Detección molecular de patotipos de Escherichia coli productores de enfermedad diarreica aguda en niños en un hospital de Rosario, Argentina: patotipos de Escherichia coli en niños / Molecular detection of Escherichia coli pathotypes associated to acute diarrheal disease in children in a hospital in Rosario, Argentina: Escherichia coli pathotypes in children

Objetivo: Detectar los patotipos de Escherichia coli en una población pediátrica con enfermedad diarreica aguda en la ciudad de Rosario para adoptar medidas de intervención oportunas y eficaces en Salud Pública. Materiales y métodos: Se estudiaron 360 muestras de heces de niños menores de 15 años que presentaron cuadro diarreico agudo y que concurrieron a un hospital pediátrico de la ciudad de Rosario, Argentina. La investigación se realizó desde enero de 2021 a abril del 2022. La detección de patotipos se realizó mediante reacción en cadena de la polimerasa. Resultados: Se identificaron el 21.11% de Escherichia coli diarrogénicas (DEC). Se detectaron los genes de virulencia correspondientes a: E. coli enteroagregativa (EAEC) (42,10%), E. coli enteroinvasiva (EIEC) (23.68%), E. coli enterotoxigénica ETEC) (14.47%), E. coli enteropatógena (EPEC) (15.79%) y E. coli enterohemorrágica (EHEC) (1.32%). Se detectaron infecciones mixtas por EAEC/EPEC (1.32%) y ETEC/EAEC (1.32%). Conclusiones: Los métodos de diagnóstico moleculares son una herramienta fundamental en el estudio de la epidemiologia de las enfermedades diarreicas aguda. Más aún, su implementación resulta primordial para identificar del agente etiológico de DEC, disminuir la diseminación de estos patógenos y reducir así la morbi-mortalidad asociada a las diarreas en la población pediátrica.

Objective: Detect Escherichia coli pathotypes in a pediatric population with acute diarrheal disease in the city of Rosario to adopt timely and effective intervention measures in Public Health. Material and methods: A total of 360 fecal samples from pediatric patient with ADD and who attended in a pediatric hospital in Rosario, Argentina, were studied. The research was carried out from January 2021 to April 2022. The identification of pathotypes was carried out by polymerase chain reaction. Results: 21.11% diarrheagenic Escherichia coli (DEC) strains were identified. The virulence genes corresponding to all the pathotypes studied were detected: enteroaggregative E. coli (EAEC) (42.10%), enteroinvasive E. coli (EIEC) (23.68%), enterotoxigenic E. coli (ETEC) (14.47%), enteropathogenic E. coli (EPEC) (15.79%) and enterohemorrhagic E. coli (EHEC) (1.32%). Mixed EAEC/EPEC (1.32%) and ETEC/EAEC (1.32%) infections were detected. Conclusions: Molecular diagnostic methods are a fundamental tool in the study of the epidemiology of acute diarrheal disease. The application of these techniques is essential to identify the etiological agent of DEC, reduce the spread of these pathogens and thus reduce morbidity and mortality associated with diarrhea in the pediatric population.

Prevalencia de serotipos del virus de papiloma humano en mujeres de Ecuador

Resumen El Virus del Papiloma Humano constituye un problema de salud pública al presentar una prevalencia muy alta debido a que es una de las infecciones de transmisión sexual más frecuente a nivel mundial, está asociado a distintos tipos de cánceres sobre todo al cáncer cérvico uterino. Este cáncer es la segunda causa de muerte por enfermedades oncológicas en mujeres del Ecuador. Objetivo . Caracterizar la infección de Virus del Papiloma Humano a partir de la prevalencia de sus serotipos asociados a lesiones cervicales en mujeres del Ecuador durante el periodo enero 2010 hasta diciembre 2020. Metodología . Se realizó una revisión sistemática de tipo documental de acuerdo a la declaración PRISMA. Para lo cual se incluyeron artículos de investigación relacionados con la problemática. La búsqueda se realizó en bases de datos de gran impacto como PubMed, Scopus, ScieLO, Redalyc, Google Académico, Web of Science, Springer, Taylor & Francis, Elsevier, MedLine; se encontraron 38 artículos de los cuales 10 fueron válidos para la investigación. Resultados . Los serotipos de Virus del Papiloma Humano más prevalentes del grupo de alto riesgo oncológico fueron el 16, 58, y 31; mientras que para los de bajo riesgo oncológico fueron los serotipos 61, 81 y 6. Conclusiones . No todas las regiones presentaron estudios de prevalencia de serotipos de VPH. Sin embargo, las regiones que si presentaron datos evidenciaron que el serotipo de alto riesgo oncológico más frecuente es el 16, mientras que el de bajo riesgo oncológico es el 61.

