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1.
Microb Ecol ; 85(4): 1423-1433, 2023 May.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35525854

RESUMEN

Plants modulate the soil microbiota and select a specific microbial community in the rhizosphere. However, plant domestication reduces genetic diversity, changes plant physiology, and could have an impact on the associated microbiome assembly. Here, we used 16S rRNA gene sequencing to assess the microbial community in the bulk soil and rhizosphere of wild, semi-domesticated, and domesticated genotypes of lima bean (Phaseolus lunatus), to investigate the effect of plant domestication on microbial community assembly. In general, rhizosphere communities were more diverse than bulk soil, but no differences were found among genotypes. Our results showed that the microbial community's structure was different from wild and semi-domesticated as compared to domesticated genotypes. The community similarity decreased 57.67% from wild to domesticated genotypes. In general, the most abundant phyla were Actinobacteria (21.9%), Proteobacteria (20.7%), Acidobacteria (14%), and Firmicutes (9.7%). Comparing the different genotypes, the analysis showed that Firmicutes (Bacillus) was abundant in the rhizosphere of the wild genotypes, while Acidobacteria dominated semi-domesticated plants, and Proteobacteria (including rhizobia) was enriched in domesticated P. lunatus rhizosphere. The domestication process also affected the microbial community network, in which the complexity of connections decreased from wild to domesticated genotypes in the rhizosphere. Together, our work showed that the domestication of P. lunatus shaped rhizosphere microbial communities from taxonomic to a functional level, changing the abundance of specific microbial groups and decreasing the complexity of interactions among them.


Asunto(s)
Microbiota , Phaseolus , Phaseolus/genética , Phaseolus/microbiología , Raíces de Plantas/microbiología , Rizosfera , Domesticación , ARN Ribosómico 16S/genética , Microbiota/genética , Proteobacteria/genética , Plantas , Acidobacteria/genética , Suelo/química , Microbiología del Suelo
2.
Ciênc. rural (Online) ; 53(1): e20210559, 2023. tab, graf
Artículo en Inglés | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1375167

RESUMEN

ABSTRACT: This research aimed to morphologically characterize and estimate the genetic diversity of 21 Capsicum accessions belonging to the Capsicum Germplasm Active Bank at the Universidade Federal do Piauí (BAGC-UFPI) using uni- and multivariate analysis. The experiment was carried out in a greenhouse, by completely randomized experimental design with four repetitions, with one plant per plot. Analysis of variance (ANOVA) and the comparison of means for seven quantitative variables were performed, followed by clustering the averages by the Scott-Knott test (P < 0.05). The analysis of the seven quantitative and thirteen qualitative descriptors was estimated based on the Gower distance. Later, it was performed the principal component analysis and the UPGMA hierarchical cluster method. Results characterized and identified a wide intra- and interspecific genetic variability related to the fruit size, colors, and shapes among the Brazilian Capsicum genotypes belonging to the BAGC-UFPI. The descriptors used in this research were effective in the discrimination of the pepper accessions, especially the closely related C. frutescens and C. chinense species.


RESUMO: Este trabalho teve como objetivo caracterizar e estimar a diversidade genética em 21 acessos de Capsicum pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Federal do Piauí (BAGC-UFPI), por análises uni e multivariadas. O experimento foi conduzido em telado, utilizando-se o delineamento inteiramente ao acaso, com quatro repetições, sendo uma planta por parcela. Realizou-se análise de variância (ANOVA) e comparação da média para as setes variáveis quantitativas, seguidas do agrupamentos de médias pelo teste Scott-Knott (P < 0,05). A análise dos sete descritores quantitativos e treze qualitativos foi estimada com base na distância de Gower. Posteriormente, foi realizada a análise de componentes principais e o método de agrupamento hierárquico UPGMA. Os resultados caracterizaram e identificaram uma ampla variabilidade genética intra e interespecífica relacionada ao tamanho, cor e formato dos frutos entre os genótipos brasileiros de Capsicum do banco de germoplasma de pimentas BAGC-UFPI. Os descritores utilizados foram eficientes na discriminação dos acessos de pimentas, especialmente para espécies proximamente relacionadas C. frutescens e C. chinense.

3.
Ciênc. rural (Online) ; 53(1): 1-9, 2023. tab, graf, ilus
Artículo en Inglés | VETINDEX | ID: biblio-1410636

RESUMEN

This research aimed to morphologically characterize and estimate the genetic diversity of 21 Capsicum accessions belonging to the Capsicum Germplasm Active Bank at the Universidade Federal do Piauí (BAGC-UFPI) using uni- and multivariate analysis. The experiment was carried out in a greenhouse, by completely randomized experimental design with four repetitions, with one plant per plot. Analysis of variance (ANOVA) and the comparison of means for seven quantitative variables were performed, followed by clustering the averages by the Scott-Knott test (P < 0.05). The analysis of the seven quantitative and thirteen qualitative descriptors was estimated based on the Gower distance. Later, it was performed the principal component analysis and the UPGMA hierarchical cluster method. Results characterized and identified a wide intra- and interspecific genetic variability related to the fruit size, colors, and shapes among the Brazilian Capsicum genotypes belonging to the BAGC-UFPI. The descriptors used in this research were effective in the discrimination of the pepper accessions, especially the closely related C. frutescens and C. chinense species.


