuvieron 82 muestras entre hisopados de canal auditivo externo (izquierdo y derecho) y diferentes regiones de piel (prepucio, glándula mamaria e ingle). Las muestras fueron procesadas mediante examen directo y cultivo en agar Dixon modificado. A partir de los aislamientos en los que se observaron colonias morfológicamente compatibles con Malassezia spp. se realizó la identificación fenotípica y molecular. Resultados: De las 82 muestras procesadas se obtuvieron 14 aislamientos de levaduras, de las cuales mediante identificación bioquímica el 50% (n=7) correspondió a Malassezia spp., el 35,7% (n=5) a Candida spp., y el 14,3% (n=2) a Cryptococcus spp. Luego mediante pruebas moleculares se identificaron las especies del género Malassezia como: M. slooffiae (28,6%) y M . nana (57,1%); y un aislamiento correspondió a Trichosporon asahii. Conclusión: Se logró identificar las especies M.nana y M. slooffiae como microbiota normal de la piel y el canal auditivo en los equinos evaluados. La prevalencia de Malassezia spp. para la población evaluada fue de 18,2% (n=4/22).


Resumo Antecedentes: As leveduras do gênero Malassezia fazem parte da microbiota cutânea normal de humanos e animais. Em cavalos, diferentes espécies de Malassezia isoladas de várias regiões da pele e do canal auditivo externo foram reproduzidas. Objetivo: Isolar, caracterizar e identificar as espécies do gênero Malassezia spp. do canal auditivo externo e pele eqüinos sem lesões cutâneas, referiu-se à Clínica de Grandes Animais da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade Nacional da Colômbia. Métodos: 22 equinos foram avaliadas a partir dos quais 82 amostras a partir de esfregaços do canal auditivo externo (esquerda e direita) e diferentes regiões da pele (prepúcio, glândula mamaria e virilha) foram obtidos. As amostras foram processadas por exame direto e cultura em ágar Dixon modificado. Dos isolados nos quais as colônias foram observadas morfologicamente compatíveis com Malassezia spp. identificação fenotípica e molecular foi realizada. Resultados: Das 82 amostras processadas 14 isolados de levedura, que foram obtidos por identificação bioquímica de 50% (n=7) correspondia a Malassezia spp., 35,7% (n=5) a Candida spp., e 14,3% (n=2) para Cryptococcus spp.. Em seguida, usando o teste molecular espécie Malassezia foram identificadas como M. slooffiae (28,6%) e M . nana (57,1%); e um isolamento correspondia a Trichosporon asahii. Conclusão: As espécies M.nana e M. slooffiae foram identificadas como microbiota de pele normal e do canal auditivo nos equídeos avaliados. A prevalência de Malassezia spp. para a população avaliada foi 18,2% (n=4/22).

18.
Rev. chil. infectol ; 36(6): 742-749, dic. 2019. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1058106

ABSTRACT

Resumen Introducción: La pitiriasis versicolor es una patología frecuente en Paraguay; sin embargo, su epidemiologia es desconocida. Objetivo: Determinar la frecuencia de especies de Malassezia causantes de pitiriasis versicolor y las características epidemiológicas de la población. Materiales y Métodos: Se recolectaron muestras de pacientes con diagnóstico presuntivo de pitiriasis versicolor. El diagnóstico de laboratorio se realizó mediante examen en fresco y cultivo en agar Dixon modificado y agar cromogénico Chromagar Malassezia®, incubados a 32°C; y la identificación por las características macro y micromorfológicas, pruebas bioquímicas y fisiológicas. Resultados: Se incluyeron 102 pacientes (51% femenino), de 1 mes a 63 años de edad, predominando el grupo de 11 a 20 años (35,3%). La localización más frecuente fue el dorso (60,8%). Predominaron las formas hipocrómicas (48%). La especie más frecuente fue M. globosa (52,9%), seguida de M. furfur (24,5%), M. sympodialis (18,6%) y M. slooffiae (6,9%). Conclusiones: La epidemiología observada es similar a otros estudios sudamericanos, no hace distinción de sexo, se presenta predominantemente en la forma clínica hipocrómica y M. globosa aparece como principal responsable. Este es el primer reporte sobre las especies causantes de pitiriasis versicolor en Paraguay y las características de la población con esta patología.


Background: Pityriasis versicolor is a frequent pathology in Paraguay; however, its epidemiology is unknown. Aim: To determine the frequency of Malassezia species causing pityriasis versicolor and the epidemiological characteristics of the population. Methods: Samples from patients with a presumptive diagnosis of pityriasis versicolor were collected. Laboratory diagnosis was carried out by fresh examination and culture in modified Dixon agar and chromogenic Chromagar Malassezia®, incubated at 32° C, and identification by macro and micromorphological features, biochemical and physiological tests. Results: 102 patients were included (51% female) from 1 month to 63 years of age, the predominant age group was 11-20 years (35.3%). The most frequent location was on the back (60.8%). Hipocromic clinical forms (48%) predominated. The most frequent species was M. globosa (52.9%), followed by M. furfur (24.5%), M. sympodialis (18.6%) and M. slooffiae (6.9%). Conclusions: The observed epidemiology is similar to other South American studies, with no sex distinction, predominantly hypochromic clinical form and as primary responsible species appears M. globosa. This is the first report on species causing pityriasis versicolor in Paraguay and the characteristics of the affected population.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Child , Adolescent , Adult , Young Adult , Tinea Versicolor/diagnosis , Tinea Versicolor/epidemiology , Malassezia , Paraguay/epidemiology
19.
Rev. chil. infectol ; 36(6): 790-793, dic. 2019. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1058113