Abstract The Human Papilloma Virus constitutes a public health problem by presenting a very high prevalence due to the fact that it is one of the most frequent sexually transmitted infections worldwide, it is associated with different types of cancers especially cervical uterine cancer. This cancer is the second cause of death due to oncological diseases in women in Ecuador. Objective . The objective of this research was to characterize the infection of Human Papillomavirus from the prevalence of its serotypes associated with cervical lesions in women in Ecuador during the period January 2010 to December 2020. Methodology . A systematic documentary review was carried out according to the PRISMA statement. For this purpose, research articles related to the problem were included. The search was carried out in high impact databases such as PubMed, Scopus, ScieLO, Redalyc, Google Scholar, Web of Science, Springer, Taylor & Francis, Elsevier, MedLine; thirty-eight articles were found of which 10 were valid for the research. Results . The most prevalent serotypes of Human Papillomavirus in the high oncologic risk group were 16, 58 and 31; while for the low oncologic risk group they were serotypes 61, 81 and 6. Conclusions . Not all regions presented studies of HPV serotype prevalence. However, the regions that did present data showed that the most frequent high oncologic risk serotype is 16, while the low oncologic risk serotype is 61.

Resumo O Vírus do Papiloma Humano constitui um problema de saúde pública ao apresentar uma prevalência muito elevada porque é uma das infecções sexualmente transmissíveis mais frequentes em todo o mundo, está associado a diferentes tipos de cancros, especialmente o cancro do útero cervical. Este cancro é a segunda principal causa de morte por doenças oncológicas nas mulheres do Equador. Objectivo . O objectivo desta investigação era caracterizar a infecção pelo Papilomavírus Humano a partir da prevalência dos seus serótipos associados a lesões cervicais em mulheres no Equador durante o período de Janeiro de 2010 a Dezembro de 2020. Metodologia . Foi realizada uma revisão documental sistemática de acordo com a declaração do PRISMA. Foram incluídos artigos de investigação relacionados com o problema. A pesquisa foi realizada em bases de dados de alto impacto tais como PubMed, Scopus, ScieLO, Redalyc, Google Scholar, Web of Science, Springer, Taylor & Francis, Elsevier, MedLine; foram encontrados 38 artigos dos quais 10 eram válidos para a pesquisa. Resultados : Os serotipos mais prevalentes do Papilomavírus Humano no grupo de alto risco oncológico foram 16, 58, e 31; enquanto para os de baixo risco oncológico foram os serotipos 61, 81, e 6. Conclusões . Nem todas as regiões apresentaram estudos de prevalência do serotipo HPV. Contudo, as regiões que apresentaram dados mostraram que o serótipo de alto risco mais frequente é o 16, enquanto que o serótipo de baixo risco mais frequente é o 61.

Comparación del rendimiento diagnóstico clínico versus la prueba rápida durante dos temporadas de influenza / Comparison of clinical diagnostic performance versus the rapid test during two seasons of influenza

Resumen Introducción Una reflexión de la pandemia de influenza en 2009 es la prioridad de la prescripción temprana de los antivirales, previniendo el uso injustificado de antibióticos. Objetivo: Describir la sintomatología que se asocia más al diagnóstico definitivo de influenza y comparar el rendimiento del diagnóstico clínico contra el diagnóstico arrojado por la prueba rápida. Material y métodos Estudio retrospectivo, transversal, descriptivo y analítico. Se incluyeron pacientes con diagnóstico presuntivo de influenza admitidos en el Servicio de Urgencias del Hospital Español de México en dos temporadas consecutivas que van de octubre de 2016 a marzo de 2017 y de octubre de 2017 a marzo de 2018. Se formaron dos grupos: pacientes con PCR positiva (grupo A) y pacientes con PCR negativa (grupo B). Resultados Se obtuvo un total de 857 pacientes con diagnóstico presuntivo clínico de influenza, de los cuales 537 se confirmaron con influenza por PCR (grupo A) y 320 fueron negativos para dicha prueba (grupo B). El síndrome conformado por tos, fiebre, rinorrea y artralgias tiene una especificidad de 92.2% en comparación con la prueba rápida de 99.1%. Conclusiones El síndrome caracterizado por tos, fiebre, rinorrea, artralgias presentes durante los meses invernales tiene una alta especificidad para infección por el virus de la influenza.