Este trabalho teve como objetivo caracterizar e estimar a diversidade genética em 21 acessos de Capsicum pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Federal do Piauí (BAGC-UFPI), por análises uni e multivariadas. O experimento foi conduzido em telado, utilizando-se o delineamento inteiramente ao acaso, com quatro repetições, sendo uma planta por parcela. Realizou-se análise de variância (ANOVA) e comparação da média para as setes variáveis quantitativas, seguidas do agrupamentos de médias pelo teste Scott-Knott (P < 0,05). A análise dos sete descritores quantitativos e treze qualitativos foi estimada com base na distância de Gower. Posteriormente, foi realizada a análise de componentes principais e o método de agrupamento hierárquico UPGMA. Os resultados caracterizaram e identificaram uma ampla variabilidade genética intra e interespecífica relacionada ao tamanho, cor e formato dos frutos entre os genótipos brasileiros de Capsicum do banco de germoplasma de pimentas BAGC-UFPI. Os descritores utilizados foram eficientes na discriminação dos acessos de pimentas, especialmente para espécies proximamente relacionadas C. frutescens e C. chinense.


Asunto(s)
Variación Genética , Brasil , Capsicum
4.
Sci Rep ; 12(1): 3472, 2022 03 02.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35236879

RESUMEN

Plant breeding reduces the genetic diversity of plants and could influence the composition, structure, and diversity of the rhizosphere microbiome, selecting more homogeneous and specialized microbes. In this study, we used 16S rRNA sequencing to assess the bacterial community in the rhizosphere of different lines and modern cowpea cultivars, to investigate the effect of cowpea breeding on bacterial community assembly. Thus, two African lines (IT85F-2687 and IT82D-60) and two Brazilian cultivars (BRS-Guariba and BRS-Tumucumaque) of cowpea were assessed to verify if the generation advance and genetic breeding influence the bacterial community in the rhizosphere. No significant differences were found in the structure, richness, and diversity of bacterial community structure between the rhizosphere of the different cowpea genotypes, and only slight differences were found at the OTU level. The complexity of the co-occurrence network decreased from African lines to Brazilian cultivars. Regarding functional prediction, the core functions were significantly altered according to the genotypes. In general, African lines presented a more abundance of groups related to chemoheterotrophy, while the rhizosphere of the modern cultivars decreased functions related to cellulolysis. This study showed that the genetic breeding process affects the dynamics of the rhizosphere community, decreasing the complexity of interaction in one cultivar. As these cowpea genotypes are genetically related, it could suggest a new hypothesis of how genetic breeding of similar genotypes could influence the rhizosphere microbiome.


Asunto(s)
Rizosfera , Vigna , Bacterias/genética , Genotipo , Fitomejoramiento , Raíces de Plantas/microbiología , Plantas/genética , ARN Ribosómico 16S/genética , Microbiología del Suelo , Vigna/genética , Vigna/microbiología
5.
Biosci. j. (Online) ; 37: e37080, Jan.-Dec. 2021. ilus, tab, graf
Artículo en Inglés | LILACS | ID: biblio-1359263

RESUMEN

Cajui (Anacardium spp.) is a native fruit tree (small cashew) of the Brazilian Cerrado and possesses the potential for commercialization. However, cajui exploitation occurs exclusively through extractivism in the absence of conservation strategies. The lack of conservation strategies may lead to a decrease in genetic diversity of Anacardium. In this work, the genetic diversity and population structure of three natural populations in Sete Cidades National Park (PNSC; PI, Brazil) were assessed using ISSR analysis of 56 cajui accessions and two A. occidentale accessions (outgroup) from Pacajus (CE, Brazil). A total of 112 markers were obtained, 93 (83.04%) of which were polymorphic. The diversity indices of these populations indicated moderate levels of genetic diversity. According to AMOVA, 96.17% of the genetic variability lay within populations, with low genetic differentiation among populations (ΦST = 0.03828). Furthermore, STRUCTURE analysis indicated the existence of four connected genetic groups. The findings show that the individuals from the three collection sites did not represent different subpopulations, likely due to the high gene flow (Nm = 6.7) favored by the floral biology of Anacardium, pollinators and small-animal seed dispersers. This research identifies genetically divergent individuals (C-03, C-05, C-22, C-26, C-34 and C-39), which should be considered priority individuals for conservation and can inform conservation programs for Anacardium spp.


Asunto(s)
Variación Genética , Anacardium , Brasil , Pradera
6.
Ci. Rural ; 51(3)2021. ilus
Artículo en Inglés | VETINDEX | ID: vti-763471

RESUMEN

This study evaluated the activity of rhizobia isolates inoculated in large (18 mm) and small (11 mm) seeds on lima bean growth, nodulation and N fixation. Selected rhizobia isolates were compared with a reference strain CIAT899 and two controls without inoculation. Large seeds contributed for highest plant growth, nodulation and N fixation than small seeds. The isolates UFPI-59, UFPI-18 and UFPI-38 promoted the highest values of shoot and root dry weight, respectively. The isolates UFPI-32 promoted the highest values of nodule number, while UFPI-59 promoted the highest values of nodule dry weight. The isolates UFPI-38 and UFPI-59 promoted the highest accumulation of N. This study showed that seed size really influences lima bean growth, nodulation and BNF. Considering rhizobia isolates, UFPI-59, UFPI-38, and UFPI-18 contributed for plant growth, promoted better nodulation and effectiveness on biological N fixation.(AU)


