The importance of deep genotyping in crop breeding / La importancia de la genotipificación profunda en el mejoramiento genético

ABSTRACT One of the greatest challenges facing humanity is the development of sustainable strategies to ensure food availability in response to population growth and climate change. One approach that can contribute to increase food security is to close yield gaps and enhancing genetic gain; to such end, what is known as "molecular breeding" plays a fundamental role. Since a crop breeding program is mainly based on the quality of the germplasm, its detailed genetic characterization is mandatory to ensure the efficient use of genetic resources and accelerating development of superior varieties. Deep genotyping is an essential tool for a comprehensive characterization of the germplasm of interest and, fortunately, the technology is now accessible at a reasonable cost. What must be ensured is the correct interpretation of the genotypic information and on that basis develop efficient practical molecular crop breeding strategies that respond to the real needs of the breeding program.

RESUMEN Uno de los mayores desafíos que enfrenta la humanidad es el desarrollo de estrategias sostenibles para asegurar la disponibilidad de alimentos en respuesta al crecimiento de la población y el cambio climático. Un enfoque que puede contribuir a aumentar la seguridad alimentaria es cerrar las brechas de rendimiento y mejorar la ganancia genética; para tal fin, lo que se conoce como "mejoramiento molecular" juega un papel fundamental. Dado que un programa de mejoramiento de cultivos se basa principalmente en la calidad del germoplasma, su caracterización genética detallada es fundamental para garantizar el uso eficiente de los recursos genéticos y acelerar el desarrollo de variedades superiores. La genotipificación profunda es una herramienta esencial para una caracterización integral del germoplasma de interés y, afortunadamente, en la actualidad se puede acceder a la tecnología a un costo razonable. Lo que debe asegurarse es la interpretación correcta de la información genotípica y sobre esa base desarrollar estrategias eficientes y prácticas de mejoramiento molecular de cultivos que respondan a las necesidades reales del programa de mejoramiento.

Morada Nova lambs' meat production potential description through morphometric evaluation / Descrição do potencial de produção de carne de cordeiros Morada Nova por meio da avaliação morfométrica

Morada Nova breed has a low effective herd, and its white variety is in risk of extinction. The selection of individuals based on breed standard without correlation with productive aptitude is predominant today. We believe that the best way to rescue this valuable genetic resource is to describe its productive potential for commercial use. Thus, this study described the meat production potential of Morada Nova lambs through morphological and zoometric data, performance and carcass characteristics. Twenty-four non-castrated male lambs from two genetic groups were used: Morada Nova red (MNR) and crossbreed Morada Nova (red x Morada Nova white-MNF1) distributed in a completely randomized design. Univariate and multivariate analysis were used. The yields of commercial cuts and the physicochemical characteristics and qualitative measurements of the carcass were similar between the genetic groups. Seven of the 28 characteristics of the carcass were greater in MNF1 lambs. The chest height, rump height and anamorphosis index showed to be important variables in the choice of MN lambs with meat production potential. Based on factor and hierarchical cluster analysis, the Morada Nova beef morphometric index (MNBMI) was created. Both of groups have high thoracic development, ability to produce meat, weight gain, feeding efficiency and breathing capacity, infusing greater rusticity and adaptability; however, the application and validation of the developed index showed superiority for meat production in the crossed lambs. Thus, the MNF1 lambs are a sustainable option for sheep production in drylands.

A raça Morada Nova possui um baixo rebanho efetivo, e sua variedade branca está em risco de extinção. A seleção de indivíduos com base no padrão racial sem correlação com a aptidão produtiva é predominante até hoje. Acreditamos que a melhor forma de resgatar esse valioso recurso genético é descrever seu potencial produtivo para uso comercial. Assim, este estudo teve como objetivo descrever o potencial de produção de carne de cordeiros Morada Nova por meio de dados morfológicos e zoométricos, desempenho e características de carcaça. Foram utilizados 24 cordeiros machos não castrados de dois grupos genéticos: Morada Nova Vermelho (MNV) e mestiços Morada Nova (vermelho x Morada Nova branco-MNF1) distribuídos em delineamento inteiramente casualizado. Análises univariadas e multivariadas foram utilizadas. Os rendimentos dos cortes comerciais e as características físico-químicas e medidas qualitativas da carcaça foram semelhantes entre os grupos genéticos. Sete, das 28 características da carcaça, foram maiores nos cordeiros MNF1. A altura do peito, altura da garupa e índice de anamorfose mostraram-se variáveis ​​importantes na escolha de cordeiros MN com potencial de produção de carne. Com base na análise fatorial e hierárquica de agrupamento, foi elaborado o índice morfométrico da carne da raça Morada Nova (IMCMN). Ambos os grupos apresentam alto desenvolvimento torácico, capacidade de produção de carne, ganho de peso, eficiência alimentar e capacidade respiratória, infundindo maior rusticidade e adaptabilidade, porém, a aplicação e validação do índice desenvolvido mostrou superioridade para produção de carne nos cordeiros cruzados. Assim, os cordeiros MNF1 são uma opção sustentável para a produção ovina em terras áridas.

Chemical and physical variability of traditional varieties of corn (Zea mays L) grown in the Juruá Valley, Acre, Brazil / Variabilidade nutricional e física de variedades tradicionais de milho (Zea mays L) cultivados no vale do Juruá, Acre, Brasil

The traditional varieties of maize grown by family farmers are a source of genetic variability and are essential for food security. Thus, the present study aims to evaluate, based on physical and chemical components, the behavior of the genetic variability of traditional maize cultivated on non-flooded and floodplain areas, in the Juruá region, state of Acre. The characteristics consisted of the determination of dry matter, mineral material, crude protein, ether extract, gross energy, neutral detergent fiber, starch and in vitro digestibility of dry matter, vitreousness and grain density. Data were analyzed using descriptive statistics, associated with multivariate analysis of principal components (PCA), with the aid of the R software. By means of the PCA, the varieties grown on non-flooded and floodplain areas formed 3 distinct groups, in which the vitreosity in the grains ranged from 73.7% to 79.46%, so that the reddish grain varieties had a greater presence of endosperm vitreous and higher density, with a strong and positive correlation between these variables. The yellow and orange-yellow grain varieties showed greater adherence to energy, starch and greater digestibility. Therefore, the traditional varieties cultivated on non-flooded and floodplain areas, present variations in relation to the physical and chemical analyses.

As variedades tradicionais de milho cultivados pelos agricultores familiares constituem-se em fonte de variabilidade genética e são fundamentais para segurança alimentar. Assim, o presente trabalho tem como objetivo, avaliar, com base em componentes físicos e químicos, o comportamento da variabilidade genética de milho tradicional cultivadas em terra firme e praia, na regional Vale do Juruá, estado do Acre. As características constaram da determinação de matéria seca, material mineral, proteína bruta, extrato etéreo, energia bruta, fibra em detergente neutro, amido e digestibilidade in vitro da matéria seca, vitreosidade e densidade dos grãos. Os dados foram analisados mediante estatística descritiva, associado à análise multivariada de componentes principais (PCA), com auxílio do software R. Por meio da PCA, as variedades cultivadas em terra firme e praia formaram 3 grupos distintos, na qual a vitreosidade nos grãos variou de 73,7% a 79,46%, de modo que, as variedades de grãos avermelhadas apresentaram maior presença de endosperma vítreo e maior densidade, havendo uma correlação forte e positiva entre essas variáveis. Já as variedades de grãos amarelas e amarelas-oranges apresentaram maior aderência a energia, amido e maior digestibilidade. Portanto, as variedades tradicionais cultivadas em terra firme e praia, apresentam variações em relação as análises físicas e químicas.

