ABSTRACT
Morada Nova breed has a low effective herd, and its white variety is in risk of extinction. The selection of individuals based on breed standard without correlation with productive aptitude is predominant today. We believe that the best way to rescue this valuable genetic resource is to describe its productive potential for commercial use. Thus, this study described the meat production potential of Morada Nova lambs through morphological and zoometric data, performance and carcass characteristics. Twenty-four non-castrated male lambs from two genetic groups were used: Morada Nova red (MNR) and crossbreed Morada Nova (red x Morada Nova white-MNF1) distributed in a completely randomized design. Univariate and multivariate analysis were used. The yields of commercial cuts and the physicochemical characteristics and qualitative measurements of the carcass were similar between the genetic groups. Seven of the 28 characteristics of the carcass were greater in MNF1 lambs. The chest height, rump height and anamorphosis index showed to be important variables in the choice of MN lambs with meat production potential. Based on factor and hierarchical cluster analysis, the Morada Nova beef morphometric index (MNBMI) was created. Both of groups have high thoracic development, ability to produce meat, weight gain, feeding efficiency and breathing capacity, infusing greater rusticity and adaptability; however, the application and validation of the developed index showed superiority for meat production in the crossed lambs. Thus, the MNF1 lambs are a sustainable option for sheep production in drylands.
A raça Morada Nova possui um baixo rebanho efetivo, e sua variedade branca está em risco de extinção. A seleção de indivíduos com base no padrão racial sem correlação com a aptidão produtiva é predominante até hoje. Acreditamos que a melhor forma de resgatar esse valioso recurso genético é descrever seu potencial produtivo para uso comercial. Assim, este estudo teve como objetivo descrever o potencial de produção de carne de cordeiros Morada Nova por meio de dados morfológicos e zoométricos, desempenho e características de carcaça. Foram utilizados 24 cordeiros machos não castrados de dois grupos genéticos: Morada Nova Vermelho (MNV) e mestiços Morada Nova (vermelho x Morada Nova branco-MNF1) distribuídos em delineamento inteiramente casualizado. Análises univariadas e multivariadas foram utilizadas. Os rendimentos dos cortes comerciais e as características físico-químicas e medidas qualitativas da carcaça foram semelhantes entre os grupos genéticos. Sete, das 28 características da carcaça, foram maiores nos cordeiros MNF1. A altura do peito, altura da garupa e índice de anamorfose mostraram-se variáveis ââimportantes na escolha de cordeiros MN com potencial de produção de carne. Com base na análise fatorial e hierárquica de agrupamento, foi elaborado o índice morfométrico da carne da raça Morada Nova (IMCMN). Ambos os grupos apresentam alto desenvolvimento torácico, capacidade de produção de carne, ganho de peso, eficiência alimentar e capacidade respiratória, infundindo maior rusticidade e adaptabilidade, porém, a aplicação e validação do índice desenvolvido mostrou superioridade para produção de carne nos cordeiros cruzados. Assim, os cordeiros MNF1 são uma opção sustentável para a produção ovina em terras áridas.
Subject(s)
Animals , Sheep , Red MeatABSTRACT
Abstract Background: The lack of information on population structure is one of the main obstacles to develop breeding and conservation programs for animal genetic resources. Objective: To characterize the population structure of Crioula Lageana cattle breed (Bos taurus) in order to assess its genetic diversity. Methods: Database with information of 1,638 Crioula Lageana animals, collected during 38 years, was analysed using the ENDOG v.4.4 program. Results: Effective population size ranged from 72.53 in complete generations to 143.90 in maximum generations. Inbreeding and Average Relatedness coefficients were 0.34 and 0.91%, respectively. The effective number of founders and ancestors were 29 and 28 animals, respectively, and only ten ancestors were responsible for 50% of the genetic variability of the whole population. The average generation interval was 5.84 years in the paternal line and 7.70 in the maternal one. Wright´s F statistics indicated low genetic distances between subsets in relation to the total population (Fst = 0.0015), between individuals with respect to their subpopulation (Fis = -0.0027), and between individuals in relation to the total population (Fit = -0.0012). Conclusion: Analysis of the population indicated that, despite the small number of animals with known parentage and considerable loss of genetic variability by the constant use of a few sires, and same value of number of founders and ancestors, the population showed good genetic management, low inbreeding, low genetic differentiation among subpopulations, and probably adequate effective population size for breed preservation.
Resumen Antecedentes: La falta de información sobre estructura poblacional es una de las principales barreras para el desarrollo de programas de mejoramiento genético y conservación de los recursos zoogenéticos. Objetivo: Caracterizar la estructura poblacional de la raza bovina Crioula Lageana (Bos taurus) para evaluar su diversidad genética. Métodos: Una base de datos con información de 1.638 animales Crioula Lageana (Bos taurus), recogidos durante 38 años, fue analizada utilizando el programa ENDOG v.4.4. Resultados: El tamaño efectivo de la población varió de 72,53 en las generaciones completas a 143,90 en las generaciones máximas. La endogamia y la relación media de los coeficientes fue 0,34 y 0,91%, respectivamente. El número efectivo de fundadores y antepasados fue de 29 y 28 animales respectivamente, y sólo diez antepasados fueron responsables del 50% de la variabilidad genética de la población. El intervalo promedio de generación fue de 5,84 años en la línea paterna y de 7,70 en la línea materna. El índice estadístico de Wright's F indica una baja distancia genética entre los subconjuntos en relación con la población total (Fst = 0,0015), entre los individuos con respecto a su subpoblación (Fis = -0,0027), y entre los individuos en relación con la población total (Fit = -0,0012). Conclusión: El análisis de la población indica que a pesar del pequeño número de animales con origen conocido y la considerable pérdida de variabilidad genética por el uso constante de pocos toros y el mismo valor del número de fundadores y antepasados, la población mostró un buen manejo genético, baja endogamia, baja diferenciación genética entre las subpoblaciones y probablemente un tamaño efectivo adecuado de la población.
