Genetic control of quality melon traits / Controle genético de caracteres de qualidade do melão

ABSTRACT: This research studied the genetic control of the traits related to melon fruit quality. The F1, F2, BC1, BC2 generations from the OL x A-16 and OL x PV crossings were evaluated in two separate trials conducted in randomized blocks with three replications. The evaluated traits were: average fruit weight, shape index, pulp thickness, pulp firmness, soluble solids content and cracking rate. The analyses were accomplished through a classic study of generations involving mixed models. The parameters on heritability and number of loci controlling the traits were evaluated in a broad and narrow sense. The inheritance of the evaluated traits is complex, presenting one gene of greater effect and polygenes with additive and dominant effects.

RESUMO: Objetivou-se com este trabalho estudar o controle genético de caracteres relacionados à qualidade do fruto do melão. Foram avaliadas as gerações F1, F2, RC1, RC2 dos cruzamentos OL x A-16 e OL x PV em dois ensaios separados conduzidos em blocos casualizados com três repetições. Os caracteres avaliados foram: peso médio do fruto, índice de formato, espessura da polpa, firmeza da polpa, sólidos solúveis e porcentagem de rachadura. As análises foram feitas por meio de estudo clássico de gerações envolvendo modelos mistos. Foram estimados os parâmetros de herdabilidades nos sentidos amplo e restrito e número de loci que controlam o caráter. A herança dos caracteres estudados é complexa com a presença de gene de efeito maior e poligenes com efeitos aditivos e de dominância.

Adaptability and stability of cowpea genotypes via REML/BLUP and GGE BIPLOT / Adaptabilidade e estabilidade de genótipos de feijão-caupi via REML/BLUP e GGE BIPLOT

Several methodologies have been proposed in order to measure the influence that genotype-by-environment interaction exerts on the various characters of interest. The mixed models using REML/BLUP and GGE Biplot have been mentioned as advantageous to identify superior genotypes. The use of environmental information can be useful to find the factors that are in the real difference between the genotypes. The objective of this study was to compare statistical methodologies for the adaptability and stability analysis of cowpea genotypes in value for cultivation and use testings. The experiments were carried out from March to July 2016 and 2017, in the municipalities of Dourados and Aquidauana. A randomized complete block design was used, with 14 genotypes and four replicates, 12 advanced lines and two commercial cultivars. After detecting significant genotype-by-environment interaction, the adaptability and phenotypic stability of cowpea genotypes were analyzed by the GGE Biplot and REML/BLUP. Both methodologies were concordant in the identification of the best cowpea genotypes for the State of Mato Grosso do Sul. Thegenotypes 6 (Pingo-de-ouro 1-5-4), 10 (Pingo-de-ouro 1-5-10) and 8 (Pingo-de-ouro 1-5-7) are the most suitable to be grown in the State, because they have gathered high grain yield, adaptability and stability.

Diversas metodologias têm sido propostas com o intuito de estimar a influência que a interação genótipos x ambientes exerce sobre os vários caracteres de interesse. Dentre estes modelos mistos via REML/BLUP e GGE-Biplot têm se destacado para identificar genótipos superiores e estratificas ambientes. O uso de informações ambientais pode ser útil para encontrar os fatores que estão na real diferença entre os genótipos. O objetivo deste estudo foi comparar metodologias estatísticas para a análise da adaptabilidade e estabilidade de genótipos de feijão-caupi em ensaios de valor de cultivo e uso. Os experimentos foram realizados no período de Março a Julho de 2016 e 2017, nos municípios de Dourados e Aquidauana, sendo dois anos em Dourados e um ano em Aquidauana. Foi utilizado o delineamento experimental blocos casualizados, com 14 genótipos e quatro repetições, sendo 12 linhagens avançadas e duas cultivares comerciais. Depois de detectar a interação significativa entre genótipos e ambientes, a adaptabilidade e a estabilidade fenotípica dos genótipos de feijão-caupi foram analisadas pelos métodos GGE-Biplot e REML/BLUP. Os dois métodos foram concordantes em 80% na identificação dos melhores genótipos de feijão-caupi para o Estado de Mato Grosso do Sul. Os genótipos Pingo-de-ouro 1-5-4, Pingo-de-ouro 1-5-10 e Pingo-de-ouro 1-5-7, foram os genótipos que apresentaram simultaneamente alta produtividade de grãos, adaptabilidade e estabilidade, sendo assim indicados para o cultivo no Mato Grosso do Sul.

Diallel analysis and prediction of untested maize single cross hybrids / Análise dialélica e predição de híbridos simples de milho não testados

Popcorn (Zea mays everta) is a popular snack food and very appreciated in Brazil, presenting higher aggregate value when compared with field corn. The aim of this study were to identify superior inbred lines and single crosses hybrids (SH) for popcorn traits, as well as the prediction of the performance of untested single cross hybrids. Sixteen maize inbred lines were crossed in a 9x7 partial diallel, but it was possible to evaluate 47 single crosses in two distinct locations. Predicted genetic values, diallel analysis and the prediction of untested HS were performed by mixed models. Deviance effects for treatments x locations were considered non-significant (p>0.05) for grain yield (GY) and popping expansion (PE), showing an average performance from the HS in the locations. Inbred lines P5-1, P3.3T, GER-P3, P9-1, P12-2 andGER-P12 were selected considering the general combining ability, and should be used for obtaining superior genotypes. Based on the non-additive effects, the single hybrid P3.3T x GERP-P12 was selected for grain yield and popping expansion, and could be exploited in future trials. Neither of the untested single crosses showed desirable performance for grain yield and popcorn expansion.

O milho pipoca (Zea mays everta) é um alimento consumido e apreciado em todo o Brasil, apresentando valor comercial superior ao do milho comum. O presente trabalho teve como objetivo identificar linhagens e híbridos simples (HS) com desempenho superior para as principais características relacionadas ao milho pipoca, além da predição do desempenho de híbridos simples não testados. Foi realizado um dialelo parcial 9x7, dos quais apenas 47 HS foram avaliados em dois locais. Os valores genéticos preditos, análise dialélica e a predição dos HS não avaliados foram realizadas via modelos mistos. Os efeitos da deviance na interação tratamentos x locais foram considerados não significativos (p>0.05) para rendimento de grãos (RG) e capacidade de expansão (CE), indicando um comportamento médio dos HS nos ambientes testados. Com base nos efeitos aditivos, as linhagens P5-1, P3.3T, GER-P3, P9-1, P12-2 e GER-P12 foram selecionados e deverão ser usadas na formação de genótipos com desempenho superior. O híbrido P3.3T x GER-P12 foi selecionadopor apresentar elevado desempenho específico para rendimento e capacidade de expansão, podendo ser utilizado em futuros experimentos. Entre os híbridos não avaliados, nenhum apresentou desempenho satisfatório para as características avaliadas.