Utilización de los recursos genéticos en un país que es centro de origen: el caso del cacao en el Perú

La producción peruana de cacao representa aproximadamente el 2% de la producción mundial; con una contribución muy reconocida por la calidad y diversidad de sus sabores y aromas. De milenario origen amazónico y probada utilización de hace por lo menos 5200 años, este cultivo recién ha sido visible para el desarrollo agrario en las dos últimas décadas, cuando se le ha utilizado con relativo éxito en la sustitución de cultivos ilegales de coca ¿Y qué tanto está contribuyendo la academia a la cadena de valor del cacao? Con carácter exploratorio, se registró y analizó una muestra de 44 tesis que tenían como objeto de estudio el cacao, obtenido por sus autores en los centros de producción y parcelas de productores. La mayor parte de estas tesis (41) estuvieron destinadas a obtener títulos profesionales, dos para optar el grado de magister y uno para obtener el grado de doctorado. Estas tesis se realizaron en universidades de 13 departamentos del Perú, contando Lima con el mayor número de tesis (12). Once tesis abarcaron actividades de investigación del germoplasma para la transformación y/o la innovación del cacao, confiriéndole así valor agregado con potencial uso comercial. Estas investigaciones estuvieron relacionadas con cuatro sectores productivos con un claro potencial comercial en el mercado global de recursos genéticos. En ningún caso, las investigaciones se realizaron bajo la seguridad jurídica del sistema de acceso a recursos genéticos y participación justa y equitativa de beneficios del Protocolo de Nagoya, del Convenio sobre la Diversidad Biológica.

The Peruvian production of cocoa represents, approximately, 2% of the world production, with a very recognized contribution because of the quality and diversity of its flavors and aromas. With a millenary Amazonian origin and proved utilization by at least 5200 years ago, this crop just became visible for the agrarian development in the last two decades, when it was used with relative success for the substitution of illegal coca crops. And how much is the academy contributing to the value chain of cocoa? A sample of 44 theses which cocoa obtained from production centers and farmers plots was their object of study, has been registered and analyzed in an exploratory way. 41 theses were to get professional titles, two for magister degree and one for doctorate degree. These theses were done in universities of 13 Department of Peru, where Lima reached the highest number (12). Eleven theses addressed germplasm research activities aimed to cocoa transformation and/or innovation, thus conferring added value with potential commercial use. These researches were related to four productive sectors with a clear potential in the global market of genetic resources. In any case, the studies were done under the legal certainty of the system of access to genetic resources and fair and equitable benefit-sharing of the Nagoya Protocol to the Convention on Biological Diversity.

Genetic evaluation and selection of cocoa tree clones / Avaliação genética e seleção de clones de cacaueiro

The cultivation of cocoa is of great socio-economic importance worldwide. Cocoa beans are the essential raw material for chocolate production. The variability of cacao studied presents only a small fraction of the existing genetic diversity, mainly in the Amazon region. Furthermore, just a small part of this variability has been exploited in cocoa breeding. Thus, the present study processed the genetic evaluation and selection of cocoa clones, based on morpho-agronomical traits. For this, we evaluated 145 clones, during 37 harvests from, four consecutive years. The following traits were evaluated: total number of fruits collected (TNFC), total number of healthy fruits (TNHF), weight of wet seeds from healthy fruits (WWSHF), average weight of wet seeds per healthy fruit (AWWSHF), weight of dry seeds from healthy fruit (WDSHF), average weight of dry seeds per healthy fruit (AWDSHF), percentage of fruits with witches' broom disease (PFWB), percentage of fruits with borer (PFBR), percentage of fruits with germinated seeds (PFGS), number of branches with witches' broom disease (NBWB), and number of inflorescence with witches' broom disease (NIWB). Significant differences (P < 0.05) among the clones were observed for all traits, which reveal an expressive variability and possibility of gains with selection. The highest significant correlations (P < 0.05) occurred between traits TNFC and TNHF (0.94), TNHF and AWWSHF (0.86), and TNHF and AWDSHF (0.86). Based on the selection index, the clones POUND 12 and CAB 12, 228, 253, 257, 258, and 422 were the most suitable for selection.

O cultivo do cacau tem grande importância socioeconômica mundial. Os amêndoas de cacau são a matéria-prima essencial para a produção de chocolate. A variabilidade do cacaueiro avaliada representa apenas uma pequena fração da diversidade genética existente, principalmente na região amazônica. Além disso, apenas uma pequena parte dessa variabilidade foi explorada no melhoramento de cacau. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo realizar a avaliação genética e seleção de clones de cacau, com base em características morfo-agronômicas. Para isso, foram avaliados 145 clones, durante 37 colheitas, em quatro anos consecutivos. As seguintes características de frutos e sementes foram avaliadas: número total de frutos colhidos (NTFC), número total de frutos sadios (NTFS), peso de sementes úmidas dos frutos sadios (PSUFS), peso médio de sementes úmidas dos frutos sadios (PMSUFS), peso de sementes secas dos frutos sadios (PSSFS), peso médio de sementes secas dos frutos sadios (PMSSFS), porcentagem de frutos com vassoura-de-bruxa (PFVB), porcentagem de frutos com broca (PFBR), porcentagem de frutos com sementes germinadas (PFSG), número de ramos com vassoura-de-bruxa (NRVB) e número de almofadas florais com vassoura-de-bruxa (NAFVB). Diferenças significativas (P < 0,05) entre os clones foram observadas para todas as características, o que revela uma expressiva variabilidade e possibilidade de ganhos com a seleção. As maiores correlações significativas (P < 0,05) ocorreram entre os caracteres NTFC e NTFS (0,94), NTFS e PMSUFS (0,86) e, NTFS e PMSSFS (0,86). Com base no índice de seleção, os clones POUND 12 e CAB 12, 228, 253, 257, 258 e 422 foram considerados os mais adequados para a seleção.

Sugar content variation in elephant grass germplasm / Variação do teor de açúcar em germoplasma de capim-elefante

The objective of this study was to estimate sugar content variation (°Brix) in 95 accessions from the elephant grass germplasm active bank of Embrapa Dairy Cattle research center, located in Coronel Pacheco, MG, Brazil. The accessions with the highest sugar content were identified, and the effect of plant age on sugar concentration was evaluated. The experiment was conducted in randomized blocks design with two replications. Sugar content analysis occurred twice during the growth-cycle (at 70 and 100 days) along two points of the stem, one 30 cm from the base and the other at the midpoint. The analysis of variance considered the split plot model, with accessions as main plots and plant age as subplots. The means were compared using the Scott Knott test. While there was sugar content variation between accessions, increased plant age had no significant effect on the sugar content. However, some accessions did have a significant increase or decrease in sugar content as they aged. The highest and lowest mean sugar content was 6.96% (in the accession BAG80) and 4.03% (in the accession BAG13) °Brix, respectively.

