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Funct Integr Genomics ; 1(3): 193-9, 2000 Nov.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-11793237

RESUMEN

The identification of proteins that interact with polycystin-1, the product of the autosomal dominant polycystic kidney disease gene, is an important step towards understanding the molecular pathogenesis of the disease. We have developed a two-step approach for the efficient identification of potential polycystin-1 ligands using the T7 phage display system. The first enrichment step of 4-5 rounds of biopanning is followed by a second step of reverse protein overlay assay. Thus, the sequencing efforts are minimized to the analysis of only positive rather than randomly chosen clones from the enriched population as in the standard phage display approach. Most importantly, the modified approach immediately provides the confirmation of the specificity of interaction and discriminates between strong and weak interactions. Here we present several potential interactors with distinct regions of polycystin-1, representing high-affinity binding partners.


Asunto(s)
Bacteriófago T7/genética , Biblioteca de Péptidos , Proteínas/metabolismo , Secuencia de Aminoácidos , Secuencia de Bases , Escherichia coli/genética , Glutatión Transferasa/genética , Glutatión Transferasa/metabolismo , Ligandos , Datos de Secuencia Molecular , Unión Proteica , Estructura Terciaria de Proteína , Proteínas/química , Proteínas/genética , Sistemas de Lectura , Proteínas Recombinantes de Fusión/química , Proteínas Recombinantes de Fusión/genética , Proteínas Recombinantes de Fusión/metabolismo , Análisis de Secuencia de ADN , Homología de Secuencia de Aminoácido , Canales Catiónicos TRPP
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