Genetic divergence between sweet sorghum genotypes by the WARD-MLM procedure / Divergência genética entre genótipos de sorgo sacarino pelo procedimento WARD-MLM

Sweet sorghum has the potential for use in bioethanol production as a complement to sugarcane. This work aimed to identify sweet sorghum genotypes by mixed models, using the Ward-MLM method. Trials were carried out in the 2013/2014 and 2014/2015 crop years at the experimental area of Embrapa Agropecuária Oeste, in Dourados, Mato Grosso do Sul. The experiment consisted of a randomized blocks design, with three replications, using 16 sweet sorghum genotypes from the breeding program of Embrapa Milho e Sorgo. The genotype effect was significant for all the variables analyzed, and the genotypes x environments interaction was significant for most of these variables. Estimates of genetic parameters indicate that gains with selection can be obtained for the dry mass yield of panicles and ºBrix. The Ward-MLM procedure is useful for detecting genetic divergence and clustering genotypes by simultaneously using morphological, agronomic, and molecular descriptors. In addition, this method showed that three was the ideal number of groups, according to the pseudo-F and pseudo-t2 criteria, identifying the most divergent groups. When crossed, these groups have a higher probability of generating genotypes with high yield and variability.

O sorgo sacarino apresenta potencial para utilização na produção de bioetanol em complementação à cana-de-açúcar. O objetivo deste trabalho foi identificar genótipos de sorgo sacarino via modelos mistos, usando o método Ward- MLM. O experimento foi conduzido nas safras 2013/2014 e 2014/2015, na área experimental da Embrapa Agropecuária Oeste, em Dourados, MS. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados com três repetições. Foram avaliados 16 genótipos de sorgo sacarino oriundos do programa de melhoramento da Embrapa Milho e Sorgo. O efeito de genótipo foi significativo para todas as variáveis analisadas, e a interação genótipos x ambientes foi significativa para a maioria destas variáveis. As estimativas de parâmetros genéticos obtidas indicam que ganhos com a seleção podem ser obtidos para as variáveis rendimento da massa seca de panículas e ºBrix. O procedimento Ward-MLM é útil para detectar divergência genética e agrupar genótipos pelo uso simultâneo de descritores morfológicos, agronômicos e moleculares. Além disso, este método mostrou que três foi o número ideal de grupos, conforme os critérios do pseudo-F e pseudo-t2, identificando os grupos mais divergentes. Estes grupos, quando cruzados, apresentam maior probabilidade gerar genótipos com alta produtividade e variabilidade.

Guaiaca a software tool for supporting the use of scientific applications designed for data analysis part I: execution assistant / Guaiaca uma ferramenta de apoio ao uso de aplicativos científicos destinados a análises de dados parte I: assistente de execução

The aim of this work is to develop a software tool that provides a user-friendly graphical interface of generic and configurable design in order to ease the researchers tasks in data manipulation and analysis. Two primary targets have influenced the design: data preparation for analysis in animal breeding programs and usability increase for those applications that perform important analysis methods, but interact with users only through text files and command lines. The Guaiaca tool was designed as a utility belt in the form of two integrated assistants, and it can be combined with multiple analysis applications. This tool offers facilities to: (a) collect, manipulate, and reorganize data; (b) organize, register, and retrieve analyses through descriptors; and (c) prepare and activate analysis processes. Guaiacas Execution Assistant module is described in this paper, where is also emphasized the parameters to configure, the main data structures to maintain, and the form of the relationship between its generic interface and combined analysis applications. The generic interface has been customized and validated for the peculiarities of two applications, WOMBAT (mixed models) and INTERGEN (Bayesian models). Several data analyses were performed with the interface support to prove its generality and ease of installation, configuration and operation. Data sets from 5,726 quails in

O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma ferramenta de software com interface gráfica amigável, genérica e configurável, para facilitar pesquisadores na organização e gerenciamento das atividades de manipulação e análises de dados. A concepção foi baseada nas características de dois focos principais: a preparação de dados para análises em pesquisas de melhoramento genético de animais e o incremento da usabilidade para aplicativos que implementam importantes métodos de análises, mas interagem com o usuário via arquivos de texto e linha de comando. A ferramenta Guaiaca foi modelada como um cinto de utilidades e desenvolvida na forma de dois assistentes integrados. Pode ser combinada com múltiplos aplicativos executores de análises. Oferece facilidades para: coleta, manipulação e reorganização de dados; organização, catalogação e recuperação de análises via descritores; ativação de processos de análise. Apresenta-se uma descrição sobre o Assistente de Execução destacando os parâmetros configuráveis, as estruturas de dados mantidas e a forma de relacionamento entre a interface genérica e os aplicativos de análise combinados. A personalização de sua interface foi testada para peculiaridades dos aplicativos WOMBAT (modelos mistos) e INTERGEN (modelos bayesianos). Foram realizadas diversas análises para comprovar sua generalidade e facilidade de instalação, configuração e opera

Guaiaca a software tool for supporting the use of scientific applications designed for data analysis part I: execution assistant / Guaiaca uma ferramenta de apoio ao uso de aplicativos científicos destinados a análises de dados parte I: assistente de execução

The aim of this work is to develop a software tool that provides a user-friendly graphical interface of generic and configurable design in order to ease the researchers tasks in data manipulation and analysis. Two primary targets have influenced the design: data preparation for analysis in animal breeding programs and usability increase for those applications that perform important analysis methods, but interact with users only through text files and command lines. The Guaiaca tool was designed as a utility belt in the form of two integrated assistants, and it can be combined with multiple analysis applications. This tool offers facilities to: (a) collect, manipulate, and reorganize data; (b) organize, register, and retrieve analyses through descriptors; and (c) prepare and activate analysis processes. Guaiacas Execution Assistant module is described in this paper, where is also emphasized the parameters to configure, the main data structures to maintain, and the form of the relationship between its generic interface and combined analysis applications. The generic interface has been customized and validated for the peculiarities of two applications, WOMBAT (mixed models) and INTERGEN (Bayesian models). Several data analyses were performed with the interface support to prove its generality and ease of installation, configuration and operation. Data sets from 5,726 quails in

O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma ferramenta de software com interface gráfica amigável, genérica e configurável, para facilitar pesquisadores na organização e gerenciamento das atividades de manipulação e análises de dados. A concepção foi baseada nas características de dois focos principais: a preparação de dados para análises em pesquisas de melhoramento genético de animais e o incremento da usabilidade para aplicativos que implementam importantes métodos de análises, mas interagem com o usuário via arquivos de texto e linha de comando. A ferramenta Guaiaca foi modelada como um cinto de utilidades e desenvolvida na forma de dois assistentes integrados. Pode ser combinada com múltiplos aplicativos executores de análises. Oferece facilidades para: coleta, manipulação e reorganização de dados; organização, catalogação e recuperação de análises via descritores; ativação de processos de análise. Apresenta-se uma descrição sobre o Assistente de Execução destacando os parâmetros configuráveis, as estruturas de dados mantidas e a forma de relacionamento entre a interface genérica e os aplicativos de análise combinados. A personalização de sua interface foi testada para peculiaridades dos aplicativos WOMBAT (modelos mistos) e INTERGEN (modelos bayesianos). Foram realizadas diversas análises para comprovar sua generalidade e facilidade de instalação, configuração e opera