O objetivo deste estudo foi estimar a variação do teor de açúcar (°Brix) existente entre 95 acessos do banco ativo de germoplasma de capim-elefante da Embrapa Gado de Leite, localizado no campo experimental de Coronel Pacheco. Foram identificados os acessos com maior teor de açúcar, bem como avaliado o efeito da idade da planta sobre a variação da concentração de açúcar. O experimento foi conduzido em blocos ao acaso com duas repetições, 95 genótipos, duas idades de planta, 70 e 100 dias de crescimento, e análise do teor de açúcar em duas secções amostradas à 30 cm da base e na metade do colmo. A análise de variância considerou modelo de parcela subdividida no tempo, sendo os acessos, as parcelas e a idade da planta as subparcelas. As médias foram comparadas pelo teste de Scott Knott. Observou-se variação no teor de açúcar entre os acessos, porém não foi observado efeito significativo no teor de açúcar devido ao aumento da idade da planta. Entretanto, alguns acessos apresentaram interação significativa com aumento ou redução do teor de açúcar em decorrência do aumento da idade da planta. O acesso de maior média de teor de açúcares entre as duas idades foi BAG80, com 6,96%, e o de menor foi BAG13, com 4,03%.

Variability of individuals from a population Varronia curassavica Jacq considering volatile compounds / Variabilidade de indivíduos de uma população de Varonia curassavica Jacq a partir de compostos voláteis

Varronia curassavica is a medicinal species native to Brazil; its anti-inflammatory properties are attributed to α-humulene and ß-caryophyllene. This study to investigated the population variability of V. curassavica. Leaves were collected from 40 individuals of a natural population and transferred to glass flasks (2 mL). The volatiles were extracted and analyzed using static headspace gas chromatography coupled with mass spectrometry (HS-GC-MS). A total of 17 compounds were detected: monoterpenes (1.6% - 68%) and sesquiterpenes (25.7% - 79.0%), including α-humulene and ß-caryophyllene. Multivariate analysis was performed to estimate the dissimilarity of individuals separated the compounds into four groups. Group I was characterized by the content of α-pinene, groups II and IV by ß-caryophyllene, and group III by ß-pinene. The abundance of α-humulene showed small variations; while ß-caryophyllene showed larger variations that contributed to the population variability. This is the first report on the chemical composition analysis of volatile compounds in V. curassavica using the HS-GC-MS technique.

Varronia curassavica é uma espécie medicinal nativa no Brasil e sua propriedade anti-inflamatória é atribuída aos compostos α-humuleno e ß-cariofileno. O objetivo foi estudar a variabilidade de população de V. curassavica. Foram coletadas folhas de 40 indivíduos de população natural, sendo estas transferidas para frascos de vidro (2 mL). Os voláteis foram extraídos e analisados por headspace estático, associado à cromatografia gasosa, acoplada à espectrometria de massas (HS-CG-EM). Detectou-se 17 compostos: monoterpenos (1,6% - 68%) e sesquiterpenos (25,7% - 79,0%), incluindo o α-humuleno e o ß-cariofileno. A análise multivariada foi realizada para estimar a dissimilaridade dos indivíduos, a qual separou quatro grupos. O grupo I foi caracterizado pela presença do α-pineno, os grupos II e IV do ß-cariofileno e o grupo III do ß-pineno. O teor do α-humuleno apresentou pequenas variações, enquanto o do ß-cariofileno contribuiu mais para a variabilidade da população. É o primeiro relato de análise da composição química de compostos voláteis de V. curassavica utilizando a técnica HS-GC-MS.

Morphological, sensory and biochemical characteristics of summer apple genotypes / Características morfológicas, sensoriais e bioquímicas de genótipos de maçã cultivada no verão

Summer apples are one of the most important plant community in Artvin province located Northeastern part of Turkey. In present study 22 local apple genotypes were characterized by phenological, morphological, biochemical and sensory properties. Harvest date was the main phenological data. Morphological measurements included fruit weight, fruit shape, fruit ground color, fruit over color, fruit over color coverage and fruit firmness, respectively. Sensory measurements were as juiciness and aroma and biochemical characteristics included organic acids, SSC (Soluble Solid Content), vitamin C, total phenolic content and antioxidant capacity. Genotypes exhibited variable harvest dates ranging from 11 July to 13 August and cv. Summered harvested 30 July 2017. The majority of genotypes were harvested before cv. Summered. Fruit weight were also quite variable among genotypes which found to be between 89 g and 132 g, and most of the genotypes had bigger fruits than cv. Summered. Pink, red, yellow and green fruit skin color was evident and main fruit shape were determined as round, conic and oblate among genotypes. ART08-9, ART08-4, ART08-21 and ART08-22 had distinct bigger fruits and ART08-1, ART08-2, ART08-5, ART08-12 and ART08-17 had higher total phenolic content and antioxidant capacity. The results of the study showed significant differences for most of the phenological, morphological, sensory and biochemical characteristics. Thus, the phonological, morphological, sensory and biochemical characteristics of summer apple genotypes were distinguishable and these results suggest that phonological, morphological, sensory and biochemical differences of the summer apple genotypes can be attributed to differences in genetic background of genotypes which placed different groups by PCoA analysis.(AU)

As maçãs cultivadas no verão são uma das culturas vegetais mais importantes da província de Artvin, localizada no nordeste da Turquia. No presente estudo, 22 genótipos locais de maçã foram caracterizados quanto às suas propriedades morfológicas, bioquímicas e sensoriais. As características analisadas foram peso do fruto, data da colheita, forma do fruto, coloração da casca, firmeza do fruto, suculência, aroma, teor de ácidos orgânicos e de sólidos solúveis, vitamina C, teor fenólico total e capacidade antioxidante. Os genótipos exibiram datas de colheita que variaram de 11 de julho a 13 de agosto, e a cultivar de verão foi colhida em 30 de julho 2017. A maioria dos genótipos foi colhida antes da cultivar de verão. O peso dos frutos também foi bastante variável entre os genótipos, apresentando entre 89 e 132 g, e a maioria dos genótipos apresentou frutos maiores que a cultivar de verão. As colorações rosa, vermelho, amarelo e verde da casca dos frutos foram as mais evidentes, e a forma principal dos frutos foi determinada como redonda, cônica e oblata entre os genótipos. ART08-9, ART08-4, ART08-21 e ART08-22apresentaram frutos maiores distintos, e ART08-1, ART08-2, ART08-5, ART08-12 e ART08-17 apresentaram maior conteúdo fenólico total e capacidade antioxidante. Os resultados do estudo mostraram diferenças significativas para a maioria das características morfológicas, sensoriais e bioquímicas. Assim, essas características dos genótipos da maçã cultivadas no verão foram distintos, e esses resultados podem ser atribuídos a diferenças no contexto genético dos genótipos.(AU)

Sugar content variation in elephant grass germplasm / Variação do teor de açúcar em germoplasma de capim-elefante