ABSTRACT

Resumen La espectrometría de masas MALDI-TOF MS es una técnica rápida y sencilla para identificar microorganismos por análisis proteico. Se estudiaron 304 aislados de levaduras procedentes de micosis superficiales y profundas, con el objetivo de comparar tres métodos: convencional (bioquímico y morfológico), MALDI-TOF MS, y reacción en cadena de la polimerasa (RPC, método de referencia). Se estudiaron 24 especies con predominio de Candida spp y Cryptococcus spp. La identificación por método convencional fue de 258/304 cepas, mientras que por MALDI-TOF MS fue de: 277/304 cepas (84,8 versus 91,2%, p = no significativo). El coeficiente Kappa entre el MALDI-TOF MS y la RPC reportó una excelente concordancia (0,99). La sensibilidad y la especificidad de MALDI-TOF MS para la identificación de levaduras patógenas oportunistas de muestras clínicas fueron de 94,6% y 99%; respectivamente. MALDI-TOF MS demostró ser una herramienta de alta precisión para la identificación de levaduras patógenas.


MALDI-TOF MS mass spectrometry is a rapid and straightforward technique to identify microorganisms by protein analysis. The study was performed in 304 yeast isolates from superficial and deep mycoses, in order to compare three methods: conventional (biochemical and morphological), MALDI-TOF MS, and polymerase chain reaction (PCR, reference). We included 24 species with predominance of Candida spp and Cryptococcus spp. The identification by conventional methods was 258/304 strains, while by MALDI-TOF MS was: 277/304 strains (84.8% versus 91.2%, P = not significant). The Kappa coefficient comparing MALDI-TOF-MS with PCR reported excellent concordance (0.99). The sensitivity and specificity of MALDI-TOF MS for the diagnosis of opportunistic pathogenic yeasts of clinical samples were 94.6% and 99% respectively. MALDI-TOF MS is a simple, fast and reliable tool for pathogenic yeasts.


Subject(s)
Humans , Mycoses , Yeasts , Candida/genetics , Sensitivity and Specificity , Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization
20.
Rev. argent. microbiol ; 51(3): 214-220, set. 2019. tab
Article in English | LILACS | ID: biblio-1041827

ABSTRACT

Reference fungal cultures (RFCs) are essential for the internal quality control of laboratories. The production of these cultures requires standardized procedures (IRAM 14950:2016 and ISO 17034:2016 standards) carried out by a recognized and accredited laboratory. The aim of this work was to produce RFC in paper disks of autochthonous strains, characterized by two, homogeneous and stable reference methods traceable at species level. RFC were produced using 14 regional species (7 yeasts and 7 filamentous fungi) from the fungal culture collection (DMic). Paper disks were impregnated with a culture suspension, dried and packed. Homogeneity, viability, identity and purity were verified. Short-and long-term stability at different temperatures and storage times were studied. Characterization of each strain allowed to confirm its identity and to ensure its traceability at international level. Produced batches were homogeneous and stable at -20 ±5 °C for 30 months. This method of production was adequate to produce homogeneous and stable RFC with phenotypic and genotypic characteristics correctly defined and internationally traceable. Standardized procedures were developed for the production of certified RFC that could be transferred to other microorganisms. Providing RFC that represent regional strains allows laboratories to produce more reliable results with a favorable impact on medical diagnosis, the environment or the food industry.


Los cultivos microbianos de referencia (CR) son imprescindibles para el control de calidad interno de los laboratorios. Asegurar su producción requiere de procedimientos estandarizados (IRAM 14950:2016 e ISO 17034:2016) realizados en un laboratorio reconocido y acreditado. El objetivo de este estudio fue producir cultivos fúngicos de referencia en discos de papel, a partir de un panel de cultivos autóctonos caracterizados por dos métodos de referencia, trazables a nivel taxonómico de especie, homogéneos y estables. Se produjeron CR de 14 especies circulantes en Argentina (7 de levaduras y 7 de hongos miceliales), depositadas en la colección de hongos de interés médico (DMic). Los discos de papel fueron embebidos con una suspensión del cultivo por producir, secados y envasados. Se verificó la homogeneidad, viabilidad, identidad y pureza de cada lote. Se evaluó la estabilidad a corto y largo plazo a distintas temperaturas y tiempos de almacenamiento. La caracterización de cada CR nos permitió confirmar su identidad y asegurar su trazabilidad a nivel internacional. Los lotes producidos fueron homogéneos y estables durante 30 meses conservados a -20 ±5 °C. Este método resultó adecuado para producir CR homogéneos y estables, con características fenotípicas y genotípicas correctamente definidas y trazables a nivel internacional. Los procedimientos estandarizados desarrollados en este trabajo pueden ser transferidos para producir CR certificados de otros microorganismos. La provisión de CR que represente cepas regionales permite a los laboratorios producir resultados más confiables con un impacto favorable en el diagnóstico médico, los estudios ambientales y la industria alimenticia.


Subject(s)
Biological Specimen Banks , Fungi , Mycology/standards , Preservation, Biological/instrumentation , Preservation, Biological/methods , Quality Control , Reference Standards , Yeasts , Culture Media , Mycology/methods
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