ABSTRACT
Resumen La inclusión de cultivos de cobertura invernales (CCI) en un sistema de siembra directa (SD) en reemplazo del barbecho constituye una alternativa promisoria para mejorar la salud del suelo y contribuir a la sustentabilidad ambiental de los sistemas agrícolas. Esta revisión ofrece un panorama integral de los efectos sobre el microbioma del suelo que tiene la introducción de CCI en rotación con cultivos de verano en sistemas de SD vs. el barbecho desnudo. Se realizó una búsqueda sistemática de la literatura que reporta los efectos de los CCI sobre los parámetros de abundancia, actividad y diversidad microbiana del suelo. Combinando 7 criterios de búsqueda se seleccionaron y analizaron 22 trabajos. El conjunto de resultados de esos trabajos muestra que la actividad enzimática del suelo se ve favorecida con la inclusión de CCI en la rotación, principalmente si estos se componen de leguminosas y mezclas de especies. Más de la mitad de esos trabajos reportan una mayor biomasa microbiana con CCI que con barbecho. Además, se advierte que los efectos de los CCI sobre los parámetros microbianos son independientes de la duración de los ensayos. Sin embargo, aún se necesitan más investigaciones básicas que permitan reducir la heterogeneidad entre estudios y comprender las complejas interacciones que ocurren entre los CCI y el microbioma del suelo.
Abstract The inclusion of winter cover crops (WCC) in no-till (NT) systems in replacement of bare fallow is a promising alternative to improve soil health and consequently, contribute to environmental sustainability of agricultural systems. This review provides a comprehensive evaluation of the effects of the use of WCC in rotation with summer cash crops under NT systems on the soil microbiome versus bare fallows. A systematic literature search was conducted to evaluate the impact of WCC on microbial parameters indicative of abundance, activity and diversity. Twenty-two papers were selected based on seven combined criteria. The results of this review show that enzyme activities in soil are enhanced with the inclusion of WCC in the rotation, particularly those that include legumes and mix of species. ln general, more than half of the analyzed papers report higher microbial biomass in soils with WCC than in bare fallow. Interestingly, the effects of WCC on microbial parameters are independent of the duration of the experiments. However, more basic research is necessary to reduce the heterogeneity of the studies and to better understand the complexity of the interactions between WCC and the soil microbiome.
ABSTRACT
The inclusion of winter cover crops (WCC) in no-till (NT) systems in replacement of bare fallow is a promising alternative to improve soil health and consequently, contribute to environmental sustainability of agricultural systems. This review provides a comprehensive evaluation of the effects of the use of WCC in rotation with summer cash crops under NT systems on the soil microbiome versus bare fallows. A systematic literature search was conducted to evaluate the impact of WCC on microbial parameters indicative of abundance, activity and diversity. Twenty-two papers were selected based on seven combined criteria. The results of this review show that enzyme activities in soil are enhanced with the inclusion of WCC in the rotation, particularly those that include legumes and mix of species. In general, more than half of the analyzed papers report higher microbial biomass in soils with WCC than in bare fallow. Interestingly, the effects of WCC on microbial parameters are independent of the duration of the experiments. However, more basic research is necessary to reduce the heterogeneity of the studies and to better understand the complexity of the interactions between WCC and the soil microbiome.
Subject(s)
Microbiota , Soil , Agriculture/methods , Crops, Agricultural , Soil MicrobiologyABSTRACT
The etiopathogenesis of recurrent aphthous stomatitis is still unknown, however, there are some studies that report a probable role of the presence of some microbial communities in the alteration of the oral microbiota. In this systematic review (PROSPERO registry # CRD42021259427), we evaluated whether imbalances in the oral microbiota are associated with recurrent aphthous stomatitis. From case-control studies we determined that bacterial diversity does not change notably in sick people, however these changes are evident in terms of relative abundance, such as the increase in the genus Prevotella and the decrease in the genus Streptococcus.