The objective of this study was to estimate sugar content variation (°Brix) in 95 accessions from the elephant grass germplasm active bank of Embrapa Dairy Cattle research center, located in Coronel Pacheco, MG, Brazil. The accessions with the highest sugar content were identified, and the effect of plant age on sugar concentration was evaluated. The experiment was conducted in randomized blocks design with two replications. Sugar content analysis occurred twice during the growth-cycle (at 70 and 100 days) along two points of the stem, one 30 cm from the base and the other at the midpoint. The analysis of variance considered the split plot model, with accessions as main plots and plant age as subplots. The means were compared using the Scott Knott test. While there was sugar content variation between accessions, increased plant age had no significant effect on the sugar content. However, some accessions did have a significant increase or decrease in sugar content as they aged. The highest and lowest mean sugar content was 6.96% (in the accession BAG80) and 4.03% (in the accession BAG13) °Brix, respectively.(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar a variação do teor de açúcar (°Brix) existente entre 95 acessos do banco ativo de germoplasma de capim-elefante da Embrapa Gado de Leite, localizado no campo experimental de Coronel Pacheco. Foram identificados os acessos com maior teor de açúcar, bem como avaliado o efeito da idade da planta sobre a variação da concentração de açúcar. O experimento foi conduzido em blocos ao acaso com duas repetições, 95 genótipos, duas idades de planta, 70 e 100 dias de crescimento, e análise do teor de açúcar em duas secções amostradas à 30 cm da base e na metade do colmo. A análise de variância considerou modelo de parcela subdividida no tempo, sendo os acessos, as parcelas e a idade da planta as subparcelas. As médias foram comparadas pelo teste de Scott Knott. Observou-se variação no teor de açúcar entre os acessos, porém não foi observado efeito significativo no teor de açúcar devido ao aumento da idade da planta. Entretanto, alguns acessos apresentaram interação significativa com aumento ou redução do teor de açúcar em decorrência do aumento da idade da planta. O acesso de maior média de teor de açúcares entre as duas idades foi BAG80, com 6,96%, e o de menor foi BAG13, com 4,03%.(AU)

Morphological, sensory and biochemical characteristics of summer apple genotypes / Características morfológicas, sensoriais e bioquímicas de genótipos de maçã cultivada no verão

Summer apples are one of the most important plant community in Artvin province located Northeastern part of Turkey. In present study 22 local apple genotypes were characterized by phenological, morphological, biochemical and sensory properties. Harvest date was the main phenological data. Morphological measurements included fruit weight, fruit shape, fruit ground color, fruit over color, fruit over color coverage and fruit firmness, respectively. Sensory measurements were as juiciness and aroma and biochemical characteristics included organic acids, SSC (Soluble Solid Content), vitamin C, total phenolic content and antioxidant capacity. Genotypes exhibited variable harvest dates ranging from 11 July to 13 August and cv. Summered harvested 30 July 2017. The majority of genotypes were harvested before cv. Summered. Fruit weight were also quite variable among genotypes which found to be between 89 g and 132 g, and most of the genotypes had bigger fruits than cv. Summered. Pink, red, yellow and green fruit skin color was evident and main fruit shape were determined as round, conic and oblate among genotypes. ART08-9, ART08-4, ART08-21 and ART08-22 had distinct bigger fruits and ART08-1, ART08-2, ART08-5, ART08-12 and ART08-17 had higher total phenolic content and antioxidant capacity. The results of the study showed significant differences for most of the phenological, morphological, sensory and biochemical characteristics. Thus, the phonological, morphological, sensory and biochemical characteristics of summer apple genotypes were distinguishable and these results suggest that phonological, morphological, sensory and biochemical differences of the summer apple genotypes can be attributed to differences in genetic background of genotypes which placed different groups by PCoA analysis.

As maçãs cultivadas no verão são uma das culturas vegetais mais importantes da província de Artvin, localizada no nordeste da Turquia. No presente estudo, 22 genótipos locais de maçã foram caracterizados quanto às suas propriedades morfológicas, bioquímicas e sensoriais. As características analisadas foram peso do fruto, data da colheita, forma do fruto, coloração da casca, firmeza do fruto, suculência, aroma, teor de ácidos orgânicos e de sólidos solúveis, vitamina C, teor fenólico total e capacidade antioxidante. Os genótipos exibiram datas de colheita que variaram de 11 de julho a 13 de agosto, e a cultivar de verão foi colhida em 30 de julho 2017. A maioria dos genótipos foi colhida antes da cultivar de verão. O peso dos frutos também foi bastante variável entre os genótipos, apresentando entre 89 e 132 g, e a maioria dos genótipos apresentou frutos maiores que a cultivar de verão. As colorações rosa, vermelho, amarelo e verde da casca dos frutos foram as mais evidentes, e a forma principal dos frutos foi determinada como redonda, cônica e oblata entre os genótipos. ART08-9, ART08-4, ART08-21 e ART08-22apresentaram frutos maiores distintos, e ART08-1, ART08-2, ART08-5, ART08-12 e ART08-17 apresentaram maior conteúdo fenólico total e capacidade antioxidante. Os resultados do estudo mostraram diferenças significativas para a maioria das características morfológicas, sensoriais e bioquímicas. Assim, essas características dos genótipos da maçã cultivadas no verão foram distintos, e esses resultados podem ser atribuídos a diferenças no contexto genético dos genótipos.

Microbial ex situ preservation supporting science and bioeconomy in Brazil / Preservação de microrganismos ex situ como suporte para a ciência e a bioeconomia no Brasil

Abstract One of the texts in the "Biodiversity in the State of São Paulo" series, within the FAPESP-Biota Program, was dedicated to the Infrastructure for Biodiversity Conservation, with a focus on Biological Collections and Conservation Units. From the early 1960s, when FAPESP was established, to the present day, financial resources have been invested in the preservation of the biodiversity of the national genetic heritage, besides other fields. History of years of advances in scientific knowledge was built, which can be portrayed through the projects that resulted in high-quality data of national and international impact. Microbiological collections are centers that generate technology and specialized human resources, and act (among other things) as living repositories preserving reference material and as witnesses to the history of microbial biodiversity because they preserve what may no longer exist. They have enormous potential to promote the global bioeconomy and address problems that have resulted from the misuse of natural resources. This reading brings everyone the history, advances, and future perspectives of culture collections, within the efforts of 60-year scientific activities in Brazil.

Resumo Um dos textos da série "Biodiversidade do Estado de São Paulo", dentro do Programa FAPESP-Biota, foi dedicado à Infraestrutura para Conservação da Biodiversidade, com foco nas coleções biológicas e nas unidades de conservação. Do início dos anos 60, quando a FAPESP foi criada, até os dias atuais muito foi investido em pesquisa nas mais diversas áreas, incluindo a preservação da biodiversidade do patrimônio genético nacional. Uma história de longos anos de avanços no conhecimento científico foi construída, a qual pode ser retratada através dos projetos que resultaram em dados de alta qualidade com impacto nacional e internacional. As coleções microbiológicas são centros geradores de tecnologia e recursos humanos especializados, que atuam (dentre outros) como repositórios vivos, preservando material de referência, e como testemunho da história da biodiversidade microbiana, preservando o que pode não mais existir. Possuem enorme potencial para alavancar a bioeconomia global e tratar de problemas que resultaram do mau uso dos recursos naturais. Essa leitura traz a todos o histórico, os avanços e as perspectivas futuras das coleções de microrganismos, dentro dos esforços de 60 anos de atividades científicas no Brasil.