Este estudo avaliou a atividade de isolados de rizóbios inoculados em sementes pequenas (11 mm) e grandes (18 mm) sobre o crescimento, nodulação e fixação de N de feijão-fava. Isolados selecionados de rizóbios foram comparados com uma estirpe de referência CIAT899 e dois controles sem inoculação. Sementes grandes contribuíram para maior crescimento de plantas, nodulação e fixação de N do que sementes pequenas. Os isolados UFPI-59, UFPI-18 e UFPI-38 promoveram os maiores valores de massa seca de parte aérea e raízes. Os isolados UFPI-32 e UFPI-59 promoveram os maiores valores de número e massa de nódulos, respectivamente. Os isolados UFPI-38 e UFPI-59 promoveram maior acúmulo de N. Este estudo mostrou que o tamanho de sementes influencia o crescimento, nodulação e fixação de N em feijão-fava. Considerando os isolados de rizóbios, UFPI-59, UFPI-38 e UFPI-18 contribuíram para o crescimento de plantas, promoveram melhor nodulação e eficiência na fixação de N.(AU)


Asunto(s)
Plantas Comestibles , Phaseolus/crecimiento & desarrollo , Rhizobium/patogenicidad , Bradyrhizobium/patogenicidad
7.
Sci. agric. ; 77(2): e20180140, 2020. tab, graf
Artículo en Inglés | VETINDEX | ID: vti-24599

RESUMEN

Some germplasm collections have a high number of accessions, which makes it difficult to explore the genetic variability present in the germplasm bank due to the redundancy and the difficulty of detailed analysis of all conserved accessions. Therefore, our study aimed to analyze the genetic diversity of 153 lima bean (Phaseolus lunatus) accessions for the purpose of constructing a core collection. Eleven SSRs were used for this purpose. The 153 lima bean accessions can be represented by low redundancy using a minimum of 34 accessions, thus representing 22 % of the size of the entire germplasm bank. The core collection had a higher Shannon diversity index and expected heterozygosity (1.906 and 0.811, respectively) than those presented by the entire germplasm bank (1.605 and 0.713, respectively), indicating a higher polymorphism of the representative cultivars in relation to the entire collection. The accessions selected for the core collection may be used in future studies of genome association as well as in genetic crosses in breeding programs aimed at developing improved cultivars with high genetic diversity which can meet current and future market needs.(AU)


Asunto(s)
Phaseolus/genética , Fitomejoramiento , Banco de Semillas
8.
Sci. agric ; 77(2): e20180140, 2020. tab, graf
Artículo en Inglés | VETINDEX | ID: biblio-1497841

RESUMEN

Some germplasm collections have a high number of accessions, which makes it difficult to explore the genetic variability present in the germplasm bank due to the redundancy and the difficulty of detailed analysis of all conserved accessions. Therefore, our study aimed to analyze the genetic diversity of 153 lima bean (Phaseolus lunatus) accessions for the purpose of constructing a core collection. Eleven SSRs were used for this purpose. The 153 lima bean accessions can be represented by low redundancy using a minimum of 34 accessions, thus representing 22 % of the size of the entire germplasm bank. The core collection had a higher Shannon diversity index and expected heterozygosity (1.906 and 0.811, respectively) than those presented by the entire germplasm bank (1.605 and 0.713, respectively), indicating a higher polymorphism of the representative cultivars in relation to the entire collection. The accessions selected for the core collection may be used in future studies of genome association as well as in genetic crosses in breeding programs aimed at developing improved cultivars with high genetic diversity which can meet current and future market needs.


Asunto(s)
Banco de Semillas , Fitomejoramiento , Phaseolus/genética
9.
Commun Biol ; 1: 135, 2018.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30272014

RESUMEN

Biodiversity underlies ecosystem functioning. While aboveground biodiversity is often well studied, the belowground microbiome, in particular protists, remains largely unknown. Indeed, holistic insights into soil microbiome structures in natural soils, especially in hyperdiverse biomes such as the Brazilian Cerrado, remain unexplored. Here, we study the soil microbiome across four major vegetation zones of the Cerrado, ranging from grass-dominated to tree-dominated vegetation with a focus on protists. We show that protist taxon richness increases towards the tree-dominated climax vegetation. Early successional habitats consisting of primary grass vegetation host most potential plant pathogens and least animal parasites. Using network analyses combining protist with prokaryotic and fungal sequences, we show that microbiome complexity increases towards climax vegetation. Together, this suggests that protists are key microbiome components and that vegetation succession towards climax vegetation is stimulated by higher loads of animal and plant pathogens. At the same time, an increase in microbiome complexity towards climax vegetation might enhance system stability.