Seleção da matriz de variância-covariância residual na análise de ensaios varietais com medidas repetidas em cana-de-açúcar / Selection of the residual variance-covariance matrix in the analysis of varietal trials with repeated measures in sugarcane

Este trabalho objetivou avaliar diferentes estruturas da matriz de variâncias e covariâncias residual (), quanto ao ajustamento de dados longitudinais via modelos mistos, em experimentos varietais de cana-de-açúcar. A seleção adequada desta matriz garante a escolha de um modelo mais representativo dos dados. Em cada modelagem, variou-se ainda a suposição associada aos efeitos de tratamentos (variedades), como fixos e aleatórios. Quatro ensaios varietais, conduzidos entre 2005 e 2009, em três localidades do Estado de Goiás, foram considerados. Cada experimento foi delineado em blocos casualizados com três ou quatro repetições. A variável resposta analisada foi toneladas de colmos por hectare (TCH). Para avaliar a qualidade de ajustamento dos modelos, foram utilizados o critério de informação de Akaike (AIC) e o teste da razão de verossimilhanças. Este último foi utilizado apenas para comparar modelos hierárquicos, tomados dois a dois. Constatou-se que as análises pelo modelo univariado clássico de parcelas subdivididas oscilaram entre as piores ou entre aquelas de ajustes apenas medianos. As estruturas da matriz com os melhores ajustamentos variaram entre os ensaios, com destaque para a matriz não-estruturada. Tais resultados revelam que a estrutura de erros independentes, em geral, não se mostra adequada para esse tipo de análise e, também, que não é seguro definir previamente uma estrutura específica de para tais ensaios. Pequenas alterações foram observadas na classificação das estruturas ao se assumirem os efeitos de tratamentos como fixos ou aleatórios; porém, sem efeito importante na classificação das melhores estruturas em cada ensaio.(AU)

This study aimed to evaluate different residual structures of variance-covariance matrix (), regarding the fitting of longitudinal data via mixed models in variety trials of sugarcane. The adequate choice of this matrix provides most representative models to the data. In each model was also evaluated the effects of treatments (varieties), either as fixed or as random. Four trials were carried out in three locations in the Goiás State, Brazil, from 2005 to 2009. Each experiment was designed in randomized complete block with three or four repetitions. The response variable analyzed was tons of stalks per hectare (TCH). The goodness of fitting of the different models to the data was assessed by Akaike information criterion (AIC) and by likelihood ratio test (LRT). This last statistic was used only to compare nested models, two by two. It was observed that classic model in split-plot design ranged among the worst or with just median adjustments. The structures of matrix with the best fittings to the data varied among trials, with outstanding for the unstructured matrix. These results show that the structure of independent errors, in general, is not adequate for these analyses, and a prior definition of the co-variance structure can lead to unreliable results for these trials. Small changes were observed in the ranking of these structures by assuming the treatment effects as fixed or random, however, without significant effects on the ranking of the best structures in each trial.(AU)

Seleção da matriz de variância-covariância residual na análise de ensaios varietais com medidas repetidas em cana-de-açúcar / Selection of the residual variance-covariance matrix in the analysis of varietal trials with repeated measures in sugarcane

Este trabalho objetivou avaliar diferentes estruturas da matriz de variâncias e covariâncias residual (Σ), quanto ao ajustamento de dados longitudinais via modelos mistos, em experimentos varietais de cana-de-açúcar. A seleção adequada desta matriz garante a escolha de um modelo mais representativo dos dados. Em cada modelagem, variou-se ainda a suposição associada aos efeitos de tratamentos (variedades), como fixos e aleatórios. Quatro ensaios varietais, conduzidos entre 2005 e 2009, em três localidades do Estado de Goiás, foram considerados. Cada experimento foi delineado em blocos casualizados com três ou quatro repetições. A variável resposta analisada foi toneladas de colmos por hectare (TCH). Para avaliar a qualidade de ajustamento dos modelos, foram utilizados o critério de informação de Akaike (AIC) e o teste da razão de verossimilhanças. Este último foi utilizado apenas para comparar modelos hierárquicos, tomados dois a dois. Constatou-se que as análises pelo modelo univariado clássico de parcelas subdivididas oscilaram entre as piores ou entre aquelas de ajustes apenas medianos. As estruturas da matriz Σ com os melhores ajustamentos variaram entre os ensaios, com destaque para a matriz não-estruturada. Tais resultados revelam que a estrutura de erros independentes, em geral, não se mostra adequada para esse tipo de análise e, também, que não é seguro definir previamente uma estrutura específica de Σ para tais ensaios. Pequenas alterações foram observadas na classificação das estruturas ao se assumirem os efeitos de tratamentos como fixos ou aleatórios; porém, sem efeito importante na classificação das melhores estruturas em cada ensaio.

This study aimed to evaluate different residual structures of variance-covariance matrix (Σ), regarding the fitting of longitudinal data via mixed models in variety trials of sugarcane. The adequate choice of this matrix provides most representative models to the data. In each model was also evaluated the effects of treatments (varieties), either as fixed or as random. Four trials were carried out in three locations in the Goiás State, Brazil, from 2005 to 2009. Each experiment was designed in randomized complete block with three or four repetitions. The response variable analyzed was tons of stalks per hectare (TCH). The goodness of fitting of the different models to the data was assessed by Akaike information criterion (AIC) and by likelihood ratio test (LRT). This last statistic was used only to compare nested models, two by two. It was observed that classic model in split-plot design ranged among the worst or with just median adjustments. The structures of Σ matrix with the best fittings to the data varied among trials, with outstanding for the unstructured matrix. These results show that the structure of independent errors, in general, is not adequate for these analyses, and a prior definition of the co-variance structure can lead to unreliable results for these trials. Small changes were observed in the ranking of these structures by assuming the treatment effects as fixed or random, however, without significant effects on the ranking of the best structures in each trial.

Performance of sugarcane families at different stages in the genetic improvement by REML/BLUP / Desempenho de famílias de cana-de-açúcar em diferentes fases no melhoramento genético via REML/BLUP

The objective of this work was to select the best sugarcane families to increase productivity (TCH) in T1 stage and monitor their performance in stages T2 and T3 of the sugarcane breeding program (PMGCA / UFPR / RIDESA). The experiments of stages T1 and T2 were performed at the experimental station of Paranavaí (PR) and T3 stage was installed in three locations in the northwestern of Paraná State. In the first phase (T1) 40 full-sib families from bi-parental crosses were evaluated and were correlated with selected families in the next stage of selection (T2), comparing the number of genotypes indicated by BLUPIS, and the number of clones that composed the T2 stage, by bulk selection. Data were analyzed by REML/BLUP methodology. In T1 stage, twenty and two (22) families were selected for T2 stage, and seven families were selected for T3 stage, being results of the crosses RB835486 x RB72454, SP70-1143 x RB855156, RB835054 x SP83-2847, SP80-3280 x RB835054, RB855156 x SP80-1816, SP80-3280 x RB855589, and SP80-3280 x RB835486. The BLUPIS selection procedure allowed the indication of a greater number of potential families and clones within these families. The genotypes with improved performance in subsequent phases were derived from families with positive genotypic values and yield above experimental average in the T1 stage.(AU)