Sugar content variation in elephant grass germplasm / Variação do teor de açúcar em germoplasma de capim-elefante

ABSTRACT: The objective of this study was to estimate sugar content variation (°Brix) in 95 accessions from the elephant grass germplasm active bank of Embrapa Dairy Cattle research center, located in Coronel Pacheco, MG, Brazil. The accessions with the highest sugar content were identified, and the effect of plant age on sugar concentration was evaluated. The experiment was conducted in randomized blocks design with two replications. Sugar content analysis occurred twice during the growth-cycle (at 70 and 100 days) along two points of the stem, one 30 cm from the base and the other at the midpoint. The analysis of variance considered the split plot model, with accessions as main plots and plant age as subplots. The means were compared using the Scott Knott test. While there was sugar content variation between accessions, increased plant age had no significant effect on the sugar content. However, some accessions did have a significant increase or decrease in sugar content as they aged. The highest and lowest mean sugar content was 6.96% (in the accession BAG80) and 4.03% (in the accession BAG13) °Brix, respectively.

RESUMO: O objetivo deste estudo foi estimar a variação do teor de açúcar (°Brix) existente entre 95 acessos do banco ativo de germoplasma de capim-elefante da Embrapa Gado de Leite, localizado no campo experimental de Coronel Pacheco. Foram identificados os acessos com maior teor de açúcar, bem como avaliado o efeito da idade da planta sobre a variação da concentração de açúcar. O experimento foi conduzido em blocos ao acaso com duas repetições, 95 genótipos, duas idades de planta, 70 e 100 dias de crescimento, e análise do teor de açúcar em duas secções amostradas à 30 cm da base e na metade do colmo. A análise de variância considerou modelo de parcela subdividida no tempo, sendo os acessos, as parcelas e a idade da planta as subparcelas. As médias foram comparadas pelo teste de Scott Knott. Observou-se variação no teor de açúcar entre os acessos, porém não foi observado efeito significativo no teor de açúcar devido ao aumento da idade da planta. Entretanto, alguns acessos apresentaram interação significativa com aumento ou redução do teor de açúcar em decorrência do aumento da idade da planta. O acesso de maior média de teor de açúcares entre as duas idades foi BAG80, com 6,96%, e o de menor foi BAG13, com 4,03%.

Spondias mombin (Anarcadiaceae): molecular characterization and conservation / Spondias mombin (Anarcadiaceae): caracterización molecular y conservación

Abstract Introduction: The fruit of the yellow mombin (Spondias mombin L.) is notable due to its sensory and functional qualities. However, there is little knowledge regarding the genetic diversity of this species, and this would aid the implantation of the cultivation of the fruit as a crop, since current production is based on extractivism. Objective: Evaluate the diversity and genetic structure of natural populations of S. mombin in the state of Mato Grosso, Brazil, through microsatellite molecular markers in order to assist in the implementation of conservation strategies and the collection of genetic resources. Methods: A total of 139 S. mombin individuals were sampled in ten natural populations. PCR amplifications were performed with seven fluorescence-marked microsatellite primers. Genetic diversity was evaluated by the number of alleles, expected (He) and observed heterozygosity (Ho), polymorphic information content (PIC), fixation index (ƒ), rare and exclusive alleles. The genetic structure was evaluated using AMOVA, UPGMA dendrogram and Bayesian statistical analysis. Results: 46 alleles were amplified, which had an average of 6.6 alleles per locus. He was higher than Ho and f was positive, indicating the presence of inbreeding. The PIC ranged from 0.048 to 0.700, and only two loci were poorly informative. We found 27 rare alleles and 16 unique alleles. The largest component of variation was intrapopulational (90.64 %). The estimated gene flow was 1.99, which indicates that there is no genetic isolation between populations, and justifies the FST value (0.0963). The ten populations were grouped into two groups, and two populations constituted an isolated group. The Mantel test demonstrated that the genetic structure is not related to the geographic distance between populations. Conclusion: There is genetic diversity in the populations of S. mombin, which must be conserved in situ or ex situ, due to the diversity they present and because they are promising sources for collection of germplasm.

Resumen Introducción: El fruto amarillo del jobo o yuplón (Spondias mombin L.) destaca por sus cualidades sensoriales y funcionales. Sin embargo, existe poco conocimiento sobre la diversidad genética de esta especie, lo que ayudaría a la implantación del cultivo del fruto como cultivo, ya que la producción actual se basa en el extractivismo. Objetivo: Evaluar la diversidad y estructura genética de poblaciones naturales de S. mombin en el estado de Mato Grosso, Brasil, a través de marcadores moleculares microsatélites para ayudar en la implementación de estrategias de conservación y recolección de recursos genéticos. Métodos: Se muestrearon un total de 139 individuos de S. mombin en diez poblaciones naturales. Las amplificaciones por PCR se realizaron con siete cebadores de microsatélites marcados con fluorescencia. La diversidad genética se evaluó por el número de alelos, heterocigosidad esperada (He) y observada (Ho), contenido de información polimórfica (PIC), índice de fijación (ƒ), alelos raros y exclusivos. La estructura genética se evaluó mediante AMOVA, dendrograma UPGMA y análisis estadístico bayesiano. Resultados: Se amplificaron 46 alelos, los cuales tenían un promedio de 6.6 alelos por locus. Fue más alto que Ho y f positivo, lo que indica la presencia de endogamia. El PIC osciló entre 0.048 y 0.700, y solo dos loci fueron poco informativos. Encontramos 27 alelos raros y 16 alelos únicos. El mayor componente de variación fue intrapoblacional (90.64 %). El flujo de genes estimado fue de 1.99, lo que indica que no hay aislamiento genético entre poblaciones y justifica el valor de FST (0.0963). Las diez poblaciones se agruparon en dos grupos y dos poblaciones constituyeron un grupo aislado. La prueba de Mantel demostró que la estructura genética no está relacionada con la distancia geográfica entre poblaciones. Conclusión: Existe diversidad genética en las poblaciones de S. mombin, la cual debe ser conservada in situ o ex situ, por la diversidad que presentan y porque son fuentes promisorias para la recolección de germoplasma.

Ex situ plant germplasm conservation revised at the light of mechanisms and methods of genetics / Conservación de germplasma Ex situ revisada a la luz de mecanismos y métodos de genética

ABSTRACT Plant genetic resources for food and agriculture are ex situ conserved in germplasm banks as samples (accessions) of natural or naturalized populations, either as the originally sampled propagules (mainly seeds) or their multiplications. The premises underlying ex situ conservation are that (a) it is the safest and cheapest alternative for germplasm preservation for future generations and (b) accessions are representative of the genetic diversity encountered in nature. In the past decades, ideas, alternatives and considerations have been put forward on the topic, and protocols have been devised for plant germplasm sampling, conservation and multiplication. However, limitations in the management efficiency of germplasm banks have been pointed out by international organizations. In our opinion, germplasm banks in general need to revise their functioning and management at the light of principles and methods of Genetics. To that end, it is necessary to consider the reproductive biology of higher plants -whose genetic consequences at both the individual plant and the population levels are not always either fully understood or taken into account in devising the protocols-, the genetic structures of wild and cultivated populations, and the course of the genetic material in the populations. In this paper, we discuss the three topics and provide an example of a national forage breeding program, from germplasm bank accessions as the germplasm of origin to the obtainment of commercial cultivars. Finally, we present a proposal as a base for discussion among curators, researchers and breeders.

