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1.
Oncotarget ; 7(50): 83319-83329, 2016 Dec 13.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27825111

RESUMEN

As a part of an international study on the molecular analysis of Diffuse Large B-cell Lymphoma (DLBCL), a robust protocol for gene expression analysis from RNA extraction to qRT-PCR using Formalin Fixed Paraffin Embedded tissues was developed. Here a study was conducted to define a strategy to validate the previously reported 6-gene (LMO2, BCL6, FN1, CCND2, SCYA3 and BCL2) model as predictor of prognosis in DLBCL. To avoid variation, all samples were tested in a single centre and single platform. This study comprised 8 countries (Brazil, Chile, Hungary, India, Philippines, S. Korea, Thailand and Turkey). Using the Kaplan-Meier and log rank test on patients (n=162) and two mortality risk groups (with those above and below the mean representing high and low risk groups) confirmed that the 6-gene predictor score correlates significantly with overall survival (OS, p<0.01) but not with event free survival (EFS, p=0.18). Adding the International Prognostic Index (IPI) shows that the 6-gene predictor score correlates significantly with high IPI scores for OS (p<0.05), whereas those with low IPI scores show a trend not reaching significance (p=0.08). This study defined an effective and economical qRT-PCR strategy and validated the 6-gene score as a predictor of OS in an international setting.


Asunto(s)
Biomarcadores de Tumor/genética , Fijadores/química , Formaldehído/química , Perfilación de la Expresión Génica/métodos , Linfoma de Células B Grandes Difuso/genética , Adhesión en Parafina , Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa , Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa , Fijación del Tejido/métodos , Transcriptoma , Anciano , Asia , Biopsia , Supervivencia sin Enfermedad , Europa (Continente) , Femenino , Perfilación de la Expresión Génica/normas , Predisposición Genética a la Enfermedad , Humanos , Estimación de Kaplan-Meier , Linfoma de Células B Grandes Difuso/tratamiento farmacológico , Linfoma de Células B Grandes Difuso/mortalidad , Linfoma de Células B Grandes Difuso/patología , Masculino , Persona de Mediana Edad , Fenotipo , Valor Predictivo de las Pruebas , Modelos de Riesgos Proporcionales , Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa/normas , Reproducibilidad de los Resultados , Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa/normas , América del Sur , Factores de Tiempo
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