In vitro conservation and leaf anatomy of different chemotypes of Lippia alba (Mill.) N. E. BR / Conservação in vitro e anatomia foliar de diferentes quimiotipios de Lippia alba (Mill.) N. E. BR

The aim of this work was to develop an in vitro conservation protocol for Lippia alba that involved mineral oil and to study the leaf anatomy of L. alba genotypes in in vitro and ex vitro environments. In vitro conservation involved five genotypes; LA-13 and LA-57 (carvone chemotype); LA-22 (linalool chemotype); and LA-29 and LA-44 (citral chemotype). Each genotype was treated with mineral oil, with water, and a control at 18°C and 23°C. Survival (%), shoot height (cm) and leaf color were assessed at 180 and 270 days. The genotypes with the best in vitro conservation outcomes (LA-13 and LA-57) were used to study the anatomy of the leaves. Midrib thickness, leaf blade thickness, adaxial and abaxial cuticles and the number of glandular and tector trichomes were assessed. A temperature of 18°C was optimal for the conservation of genotypes of the carvone chemotypes. The explants were short and had green leaves. This was especially true for LA-57, whose height did not exceed 2.0 cm. At 270 days, the LA-13 and LA-57 genotypes continued to have green and viable leaves, especially LA-57, which had the lowest mean height. Field plants of the carvone chemotype had thicker midribs, leaf blades, and cuticles and had more trichomes. The LA-57 genotype had the most glandular and tector trichomes.

O objetivo deste estudo foi desenvolver um protocolo de conservação in vitro com óleo mineral e estudar a anatomia foliar de genótipos de L. alba nos ambientes in vitro e ex vitro. A conservação in vitro constou de cinco genótipos LA-13 e LA-57 (quimiotipo carvona); LA-22 (quimiotipo linalol); LA-29 e LA-44 (quimiotipo citral), três tratamentos (com óleo mineral, com água e controle) e duas temperaturas 18 e 23°C. Aos 180 e 270 dias, avaliou-se a sobrevivência (%), altura da parte aérea (cm) e coloração das folhas. Os genótipos com os melhores resultados da conservação in vitro (LA-13 e LA-57) foram utilizados para estudos de anatomia. Avaliou-se espessura da nervura central, espessura do limbo foliar, cutículas adaxial e abaxial e quantidade de tricomas glandulares e tectores. A temperatura a 18°C foi a ideal para a conservação dos genótipos do quimiotipo carvona, com folhas verdes e baixos valores para altura, destacando-se LA-57 cuja altura não ultrapassou 2,0 cm. Aos 270 dias LA-13 e LA-57 permaneceram com folhas verdes e viáveis, com destaque para LA-57 com menores médias de altura. A anatomia do quimiotipo carvona mostrou que as plantas de campo apresentaram maiores espessuras da nervura, limbo e cutículas, e maiores quantidades de tricomas. O genótipo LA-57 obteve a maior quantidade de tricomas glandulares e tectores.

Avaliação de softwares para análises de citometria de fluxo em bananeira / An assessment of software for flow cytometry analysis in banana plants

A citometria de fluxo é uma técnica que apresenta resultados com extrema rapidez para análises de propriedades celulares como volume, complexidade morfológica e conteúdo de DNA, e é considerada mais conveniente que outras técnicas. Entretanto, as análises muitas vezes geram histogramas com variações que podem ser devidas a vários fatores, dentre os quais, as diferenças entre os softwares que realizam a aquisição dos dados gerados pelo citômetro de fluxo. Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar o desempenho de quatro softwares comumente utilizados em análises de citometria de fluxo, por meio de quantificações do conteúdo de DNA e análises do coeficiente de variação gerados por eles. Foram realizadas leituras de 25 amostras foliares de bananeira NBA (AA) utilizando o citômetro de fluxo modelo FACSCalibur (BD) e 25 histogramas de cada software (CellQuest, WinMDI, FlowJo  e FCS Express) foram analisados para obtenção do conteúdo de DNA estimado e do coeficiente de variação das estimativas. Não há diferença entre os softwares quanto aos valores de conteúdo de DNA. Entretanto, as análises do CV indicaram que a precisão do software WinMDI foi baixa e que os valores de CV foram subestimados, enquanto que os demais softwares apresentaram valores de CV mais condizentes com a literatura. O software CellQuest é recomendado por ser desenvolvido pela própria empresa fabricante do citômetro de fluxo utilizado nas análises do presente trabalho.(AU)