10.
Ci. Rural ; 47(6): 01-06, jun. 2017. tab, graf
Artículo en Inglés | VETINDEX | ID: vti-688129

RESUMEN

In garlic (Allium sativum L.), genotype evaluation facilitates the search for better varieties. The aim of this study was to use morphoagronomic traits to evaluate three garlic landraces, namely, “Cateto Roxo Local”, “Cateto Roxo Mineiro 1” and “Cateto Roxo Mineiro 2”. They were planted on May 1, 2014 and May 23, 2014, in the municipality of Sussuapara, State of Piauí, Brazil. These varieties have similar behavior at the vegetative stage. “Cateto Roxo Local” had the highest average bulb mass, clove number per bulb, and clove mass per bulb. “Cateto Roxo Mineiro 1” and “Cateto Roxo Mineiro 2” had the largest clove diameter per bulb. In Sussuapara - PI, “Cateto Roxo Mineiro 1” and “Cateto Roxo Mineiro 2” are recommended for planting in the beginning of May, whereas “Cateto Roxo Local” should be planted in the third week of May.(AU)


Na cultura do alho (Allium sativum L.), a atividade de avaliação de genótipos é importante na busca por variedades superiores e adaptadas. Nesse sentido, o objetivo do presente trabalho foi realizar avaliação agromorfológica em três variedades crioulas de alho, Cateto Roxo Local, Cateto Roxo Mineiro 1 e Cateto Roxo Mineiro 2, em duas épocas de plantio, 1o de maio e 23 de maio de 2014, no município de Sussuapara - Piauí. As variedades apresentam comportamento semelhante na fase vegetativa das plantas, considerando as duas épocas de plantio. Quanto aos caracteres relacionados à produção, Cateto Roxo Local apresentou maior média para massa de bulbos, número e massa de bulbilhos por bulbo, enquanto Cateto Roxo Mineiro 1 e Cateto Roxo Mineiro 2, se destacaram quanto ao diâmetro dos bulbilhos por bulbo. Cateto Roxo Mineiro 1 e 2 devem ser recomendadas para o plantio no início do mês de maio, enquanto para Cateto Roxo Local, o plantio pode ocorrer até a terceira semana de maio, em Sussuapara - PI.(AU)


Asunto(s)
Ajo/crecimiento & desarrollo , Ajo/genética , 24444 , Genotipo
11.
Ciênc. rural (Online) ; 47(6): 01-06, jun. 2017. tab, graf
Artículo en Inglés | VETINDEX | ID: biblio-1479987

RESUMEN

In garlic (Allium sativum L.), genotype evaluation facilitates the search for better varieties. The aim of this study was to use morphoagronomic traits to evaluate three garlic landraces, namely, “Cateto Roxo Local”, “Cateto Roxo Mineiro 1” and “Cateto Roxo Mineiro 2”. They were planted on May 1, 2014 and May 23, 2014, in the municipality of Sussuapara, State of Piauí, Brazil. These varieties have similar behavior at the vegetative stage. “Cateto Roxo Local” had the highest average bulb mass, clove number per bulb, and clove mass per bulb. “Cateto Roxo Mineiro 1” and “Cateto Roxo Mineiro 2” had the largest clove diameter per bulb. In Sussuapara - PI, “Cateto Roxo Mineiro 1” and “Cateto Roxo Mineiro 2” are recommended for planting in the beginning of May, whereas “Cateto Roxo Local” should be planted in the third week of May.


Na cultura do alho (Allium sativum L.), a atividade de avaliação de genótipos é importante na busca por variedades superiores e adaptadas. Nesse sentido, o objetivo do presente trabalho foi realizar avaliação agromorfológica em três variedades crioulas de alho, Cateto Roxo Local, Cateto Roxo Mineiro 1 e Cateto Roxo Mineiro 2, em duas épocas de plantio, 1o de maio e 23 de maio de 2014, no município de Sussuapara - Piauí. As variedades apresentam comportamento semelhante na fase vegetativa das plantas, considerando as duas épocas de plantio. Quanto aos caracteres relacionados à produção, Cateto Roxo Local apresentou maior média para massa de bulbos, número e massa de bulbilhos por bulbo, enquanto Cateto Roxo Mineiro 1 e Cateto Roxo Mineiro 2, se destacaram quanto ao diâmetro dos bulbilhos por bulbo. Cateto Roxo Mineiro 1 e 2 devem ser recomendadas para o plantio no início do mês de maio, enquanto para Cateto Roxo Local, o plantio pode ocorrer até a terceira semana de maio, em Sussuapara - PI.


Asunto(s)
Ajo/crecimiento & desarrollo , Ajo/genética , 24444 , Genotipo
12.
Ciênc. rural ; Ciênc. rural (Online);47(6): e20160017, 2017. tab, graf
Artículo en Inglés | LILACS | ID: biblio-839845

RESUMEN

ABSTRACT: In garlic (Allium sativum L.), genotype evaluation facilitates the search for better varieties. The aim of this study was to use morphoagronomic traits to evaluate three garlic landraces, namely, “Cateto Roxo Local”, “Cateto Roxo Mineiro 1” and “Cateto Roxo Mineiro 2”. They were planted on May 1, 2014 and May 23, 2014, in the municipality of Sussuapara, State of Piauí, Brazil. These varieties have similar behavior at the vegetative stage. “Cateto Roxo Local” had the highest average bulb mass, clove number per bulb, and clove mass per bulb. “Cateto Roxo Mineiro 1” and “Cateto Roxo Mineiro 2” had the largest clove diameter per bulb. In Sussuapara - PI, “Cateto Roxo Mineiro 1” and “Cateto Roxo Mineiro 2” are recommended for planting in the beginning of May, whereas “Cateto Roxo Local” should be planted in the third week of May.