Abstract Introduction One of the reflections of the influenza pandemic in 2009 is the priority of the early prescription of antivirals, preventing the unjustified use of antibiotics. Objective: To describe the symptomatology that is associated more with the definitive diagnosis of Influenza and to compare the performance of the clinical diagnosis against the diagnosis thrown by the rapid test. Material and methods A retrospective, cross-sectional, descriptive and analytical study. All patients with presumptive diagnosis of Influenza admitted to the Emergency Service of the Hospital Español de Mexico were included in two consecutive seasons from October 2016 to March 2017 and October 2017 to March 2018. Two groups were formed of the included patients: patients with positive PCR (group A) and patients with negative PCR (group B). Results A total of 857 patients with presumptive clinical diagnosis of influenza were obtained, of whom 537 were confirmed with Influenza by PCR (group A) and 320 were negative for the test (group B). The syndrome consisting of cough, fever, rhinorrhea and arthralgia has a specificity of 92.2% compared to the rapid test of 99.1%. Conclusions The syndrome characterized by cough, fever, rhinorrhea, arthralgia present during winter months has a high specificity for an infection by the Influenza virus.

Recidiva de encefalitis por herpes simple tipo 1 luego de tratamiento antiviral / Recurrence of herpes encephalitis simple type 1 after treatment antiviral

La encefalitis es defnida como la presencia de inflamación en el sistema nervioso central que puede presentarse con manifestaciones clínicas variables. Los organismos que pueden causar encefalitis son bacterias, virus, ricketsias, espiroquetas, hongos y protozoarios [1, 2]. En el mundo la mayor causa de encefalitis es provocada por virus, entre ellos herpes simple virus (tipos 1 y 2), virus de varicela zoster, citomegalovirus, enterovirus [1, 2] y Epstein Barr [3, 4]. El herpes virus es la causa más común de encefalitis no epidémica, con una incidencia de 1 caso por cada 250000 habitantes [3, 5], el más frecuente es el herpes simple tipo 1 [3, 6, 7]. Las manifestaciones clínicas se caracterizan por un cuadro febril precedido de un cuadro pseudogripal, alteraciones de conciencia, cuadros confusionales, deterioro del nivel de vigilia, crisis epilépticas, cefaleas, vómitos, afasia y edema de papila[3, 7]. Sin embargo, existen presentaciones atípicas con cuadros de amnesia, alteraciones del comportamiento [8], síntomas neuropsiquiátricos que hacen sospechar una probable etiología autoinmune.

Estandarización de un sistema PCR multiplex para la determinación molecular de infertilidad masculina idiopática

Objetivo: Diseñar y optimizar sistemas de reacción en cadena de polimerasa individuales y multiplex para la detección de microdeleciones de genes asociados a infertilidad masculina en el cromosoma Y. Métodos: Se estandarizaron sistemas de reacción en cadena de polimerasa multiplex utilizando oligonucleótidos STS (Sequence Target Site) específicos asociados a infertilidad masculina, con previa estandarización de cada par de oligos en reacciones individuales. Resultados: Se logró estandarizar 7 sistemas individuales y 2 sistemas multiplex de alta sensibilidad y especificidad que pueden indicar la presencia o ausencia de un gen, en este caso, son utilizados para indicar la mutación por microdeleción de algún fragmento específico de Yq que conlleva a la inactivación de un gen. Conclusiones: Se pudo realizar la estandarización de dos sistemas multiplex para el análisis de microdeleciones del cromosoma Y asociados a infertilidad masculina como una herramienta molecular para el diagnóstico rápido y preciso de esta patología. El amplificado del marcador RBM1 no pudo ser incluido en ninguna de los dos multiplex estandarizados, no obstante, se sugiere el estudio de otros marcadores de infertilidad masculina que puedan ser incluidos en la estandarización de nuevos multiplex.

Objective: To design and optimize individual systems and multiplex polymerase chain reaction for detection of microdeletions of male infertility associated genes on the Y chromosome. Methods: multiplex polymerase chain reaction systems were standardized using oligonucleotides STS (Sequence Target Site) specific to male infertility associated with prior standardization of each pair of oligos in individual reactions. Results: It was possible to standardize 7 individual systems and two multiplex systems high sensitivity and specificity that may indicate the presence or absence of a gene, in this case, are used to indicate the mutation microdeletion of a specific fragment Yq leading to the inactivation of a gene. Conclusions: standardization could make two multiplex systems for the analysis of microdeletions of the Y chromosome associated with male infertility as a molecular tool for rapid and accurate diagnosis of this disease. The amplified RBM1 marker could not be included in either standard multiplex, despite the studies of other markers of male infertility is suggested to be included in new in the standardization of new multiplexes.