Aún se desconoce la etiopatogenia de la estomatitis aftosa, no obstante, existen algunos estudios que reportan un probable rol de la presencia de algunas comunidades microbianas en la alteración de la microbiota oral. En esta revisión sistemática (registro PROSPERO #CRD42021259427), evaluamos si los desequilibrios en la microbiota oral están asociadas con la estomatitis aftosa recurrente. A partir de estudios de casos y controles determinamos que la diversidad bacteriana no cambia notablemente en personas enfermas, sin embargo esos cambios son evidentes en términos de abundancia relativa como el aumento del género Prevotella y la disminución del género Streptococcus.
ABSTRACT
INTRODUCTION: In recent years, the advance in gut microbiota knowledge has shown that is key in the development and health status of humans. There are many factors that influence the gut microbiota and its balance, being our lifestyle one of the key factors. There is an association between feeding and practicing physical exercise. People who have an active life have a healthier diet, richer in fiber, vegetables and fruits, while sedentary lifestyle is associated with diets with higher fat content and lower fiber. Our feeding behavior and the practice of physical exercise, determine the microbial diversity, as well as the presence of beneficial bacteria for our health. The influence of these factors is determined by the physiological state of the individual (illness/health, obese/lean, young/old), thus more research is needed to determine how changes occur in the microbiota depending on the individual in order to be able to move towards customized nutrition and exercise recommendations according to the needs of each individual.
INTRODUCCIÓN: En los últimos años, el avance en el conocimiento de la microbiota intestinal nos ha demostrado que es clave en el desarrollo y en el estado de salud del ser humano. Son numerosos los factores que influyen sobre la microbiota intestinal y su equilibrio, y nuestro estilo de vida es uno de los factores claves. Existe una asociación entre la alimentación y la práctica de ejercicio físico. Las personas que tienen una vida activa tienen, además, una alimentación más saludable, más rica en fibra, verduras y frutas, mientras que el sedentarismo se asociada al consumo de dietas con mayor contenido de grasa y poca fibra. Nuestro estilo de vida, entendido como alimentación y realización de ejercicio físico, determina la diversidad microbiana, así como la presencia de bacterias beneficiosas para nuestra salud. La influencia de estos factores está determinada por el estado del individuo (enfermedad/salud, obeso/delgado, joven/anciano), por lo que es necesaria más investigación para determinar cómo se producen los cambios en la microbiota en función del individuo, con el fin de poder avanzar hacia una nutrición y unas recomendaciones de ejercicio personalizadas acordes a las necesidades de cada persona.
Subject(s)
Diet, Healthy , Exercise/physiology , Gastrointestinal Microbiome/physiology , Gastrointestinal Tract/microbiology , Life Style , Dietary Fiber/microbiology , Humans , Sedentary BehaviorABSTRACT
During the last decade, there has been increasing awareness of the massive number of microorganisms, collectively known as the human microbiota, that are associated with humans. This microbiota outnumbers the host cells by approximately a factor of ten and contains a large repertoire of microbial genome-encoded metabolic processes. The diverse human microbiota and its associated metabolic potential can provide the host with novel functions that can influence host health and disease status in ways that still need to be analyzed. The microbiota varies with age, with features that depend on the body site, host lifestyle and health status. The challenge is therefore to identify and characterize these microbial communities and use this information to learn how they function and how they can influence the host in terms of health and well-being. Here we provide an overview of some of the recent studies involving the human microbiota and about how these communities might affect host health and disease. A special emphasis is given to studies related to tuberculosis, a disease that claims over one million lives each year worldwide and still represents a challenge for control in many countries, including Colombia.