RESUMO: Na cultura do alho (Allium sativum L.), a atividade de avaliação de genótipos é importante na busca por variedades superiores e adaptadas. Nesse sentido, o objetivo do presente trabalho foi realizar avaliação agromorfológica em três variedades crioulas de alho, Cateto Roxo Local, Cateto Roxo Mineiro 1 e Cateto Roxo Mineiro 2, em duas épocas de plantio, 1o de maio e 23 de maio de 2014, no município de Sussuapara - Piauí. As variedades apresentam comportamento semelhante na fase vegetativa das plantas, considerando as duas épocas de plantio. Quanto aos caracteres relacionados à produção, Cateto Roxo Local apresentou maior média para massa de bulbos, número e massa de bulbilhos por bulbo, enquanto Cateto Roxo Mineiro 1 e Cateto Roxo Mineiro 2, se destacaram quanto ao diâmetro dos bulbilhos por bulbo. Cateto Roxo Mineiro 1 e 2 devem ser recomendadas para o plantio no início do mês de maio, enquanto para Cateto Roxo Local, o plantio pode ocorrer até a terceira semana de maio, em Sussuapara - PI.

13.
Ciênc. rural ; Ciênc. rural (Online);46(2): 203-209, fev. 2016. tab, graf
Artículo en Portugués | LILACS | ID: lil-767645

RESUMEN

RESUMO: O alho é uma das hortaliças mais importantes no mercado brasileiro e mundial. No Piauí, mais especificamente na microrregião de Picos, o alho semi-nobre foi cultivado em larga escala e supria a demanda de vários municípios do estado. Devido à entrada do alho nobre no mercado brasileiro, houve redução na produção de alho semi-nobre que pode ter levado à perda de diversidade genética. O objetivo deste trabalho foi estudar a diversidade genética em doze variedades de alho, sendo quatro de origem piauiense e oito da Coleção de Germoplasma de Alho da Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - Universidade de São Paulo (ESALQ/USP). Para isso, caracterizou-se o germoplasma com base nos descritores propostos pelo International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI), atualmente Bioversity International, e realizou-se a genotipagem das variedades a partir de oito locos SSR. Os resultados obtidos com a análise morfológica corroboraram as análises moleculares, evidenciando complementaridade dessas dimensões de análise no estudo da diversidade genética em alho. Assim, conclui-se que existe divergência genética entre as variedades de alho estudadas em função da procedência do germoplasma e sugere-se que o material oriundo da ESALQ/USP trata-se de um germoplasma distinto do cultivado no Piauí. A divergência genética existente entre as variedades de alho no Piauí indica a possibilidade de seleção de genótipos superiores que aumentem a competitividade do alho piauiense frente ao alho importado.


ABSTRACT: Garlic is one of the most important crops in Brazil and in the world. In Piauí State, specifically in micro region of Picos, semi-noble garlic was once grown on a large scale and supplied the demand of various municipalities in the state. After the noble garlic was introduced to the Brazilian market, the production of semi-noble garlic reduced which may have led to loss of genetic diversity.This study investigated the genetic diversity in twelve varieties of garlic, four originally from Piauí State and eight from the Garlic Germplasm Collection of the College of Agricultura "Luiz de Queiroz" - Universidade de São Paulo (ESALQ / USP). The present study characterized the germplasm based on descriptions proposed by the International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI), currently Bioversity International, and conducted the genotyping of varieties from eight SSR loci. The agronomic characters and microsatellite genotyping were efficient to estimate genetic diversity among the garlic varieties. The results obtained with the morphological analysis corroborated the molecular analyses, demonstrating complementarity of these analyses dimensions in the study of genetic diversity in garlic. Thus, we concluded that genetic diversity exists among the varieties of garlic studied in terms of the germplasm origin and suggests that the material from the ESALQ / USP is a germplasm distinct from that grown in Piauí State. The genetic divergence among varieties of garlic in Piauí State indicates the possibility of selecting superior genotypes that increase the competitiveness of garlic from Piauí State against imported garlic.

14.
Ci. Rural ; 46(2): 203-209, 2016.
Artículo en Portugués | VETINDEX | ID: vti-14010

RESUMEN

Garlic is one of the most important crops in Brazil and in the world. In Piauí State, specifically in micro region of Picos, semi-noble garlic was once grown on a large scale and supplied the demand of various municipalities in the state. After the noble garlic was introduced to the Brazilian market, the production of semi-noble garlic reduced which may have led to loss of genetic diversity.This study investigated the genetic diversity in twelve varieties of garlic, four originally from Piauí State and eight from the Garlic Germplasm Collection of the College of Agricultura "Luiz de Queiroz" - Universidade de São Paulo (ESALQ / USP). The present study characterized the germplasm based on descriptions proposed by the International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI), currently Bioversity International, and conducted the genotyping of varieties from eight SSR loci. The agronomic characters and microsatellite genotyping were efficient to estimate genetic diversity among the garlic varieties. The results obtained with the morphological analysis corroborated the molecular analyses, demonstrating complementarity of these analyses dimensions in the study of genetic diversity in garlic. Thus, we concluded that genetic diversity exists among the varieties of garlic studied in terms of the germplasm origin and suggests that the material from the ESALQ / USP is a germplasm distinct (AU)