Tipificación de virus de papiloma humano en lesiones preneoplásicas y neoplásicas del cérvix

Objetivo: Determinar los tipos de virus papiloma humano mediante la técnica de reacción en cadena de polimerasa en lesiones preneoplásicas (neoplasia intraepitelial cervical I, II, III) y neoplásica (cáncer in situ), en pacientes que acudieron a la consulta de patología cervical. Métodos: Estudio descriptivo transversal, no experimental y de campo, se evaluaron 102 pacientes de la consulta de patología cervical, de las cuales 42 pacientes se incluyeron en el estudio, se les practicó una entrevista y luego una toma de exfoliado cervical por la técnica de hisopado, que fueron recogidas en un tubo recolector, para ser procesados en el laboratorio clínico e inmunodiagnóstico BRIMED C. A. mediante la técnica de reacción en cadena de polimerasa. Resultados: Mediante reacción en cadena polimerasa para virus papiloma humano dieron positivo en 24 pacientes, mayormente entre las edades de 34 a 39 años con 7 pacientes, el genotipo 6 fue el más común con un total de 12 de pacientes, siendo la neoplasia intraepitelial cervical I el tipo de lesión cervical más afectada con 5 pacientes en este grupo, mientras que solo 10 pacientes dieron positivo para genotipo de riesgo alto, siendo el más común el de otro genotipo con un total de 7 pacientes, obteniéndose la cervicitis y la neoplasia intraepitelial cervical II como las lesiones cervicales más afectadas con 2 pacientes en cada grupo. Conclusiones: La técnica por reacción en cadena de polimerasa para virus papiloma humano obtuvo una sensibilidad de 57,1 % y especificidad de un 42,9 % en este estudio, siendo el genotipo 6 de bajo riesgo el más frecuente en total, el de riesgo intermedio fue habitual en solo 2 pacientes y el de riesgo alto, el más común fue el de otro genotipo con un total de 7 pacientes, mientras que el genotipo 16 fue el menos frecuente. Asimismo, la relación del virus papiloma humano con el grupo etario se ubicó frecuentemente entre las edades de 34 a 39 años, y en relación al tipo de lesión cervical la neoplasia intraepitelial cervical I fue la más común.

Objective: To determine the type of virus human papillomavirus by the technique of polymerase chain reaction in premalignant lesions (NIC I, II, III) and neoplastic (cancer in situ) in patients who attended the consultation cervical pathology. Methods: Not experimental and field, cross-sectional study of 102 patients with cervical pathology consultation, of which 42 patients were included in the study and, she underwent an interview and then a decision by the exfoliated cervical swab technique, which were collected in a collecting tube to be processed in the clinical laboratory and immunodiagnostic BRIMED CA by polymerase chain reaction. Results: Using polymerase chain reaction were positive for human papillomavirus 24 patients, mostly between the ages of 34 to 39 with 7 patients, genotype 6 was the most common with a total of 12 patients being the NIC I the type of neck injury more affected with 5 patients in this group, while only 10 patients tested positive for high-risk genotype, the most common being that of another genotype with a total of 7 patients, obtaining cervicitis NIC II and neck injuries as most affected 2 patients in each group. Conclusions: Human papillomavirus polymerase chain reaction technique had a sensitivity of 57.1 % and specificity of 42.9 % in this study, with the low risk genotype 6 the most common in all, the intermediate risk was common in just 2 patients and high risk, the most common was that of another genotype with a total of 7 patients, while genotype 16 was the least frequent. Likewise, the ratio of the age group human papillomavirus is frequently ranked among the ages of 34-39 years and in relation to the type of cervical lesion NIC I was the most common.

Papilomatosis laríngea juvenil y su relación con la infección genital por virus de papiloma humano durante el embarazo / Laryngeal papillomatosis youth and their relationship with infection Genital human papilloma virus during pregnancy

OBJETIVO: establecer la relación entre el diagnóstico de papilomatosis laríngea juvenil y la infección genital por virus de papiloma humano durante el embarazo. MÉTODOS: Se incluyeron 18 madres de hijos con diagnóstico de papilomatosis laríngea juvenil. Se revisaron las historias de los niños, se realizó anamnesis a las madres buscando antecedentes de infección por virus de papiloma humano durante el embarazo, se practicó evaluación ginecológica actual, citología, vulvoscopia, vaginoscopia, colposcopia y biopsia, de ser necesario. Se tomaron muestras para tipificación viral. RESULTADOS: Hubo 120 casos de papilomatosis laríngea juvenil entre 14 400 pacientes, para una frecuencia de 0,8 %. Entre los pacientes evaluados, predominó el sexo masculino (61,1 %). La edad al momento del diagnóstico fue de 5,7 ± 3,2 años. La enfermedad tenía una mediana de evolución de 2 años. La mediana del número de intervenciones quirúrgicas requeridas por paciente, fue 3. Las manifestaciones clínicas más frecuentes fueron disnea (83,3 %), y disfonía (61,1 %). El genotipo viral en las lesiones laríngeas fue 6 (50 %), 11 (11,1 %) y coinfección 6 y 11 (11,1 %). Se detectó virus de papiloma humano en 5 madres: 3 de alto riesgo y 2 no tipificables. La vía del parto vaginal fue la más frecuente con un 83,3 %. CONCLUSIONES: La papilomatosis laríngea es poco frecuente (0,8 %), genera un cuadro de severidad variable caracterizado por disnea y disfonía, es producido por papilomavirus humano 6 y 11 y se asocia al nacimiento vía vaginal. No hubo correlación entre los tipos virales de madres e hijos.