O objetivo deste trabalho foi selecionar as melhores famílias de cana-de-açúcar para aumento de produtividade (TCH) na fase T1 e acompanhar seu desempenho nas fases T2 e T3 do programa de melhoramento genético da cana-de-açúcar (PMGCA/UFPR/RIDESA). Os experimentos das fases T1 e T2 foram realizados na estação experimental de Paranavaí (PR) e a fase T3 foi instalada em três locais da região noroeste do estado do Paraná. Na primeira fase (T1) foram avaliadas 40 famílias de irmãos-completos oriundos de cruzamentos bi-parentais e foram correlacionados com as famílias selecionadas na etapa seguinte de seleção (T2), comparando o número de genótipos indicado pelo BLUPIS e o número de clones que compuseram o T2, via seleção massal. Os dados foram analisados via metodologia REML/BLUP. Vinte e duas (22) famílias foram selecionadas para a fase T2 e sete famílias foram selecionadas para a fase T3, sendo resultados dos cruzamentos RB835486 x RB72454; RB855156 x SP70-1143; RB835054 x SP83-2847; RB835054 x SP80-3280; SP80-1816 x RB855156; SP80-3280 x RB855589; e SP80-3280 x RB835486. A seleção via procedimento BLUPIS permitiu indicar maior número de famílias potenciais e clones dentro destas famílias. Os genótipos com melhor desempenho nas fases seguintes foram originados das famílias com valores genotípicos positivos e produtividade acima da média experimental em T1.(AU)

Multivariate genetic divergence among sugarcane clones by multivariate analysis associated with mixed models / Divergência genética entre clones de cana-de-açúcar usando análise multivariada associada a modelos mistos

This work had the aim to evaluate the genetic divergence in sugarcane clones using the methodology of graphic dispersion by principal components analysis associated to linear mixed models, indentifying the more divergent and productive genotypes with more precision, for a subsequent combination. 138 sugarcane clones of the RB97 series of the Sugarcane Breeding Program of the Universidade Federal do Parana, more two standard cultivars were evaluated in three environments, with two replications. The two first components explained 96% of the total variation, sufficiently for explaining the divergence found. The variable that contributed the most to de divergence was kilogram of brix per plot (BKP) followed by brix, mass of 10 stalks and number of stalks per plot. The more divergent sugarcane clones were RB975008, RB975112, RB975019, RB975153 and RB975067 and the more productive clones were RB975269, RB977533, RB975102, RB975317 and RB975038.(AU)

Este trabalho teve como objetivo avaliar a divergência genética em clones da cana-de-açúcar usando a metodologia de dispersão gráfica por componentes principais associada aos modelos lineares mistos, identificando quais os genótipos mais divergentes e os mais produtivos de forma mais precisa, para posterior combinação. Foram avaliados 138 clones de cana-de-açúcar da Série RB97 do Programa de Melhoramento Genético de Cana-de-Açúcar da Universidade Federal do Paraná, mais duas variedades padrões, em três ambientes, com duas repetições. Os dois primeiros componentes explicaram 96% da variação total, sendo suficientes para explicar a divergência encontrada. A característica que mais contribuiu para a divergência genética foi quilograma de brix por parcela (KBP), seguida por brix, massa de 10 colmos (M10) e número de colmos por parcela (NCP). Os clones mais divergentes foram RB975008, RB975112, RB975019, RB975153 e RB975067 e os clones mais produtivos foram RB975269, RB977533, RB975102, RB975317 e RB975038.(AU)

Performance of sugarcane families at different stages in the genetic improvement by REML/BLUP / Desempenho de famílias de cana-de-açúcar em diferentes fases no melhoramento genético via REML/BLUP

The objective of this work was to select the best sugarcane families to increase productivity (TCH) in T1 stage and monitor their performance in stages T2 and T3 of the sugarcane breeding program (PMGCA / UFPR / RIDESA). The experiments of stages T1 and T2 were performed at the experimental station of Paranavaí (PR) and T3 stage was installed in three locations in the northwestern of Paraná State. In the first phase (T1) 40 full-sib families from bi-parental crosses were evaluated and were correlated with selected families in the next stage of selection (T2), comparing the number of genotypes indicated by BLUPIS, and the number of clones that composed the T2 stage, by bulk selection. Data were analyzed by REML/BLUP methodology. In T1 stage, twenty and two (22) families were selected for T2 stage, and seven families were selected for T3 stage, being results of the crosses RB835486 x RB72454, SP70-1143 x RB855156, RB835054 x SP83-2847, SP80-3280 x RB835054, RB855156 x SP80-1816, SP80-3280 x RB855589, and SP80-3280 x RB835486. The BLUPIS selection procedure allowed the indication of a greater number of potential families and clones within these families. The genotypes with improved performance in subsequent phases were derived from families with positive genotypic values and yield above experimental average in the T1 stage.

O objetivo deste trabalho foi selecionar as melhores famílias de cana-de-açúcar para aumento de produtividade (TCH) na fase T1 e acompanhar seu desempenho nas fases T2 e T3 do programa de melhoramento genético da cana-de-açúcar (PMGCA/UFPR/RIDESA). Os experimentos das fases T1 e T2 foram realizados na estação experimental de Paranavaí (PR) e a fase T3 foi instalada em três locais da região noroeste do estado do Paraná. Na primeira fase (T1) foram avaliadas 40 famílias de irmãos-completos oriundos de cruzamentos bi-parentais e foram correlacionados com as famílias selecionadas na etapa seguinte de seleção (T2), comparando o número de genótipos indicado pelo BLUPIS e o número de clones que compuseram o T2, via seleção massal. Os dados foram analisados via metodologia REML/BLUP. Vinte e duas (22) famílias foram selecionadas para a fase T2 e sete famílias foram selecionadas para a fase T3, sendo resultados dos cruzamentos RB835486 x RB72454; RB855156 x SP70-1143; RB835054 x SP83-2847; RB835054 x SP80-3280; SP80-1816 x RB855156; SP80-3280 x RB855589; e SP80-3280 x RB835486. A seleção via procedimento BLUPIS permitiu indicar maior número de famílias potenciais e clones dentro destas famílias. Os genótipos com melhor desempenho nas fases seguintes foram originados das famílias com valores genotípicos positivos e produtividade acima da média experimental em T1.