RESUMEN Los recursos genéticos vegetales para la alimentación y la agricultura se conservan ex situ en bancos de germoplasma como muestras (introducciones) de poblaciones naturales o naturalizadas ya sea como propágulos originales (mayoritariamente semillas) o sus multiplicaciones. Las premisas subyacentes son que (a) es la alternativa más segura y barata de preservación de germoplasma para futuras generaciones y (b) las introducciones son representativas de la diversidad genética que se encuentra en la naturaleza En las últimas décadas, se han presentado ideas, alternativas y consideraciones sobre el tema y se han elaborado protocolos para el muestreo, conservación y multiplicación de germoplasma. Sin embargo, organizaciones internacionales han señalado limitaciones en la eficiencia del manejo de los bancos de germoplasma. En nuestra opinión, se necesita revisar el funcionamiento y manejo de dichos bancos en general a la luz de los principios y métodos de Genética. Para tal fin, es necesario considerar la biología reproductiva de las plantas superiores -cuyas consecuencias genéticas a nivel de planta individual y de población no se comprenden en su totalidad o no se consideran al idear los protocolos -, las estructuras genéticas de poblaciones naturales y cultivadas, y el curso del material genético en las poblaciones. En este trabajo discutimos los tres temas y proveemos un ejemplo de un programa nacional de mejoramiento de forrajeras, desde las introducciones como germoplasma de origen hasta la obtención de cultivares comerciales. Finalmente, presentamos una propuesta como base de discusión entre curadores, investigadores y mejoradores.

Evaluación de la variabilidad fenotípica en Simarouba amara Aubl., mediante descriptores cualitativos y cuantitativos / Assessment of phenotypic variability in Simarouba amara Aubl., through qualitative and quantitative descriptors / Avaliação da variabilidade fenotípica em Simarouba amara Aubl.,usando descritores qualitativos e quantitativos

Resumen Dentro de las estrategias de evaluación de especies forestales nativas por parte de la Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA, se encuentra la caracterización fenotípica. Con el propósito de validar el uso de descriptores morfológicos y determinar la variabilidad fenotípica de la colección de trabajo del Centro de Investigación La Libertad ubicado en el piedemonte llanero (Villavicencio, Meta); se evaluaron 121 individuos de machaco (Simarouba amara Aubl.) de 6.2 años de edad, por medio de 34 descriptores de planta, hoja y fruto. Los datos cualitativos y cuantitativos se analizaron mediante análisis de correspondencias múltiples y análisis de componentes principales respectivamente, con el fin de reducir la dimensionalidad de los datos, seguido de análisis de conglomerados, utilizando el algoritmo de WARD para el agrupamiento de los individuos. Los resultados obtenidos permitieron identificar que el volumen de tronco presentó la mayor variabilidad (31.13%) y las variables cuantitativas asociadas al tamaño y diámetro de la copa, diámetro de fuste, volumen del tronco, longitud y ancho de la hoja, altura total y de copa presentaron las mayores correlaciones con los tres primeros componentes principales (57.82%). Se obtuvieron nueve conglomerados que reúnen el 95.73% de la variabilidad original y en los cuales se encontraron individuos potencialmente útiles con fines maderables, arboricultura y sistemas agroforestales. La forma del fuste, la altura de ramificación y de bifurcación, el tipo de corteza y el hábito de fructificación presentaron mínima variación en los individuos, contrario a la rectitud del fuste y la forma de la copa.

Abstract Phenotyping is one of the strategies used by Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) for evaluating native forest species. One hundred and twenty-one 6.2 year-old mountain damson/stavewood/bitterwood/paradise trees (Simarouba amara Aubl. commonly known as machaco in Colombia) were evaluated using 34 plant, leaf and fruit descriptors to validate the use of morphological descriptors and determine the phenotype variability of AGROSAVIA's La Libertad Research Centre's working collection. The centre is located in the foothills of Colombia's eastern plains (Villavicencio, Meta). Multiple correspondence analysis (MCA) was used for analysing qualitative data and principal component analysis (PCA) for +data to reduce dataset dimensionality; this was followed by cluster analysis, using Ward's method (minimum variance method or Ward's minimum - agglomerative algorithm) for hierarchical cluster analysis for grouping the trees. The results led to identifying that the wood volume descriptor had the greatest variability (31.13%) and the quantitative variables associated with crown size and diameter, stem diameter, trunk volume, leaf length and width, total and crown height had the greatest correlation with the first three components (57.82%). Nine clusters were obtained (accounting for 95.73% of original variability) and in which trees were found for timber, arboriculture and agroforestry system purposes. The trees' stem shape, branch height and bifurcation, the type of bark and fruiting habits had minimum variation, contrary to the that found regarding stem straightness and crown shape.

Resumo Dentro das estratégias de avaliação de espécies florestais nativas pela Colombian Agricultural Research Corporation - AGROSAVIA, está a caracterização fenotípica. A fim de validar o uso de descritores morfológicos e determinar a variabilidade fenotípica da coleção de trabalhos do Centro de Pesquisa La Libertad localizado no sopé da planície, (Villavicencio, Meta); 121 indivíduos de machaco (Simarouba amara Aubl.) de 6,2 anos de idade foram avaliados por meio de 34 descritores de planta, folha e fruto. Os dados qualitativos e quantitativos foram analisados por meio da análise de correspondência múltipla e da análise de componentes principais, respectivamente, a fim de reduzir a dimensionalidade dos dados, seguida da análise de cluster, por meio do algoritmo WARD, para agrupamento dos indivíduos. Os resultados obtidos permitiram identificar que o volume do tronco apresentou a maior variabilidade (31,13%) e as variáveis quantitativas associadas ao tamanho e diâmetro da copa, diâmetro do caule, volume do tronco, comprimento e largura da folha, total a altura e a copa apresentaram as maiores correlações com os três primeiros componentes principais (57,82%). Foram obtidos nove aglomerados que atendem a 95,73% da variabilidade original e nos quais foram encontrados indivíduos potencialmente úteis para fins madeireiros, arboricultura e sistemas agroflorestais. O formato do caule, a altura da ramificação e bifurcação, o tipo de casca e o hábito de frutificação apresentaram variação mínima nos indivíduos, ao contrário da retidão do caule e do formato da copa.