OBJECTIVE: to establish the relationship between the diagnosis of juvenile laryngeal papillomatosis and genital infection with human papilloma virus during pregnancy. METHODS: 18 mothers whose children’s diagnoses were juvenile laryngeal papillomatosis were included. The children’s history were checked, the mothers were given the anamnesis procedure looking for human papilloma virus infections during pregnancy, they were given actual gynecologic evaluations, citology, vulvoscopy, vaginoscopy, colposcopy and biopsy where needed. Samples were taken for their viral tipification. RESULTS: There were 120 cases of juvenile laryngeal papillomatosis in 14400 patients, an 0.8% frecuency. Amongst the evaluated patients, most were males (61.1 %). Age at diagnosis was 5.7 ± 3.2 años. The disease had an evolution median time of 2 years. The medical intervention median per patient was 3. The most frecuent clinical manifestations were disnea (83.3 %) and dysphonia (61.1%). The viral genotype on laryngeal lesions was 6 (50%), 11 (11.11 %) and coinfection 6 y 11 (11.1 %). Human papilloma virus was detected in 5 mothers: 3 high risk and 2 non classifiable. Vaginal birth was the most frequent with an 83.3 % rate. CONCLUSION: Juvenile laryngeal papillomatosis is not very frequent (0.8 %), generates a manifestation of variable severity characterized by dysnea and dysphonia, produced by human papillomavirus 6 and 11 and is associated to vaginal birth. There was no correlation between the viral types of mothers and children.

Diagnóstico de neumocistosis a través de la inmunofluorescencia directa y la PCR anidada en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica / Diagnosis through pneumocystosis direct immunofluorescence and nested PCR in patients with chronic obstructive pulmonary disease

La asociación EPOC- neumocitosis está descrita y existe la necesidad de optimizar la diferenciación entre enfermedad y colonización. Demostrar la presencia del Pneumocistys Jirovecci, como patógeno y/o colonizador. Estudio descriptivo, analítico, de cohorte de pacientes con diagnóstico de EPOC del Hospital General del Oeste (Caracas, Venezuela) durante el periodo de abril – julio 2012 con seguimiento hasta julio de 2013 y aplicación de la técnica de inmunofluorescencia directa (IFD) y/o PCR anidada (PCRa) en muestra de esputo (espontáneo – inducido) durante los periodos asintomáticos o durante la exacerbación del EPOC en seguimiento de un año. Se incluyeron 20 pacientes en el reclutamiento, con seguimiento al primer control de 5 pacientes; de estos solo 2 cumplieron la medición de esputo. Para la tercera evaluación una paciente había fallecido y la otra no cumplió con el seguimiento. Se demostró IFI+ en 10% de los reclutados, todos con clínica de exacerbación de la EPOC. La PCRa se demostró en 45%, 2 con exacerbación y el resto sin exacerbación. De los dos pacientes de seguimiento, una fue positiva para PCRa y no tenía exacerbación, la otra negativa por ambos métodos. Se demostró infección por Pj en los pacientes con EPOC exacerbado a través de IFI y la PCRa señala su positividad en infección pero también en aquellos sin infección o exacerbación documentando así la colonización y potencial fuente de infección para neumocistosis. Se demostró infección por Pj en paciente con exacerbación y colonización a través de la evidencia del genoma del hongo en pacientes sin exacerbación.

Pneumocistosis and COPD association is described and there is a need to differenciate between disease and colonization. To document the presence of Pnemocistys jirovecci as pathogenic or colonizer by direct immunofluoresencence technique (DIF) and/or nested polymerase chain reaction (nPCR) in sputum (spontaneous-induced) during asymptomatic periods or exacerbation of COPD during a year of follow-up. This is a a descriptive, analytic cohort of patients with COPD of the Hospital General del Oeste (Caracas, Venezuela) . They were studied during April - July 2012, with follow-up until July 2013. 20 patients were included. The first control follow up was in 5 patients with only two measures of IFI - PCRa. For the third evaluation one patient had died and the other did not comply with control. IFI + was demonstrated in 10 % of the recruits, all had COPD, exacerbation. PCRa + was demonstrated in 45%, 2 with exacerbation and all other without exacerbation. From the two followed patients one was positive for PCRn and had no exacerbation, the other was negative by both methods. Pj infection was demonstrated in patients with exacerbated COPD by IFI+ and the PCRa positivity in infection but also in those without infection or exacerbation documenting the colonization and potential source of infection for Pj. Pj infection wasdiagnosed in patients with exacerbation COPD and colonization through the evidence of the genome of the fungus in patients without exacerbation.