Multivariate genetic divergence among sugarcane clones by multivariate analysis associated with mixed models / Divergência genética entre clones de cana-de-açúcar usando análise multivariada associada a modelos mistos

This work had the aim to evaluate the genetic divergence in sugarcane clones using the methodology of graphic dispersion by principal components analysis associated to linear mixed models, indentifying the more divergent and productive genotypes with more precision, for a subsequent combination. 138 sugarcane clones of the RB97 series of the Sugarcane Breeding Program of the Universidade Federal do Parana, more two standard cultivars were evaluated in three environments, with two replications. The two first components explained 96% of the total variation, sufficiently for explaining the divergence found. The variable that contributed the most to de divergence was kilogram of brix per plot (BKP) followed by brix, mass of 10 stalks and number of stalks per plot. The more divergent sugarcane clones were RB975008, RB975112, RB975019, RB975153 and RB975067 and the more productive clones were RB975269, RB977533, RB975102, RB975317 and RB975038.

Este trabalho teve como objetivo avaliar a divergência genética em clones da cana-de-açúcar usando a metodologia de dispersão gráfica por componentes principais associada aos modelos lineares mistos, identificando quais os genótipos mais divergentes e os mais produtivos de forma mais precisa, para posterior combinação. Foram avaliados 138 clones de cana-de-açúcar da Série RB97 do Programa de Melhoramento Genético de Cana-de-Açúcar da Universidade Federal do Paraná, mais duas variedades padrões, em três ambientes, com duas repetições. Os dois primeiros componentes explicaram 96% da variação total, sendo suficientes para explicar a divergência encontrada. A característica que mais contribuiu para a divergência genética foi quilograma de brix por parcela (KBP), seguida por brix, massa de 10 colmos (M10) e número de colmos por parcela (NCP). Os clones mais divergentes foram RB975008, RB975112, RB975019, RB975153 e RB975067 e os clones mais produtivos foram RB975269, RB977533, RB975102, RB975317 e RB975038.

Postweaning growth of performance-tested buffaloes (Bubalus bubalis, Artiodactyla, Bovidae) reared under no-milking versus a dual-purpose system / Crecimiento posdestete de búfalos (Bubalus bubalis, Artiodactyla, Bovidae) sometidos a pruebas de desempeño provenientes de dos sistemas de manejo predestete: cría sin ordeño y doble propósito / Crescimento pós-desmame para búfalo (Bubalus bubalis, Artiodactyla, Bovidae) emprovas de desempenho a partir dedois sistemas de manejo pré-desmame: sem ordenha e dupla aptidão

Objective: the objective of this study was to compare growth traits in buffaloes reared in farms using a pre-weaning management system with no milking (NM), or a dual-purpose system (DP: meat and milk production). Methods: performance tests were conducted at the Experimental Station of the University of Antioquia, located in Barbosa (Antioquia, Colombia). Buffaloes were confined and fed with fresh Maralfalfa grass (Pennisetum sp.) ad libitum, plus two kilograms of mixed plus two 2 kilograms of concentrate supplement per day. Weight, ultrasound, and bovinometric measurements were taken every 14 d. Bovinometric measurements were chest girth (CG), height at withers (HW), and height at sacrum (HS). Ultrasound measurements were Longissimus muscle area (REA) and rump fat thickness (RFT). Traits were analyzed using a linear regression and second order polynomial model using unstructured variance-covariance matrices and accounting for relationships among animals. Results: all the traits in DP animals, as well as RFT, HW, and HS in NM animals fit well with a second-order regression mixed model. Weight, CG, and REA in NM animals fit well with a first-order regression mixed model. The rate of increase for HW and HS declined at the end of the test in NM animals, while weight, CG, RFT, and REA did not. The DP buffaloes displayed an accelerated rate of increase for all traits towards the end of the evaluation. The non-zero estimates of genetic variances for random regression effects suggests that these characteristics may be improved genetically in Colombia. Environmental and genetic differences among farms may have influenced the high variability among individuals for the intercept. Conclusions: the linear regression variances were small for all traits, suggesting that although selection of animals within these performance tests is possible, expected changes in the buffalo population will be small.

Objetivo: el objetivo de este estudio fue comparar características de crecimiento de búfalos sometidos a pruebas de desempeño, pertenecientes a dos sistemas de producción: cría sin ordeño (CSO) y doble propósito (DP). Métodos: las pruebas se realizaron en la Estación Experimental de la Universidad de Antioquia, ubicada en Barbosa, Colombia. Los animales fueron confinados y alimentados con pasto Maralfalfa (Pennisetum sp.) y dos kilogramos de un suplemento concentrado por día. El peso, las medidas de ultrasonido y bovinométricas fueron tomadas cada 14 días. Las medidas bovinométricas fueron perímetro torácico (PT), altura a la cruz (AC) y altura al sacro (AS). Las medidas por ultrasonido fueron área del músculo Longissimus (AOL) y espesor de grasa de la cadera (EGC). Las características fueron analizadas utilizando un modelo de regresión lineal mixto de primer orden y polinomial de segundo orden, con matrices de varianzas y covarianzas sin estructura, teniendo en cuenta la matriz de parentesco entre los animales. Resultados: todas las características en los animales provenientes del sistema DP y las caracteristicas EGC, AC y AS en animales de CSO, presentaron un mejor ajuste al modelo de regresión de segundo orden. El peso, PT y AOL en animales de CSO ajustaron mejor con un modelo de regresión de primer orden. La tasa de incremento de AC y AS en los búfalos de CSO declinó al final de la prueba, mientras que las otras características no presentaron disminución. Los búfalos del sistema DP aceleraron la tasa de incremento para todas las características al final de la evaluación. Las varianzas genéticas estimadas para los coeficientes de regresión fueron diferentes de cero, sugiriendo que estas características pueden ser mejoradas genéticamente en Colombia. Diferencias ambientales y genéticas entre fincas pueden haber influido en la alta variabilidad del intercepto entre los individuos. Conclusiones: las varianzas de los coeficientes de la regresión lineal fueron pequeñas para todas las características, sugiriendo que, aunque la selección de animales en pruebas de desempeño es posible, los cambios esperados en la población de búfalos serán pequeños.

Objetivo: o objetivo deste estudo foi comparar as características de crescimento de búfalos submetidos em testes de desempenho. Estes búfalos foram provenientes de fazendas de gado de corte (CSO) ou dupla aptidão (DP). Métodos: as provas foram conduzidas na Estação Experimental da Universidade de Antioquia, localizada no município de Barbosa, na Colômbia. Os animais foram confinados e alimentados com capim Maralfalfa (Pennisetum sp.) e dois kg de suplemento por dia. Medidas morfométricas, de pesagem e ultrassom foram realizadas a cada 14 dias. As medidas morfométricas foram: perímetro torácico (PT), altura de cernelha (AC) e altura da garupa (AS). As mensurações de ultrassom foram: área do olho do lombo (AOL) e espessura de gordura na anca (EGA). As características foram analisadas utilizando um modelo de regressão linear misto de primeira ordem e polinomial de segunda ordem, com uma matriz de variância e covariância não estruturada, tendo em conta a matriz de parentesco entre os animais. Resultados: todas as características em búfalos provenientes do sistema DP e as características EGA, AC e AS em búfalos do sistema CSO, apresentaram um melhor ajuste em regressões de segunda ordem. O Peso, PT e AOL em animais provenientes do sistema CSO, ajustaram se melhor em regressões de primeira ordem. Em animais do sistema CSO a taxa de incremento da AC e AS diminuiu no final do período, as outras características não apresentaram diminuição. Os búfalos do sistema DP apresentaram um aumento considerável de todas as características ao final da avaliação. A variância genética estimada para os coeficientes de regressão foram diferentes de zero, o que sugere que estas características podem ser melhoradas geneticamente na Colômbia. Diferenças ambientais e genéticas entre as fazendas podem ter influenciado na alta variabilidade do intercepto entre os indivíduos. Conclusões: as variâncias do coeficiente de regressão linear foram pequenas para todas as características, sugerindo que, embora a seleção de animais em testes de desempenho seja possível, as mudanças esperadas na população de búfalos serão pequenas.