Relationship between superovulation and embryo production with ovarian follicular population before superovulatory treatment in Brazilian Bergamasca sheep / [Relação da resposta superovulatória e produção embrionária com a população folicular ovariana antes do tratamento superovulatório de ovelhas da raça Bergamácia Brasileira]

The objective of this study was to quantify the superovulatory response and embryo production of Brazilian Bergamasca sheep and to evaluate the link to the follicular condition before superovulatory treatment, as a reference for selection of donors with potential for superovulation. Follicular population of twenty-three sheep was evaluated by ultrasound during metestrus phase of the estrous cycle and divided into groups of low, medium and high follicular population. Subsequently, they were synchronized, superovulated with 133mg of pFSH, mated and subjected to embryo collection. The superovulatory response (9.0±3.3 vs 10.7±6.2 vs 13.8±7.1) and embryo production (4.0±3.8 vs 2.6±2.0 vs 1,8±4.0) were similar between groups (P>0.05). There was a positive correlation between the number of follicles during the metestrus phase and the number of corpus luteum with premature regression (PLR) (0.52) and a negative correlation between the recovery rate and PLR (-0.44) (P<0.05). The sheep that presented PLR had more follicles during metestrus (16.9±7.8 vs 12.7±3.2) and lower embryo recovery rate (38.8±29.3 vs 72.2±29.9) than those with functional CLs (P<0.05). Follicular quantification during metestrus phases was unable to identify donors with high embryo production. Animals with PLR had a larger follicular population during metestrus and lower embryo recovery rate.(AU)

O objetivo deste trabalho foi quantificar a resposta superovulatória e a produção embrionária de ovelhas Bergamácia Brasileira e relacioná-las com a condição folicular antes do tratamento superovulatório, como referência para seleção de doadoras com potencial para superovulação. Vinte e três ovelhas foram avaliadas quanto à população folicular por ultrassonografia na fase de metaestro do ciclo estral e divididas em grupos com baixa, média e alta população folicular. Posteriormente foram sincronizadas, superovuladas com 133mg de pFSH, acasaladas e submetidas à coleta de embriões. A resposta superovulatória (9,0±3,3 vs. 10,7±6,2 vs. 13,8±7,1) e a produção embrionária (4,0±3,8 vs. 2,6±2,0 vs. 1,8±4,0) foram semelhantes entre os grupos (P>0,05). Houve correlação positiva entre o número de folículos no metaestro e o número de corpos lúteos com regressão prematura (RPCL) (0,52) e correlação negativa entre a taxa de recuperação e RPCL (-0,44) (P <0,05). As ovelhas que apresentaram RPCL tiveram mais folículos no metaestro (16,9±7,8 vs. 12,7±3,2) e menor taxa de recuperação embrionária (38,8±29,3 vs. 72,2±29,9) do que as que apresentaram CLs funcionais (P<0,05). A quantificação folicular nas fases de metaestro não foi capaz de identificar doadoras com alto potencial de produção embrionária. Animais com RPCL tiveram maior população folicular no metaestro e menor recuperação de embriões.(AU)

Bioética en los procesos de investigación y bioprospección: relaciones con pueblos indígenas y comunidades locales en Colombia

Propósito/Contexto. En este artículo se exploran los principios bioéticos de autonomía y justicia, a la luz de tres casos de uso de la biodiversidad, tanto para fines investigativos como de aprovechamiento comercial, que involucran territorios colectivos de comunidades indígenas, afrodescendientes y predios de población campesina. Metodología/Enfoque. En cada caso se examinaron sus características, los actores, las relaciones entre los actores y los beneficios contemplados para las partes. El estudio comprendió la recopilación y análisis de documentación y la realización de 10 entrevistas semiestructuradas con investigadores, representantes de instituciones, empresas y organizaciones indígenas y afrocolombianas. La investigación se realizó entre 2015 y 2017 e incluyó comunidades del Amazonas, Risaralda, Chocó y Antioquia. Resultados/Hallazgos. Se encontró que las instituciones de investigación y los investigadores tramitan y obtienen las autorizaciones reglamentarias, mientras que las entidades del Estado registran una progresiva omisión de responsabilidades que afecta los derechos de las comunidades, por ejemplo, a través de la inobservancia del derecho a la consulta previa. Adicionalmente, en los casos de estudio, las relaciones que los actores establecen con las comunidades INAPRR-CL (sigla de indígenas, negros, afrodescendientes, palenqueros, raizales, Rrom, campesinas y locales) varían en la observancia de principios bioéticos. Discusión/Conclusiones/Contribuciones. Debido a que el régimen jurídico tiene un alcance limitado para el uso de la biodiversidad en investigación o innovación tecnológica, se evalúa y se discute si la bioética podría servir de guía para el respeto de la autonomía y la participación de beneficios de las comunidades en proyectos de investigación y bioprospección.

Purpose/Context. This article explores the bioethical principles of autonomy and justice in the light of three cases of use of biodiversity, both for research purposes and for commercial use, involving collective territories of indigenous communities, afro-descendants, and proper-ties of the peasant population. Methods/Approach. In each case, we examined the characteristics, agents, relationships be-tween agents, and benefits contemplated for the parties. The study included document compilation and analysis and ten semi-structured interviews with researchers, representatives of indigenous and Afro-Colombian institutions, companies, and organizations. The research was carried out between 2015 and 2017 and involved Amazon, Risaralda, Chocó, and Antioquia communities. Results/Findings. Research institutions and researchers process and obtain regulatory authorizations, while State entities report a progressive omission of responsibilities that adversely affects communities' rights, for example, through non-observance of the right to prior con-sultation. Besides, in the study cases, the agents' relationships with the INAPRRCL (acronym in Spanish for indigenous, black people, Afro-descendants, palenqueros, raizales, Rrom, peasants, and locals) vary regarding the application of bioethical principles. Discussion/Conclusions/Contributions. Because the legal system has a limited scope on the use of biodiversity in research or technological innovation, we assessed and discussed whether bioethics could serve as a guide for respecting communities' autonomy and benefit share in research and bioprospecting projects.

Objetivo/Contexto. Neste artigo exploram-se os princípios bioéticos de autonomia e justiça, à luz de três casos de uso da biodiversidade, tanto para fins investigativos como de aproveitamento comercial, que envolvem territórios coletivos de comunidades indígenas, afrodescendentes e prédios de população camponesa. Metodologia/Abordagem. Em cada caso, foram examinadas as suas características, os intervenientes, as relações entre os intervenientes e os benefícios previstos para as partes. O estudo incluiu a coleta e análise de documentação e a realização de 10 entrevistas semiestruturadas com pesquisadores, representantes de instituições, empresas e organizações indígenas e afro-colombianas. A pesquisa foi realizada entre 2015 e 2017 e incluiu comunidades do Amazonas, Risaralda, Chocó e Antioquia. Resultados/Descobertas. Verificou-se que as instituições de investigação e os investigadores processam e obtêm as autorizações regulamentares, no entanto que as entidades do Estado registram uma progressiva omissão de responsabilidades que afeta os direitos das comunidades, por exemplo, através da inobservância do direito à consulta prévia. Adicionalmente, nos casos de estudo, as relações que os atores estabelecem com as INAPRRCL (sigla de indígenas, negros, afrodescendentes, palenqueros, raizais, Rrom, camponesas e locais) variam na observância de princípios bioéticos. Discussão/Conclusões/Contribuições. Dado que o regime jurídico tem um âmbito limitado para a utilização da biodiversidade na investigação ou inovação tecnológica, se avalia e se discute se a bioética poderia servir de guia para o respeito da autonomia e a participação de benefícios das comunidades em projetos de pesquisa e bioprospeção.