Resumo Antecedentes: A falta de informações sobre a estrutura da população está entre os principais obstáculos ao desenvolvimento de programas de melhoramento e conservação de recursos genéticos animais. Objetivo: Caracterizar a estrutura populacional da raça bovina Crioula Lageana (Bos taurus) para acessar a diversidade genética da raça. Métodos: Banco de dados com informação de 1.638 animais Crioula Lageana, recolhidos durante 38 anos, foi analisado utilizando EndoG v.4.4. Resultados: O tamanho efetivo populacional variou de 72,53 nas gerações completas para 143,90 nas gerações máximas. Coeficientes de Endogamia e Relação foram 0,34 e 0,91%, respectivamente. O número efetivo de fundadores e ancestrais foram 29 e 28 animais, respectivamente, sendo que apenas dez ancestrais foram responsáveis por 50% da variabilidade genética de toda a população. O intervalo de gerações foi de 5,84 anos para linha paterna e 7,70 para linha materna. As estatísticas F de Wright indicaram uma pequena distância genética das subpopulacoes entre os subgrupos em relação à população total (FST = 0,0015), entre os indivíduos em relação à sua subpopulação (FIS = -0,0027) e entre indivíduos em relação à população total (Fit = -0,0012). Isto indica uma baixa diferenciação genética na população estudada. Conclusão: A análise populacional indicou que, apesar do número pequeno de animais com ascendência conhecida e considerável perda de variabilidade genética pelo uso constante de alguns touros e mesmo valor do número de fundadores e antepassados, a população mostrou boa gestão genética, endogamia baixa, baixa diferenciação genética entre subpopulações e provavelmente adequado tamanho efetivo da população para a preservação da raça.
ABSTRACT
O objetivo desse trabalho foi analisar a diversida de genética e estrutura de população das variedades Branca (N=40), Vermelha (N=32) e Neg ra (31) da raça ovina Morada Nova, em rebanhos do semiarido nordestino Brasileiro através do uso de 17 marcadores nucleares microssatélites e duas regiões do DNA mitocondrial (mtDNA), o gene ND5 e a região controle (D- loop). A análise da variabilidade intrapopulacional demons trou que a variedade Branca apresentou maiores valores de diversidade, enquanto a Vermelha apresentou os menores valores. A análise bayesiana para avaliar a estrutura genética populacional permitiu diferenciar entre as variedades Branca, Vermelha e Negra e uma tendência de subestruturação relacionada aos rebanhos da variedade Branca. Os resultados das Análises de Variância Molecular (AMOVA) evidenciaram que a maior estruturação genética foi observada quando se compararam rebanhos ao invés de variedades (8,59% versus 6,64% da variação total observada, P < 0,001). Tanto a análise de Coordenadas Principais como o dendrograma, por meio da distância genética Dtl, mostraram à formação de dois grupos principais, um composto por indivíduos brancos e outro por indivíduos vermelhos e Negros. Seis haplótipos foram encontrados para região D-loop e dois para o gene ND5. Um haplótipo exclusivo para variedade vermelha e outro para variedade Negra foram encontrados na região D-loop e um haplótipo exclusi vo para variedade Negra no gene ND5, mas as frequências destes foram baixas e, portanto existe necessidade de validação adicional. Os resultados obtidos reforçam a existência de diferen ças significativas entre as variedades Vermelha e Branca da raça e poderão ser utilizados para o aperfeiçoamento de programas de conservação e uso de recursos genéticos.
Genetic diversity and population structure of varieties of Morada Nova sheep with microsatellite markers and mtDNA. 2012.48f. Master Science in Animal Production: Characterization, Conservation and Breeding of Local Resources - Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA), Mossoró-RN, 2012. ABSTRACT: The aim of this study was to analyze the genetic diversity and population structure of varieties White ( N = 40) , Red ( N = 32) and Black (31) of Morada Nova breed of sheep , herds in the northeastern Brazilian semiarid through the use of 17 nuclear microsatellite markers and two regions in the mitochondrial DNA (mtDNA ), the ND5 gene and the control region ( D - loop). The analysis of intra- population demonstrated that the variety White had higher diversity , while Red had the lowest values . The Bayesian analysis to assess the population genetic structure allowed differentiation between varieties White , Red and Black and a tendency to sub- structuring related to the flocks of White variety . The results of analyzes of molecular variance ( AMOVA) showed that the greatest genetic structure was found when comparing herds rather than varieties (8.59 % versus 6.64% of the total variation , P < 0.001). Both the analysis of the dendrogram as Principal Coordinates, through genetic distance Dtl , showed the formation of two main groups , one composed of whites and another for blacks and reds individuals . Six haplotypes were found for D- loop region and two for the ND5 gene . A haplotype unique to other red variety to variety and Black were found in the D- loop region and a variety haplotype unique to the Black ND5 gene , but these frequencies were low and therefore there is need for further validation . The results support the existence of significant differences between the varieties Red and White breed and can be used for the improvement of conservation programs and use of genetic resource.