Cattle genetic evaluation: a historical perception / La evaluación genética de vacunos: una percepción histórica / A avaliação genética de bovinos: uma percepçã

Mixed model methodology has been the main statistical tool for unbiased genetic animal evaluation and selection of domestic animals, such as bovines, for over thirty years. Since the use of linear mixed models to obtain the best linear unbiased prediction of the breeding value of the individuals in a population was proposed, there have been scientific advances at the statistical and computational level that have led to implement more complex models describing different biological situations and data structures. This work briefly reviews the history of genetic evaluation in cattle emphasizing on the mixed model methodology in which these evaluations are based. The following topics are discussed in this paper: The unibreed animal model, the derivation of the mixed model equations, some extensions of the unibreed animal model (additive direct and maternal effects, random environmental effects, multiple traits model), the mutibreed animal model, models for the genetic evaluation of longitudinal data and, finally, a brief description of genomic evaluation.

La metodología de modelos mixtos ha sido la principal herramienta estadística para la evaluación y la selección de animales domésticos tales como el vacuno durante más de 30 años. Desde que se propuso el uso de modelos lineales mixtos para obtener los mejores predictores lineales insesgados de los valores genéticos de los individuos en una población se han dado avances científicos a nivel estadístico y computacional que han permitido implementar modelos más complejos, los cuales describen diferentes situaciones biológicas y estructuras de datos. En el presente trabajo se hace una breve revisión de la historia de las evaluaciones genéticas en vacunos haciendo énfasis en la metodología de modelos mixtos en la cual se han basado dichas evaluaciones. Los siguientes tópicos son descritos en este documento: El modelo animal unirracial, la derivación de las ecuaciones de modelos mixtos, algunas extensiones del modelo animal unirracial (efectos aditivos directos y maternos, efectos ambientales aleatorios, modelo para múltiples caracteres), el modelo animal multirracial, modelos para la evaluación genética de datos longitudinales y finalmente una breve descripción de la evaluación genómica.

A metodologia dos modelos mistos tem sido a principal ferramenta estatística para a avaliação e seleção de animais domésticos, como ocorreu em bovinos há mais de trinta anos. Desde sua proposta, o uso de modelos lineares mistos, para obter os melhores preditores lineares imparciais dos valores genéticos de indivíduos de uma população, têm sofrendo avanços científicos a nível estatístico e computacional, tornando-se possível implementar modelos mais complexos que descrevem diferentes situações biológicas e estruturas de dados. No presente trabalho, é feita uma breve revisão histórica sobre as avaliações genéticas em bovinos, com ênfase na metodologia de modelos mistos, na qual estas avaliações são baseadas. Os seguintes tópicos são descritos neste documento: o modelo animal unirracial, a derivação das equações de modelos mistos, algumas extensões do modelo animal unirracial (efeitos aditivos direto e materno, efeitos aleatórios ambientais, modelos multicaracterísticas), o modelo animal multirracial, modelos para a avaliação genética de dados longitudinais e, finalmente, uma breve descrição da avaliação genômica.

Curva de crescimento usando modelo misto: uma aplicação na progressão da Doença de Machado-Joseph / Growth curve using mixed model: an application on Machado-Joseph Disease progression

Introdução: A obtenção dos dados por meio de medidas repetidas em diversas ocasiões no tempo em um mesmo sujeito torna possível o ajuste de curvas que descrevam padrões de evolução e identificam preditores de evolução. O objetivo deste trabalho foi ajustar curvas para descrever a progressão da doença de Machado-Joseph (DMJ), quantificada pelo escore NESSCA (Neurological Examination Score for Spinocerebellar Ataxia), utilizando modelos mistos. Métodos: Os dados foram obtidos de uma coorte de pacientes da DMJ acompanhada no Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA) durante um período de 10 anos. Nas avaliações clínicas realizadas, o comprometimento clínico do paciente foi mensurado várias vezes através do escore NESSCA. Esse escore foi considerado como desfecho, e a progressão da doença poderia ser influenciada pelas variáveis explicativas: idade no início da doença e comprimento da mutação. O procedimento Proc MIXED do software SAS foi utilizado para realizar o ajuste dos modelos. Resultados: Progressão da doença ocorre mais lentamente com o aumento na idade de início da doença, por outro lado, com o aumento do comprimento da mutação, mais rápida é a progressão da doença. Conclusão: Uma maior idade no início da doença é fator de proteção para a progressão da DMJ e um maior comprimento da mutação é fator de risco. Ressalta-se que as atribuições de proteção e risco estão relacionadas exclusivamente com a velocidade de progressão da doença, não sendo observados efeitos significativos dessas variáveis para o escore no início da doença.

Background: Obtaining data with repeated measures in different occasions, from the same patient, makes the growth curve adjustment possible. These curves describe evolution patterns and identify evolution predictors. The main purpose of this study was to adjust growth curve to describe Machado-Joseph disease progression (MJD), quantified by the NESSCA score (Neurological Examination Score for Spinocerebellar Ataxia) using linear mixed model. Methods: the data were obtained from a cohort of MJD patients observed at Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA) during 10 years. In the clinical evaluation performed, the clinical implications of these patients were measured by the NESSCA score. In order to accomplish the data analysis, the NESSCA score was used as an outcome and it was considered that the disease progression could be influenced by explaining variables such as age at onset and CAG length. The procedure Proc MIXED of the software SAS was used to perform the models adjustment. Results: the disease progression is slower with the increase of age at onset, on the other hand, the progression of the disease is faster with CAG length increase. Conclusion: a higher age at onset is a protection factor to the MJD progression and a higher CAG length is a risk factor. It is highlighted that the attributions of protection and risk are exclusively related with the progression speed of the disease, since there were no significant effects of these variables to the score at the beginning of the disease.