O alho é uma das hortaliças mais importantes no mercado brasileiro e mundial. No Piauí, mais especificamente na microrregião de Picos, o alho semi-nobre foi cultivado em larga escala e supria a demanda de vários municípios do estado. Devido à entrada do alho nobre no mercado brasileiro, houve redução na produção de alho semi-nobre que pode ter levado à perda de diversidade genética. O objetivo deste trabalho foi estudar a diversidade genética em doze variedades de alho, sendo quatro de origem piauiense e oito da Coleção de Germoplasma de Alho da Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - Universidade de São Paulo (ESALQ/USP). Para isso, caracterizou-se o germoplasma com base nos descritores propostos pelo International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI), atualmente Bioversity International, e realizou-se a genotipagem das variedades a partir de oito locos SSR. Os resultados obtidos com a análise morfológica corroboraram as análises moleculares, evidenciando complementaridade dessas dimensões de análise no estudo da diversidade genética em alho. Assim, conclui-se que existe divergência genética entre as variedades de alho estudadas em função da procedência do germoplasma e sugere-se que o material oriundo da ESALQ/USP trata-se de um germoplasma distinto do cultivado no Piauí. A divergência genética existente entre as variedades de alho no Piauí indica a possibilid(AU)


Asunto(s)
Ajo/metabolismo , Repeticiones de Microsatélite , Variación Genética
15.
Semina Ci. agr. ; 36(2): 683-692, mar.-abr. 2015. tab, ilus
Artículo en Inglés | VETINDEX | ID: vti-30007

RESUMEN

Lima bean is a source of income for the rural population of Northeast Brazil because people purchase and consume the imature and mature beans. In this region, all of the germplasms used by farmers come from their own crops or they trade between rural communities. Understanding the genetic diversity of the lima bean germplasm provides important information for both managing germplasm banks and genetic conservation. In this study, we aimed to estimate the genetic diversity between 24 lima bean accessions from the Active GermplasmBank (AGB) at the Universidade Federal do Piauí (UFPI) based on morphoagronomic descriptors. The experiment was conducted under field conditions in lattice design with four replications and ten plants per plot, from February to August 2009. Seven qualitative and six quantitative descriptors were used. Four groups were created for quantitative traits using the Tocher and Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) methods, while qualitative traits were divided into three groups using the Tocher method and into six groups using UPGMA. The trait that contributed the most to genetic diversity (35.23%) was pod width. UFPI-220 produced a large number of pods per plant, an important trait for identifying potentially productive accessions. We expect that beneficial combinations can be made between UFPI-220 x UFPI-468 due to both the high level of...(AU)


O feijão-fava é uma alternativa de renda para a população rural do Nordeste do Brasil, que consome seus grãos verdes ou maduros. Nessa região, todo germoplasma utilizado pelos agricultores é originário de seus próprios cultivos havendo intercâmbio de sementes entre comunidades rurais. O conhecimento sobre a diversidade genética tem proporcionado importantes contribuições no gerenciamento de bancos de germoplasmas e na conservação de recursos genéticos. Neste trabalho, objetivou-se estimar a diversidade genética entre vinte quatro acessos de feijão-fava do Banco Ativo de Germoplasma (BAG) da Universidade Federal do Piauí (UFPI), com base em descritores morfoagronômicos. O experimento foi conduzido em condições de campo, em látice com quatro repetições e dez plantas por parcela, no período de fevereiro a agosto de 2009, sendo utilizados sete descritores qualitativos e seis quantitativos. Para os caracteres quantitativos foram formados quatro grupos pelos métodos de Tocher e UPGMA, enquanto que para os qualitativos formaram-se três grupos pelo método de Tocher e seis pelo UPGMA. O caráter que mais contribuiu para divergência genética (35,23%) foi largura da vagem. UFPI-220 produziu grande número de vagens por planta, característica importante na identificação de acessos potencialmente produtivos. Há expectativa de combinação promissora entre UFPI-220 x UFPI-468, em virtude da...(AU)


Asunto(s)
Variación Genética , Fitomejoramiento , Phaseolus/genética
16.
Semina ciênc. agrar ; 36(2): 683-692, 2015. tab, ilus
Artículo en Inglés | VETINDEX | ID: biblio-1499886

RESUMEN

Lima bean is a source of income for the rural population of Northeast Brazil because people purchase and consume the imature and mature beans. In this region, all of the germplasms used by farmers come from their own crops or they trade between rural communities. Understanding the genetic diversity of the lima bean germplasm provides important information for both managing germplasm banks and genetic conservation. In this study, we aimed to estimate the genetic diversity between 24 lima bean accessions from the Active GermplasmBank (AGB) at the Universidade Federal do Piauí (UFPI) based on morphoagronomic descriptors. The experiment was conducted under field conditions in lattice design with four replications and ten plants per plot, from February to August 2009. Seven qualitative and six quantitative descriptors were used. Four groups were created for quantitative traits using the Tocher and Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) methods, while qualitative traits were divided into three groups using the Tocher method and into six groups using UPGMA. The trait that contributed the most to genetic diversity (35.23%) was pod width. UFPI-220 produced a large number of pods per plant, an important trait for identifying potentially productive accessions. We expect that beneficial combinations can be made between UFPI-220 x UFPI-468 due to both the high level of...


