A 6-year retrospective study of clinical features, microbiology, and genomics of Shiga toxin-producing Escherichia coli in children who presented to a tertiary referral hospital in Costa Rica.

Shiga-toxin-producing Escherichia coli (STEC) is associated with diarrhea and hemolytic uremic syndrome (HUS). STEC infections in Costa Rica are rarely reported in children. We gathered all the records of STEC infections in children documented at the National Children's Hospital, a tertiary referral hospital, from 2015 to 2020. Clinical, microbiological, and genomic information were analyzed and summarized. A total of 3,768 diarrheal episodes were reviewed. Among them, 31 STEC were characterized (29 fecal, 1 urine, and 1 bloodstream infection). The prevalence of diarrheal disease due to STEC was estimated at 0.8% (n = 29/3,768), and HUS development was 6.4% (n = 2/31). The stx1 gene was found in 77% (n = 24/31) of STEC strains. In silico genomic predictions revealed a predominant prevalence of serotype O118/O152:H2, accompanied by a cluster exhibiting allele differences ranging from 33 to 8, using a core-genome multilocus sequence typing (cgMLST) approach. This is the first study using a genomic approach for STEC infections in Costa Rica.IMPORTANCEThis study provides a comprehensive description of clinical, microbiological, genomic, and demographic data from patients who attended the only pediatric hospital in Costa Rica with Shiga-toxin-producing Escherichia coli (STEC) infections. Despite the low prevalence of STEC infections, we found a predominant serotype O118/O152:H2, highlighting the pivotal role of genomics in understanding the epidemiology of public health threats such as STEC. Employing a genomic approach for this pathogen for the first time in Costa Rica, we identified a higher prevalence of STEC in children under 2 years old, especially those with gastrointestinal comorbidities, residing in densely populated regions. Limitations such as potential geographic bias and lack of strains due to direct molecular diagnostics are acknowledged, emphasizing the need for continued surveillance to uncover the true extent of circulating serotypes and potential outbreaks in Costa Rica.

Shewanella algae en un paciente con diarrea crónica: primer caso en Costa Rica / Shewanella algae in a patient with chronic diarrhea: first case in Costa Rica

Se presenta el caso de un paciente masculino, vecino de Pavas-San José, con historia de diarrea crónica. En el coprocultivo se identificó shewanella algae. Casos de infección en humanos por esta bacteria son raros y se han encontrado, predominantemente localizadas, en piel, oídos y tejidos blandos con o sin bacteremia, en la mayoría de los cuales existe el antecedente de contacto con ambientes marinos. Shewanella algae es sensible a aminoglicósidos, carbapanemes, eritromicina y quinolonas, pero resistente a penicilinas. La sensibilidad a ampicilina y cefalosporinas es variable. Nuestro paciente fue tratado con cefalexina y tuvo una respuesta satisfactoria al mismo, con cese de los síntomas. De acuerdo con nuestro conocimiento este el primer caso documentado, en Costa Rica, de infección gastrointestinal por esta bacteria.

We report herein the case of a male patient, from Pavas, San Jose, with chronic diarrhea whose stool culture grew Shewanella algae. Infections caused by this micro-organism are infrequent and most commonly involve ears, skin and soft tissue, with or without bacteremia and are usually linked to ocean contact in warm climate countries. Shewanella algae is sensitive to aminoglycosides, carbapenems, erythromycin and quinolones, but resistant to penicillin. Sensitivity to amplicilin and cephalosporins is variable. Our patient was treated withcefalexin, with satisfactory results. To our knowledge, this is the first documented case in Costa Rica of gastrointestinal infection caused by this microorganism.

Brotes de diarrea e intoxicaciones transmitidas por alimentos en Costa Rica, 2005 / Outbreaks of diarrhea and transmitted by food poisoning in Costa Rica, 2005

Justificación y objetivos: En la actualidad, las enfermedades de transmisión alimentaria, incluyendo las diarreas e intoxicaciones, constituyen uno de los problemas de salud pública de mayor importancia a nivel mundial, ya que ocasionan alta morbilidad y mortalidad, generan grandes costos a los servicios de salud, pérdidas económicas, demandas y pérdida de confianza de los consumidores. El objetivo del trabajo es analizar la información disponible en el Centro nacional de referencia en bacteriología del INCIENSA, CNRB, de los brotes de diarrea e intoxicaciones alimentarias ocurridos en 2005, en los que se refirieron muestras clínicas o de alimentos, para identificar los agentes y vehículos de infección asociados. Materiales y métodos: Se realizó el análisis descriptivo de la información epidemiológica y de laboratorio disponible en el CNRB en relación con los brotes de diarrea e intoxicaciones alimentarias ocurridos en 2005. Resultados: Durante el período el CNRB documentó 23 brotes de diarrea e intoxicaciones alimentarias, para un total aproximado de 819 afectados, en su mayoría procedentes de la gran área metropolitana. Trece de los brotes fueron intrafamiliares, diez de ellos debidos a especies y serotipos de Shigella; sin embargo, el mayor número de enfermos se presentó en los brotes comunitarios y los que se produjeron en poblaciones cautivas, asociados a rotavirus, Escherichia coli enterotoxigénica y Clostridium productor de toxina A, con 518, 138 y 54 enfermos, respectivamente. Conclusión: Estos hallazgos evidencian deficiencias en la cadena de transporte, conservación y manipulación de los alimentos, así como en la higiene personal, y pueden ser de utilidad para la implementación de intervenciones inmediatas.