Metanálise da relação entre espessura de toicinho e variáveis nutricionais de porcas gestantes e lactantes / Meta-analysis of relation among backfat thickness and nutritional variables of gestating and lactating sows

Uma metanálise foi realizada para avaliar a relação entre a espessura de toicinho e as variáveis nutricionais de porcas gestantes e lactantes. A base de dados contemplou 14 artigos publicados de 2000 a 2006 em revistas indexadas. A metanálise foi realizada através de análises gráfica, de correlação e de variância. A correlação entre espessura de toicinho na gestação (ETg) com consumo de alimento na gestação (CAl G) foi de -0,09 (P=0,04), com CAl na lactação (CAl L) baseado na tabela NRC (1998) foi de -0,09 (P=0,06), com CAl na lactação baseado na tabela Rostagno (2000) foi de -0,08 (P=0,06) e com consumo de proteína bruta na lactação (CAl L PB) foi de -0,08 (P=0,06). A correlação entre espessura de toicinho na lactação (ETl) com CAl na gestação foi de 0,29 (P<0,01), com CAl na gestação NRC (1998) foi de 0,20 (P<0,01), com CAl na gestação Rostagno (2000) foi de 0,20 (P<0,01), com CAl na lactação foi de -0,21 (P<0,01), com consumo na lactação NRC (1998) foi de -0,24 (P<0,01) e com consumo na lactação Rostagno (2000) foi de 0,24 (P<0,01). O CAl de PB na gestação foi de 0,20 (P<0,01) e o CAl de PB na lactação foi de -0,26 (P<0,01). A variação da espessura de toicinho durante a lactação é influenciada pelos níveis de proteína e lisina da dieta e pela gordura e proteína no leite. A variação da espessura de toicinho na gestação e na lactação foi semelhante para as tabelas do NRC (1998) e de Rostagno (2000). Há relação significativa entre espessura de toicinho e variáveis nutricionais em porcas gestantes e lactantes.(AU)

A meta-analysis was undertaken to evaluate the relationship between backfat thickness and nutritional variables of sows during gestation and lactation. The database was developed from 14 studies published between 2000 and 2006. The meta-analysis was carried out trough by graphical analysis, correlation and variance. The correlation between backfat thickness at gestation (BTg) and feed intake (FI) at this phase was -0.09 (P=0.04). The correlation between backfat thickness at gestation (BTg) and lactation FI NRC (1998) was -0.09 (P=0.06); BTg and FI at lactation Rostagno (2000) presented a correlation of-0.08 (P=0.06). In the same way the correlation between BTg and crude protein (CP) intake at lactation was -0.08 (P=0.06). The correlation between backfat thickness at lactation (BTl) and FI at gestation was 0.29 (P<0.01). BTl and FI at gestation NRC (1998) presented a correlation of 0.20 (P<0.01). For BTl and gestation feed intake Rostagno (2000) a correlation of 0.20 (P<0.01) was reported. The correlation between BTl and lactation FI was -0.21 (P<0.01), the correlations between BTl and lactation FI NRC (1998) were -0.24 (P<0.01) and lactation FI Rostagno (2000) 0.24 (P<0.01). Correlations of 0.20 (P<0.01) and -0.26 (P<0.01) were observed between BTl and CP intake at gestation and CP intake at lactation respectively. The backfat thickness variation at lactation is influenced by protein and lysine levels in the diet and fat and protein of the milk. Gestation and lactation backfat thickness variation was similar to NRC (1998) and Rostagno (2000). There is a significant relationship between backfat thickness and nutritional variables in pregnant and farrowing sows.(AU)

Metanálise da relação entre espessura de toicinho e variáveis nutricionais de porcas gestantes e lactantes / Meta-analysis of relation among backfat thickness and nutritional variables of gestating and lactating sows

Uma metanálise foi realizada para avaliar a relação entre a espessura de toicinho e as variáveis nutricionais de porcas gestantes e lactantes. A base de dados contemplou 14 artigos publicados de 2000 a 2006 em revistas indexadas. A metanálise foi realizada através de análises gráfica, de correlação e de variância. A correlação entre espessura de toicinho na gestação (ETg) com consumo de alimento na gestação (CAl G) foi de -0,09 (P=0,04), com CAl na lactação (CAl L) baseado na tabela NRC (1998) foi de -0,09 (P=0,06), com CAl na lactação baseado na tabela Rostagno (2000) foi de -0,08 (P=0,06) e com consumo de proteína bruta na lactação (CAl L PB) foi de -0,08 (P=0,06). A correlação entre espessura de toicinho na lactação (ETl) com CAl na gestação foi de 0,29 (P<0,01), com CAl na gestação NRC (1998) foi de 0,20 (P<0,01), com CAl na gestação Rostagno (2000) foi de 0,20 (P<0,01), com CAl na lactação foi de -0,21 (P<0,01), com consumo na lactação NRC (1998) foi de -0,24 (P<0,01) e com consumo na lactação Rostagno (2000) foi de 0,24 (P<0,01). O CAl de PB na gestação foi de 0,20 (P<0,01) e o CAl de PB na lactação foi de -0,26 (P<0,01). A variação da espessura de toicinho durante a lactação é influenciada pelos níveis de proteína e lisina da dieta e pela gordura e proteína no leite. A variação da espessura de toicinho na gestação e na lactação foi semelhante para as tabelas do NRC (1998) e de Rostagno (2000). Há relação significativa entre espessura de toicinho e variáveis nutricionais em porcas gestantes e lactantes.

A meta-analysis was undertaken to evaluate the relationship between backfat thickness and nutritional variables of sows during gestation and lactation. The database was developed from 14 studies published between 2000 and 2006. The meta-analysis was carried out trough by graphical analysis, correlation and variance. The correlation between backfat thickness at gestation (BTg) and feed intake (FI) at this phase was -0.09 (P=0.04). The correlation between backfat thickness at gestation (BTg) and lactation FI NRC (1998) was -0.09 (P=0.06); BTg and FI at lactation Rostagno (2000) presented a correlation of-0.08 (P=0.06). In the same way the correlation between BTg and crude protein (CP) intake at lactation was -0.08 (P=0.06). The correlation between backfat thickness at lactation (BTl) and FI at gestation was 0.29 (P<0.01). BTl and FI at gestation NRC (1998) presented a correlation of 0.20 (P<0.01). For BTl and gestation feed intake Rostagno (2000) a correlation of 0.20 (P<0.01) was reported. The correlation between BTl and lactation FI was -0.21 (P<0.01), the correlations between BTl and lactation FI NRC (1998) were -0.24 (P<0.01) and lactation FI Rostagno (2000) 0.24 (P<0.01). Correlations of 0.20 (P<0.01) and -0.26 (P<0.01) were observed between BTl and CP intake at gestation and CP intake at lactation respectively. The backfat thickness variation at lactation is influenced by protein and lysine levels in the diet and fat and protein of the milk. Gestation and lactation backfat thickness variation was similar to NRC (1998) and Rostagno (2000). There is a significant relationship between backfat thickness and nutritional variables in pregnant and farrowing sows.