O feijão-fava é uma alternativa de renda para a população rural do Nordeste do Brasil, que consome seus grãos verdes ou maduros. Nessa região, todo germoplasma utilizado pelos agricultores é originário de seus próprios cultivos havendo intercâmbio de sementes entre comunidades rurais. O conhecimento sobre a diversidade genética tem proporcionado importantes contribuições no gerenciamento de bancos de germoplasmas e na conservação de recursos genéticos. Neste trabalho, objetivou-se estimar a diversidade genética entre vinte quatro acessos de feijão-fava do Banco Ativo de Germoplasma (BAG) da Universidade Federal do Piauí (UFPI), com base em descritores morfoagronômicos. O experimento foi conduzido em condições de campo, em látice com quatro repetições e dez plantas por parcela, no período de fevereiro a agosto de 2009, sendo utilizados sete descritores qualitativos e seis quantitativos. Para os caracteres quantitativos foram formados quatro grupos pelos métodos de Tocher e UPGMA, enquanto que para os qualitativos formaram-se três grupos pelo método de Tocher e seis pelo UPGMA. O caráter que mais contribuiu para divergência genética (35,23%) foi largura da vagem. UFPI-220 produziu grande número de vagens por planta, característica importante na identificação de acessos potencialmente produtivos. Há expectativa de combinação promissora entre UFPI-220 x UFPI-468, em virtude da...


Asunto(s)
Fitomejoramiento , Phaseolus/genética , Variación Genética
17.
Ciênc. rural ; Ciênc. rural (Online);44(4): 599-604, Apr. 2014. ilus, tab
Artículo en Portugués | LILACS | ID: lil-705298

RESUMEN

O trabalho estudou o controle genético dos caracteres comprimento (CRP) e número de nós (NNRP) do ramo principal e hábito de crescimento em feijão-caupi, a partir dos cruzamentos TE96-282-22G x TVX-5058-09C e TE96-282-22G x IT81D-1332. O experimento foi conduzido na Embrapa Meio-Norte, em Teresina, PI, Brasil, no ano de 2003. Estimaram-se os componentes genéticos de média, variância e herdabilidades para os caracteres CRP e NNRP. O estudo da herança do hábito de crescimento foi realizado com base nas frequências dos fenótipos observados. Em ambos os cruzamentos, o modelo genético aditivo-dominante foi suficiente para explicar a variação fenotípica observada para o CRP e NNRP; os efeitos aditivos e de dominância são importantes no controle do CRP e NNRP, mas a variância aditiva é prevalente como componente genético. O CRP e NNRP apresentam controle oligogênico, associado com alta expressão do caráter. O hábito de crescimento apresenta herança monogênica, com dominância para o tipo indeterminado.


The aim of this study was to investigate the genetic control of traits related to plant architecture in cowpea: length and number of nodes on main stem, growth habit, from the crossings TE96-282-22G x TVX-5058-09C and TE96-282-22G x IT81D-1332. The experiment was conducted at Embrapa Mid-North, Teresina, PI, Brazil, in 2003. Experiments were carried out under randomized block design with four replications. Genetic components of mean and variance and heritability for the traits length and number of nodes on main stem were estimated. Growth habit was based on the frequencies of the phenotypes observed. In both crosses, the additive-dominant genetic model was sufficient to explain the phenotypic variation observed for length and number of nodes on main stem; additive and dominance effects are important in controlling the length and number of nodes on main stem, but the additive variance is prevalent as a component of genetic variance. Length and number of nodes on main stem presents oligogenic control associated with a high expression of trait. Growth habit has monogenic control, with dominance for the indeterminate type.

18.
Ci. Rural ; 44(4): 599-604, abr. 2014. tab, graf
Artículo en Portugués | VETINDEX | ID: vti-28985

RESUMEN

O trabalho estudou o controle genético dos caracteres comprimento (CRP) e número de nós (NNRP) do ramo principal e hábito de crescimento em feijão-caupi, a partir dos cruzamentos TE96-282-22G x TVX-5058-09C e TE96-282-22G x IT81D-1332. O experimento foi conduzido na Embrapa Meio-Norte, em Teresina, PI, Brasil, no ano de 2003. Estimaram-se os componentes genéticos de média, variância e herdabilidades para os caracteres CRP e NNRP. O estudo da herança do hábito de crescimento foi realizado com base nas frequências dos fenótipos observados. Em ambos os cruzamentos, o modelo genético aditivo-dominante foi suficiente para explicar a variação fenotípica observada para o CRP e NNRP; os efeitos aditivos e de dominância são importantes no controle do CRP e NNRP, mas a variância aditiva é prevalente como componente genético. O CRP e NNRP apresentam controle oligogênico, associado com alta expressão do caráter. O hábito de crescimento apresenta herança monogênica, com dominância para o tipo indeterminado.(AU)