Flow cytometry is a technique that yields rapid results in analyses of cell properties such as volume, morphological complexity and quantitative DNA content, and it is considered more convenient than other techniques. However, the analysis usually generates histograms marked by variations that can be produced by many factors, including differences between the software packages that capture the data generated by the flow cytometer. The objective of the present work was to evaluate the performance of four software products commonly used in flow cytometry based on quantifications of DNA content and analyses of the coefficients of variation associated with the software outputs. Readings were obtained from 25 NBA (AA) banana leaf samples using the FACSCalibur (BD) flow cytometer, and 25 histograms from each software product (CellQuest, WinMDI, FlowJo and FCS Express) were analyzed to obtain the estimated DNA content and the coefficient of variation (CV) of the estimates. The values of DNA content obtained from the software did not differ significantly. However, the CV analysis showed that the precision of the WinMDI software was low and that the CV values were underestimated, whereas the remaining software showed CV values that were in relatively close agreement with those found in the literature. The CellQuest software is recommended because it was developed by the same company that produces the flow cytometer used in the present study.(AU)

Avaliação de softwares para análises de citometria de fluxo em bananeira / An assessment of software for flow cytometry analysis in banana plants

A citometria de fluxo é uma técnica que apresenta resultados com extrema rapidez para análises de propriedades celulares como volume, complexidade morfológica e conteúdo de DNA, e é considerada mais conveniente que outras técnicas. Entretanto, as análises muitas vezes geram histogramas com variações que podem ser devidas a vários fatores, dentre os quais, as diferenças entre os softwares que realizam a aquisição dos dados gerados pelo citômetro de fluxo. Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar o desempenho de quatro softwares comumente utilizados em análises de citometria de fluxo, por meio de quantificações do conteúdo de DNA e análises do coeficiente de variação gerados por eles. Foram realizadas leituras de 25 amostras foliares de bananeira NBA (AA) utilizando o citômetro de fluxo modelo FACSCalibur (BD) e 25 histogramas de cada software (CellQuest, WinMDI, FlowJo  e FCS Express) foram analisados para obtenção do conteúdo de DNA estimado e do coeficiente de variação das estimativas. Não há diferença entre os softwares quanto aos valores de conteúdo de DNA. Entretanto, as análises do CV indicaram que a precisão do software WinMDI foi baixa e que os valores de CV foram subestimados, enquanto que os demais softwares apresentaram valores de CV mais condizentes com a literatura. O software CellQuest é recomendado por ser desenvolvido pela própria empresa fabricante do citômetro de fluxo utilizado nas análises do presente trabalho.

Flow cytometry is a technique that yields rapid results in analyses of cell properties such as volume, morphological complexity and quantitative DNA content, and it is considered more convenient than other techniques. However, the analysis usually generates histograms marked by variations that can be produced by many factors, including differences between the software packages that capture the data generated by the flow cytometer. The objective of the present work was to evaluate the performance of four software products commonly used in flow cytometry based on quantifications of DNA content and analyses of the coefficients of variation associated with the software outputs. Readings were obtained from 25 NBA (AA) banana leaf samples using the FACSCalibur (BD) flow cytometer, and 25 histograms from each software product (CellQuest, WinMDI, FlowJo and FCS Express) were analyzed to obtain the estimated DNA content and the coefficient of variation (CV) of the estimates. The values of DNA content obtained from the software did not differ significantly. However, the CV analysis showed that the precision of the WinMDI software was low and that the CV values were underestimated, whereas the remaining software showed CV values that were in relatively close agreement with those found in the literature. The CellQuest software is recommended because it was developed by the same company that produces the flow cytometer used in the present study.