En las últimas décadas ha incrementado nuestro conocimiento sobre la gran cantidad de microorganismos que conviven con nosotros, comunidades que colectivamente se conocen como la microbiota humana. El número de microorganismos que conforman la microbiota supera el número de células del cuerpo humano por un factor de diez aproximadamente y aporta un gran repertorio de genes y procesos metabólicos. La diversidad de la microbiota humana y su potencial metabólico brindan al hospedero una serie de funciones que complementan sus procesos y a su vez pueden influir sobre la salud del ser humano en formas que apenas se empiezan a conocer. La microbiota varía desde el nacimiento hasta la vejez del individuo, con características que dependen del sitio corporal, del estilo de vida y del estado de salud del hospedero. El reto actual es aprovechar el conocimiento derivado de la identificación y caracterización de estas comunidades microbianas para entender cómo funcionan estos microorganismos y cómo pueden influir de forma positiva o negativa sobre la salud del humano. En este documento ofrecemos una revisión general de algunos estudios recientes sobre la microbiota humana y su posible efecto en el hospedero en términos de salud y bienestar. Igualmente, se mencionan estudios sobre microbiota y su posible asociación con la tuberculosis, una enfermedad que todavía cobra más de un millón de vidas anualmente a nivel mundial y cuyo control todavía representa un gran reto en varios países del mundo, incluido Colombia.
ABSTRACT
El presente estudio brinda la primera información sobre diversidad y abundancia de las comunidades microbianas en dos ambientes del Mar Argentino obtenida mediante la técnica de pirosecuenciación tag ribosomal 454. Dentro del dominio Bacteria, se observaron más de 4 600 secuencias únicas a partir de 36 188 amplicones de tags y se identificaron 280 filotipos. Además, se detectaron cerca de 2 700 secuencias únicas a partir de más de 47 700 tags pertenecientes al dominio Archaea, lo que definió sólo 5 filotipos diferentes. La distancia de Jaccard presentó valores de 0,6 para bacterias y de 0,2 para arqueas, esto indica mayor diferencia entre las bacterias en los dos sitios. En el ambiente marino los filotipos más dominantes fueron Bacteroidetes Flavobacteriaceae, Proteobacteria Gammaproteobacteria, Proteobacteria Rhodobacteraceae y Proteobacteria Rickettsiales SAR11, mientras que en el estuario predominaron Pseudoalteromonadaceae Pseudoalteromonas, Proteobacteria Gammaproteobacteria, Proteobacteria Shewanella y Proteobacteria Rickettsiales SAR11. Los 2 filotipos de arqueas encontrados en mayor proporción fueron Archaea Euryarchaeota y Archaea Crenarchaeota. Las secuencias tag más numerosas representaron taxa caracterizados previamente, aunque también se halló un elevado número de filotipos de gran diversidad y de baja abundancia, que forman parte de la denominada "biosfera rara", aún no explorada, que pueden tener un papel ecológico crucial.
The present study provides the first information about diversity and abundance of microbial communities in two environments of the Argentinian Sea by the 454 - tag pyrosequencing technique. We observed more than 4,600 unique bacterial sequences from 36,188 tag amplicons, forming 280 phylotypes. In addition, nearly 2,700 unique sequences from more than 47,700 tags identified as Archaea, defined only 5 different phylotypes. The Jaccard distance (0.6 for Bacteria and 0.2 for Archaea) indicated higher differences among Bacteria rather than among Archaea in both studied sites. The dominant phylotypes in marine environment were Bacteroidetes Flavobacteriaceae, Proteobacteria Gammaproteobacteria, Proteobacteria Rhodobacteraceae and Proteobacteria Rickettsiales SAR11; and Pseudoalteromonadaceae Pseudoalteromonas, Proteobacteria Gammaproteobacteria, Proteobacteria Shewanella, Proteobacteria Rickettsiales SAR11 in the estuary sampling site. Archaea Euryarchaeota and Archaea Crenarchaeota were the major archaeal phylotypes found. The most abundant tag sequences included previously characterized taxa, although we also retrieved a large number of highly diverse, low-abundant phylotypes which constitute a largely unexplored "rare" biosphere. These microorganisms could have a crucial ecological role.