The aim of this study was to investigate the genetic control of traits related to plant architecture in cowpea: length and number of nodes on main stem, growth habit, from the crossings TE96-282-22G x TVX-5058-09C and TE96-282-22G x IT81D-1332. The experiment was conducted at Embrapa Mid-North, Teresina, PI, Brazil, in 2003. Experiments were carried out under randomized block design with four replications. Genetic components of mean and variance and heritability for the traits length and number of nodes on main stem were estimated. Growth habit was based on the frequencies of the phenotypes observed. In both crosses, the additive-dominant genetic model was sufficient to explain the phenotypic variation observed for length and number of nodes on main stem; additive and dominance effects are important in controlling the length and number of nodes on main stem, but the additive variance is prevalent as a component of genetic variance. Length and number of nodes on main stem presents oligogenic control associated with a high expression of trait. Growth habit has monogenic control, with dominance for the indeterminate type.(AU)


Asunto(s)
Vigna/anatomía & histología , Vigna/crecimiento & desarrollo , Vigna/genética , Fitomejoramiento , Herencia
19.
Biota neotrop. (Online, Ed. port.) ; 13(1): 383-386, jan.-mar. 2013. ilus, tab
Artículo en Inglés | LILACS | ID: lil-673185

RESUMEN

Thrips are still poorly known in cowpea, Vigna unguiculata (L.) Walp., in Piauí, despite their economic importance in this crop, which stands out as one of the major cultures of North and Northeast regions from Brazil. Thus, this study aimed to identify the thrips species associated to the crop in Teresina and Bom Jesus, Piauí, Brazil. From October 2007 to August 2008, cowpea inflorescences were sampled in the municipalities by the technique of simple bagging. After screenings, thrips were preserved in AGA, mounted on permanent microscope slides and identified. The identified species were: Frankliniella brevicaulis Hood, 1937, F. insularis (Franklin, 1908), F. schultzei (Trybom, 1910), F. tritici (Fitch, 1855) and Haplothrips gowdeyi (Franklin, 1908). The slides are deposited at the entomological collection of the Departamento de Biologia, Universidade Federal do Piauí. A key to the species is provided.


Tripes ainda são pouco conhecidos em caupi, Vigna unguiculata (L.) Walp., no Piauí, a despeito de sua importância econômica na cultura, que se destaca como um dos principais cultivos das regiões Norte e Nordeste do Brasil. Assim, esse estudo objetivou identificar as espécies de tripes associadas à cultura em Teresina e Bom Jesus, Piauí, Brasil. De outubro de 2007 a agosto de 2008, inflorescências de caupi foram amostradas no dois municípios, por meio técnica do ensacamento simples. Após triagens, os tripes foram preservados em AGA, montados em lâminas de microscopia permanentes e identificados. As espécies identificadas foram: Frankliniella brevicaulis Hood, 1937, F. insularis (Franklin, 1908), F. schultzei (Trybom, 1910), F. tritici (Fitch, 1855) e Haplothrips gowdeyi (Franklin, 1908). As lâminas estão depositadas na coleção entomológica do Departamento de Biologia, Universidade Federal do Piauí. Uma chave de identificação para as espécies é fornecida.

20.
Ciênc. rural ; Ciênc. rural (Online);40(2): 288-293, fev. 2010. ilus
Artículo en Portugués | LILACS | ID: lil-539940

RESUMEN

O conhecimento da diversidade genética entre acessos em bancos de germoplasma é importante para fins de conservação de recursos genéticos e uso em programas de melhoramento genético. Neste estudo, objetivou-se avaliar a divergência genética entre 23 acessos de pimentas do gênero Capsicum, a partir de sete descritores quantitativos e 19 qualitativos multicategóricos, com auxílio de técnicas multivariadas. Pela análise de variância, evidenciaram-se diferenças significativas entre os acessos de pimentas para todos os descritores quantitativos. Os coeficientes de variação (CV) do experimento variaram de 8,97 (LF) a 30,91 por cento (NFA). O Método de agrupamento de otimização via Tocher detectou a formação de oito grupos, tanto para descritores quantitativos, quanto para os qualitativos multicategóricos. Pelo Método UPGMA, formaram-se três grupos baseando-se nos descritores quantitativos e quatro grupos com base nos qualitativos. Há diversidade genética inter e intraespecífica no Banco de Germoplasma de Capsicum spp. da Universidade Federal do Piauí, com evidências de que não existem duplicatas entre os acessos estudados.


The knowledge of the genetic diversity among the accessions in germplasm banks it is important for the conservation of genetic resources and the use in breeding programs. This study aimed to evaluate the genetic divergence of 23 accessions of the genus Capsicum, and was based in seven quantitative and nineteen qualitative multicategorical descriptors and using multivariate techniques. The analyses of variance revealed significant difference (P<0.05) among the accessions of peppers for all quantitative descriptors. The coefficient variation ranged from 8,97 percent (LF) to 30,91 percent (NFA). The Tocher optimization method detected eight clusters for quantitative descriptors and also in as well as qualitative multicategoric descriptors. The UPGMA method detected three clusters for quantitative descriptors and four clusters within qualitative multicategoricdescriptors. There is genetic diversity inter and intraspecific in germplasm bank of Capsicum coming from The Federal University of Piauí, and these results indicate that there are not duplicated accessions.

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