Infección por virus del papiloma humano: asociación entre infección genital y bucal / Infection with human papillomavirus: association between genital and oral infection

Identificar las características de la infección por VPH en la cavidad bucal asociada a la infección por VPH genital. En el Servicio de Ginecología Maternidad "Concepción Palacios". Caracas. Se estudiaron 60 pacientes con diagnóstico histológico de VPH genital a quienes se les realizó oroscopia, citología bucal y determinación viral por reacción en cadena de polimerasa (PCR) en boca y cérvix. Se aisló el genotipo viral en la cavidad bucal en 48,33 por ciento de las pacientes (29 / 60). Hubo concordancia entre la infección genital y bucal en 44,20 por ciento de los casos. Los genotipos aislados más frecuentes fueron el 6 (71,43 por ciento) y el 11 (22,86 por ciento), solos o en combinación; solo hubo un caso con genotipo 16 (2,86 por ciento). La concordancia entre el genotipo genital y bucal fue de 10,45 por ciento (P=0,1547), sin embargo, cuando el genotipo aislado fue 6 la concordancia fue de 75,86 por ciento. La citología de la cavidad bucal tuvo una sensibilidad de 3,5 por ciento y una especificidad de 93,6 por ciento. La oroscopia tuvo una sensiblidad de 27,6 por ciento y una especificidad de 74,2 por ciento. Es frecuente la asociación entre infección por VPH genital y bucal. Tanto la citología exfoliativa de la boca como la oroscopia, son métodos diagnósticos poco sensibles y específicos.

To describe the characteristics of HPV infection in the oral cavity associated with genital HPV infection. Service of Ginecology of the Maternidad "Concepcion Palacios". Caracas. 60 patients with histological diagnosis of genital HPV were studied with oroscopy, oral cytology and viral determination with polymerase chain reaction (PCR) in the mouth and in the cervix. Viral genotype was isolated in the oral cavity in 48.33 percent of patients (29/60). There was concordance between genital and oral infection in 44.20 percent of cases. Frequently isolated genotypes were 6 (71.43 percent) and 11 (22.86 percent), alone or in combination, there was only one case with genotype 16 (2.86 percent). The concordance between genital and oral genotype was 10.45 percent (p = 0.1547), but when isolated genotype was 6, the agreement was 75.86 percent. The cytology of the oral cavity had a sensitivity of 3.5 percent and a specificity of 93.6 percent. The oroscopy sensitivity was 27.6 percent and the specificity was 74.2 percent. It is often an association between genital and oral HPV infection. Both exfoliative cytology of the mouth and the oroscopy have low sensitivity and specificity as diagnostic methods.

Rastreo genético del streptococcus mutans / Streptococcus mutans genetic tracking

Las técnicas moleculares para recuperar DNA antiguo brindan la posibilidad de comparar la evolución molecular a través del tiempo, ya que constituye una herramienta para aclarar el diagnóstico de posibles enfermedades infecciosas del pasado. Aislar y secuenciar un fragmento de DNA de Streptococcus mutans fosilizado, considerado el principal agente infeccioso implicado en la formación de la placa bacteriana y el desarrollo de la caries dental, utilizando la reacción en cadena de polimerasa (PCR). La muestra estuvo conformada por caries y tártaro dental proveniente de dientes de diferentes colecciones de México, Barcelona e Islas Baleares. La metodología fue adaptada a las condiciones de conservación de este tipo de muestra para obtener DNA y los primers fueron específicos para la amplificación de un fragmento de 124 pb del gen de la Dextranasa del S. mutans. De las 24 muestras analizadas, 9 resultaron positivas para la amplificación y en 6 se lograron las secuencias correspondientes. Para la alineación de las secuencias obtenidas, se empleó la base de datos BLAST encontrándose una homología del 95% con el genoma del S. mutans UA159. Este estudio demuestra la primera evidencia de obtención de la secuencia de un fragmento de DNA de Streptococcus mutans recuperados a partir de caries y cálculo dental de restos humanos antiguos, presentando un 95% de homología con el DNA de S. mutans de la subespecie UA159 moderno