Utilização da modelagem matemática (redes neurais artificiais) na classificação de autotetraploides de bananeira (Musa acuminata Colla) / Use of mathematical modeling (artificial neural networks) in classification of banana autotetraploid (Musa acuminata Colla)

Objetivou-se desenvolver uma metodologia para possibilitar a classificação de plantas de bananeira submetidas à indução de duplicação cromossômica utilizando Redes Neurais Artificiais (RNA). Os dados utilizados neste trabalho foram retirados de uma tese já apresentada, cujo autor estudou a correlação entre a massa fresca de discos foliares e o conteúdo de DNA. A RNA foi implementada com a função de classificação. A taxa de aprendizado e o termo momentum adotados foram respectivamente iguais a 0,01 e 0,2, o número de épocas de treinamento foi 1000. Esses valores foram determinados por meio de tentativa e erro. Para o treinamento, 90% das plantas foram utilizadas e, para validação, 10% do total de 114 autotetraploides produzidos artificialmente por meio de exposição ao antimitódico colchicina. A RNA classificou corretamente 10 das 11 amostras utilizadas para validação. A estatística Kappa foi de 63,33%, o que indica que a RNA pode ainda ser melhorada. A rede neural artificial do tipo Multi Layer Perceptron implementada é eficaz na préseleção de poliploides desejáveis de bananeira Tong Dok Mak.

The objective was to develop a methodology to enable the classification of banana crop subjected to induction of chromosome doubling using Neural Networks (NN). The data used in this study were taken from a thesis already presented, whose authors studied the correlation between fresh weight of leaf discs and DNA content. The NN was implemented by the ranking function. The learning rate and momentum term used were respectively equal to 0.01 and 0.2, the number of training epochs was 1000. These values were determined by trial and error. For training, 90% of the plants were employed, and for validation, 10% of the total of 114 autotetraploids artificially produced by exposure to antimitodic agent colchicine. The NN correctly classified 10 of the 11 samples used for validation. Kappa statistics was 63.33%, which indicates that the NN can be further improved. The artificial neural network-type Multi Layer Perceptron is effectively implemented in the pre-selection of polyploid desirable banana Tong Dok Mak.

Análise bioquímica de calos de pinhão-manso / Biochemical analysis of callus from physic nut

O pinhão-manso (Jatropha curcas L.) vem ganhando importância por seu potencial como insumo ao biodiesel. Estudos visam à adequação agronômica e a cultura de tecidos contribui indiretamente com este aspecto, auxiliando em pesquisas aplicadas como em biotecnologia, em situações que visam à regeneração de plantas. Nesse intuito, é fundamental avaliar, durante os períodos de cultivo dos calos, o comportamento dos metabólitos primários. A massa calogênica, por ocasião da inoculação, não apresentou reserva na forma de carboidratos. Aos 42 dias iniciou a absorção da sacarose do meio, enquanto o acúmulo no explante ocorreu a partir dos 98 dias de cultivo. O teor de aminoácidos foi alto no dia da inoculação e, por volta dos 98 dias, tanto os níveis de aminoácidos quanto os de proteínas decresceram.

The physic nut (Jatropha curcas L.) is gaining importance because of its potential as raw material for biodiesel. Studies aiming the adequacy of agronomic techniques and tissue culture contribute, indirectly, to this aspect, helping applied research as biotechnology, in situations that aim plant regeneration. Therefore, it is essential to evaluate, the behavior of primary metabolites during the callus growing season. The callus mass at the inoculation time showed no carbohydrates reserve. At the 42nd day the sucrose absorption started in the medium, while the accumulation in the explant occurred from the 98th day of cultivation. Amino acid content was high at the inoculation's day and around the 98th day, both amino acids and protein levels decreased.