RESUMEN
Objetivo: Dilucidar el papel de la coevolución del genoma humano y de Helicobacter pylori en la patogenesis gástrica en población de Nariño-Colombia. Materiales y Métodos: Se aisló Helicobacter pylori de biopsias gástricas obtenidas de 292 pacientes con enfermedad gástrica de Nariño. El diagnóstico histológico se realizó por la clasificación de Sydney. Se incluyeron 252 cepas de H. pylori para el análisis MLST, que las asignó a poblaciones ancestrales (hpAfrica1, hpAfrica2, hpEurope, hpEAsia). Para los análisis evolutivos humanos se utilizó Immunochip y el software ESTRUCTURE para determinar proporciones de ascendencia por comparación con 712 secuencias globales de base MLST de H. pylori (http://pubmlst.org/helicobacter). Resultados: Las cepas de H. pylori en Nariño se derivan de cuatro poblaciones ancestrales: Africa (AA1), Europea (AE1 y AE2) y Asia Oriental (AEA). Los aislamientos contenían fracciones sustanciales de ancestría africana AA1 en la costa, y europea, AE2 en la región montañosa. Debido a que la población de montaña tenía un mínimo de ancestría africana del huésped, nos preguntamos si AA1 aumentaba la gravedad de las lesiones gástricas en los sujetos con baja ancestría africana. Tal escenario podría significar una coadaptación interrumpida: disrupción de la coevolución humano-H. pylori. Cuando consideramos a las 56 personas con menos del 17,6% de ancestria africana, encontramos que todas las personas que portaban H. pylori con >19,8% de ancestría africana AA1, n = 20 tenían lesiones severas. Conclusión: Las relaciones coevolutivas humano-H. pylori son biomarcadores importantes de enfermedad gástrica, y la interrupción de estas relaciones desenlazan lesiones gástricas mas avanzadas en Nariño.
Objective: To elucidate the role of the coevolution of the human genome and Helicobacter pylori in gastric pathogenesis in a population from Nariño-Colombia. Materials and Methods: Helicobacter pylori was isolated from gastric biopsies obtained from 292 patients with Nariño gastric disease. The histological diagnosis was made by the Sydney classification. 252 H. pylori isolates were included for MLST analysis, which assigned them to ancestral populations (hpAfrica1, hpAfrica2, hpEurope, hpEAsia). Immunochip was used for human evolutionary analyses. STRUCTURE software to determine ancestry proportions by comparison with 712 global H. pylori MLST base sequences (http://pubmlst.org/helicobacter). Results: The H. pylori strains in Nariño derive from four ancestral populations: African (AA1), European (AE1 and AE2), and East Asian (AEA). The isolates contained substantial fractions of AA1 African ancestry on the coast, and AE2 European ancestry in the mountains. Because the mountain population had minimal African ancestry of the host, we wondered if AA1 increased the severity of gastric lesions in subjects of low African ancestry. Such a scenario could signify disrupted coadaptation: disruption of human-H. pylori coevolution. When we considered the 56 individuals with less than 17.6% African ancestry, we found that all individuals carrying H. pylori with >19.8% AA1 African ancestry, (n = 20) had severe lesions. Conclusion: Human and H. pylori coevolutionary relationships are important biomarkers of gastric disease, and disruption of these relationships results in more advanced gastric lesions in Nariño-Colombia.