Efeito da duração da amamentação predominante no crescimento infantil: um estudo prospectivo com modelos não lineares de efeitos mistos / Effect of predominant breastfeeding duration on infant growth: prospective study using nonlinear mixed effect models

OBJETIVO: Avaliar o efeito da duração da amamentação predominante no crescimento infantil com uso de modelos para medidas repetidas. MÉTODOS: Trata-se de estudo prospectivo com quatro ondas de seguimento realizadas com aproximadamente 0,5, 2, 6 e 9 meses pós-parto, que incluiu entrevistas estruturadas e coleta de dados de peso, comprimento e sobre práticas de aleitamento. O estudo foi desenvolvido em um Centro Municipal de Saúde no Rio de Janeiro, Brasil, entre 1999 e 2001. Quatrocentos e setenta e nove mulheres e seus filhos foram estudados. As variáveis dependentes foram o peso e o comprimento, aferidas em cinco momentos (ao nascimento, 0,5, 2, 6 e 9 meses). O crescimento foi analisado usando modelos não lineares de efeitos mistos. RESULTADOS: Crianças com maior duração de aleitamento predominante apresentaram maior velocidade de crescimento durante os primeiros meses de vida, mas alcançaram peso e comprimento de equilíbrio menor quando comparadas com crianças que receberam outros leites não humanos no início da vida. A idade na qual a velocidade de crescimento de crianças alimentadas com fórmulas tornou-se maior do que as amamentadas foi de 6,75 meses para meninos e 7 meses para meninas. CONCLUSÕES: Esse estudo confirma a presença de diferenças no crescimento físico segundo práticas de aleitamento a partir dos 6 meses de vida. O uso de modelos não lineares permitiu maior precisão na estimativa dos parâmetros. Acredita-se que essa abordagem facilite a análise e interpretação de dados de crescimento nos níveis individual e populacional.

OBJECTIVE: The aim of this study is to assess the effect of predominant breastfeeding duration on infant growth by means of repeated measurements model. METHODS: This prospective study is comprised of four follow-up evaluations at approximately 0.5, 2, 6 and 9 months after birth, including structured interviews that simultaneously gathered information regarding infant growth and breastfeeding practices. The study took place in a healthcare center in Rio de Janeiro, Brazil, from 1999 to 2001. Four hundred seventy-nine postpartum women and their newborns were enrolled in the cohort. Body weight and length measurements taken at five different occasions (birth, 0.5, 2, 6, and 9 months) constituted the dependent variables. We expressed the growth process using nonlinear mixed models. RESULTS: Infants with longer predominant breastfeeding duration, although growing faster in the first months of life, reached an inferior equilibrium body weight and length compared to infants who received nonhuman milk earlier in life. The age at which the rate of weight gain of the formula-fed infants becomes greater than that of the breastfed infants is approximately 6.75 months for boys and 7 months for girls. CONCLUSIONS: This study confirms the differences observed in infant growth according to different breastfeeding practices starting from the sixth month of life. Use of nonlinear models allowed for a greater precision of parameter estimates. We believe that this approach facilitates the analysis and interpretation of growth data at the individual and population levels.

Esperanças matemáticas dos quadrados médios: uma análise essencial

This research was aimed at evaluating and identifing which type of sum of squares can be more appropriate to test hypotheses and also presenting appropriate alternatives to solution of problems through the analysis of mean square expected values used in the methodology of mixed linear models. The analysis of mean square expected values can be a tool of great importance in analysis of data as incomplete (empty casela) as unbalanced experiment. Therefore, four examples were used each one with its pecualiarity concerning the complete or incomplete experiment with balanced or unbalanced data and in the presence of empty casela. The SAS statistical package, version Learning Edition, was used to analyze the experiments. The result of the analysis of mean square expected values indicated that the sum of squares of the type ‘I can be used only at of condition of completely balanced data. These results indicated on the other hand, that the sum of squares of the type ‘III is the most appropriate type for unbalanced data. The sum of squares of the type ‘II and ‘IV are the most important in the case of empty caselas; fact that supports the idea of a necessity of always evaluating the mean square expected values.

Este trabalho teve como objetivo avaliar e identificar qual o tipo de soma de quadrados mais apropriada para testar hipóteses de interesse, assim como discutir alternativas mais adequadas para a solução de inconvenientes expressos por meio da análise da esperança matemática dos quadrados médios utilizados em modelos lineares mistos. A análise das esperanças matemáticas dos quadrados médios pode ser uma ferramenta de grande importância nas inferências a partir de dados experimentais, tanto incompletos (casela vazia) quanto não-balanceados. Desta forma, foram utilizados quatro exemplos, cada qual com sua peculiaridade em função do experimento ser completo ou incompleto com dados balanceados ou não-balanceados e na presença de casela vazia. O pacote estatístico SAS, versão Learning Edition, foi empregado para analisar os experimentos. O resultado da análise das esperanças matemáticas dos quadrados médios indicou que a soma de quadrados do tipo I somente apresentou condições de ser utilizada em presença de dados completamente balanceados. De modo contrário, os resultados apontam que a soma de quadrados tipo III é a soma de quadrados mais apropriada no caso de dados não-balanceados. As somas de quadrados tipo II e IV são as mais importantes no caso de caselas vazias, fato que corrobora a necessidade de avaliar sempre as esperanças matemáticas dos quadrados médios.

Esperanças matemáticas dos quadrados médios: uma análise essencial

This research was aimed at evaluating and identifing which type of sum of squares can be more appropriate to test hypotheses and also presenting appropriate alternatives to solution of problems through the analysis of mean square expected values used in the methodology of mixed linear models. The analysis of mean square expected values can be a tool of great importance in analysis of data as incomplete (empty casela) as unbalanced experiment. Therefore, four examples were used each one with its pecualiarity concerning the complete or incomplete experiment with balanced or unbalanced data and in the presence of empty casela. The SAS statistical package, version Learning Edition, was used to analyze the experiments. The result of the analysis of mean square expected values indicated that the sum of squares of the type ‘I’ can be used only at of condition of completely balanced data. These results indicated on the other hand, that the sum of squares of the type ‘III’ is the most appropriate type for unbalanced data. The sum of squares of the type ‘II’ and ‘IV’ are the most important in the case of empty caselas; fact that supports the idea of a necessity of always evaluating the mean square expected values.

Este trabalho teve como objetivo avaliar e identificar qual o tipo de soma de quadrados mais apropriada para testar hipóteses de interesse, assim como discutir alternativas mais adequadas para a solução de inconvenientes expressos por meio da análise da esperança matemática dos quadrados médios utilizados em modelos lineares mistos. A análise das esperanças matemáticas dos quadrados médios pode ser uma ferramenta de grande importância nas inferências a partir de dados experimentais, tanto incompletos (casela vazia) quanto não-balanceados. Desta forma, foram utilizados quatro exemplos, cada qual com sua peculiaridade em função do experimento ser completo ou incompleto com dados balanceados ou não-balanceados e na presença de casela vazia. O pacote estatístico SAS, versão Learning Edition, foi empregado para analisar os experimentos. O resultado da análise das esperanças matemáticas dos quadrados médios indicou que a soma de quadrados do tipo I somente apresentou condições de ser utilizada em presença de dados completamente balanceados. De modo contrário, os resultados apontam que a soma de quadrados tipo III é a soma de quadrados mais apropriada no caso de dados não-balanceados. As somas de quadrados tipo II e IV são as mais importantes no caso de caselas vazias, fato que corrobora a necessidade de avaliar sempre as esperanças matemáticas dos quadrados médios.