The molecular techniques for ancient DNA recovering, offers the possibility to compare the molecular evolution through time as these are tools which make clear possible infectious diseases from the ancient times Objective: To isolate and sequence fossilized Streptococcus mutans DNA fragments, considered the infectious agent involved with dental caries and plaque formation and development, by using the polymerase chain reaction (PCR). Dental caries and tartar samples of teeth collections from Mexico, Barcelona and Balearic Islands. The methodology was adapted to the conservation conditions of this type of DNA samples, and primers were specific to amplify a fragment of 124 bp of S. mutans dextranase gene. Results: 24 samples were analyzed, 9 were positive for amplification and 6 were obtained with its corresponding sequences. To alignment the sequences obtained, we used the BLAST database, giving us the 95% homology with the S. mutans UA159 genome. This study shows us the first evidence of Streptococcus mutans DNA sequence fragment recovered from dental caries and tartar from ancient human remains, presenting a 95% homology with S. mutans UA159 modern subspecies DNA

Detección del virus papiloma humano: influencia del tipo de muestra y la severidad de la lesión intraepitelial cervical / Detection of human papillomavirus: the influence os sample type and severity od cervical intraepithelial lesion

Identificar la influencia del tipo de muestra y la severidad de la lesión, en la detección del ácido desoxirribonucleico del virus papiloma humano mediante reacción en cadena de polimerasa. Entre octubre 2008 y enero 2009, se seleccionaron 68 pacientes con diagnóstico histológico de lesión intraepitelial. Se realizó la detección del ácido desoxirribonucleico de virus papiloma humano a través de reacción en cadena de polimerasa, en muestra citológica e histológica de cuello uterino. Se analizaron los resultados agrupados según tipo de muestra (citológica o histológica) y tipo de lesión intraepitelial (alto o bajo grado). Servicio de Ginecología de la Maternidad "Concepción Palacios" La sensibilidad de la reacción en cadena de polimerasa para la detección del ácido desoxirribonucleico del virus papiloma humano en muestra histológica fue 92,98 por ciento, mayor que la citológica 72,06 por ciento (P < 0,05). La severidad de la lesión no afectó la capacidad global de detección de la prueba (P > 0,05). En lesiones de bajo grado la sensibilidad del extendido fue de 65 por ciento y la de la biopsia fue de 97,2 por ciento; mientras que en las lesiones de alto grado fue de 82,14 por ciento (extendidos) y 85,71 por ciento (biopsias). La severidad de la lesión intraepitelial (alto o bajo grado) no afecta la eficacia de la prueba para detectar el ácido desoxirribonucleico del virus papiloma humano. La detección fue más efectiva en muestras histológicas que en citológicas

Identify the influence of the kind of sample and the severity of the injury, to detect the desoxyribonucleic acid of the human papilloma virus using polymerase chain reaction. Between October 2008 and January 2009, 68 patients with histological diagnosis of intraepithelial lesion were selected, making detection of human papilloma virus desoxyribonucleic acid in polymerase chain reaction, in both, histological and cytological cervical sample. Analysed the results grouped by type specimen (cytological and/or histological) and type of lesion (high or low grade). Service of Gynecology of the Maternidad "Concepcion Palacios", The sensitivity of the polymerase chain reaction for the detection of human papilloma virus desoxyribonucleic acid in histological sample was 92.98 percent, higher than the cytological 72.06 percent (P < 0.05). The severity of the lesions didn’t afect the detection capability of polymerase chain reaction. (P>0.05). The sensitivity of the extended in low grade lesions was 65 percent and the biopsy was 97.2 percent; while in high-grade lesions was 82.14 percent (extended) and 85.71 percent (biopsies). The severity of intraepithelial lesion (high or low grade) does not affect the effectiveness to detect human papilloma virus desoxyribonucleic acid. Detection was more effective in histological samples than in cytological

Infección por virus de papiloma humano: asociación entre infección genital y anal-perianal / Infection with human papillomavirus: association between anal-genital and perianal infection