Caracterización morfoestructural e índices zoométricos de hembras Ovino de Pelo Criollo Colombiano "OPC" Sudán

RESUMEN Objetivo. El objetivo de este estudio fue describir las medidas corporales e índices zoométricos de Ovinos de Pelo Criollos Colombianos (OPC), en dos de sus variedades, Sudán Bayo y Sudán Blanco. Materiales y métodos. Esta investigación fue llevada a cabo en los departamentos de Córdoba, Cesar y La Guajira, se visitaron dos granjas en cada uno de los primeros dos departamentos y una en el tercero. 21, 75 y 14 animales por departamento fueron evaluados, respectivamente. Se estudiaron 29 variables morfoestructurales y el peso corporal en 110 ovejas Sudán, y con estas variables evaluadas, se construyeron 15 índices zoométricos. A la información recolectada se le aplicó estadística descriptiva mediante el software InfoStat®. Resultados. Las Sudán Bayo presentaron valores superiores a las Sudán Blanco para el peso (40.8 y 40.57 kg), al igual que para todas las medidas zoométricas relativas a la cabeza, las extremidades y la mayoría de las del tronco; para la primera variedad se emplearon 83 ejemplares y para la segunda 27. En cuanto a los índices zoométricos, las Sudán se caracterizaron por ser dolicocraniotas, dolicocéfalas, eumétricas, de tórax con tendencia elíptica, de grupas convexilíneas y de acuerdo a dos índices etnológicos longilíneas, mientras que con base en un índice funcional brevilíneas. Conclusiones. A través de esta investigación se conoció de manera detallada el estado morfométrico actual de las OPC Sudán, así como también la proporcionalidad entre las regiones corporales de estas, cuya inclinación es hacia el biotipo cárnico. Esta información es de importancia para el conocimiento, caracterización racial, definición de biotipo, conservación, fomento y mejora genética de los OPC.

ABSTRACT Objective. The objective of this study was to describe the body measurements and zoometric indices of Sudán Bayo and Sudán Blanco, two breed varieties of Colombian creole woolless sheep (OPC). Materials and methods. This research was carried out in the departments of Córdoba, Cesar, and La Guajira. Two farms were visited in each of the first two departments and one farm in the third department. Twenty-one, 75, and 14 animals were evaluated in each department, respectively. Twenty-nine morphostructural variables and body weight were studied in 110 Sudán sheep. Based on this, 15 zoometric indices were also estimated. Descriptive statistic was applied to the information collected through the InfoStat® software. Results. Sudán Bayo sheep had higher values than Sudán Blanco sheep for the body weight (40.8 and 40.57 kg), as well as for all the zoometric measurements relative to the head and extremities, and most of the trunk morphometric measurements; in the first breed variety 83 ewes were used and in the second 27 individuals. Regarding the zoometric indices, Sudán sheep were characterized as dolichocranial, dolichocephalic, eumetric, of thorax with elliptical tendency, convex rump, and longilineal animals according to two ethnological indices while brevilineal animals based on one functional index. Conclusions. Through this investigation, the current morphometric status of Sudán OPC sheep was known in detail, as well as the proportionality between the corporal regions of these, whose inclination is towards the meat biotype. This information is of importance for the breed recognition and characterization, biotype definition, conservation, development, and genetic improvement of OPC sheep.

Testing accession genetic composition of a germ-plasm bank for mangabeira (Hancornia speciosa) / Validação da amostragem para composição de um banco de germoplasma de mangabeira (Hancornia speciosa)

The objective of the current study was to measure the genetic variability of natural populations of Hancornia speciosa using RAPD type molecular markers to assay variation in existing sampled genotypes, using morphological variables, and so assess germplasm bank composition. Morphological and chemical characteristics H. speciosa fruits and seeds were evaluated using descriptive statistics and principal components analysis. Cluster analyzes was conducted using Jaccard's similarity index, via the UPGMA hierarchical agglomerative method. Phenotypic variability was found in the two studied populations. However, variability was higher in the São Judas population, where the variables: pulp yield and soluble solids content were higher than those in the Canaã population. High genetic variability was found in both study populations, and between- and within-population morphological and genetic variation was present in the studied populations. The nine primers generated 70 bands, of which 68 were polymorphic, with the primers A-08 and C-04 generating the highest number of polymorphic bands. The two populations differ principally in the pulp ratio and the proportion of total solids in the pulp (°Brix). RAPD markers used gave acceptable results and, to initiate the Federal University of Tocantins Active Mangaba Germplasm Bank, seven genotypes were sampled from the Canaã population and five from the São Judas Tadeu population.

O presente trabalho teve como objetivo mensurar a variabilidade genética de populações naturais de Hancornia speciosa utilizando marcadores moleculares do tipo RAPD para validar a amostragem de genótipos, realizada por meio de variáveis morfológicas, para a composição de um banco de germoplasma. Foram avaliadas características morfológicas e químicas de frutos e sementes de mangaba, utilizando-se estatística descritiva e análise de componentes principais. As análises de agrupamento foram feitas utilizando índice de similaridade de Jaccard, através do método hierárquico aglomerativo UPGMA. Foi observada grande variabilidade fenotípica nas duas populações estudas, porém, essa variabilidade foi maior na população São Judas, onde as variáveis: rendimento de polpa e teor de sólidos solúveis foram maiores que os encontrados na população Canaã. Observou-se uma elevada variabilidade genética nas duas populações estudadas e que existe variabilidade morfológica e genética entre e dentro das populações. As duas populações diferem principalmente em relação ao rendimento de polpa e teor de sólidos solúveis totais (°Brix). Os nove iniciadores que amplificaram geraram 70 bandas, destas, 68 foram polimórficas, onde os primers A-08 e C-04 foram os que geraram maior número de bandas polimórficas. Portanto, os marcadores RAPD utilizados foram eficientes no presente estudo e para comporem o Banco Ativo de Germoplasma de Mangaba da Universidade Federal do Tocantins foram amostrados sete genótipos da população Canaã e cinco da população São Judas Tadeu.

Reflexiones sobre la ética de la investigación en Colombia / Reflections on Ethics of Research in Colombia

Resumen Se reflexiona en torno al diseño normativo que regula la investigación en Colombia y las prácticas de los investigadores desde un enfoque ético, abordando asuntos pro blemáticos en las ciencias de la salud, las ciencias sociales y las disciplinas ambien tales, para concluir que se necesita fortalecer el control del Estado en estos temas, la actualización de la normatividad y una mayor formación de los investigadores y miembros de Comités de Ética en investigación, especialmente en: la protección de los participantes, el cuidado de los animales, los conflictos de interés, el manejo de comunidades y de grupos vulnerables, los protocolos comunitarios, el consentimien to informado, la consulta previa, el cuidado de la biodiversidad y el acceso a recursos genéticos.

Abstract This paper reflects on the normative design, which regulates research in Colombia and the practices of researchers from an ethical approach, by addressing critical issues in the health sciences, social sciences, and environmental disciplines, to conclude that it is necessary to strengthen state control in these issues, the updating of the regulations and greater training of researchers and members of Ethics Committees in research , especially in the protection of participants, animal care, conflicts of interest, the management of communities, and vulnerable groups, community pro tocols, informed consent, prior consultation, biodiversity care, and access to genetic resources.