Describir las características de la infección por virus de papiloma humano anal y perianal asociada a la infección por genital por el mismo virus. Se seleccionaron 65 pacientes con virus de papiloma humano genital, a quienes se les realizó citología, identificación viral por reacción en cadena de polimerasa y colposcopia de región genital, ano y periano. En el Servicio de Ginecología de la Maternidad "Concepción Palacios". Se observó una frecuencia de detección del virus en ano y periano de 31,3 por ciento. En 19,67 por ciento de las pacientes hubo concordancia entre la infección en genitales y la de ano y región perianal (P > 0,397). Entre los genotipos virales hubo concordancia del 33,74 por ciento (P= 0,0053), esta correlación fue mayor para el virus 6. Fueron evaluables 38 citologías anales y perianales (59,4 por ciento) y ninguna diagnosticó anormalidades. Entre estas citologías, al hacer la reacción en cadena de polimerasa, 15 resultaron positivas para virus de papiloma humano, 21 negativas y 2 insatisfactorias. Las lesiones más frecuentes fueron subclínicas. La distribución del resultado de la anoscopia, refleja que la normalidad es lo más frecuente (67,2 por ciento). El riesgo de infección por virus de papiloma humano en ano y periano se incrementa en pacientes con infección genital. Consideramos que es importante extender la evaluación ginecológica a la región anal y perianal a pesar de las limitaciones del uso de la citología y la colposcopia

To describe the characteristics of the anal and perianal human papillomavirus infection associated with genital infection by the same virus. We selected 65 patients, with genital infection by human papillomavirus, who was made them cytology, polymerase chain reaction and colposcopy in genital region, anus and periano. Servicio de Ginecologia de la Maternidad "Concepción Palacios" The frequency of detection of papillomavirus in anus and periano was 31.3 percent. There was consistency between the genital papillomavirus infection and the anus and region parianal in 19.67 percent (P > 0,397) and between viral genotypes in 33.74 percent (P = 0,0053), this correlation was increased to virus 6. They were 38 evaluable Papanicolaou test anal and perianal (59.4 percent) and none diagnosed abnormalities. Among these, 15 were polymerase chain reaction positive for papillomavirus, 21 negative and 2 unsatisfactory. The most common lesions were subclinical. The distribution of the anoscopia result reflects normal is most often (67.2 percent). The risk of HPV infection in anus and periano is increased in patients with genital infection. We believe it is important to extend the gynecologic evaluation to the anal and perianal region despite the limitations of the use of Papanicolaou test and the colposcopy

Detección y diferenciación de entamoeba histolytica / entamoeba dispar mediante reacción en cadena de la polimerasa (pcr) usando dna extraído de quistes presentes en muestras de heces fecales humanas / Detection and differentiation of entamoeba histolytica / entamoeba dispar by polymerase chain reaction (pcr) using DNA extracted from cysts present in human stool samples

Está establecido que existen dos especies distintas de amebas que originalmente fueron conocidas como Entamoeba Histolytica. Ellas son E. dispar (forma no patogénica) y E. histolytica (forma patogénica). La diferencia entre estos dos organismos es de gran importancia clínica desde que son morfológicamente indistinguibles. El diagnóstico diferencial de estas dos especies es esencial para la decisión del tratamiento y la salud pública. Se puede usar un método rápido de extracción de DNA directamente de especímenes suspendidos en formalina éter. La extracción de ADN fue usada para la identificación de las especies existentes en las herramientas por reacción de cadena polimerasa (PCR). Un total de 75 muestras recolectadas aleatoriamente fueron analizadas. Despues de la confirmación por PCR: 7/75 muestras resultaron positivas para E. histolytica, 60/75 muestras resultaron positivas para E. dispar y 8/75 resultaron negativas porque no amplificaron, pudiendo tratarse de otras amebas como E. hartmani. E. iodoamoeba, E. coli, etc. Con estos resultados podemos darnos cuenta de la magnitud de falsos positivos que se generan con los exámenes microscópicos. Estas observaciones implican que el uso del DNA extraído directamente a partir de concentración de quistes para amplificación por PCR, es una herramienta útil para obtener un diagnóstico sensitivo y preciso que puede ser aplicado incluso en epidemiología.

It has been established that two distinct species exist within what was originally known as Entamoeba histolytica. These are E. dispar (nonpathogenic form) and E. histolytica (pathogenic form). Differentiation of these two organisms is of great clinical importance since they are morphologically indistinguishable. Differential diagnosis of this two species is essential for treatment decision and public health knowledge. A simple and rapid DNA-extraction method that can be used directly on formalin-ether stool specimens. The extracted DNA was used for the identification of the species existing in the stools by polymerase chain reaction (PCR). A total of 75 randomly collected stool sample were analyzed. The samples analyzed by microscopic were 75, after confirmation by PCR: 7/75 samples resulting positive for E. histolytica, 60/75 samples resulting positive for E. dispar and 8/75 resulting negative because didn't amplify be able to be other amoebas like E. hartmani, E. iodoamoeba, E. coli, etc. With these results we can realize the magnitude of false positive that are generated with the microscopic exams. These observations imply that the use of the DNA extracted directly of the concentrate of cysts for PCR amplification is a useful tool for obtaining a sensitive and accurate diagnosis that can be applied even in epidemiology.