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1.
Sci Rep ; 14(1): 2054, 2024 01 24.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38267502

RESUMEN

Chagas is an endemic disease in tropical regions of Latin America, caused by the parasite Trypanosoma cruzi. High intraspecies variability and genome complexity have been challenges to assemble high quality genomes needed for studies in evolution, population genomics, diagnosis and drug development. Here we present a chromosome-level phased assembly of a TcI T. cruzi strain (Dm25). While 29 chromosomes show a large collinearity with the assembly of the Brazil A4 strain, three chromosomes show both large heterozygosity and large divergence, compared to previous assemblies of TcI T. cruzi strains. Nucleotide and protein evolution statistics indicate that T. cruzi Marinkellei separated before the diversification of T. cruzi in the known DTUs. Interchromosomal paralogs of dispersed gene families and histones appeared before but at the same time have a more strict purifying selection, compared to other repeat families. Previously unreported large tandem arrays of protein kinases and histones were identified in this assembly. Over one million variants obtained from Illumina reads aligned to the primary assembly clearly separate the main DTUs. We expect that this new assembly will be a valuable resource for further studies on evolution and functional genomics of Trypanosomatids.


Asunto(s)
Enfermedad de Chagas , Trypanosoma cruzi , Humanos , Trypanosoma cruzi/genética , Colombia , Histonas , Brasil
2.
Biomédica (Bogotá) ; 43(4)dic. 2023.
Artículo en Español | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1533952

RESUMEN

Introducción. Aedes albopictus es un vector de arbovirus como dengue, Zika, chikungunya y fiebre amarilla. Los primeros reportes en el continente americano datan de 1985 y dada su capacidad de adaptación ecológica y fisiológica, se ha distribuido rápidamente en el territorio colombiano desde su primer reporte en 1998. Objetivo. Determinar la distribución de A. albopictus en las comunas de Ibagué, Colombia. Materiales y métodos. Los muestreos se realizaron entre mayo y noviembre de 2022 en zonas con abundante vegetación de las 13 comunas de Ibagué. Se emplearon aspiradores y redes entomológicas. Los mosquitos fueron transportados al Laboratorio de Investigaciones en Parasitología Tropical de la Universidad del Tolima para su determinación taxonómica. Resultados. Se identificaron 708 ejemplares de A. albopictus, distribuidos en las comunas de Ibagué. La mayor abundancia del vector se presentó en las comunas 10, 11, 7, 8, 2 y 9. Las comunas 3, 4, 5, 6, 12 y 13 presentaron abundancias relativas cercanas al 3 %, y la comuna 1 tuvo una abundancia del 2 %. Conclusiones. Aedes albopictus está distribuido en todas las comunas de Ibagué, probablemente su dispersión se ha visto favorecida por las condiciones ambientales y sociales de esta región. Se recomienda hacer seguimiento anual a las poblaciones de este vector y realizar una caracterización molecular de los arbovirus encontrados. Además, el conocer la distribución de este mosquito en la ciudad permitirá focalizar las estrategias de control entomológico y prevenir futuros brotes de arbovirosis.


Introduction. Aedes albopictus is a vector for arboviruses, such as dengue, Zika, chikungunya, and yellow fever. The first A. albopictus reports on the American continent date back to 1985. It has spread rapidly throughout Colombia since its first report in 1998 due to its ecological and physiological adaptation capability. Objective. To determine A. albopictus distribution in the 13 communes of Ibagué, Colombia. Materials and methods. Samples were collected between May and November 2022 in the 13 communes of Ibagué. Vacuum sampling and sweep-netting entomological nets were used in areas with abundant vegetation. The mosquitoes were transported to the Laboratorio de Investigaciones en Parasitología Tropical at the Universidad del Tolima for taxonomic determination. Results. We identified 708 A. albopictus specimens distributed throughout Ibague's 13 communes. The highest vector abundance occurred in communes 10, 11, 7, 8, 2, and 9; communes 3, 4, 5, 6, 12, and 13 had a relative abundance of around 3%, while commune 1 had 2% of relative abundance. Conclusions. Aedes albopictus is distributed throughout all the communes of Ibague. Its dispersion has probably been favored by this region's environmental and social conditions. We recommend annual monitoring of these vectors populations and molecular characterization of the found arboviruses. Ascertaining this mosquito's distribution throughout the city will enable focusing entomological control strategies and preventing future arbovirus outbreaks.

3.
Biomedica ; 43(4): 506-519, 2023 12 01.
Artículo en Inglés, Español | MEDLINE | ID: mdl-38109139

RESUMEN

Introduction: Aedes albopictus is a vector for arboviruses, such as dengue, Zika, chikungunya, and yellow fever. The first A. albopictus reports on the American continent date back to 1985. It has spread rapidly throughout Colombia since its first report in 1998 due to its ecological and physiological adaptation capability. Objective: To determine A. albopictus distribution in the 13 communes of Ibagué, Colombia. Materials and methods: Samples were collected between May and November 2022 in the 13 communes of Ibagué. Vacuum sampling and sweep-netting entomological nets were used in areas with abundant vegetation. The mosquitoes were transported to the Laboratorio de Investigaciones en Parasitología Tropical at the Universidad del Tolima for taxonomic determination. Results: We identified 708 A. albopictus specimens distributed throughout Ibague's 13 communes. The highest vector abundance occurred in communes 10, 11, 7, 8, 2, and 9; communes 3, 4, 5, 6, 12, and 13 had a relative abundance of around 3%, while commune 1 had 2% of relative abundance. Conclusions: Aedes albopictus is distributed throughout all the communes of Ibague. Its dispersion has probably been favored by this region's environmental and social conditions. We recommend annual monitoring of these vectors populations and molecular characterization of the found arboviruses. Ascertaining this mosquito's distribution throughout the city will enable focusing entomological control strategies and preventing future arbovirus outbreaks.


Introducción: Aedes albopictus es un vector de arbovirus como dengue, Zika, chikungunya y fiebre amarilla. Los primeros reportes en el continente americano datan de 1985 y dada su capacidad de adaptación ecológica y fisiológica, se ha distribuido rápidamente en el territorio colombiano desde su primer reporte en 1998. OBJETIVO: Determinar la distribución de A. albopictus en las comunas de Ibagué, Colombia. Materiales y métodos: Los muestreos se realizaron entre  mayo y noviembre de 2022 en zonas con abundante  vegetación de las 13 comunas de Ibagué. Se emplearon aspiradores y redes entomológicas. Los mosquitos fueron transportados al Laboratorio de Investigaciones en  Parasitología Tropical de la Universidad del Tolima para su determinación taxonómica. RESULTADOS: Se identificaron 708 ejemplares de A.  lbopictus, distribuidos en las comunas de Ibagué. La mayor abundancia del vector se presentó en las comunas 10, 11, 7, 8, 2 y 9. Las comunas 3, 4, 5, 6, 12 y 13 presentaron abundancias relativas cercanas al 3 %, y la comuna 1 tuvo una abundancia del 2 %. CONCLUSIONES: Aedes albopictus está distribuido en todas las comunas de Ibagué, probablemente su dispersión se ha visto favorecida por las condiciones ambientales y sociales de esta región. Se recomienda hacer seguimiento anual a las poblaciones de este vector y realizar una caracterización molecular de los arbovirus encontrados. Además, el conocer la distribución de este mosquito en la ciudad permitirá focalizar las estrategias de control entomológico y prevenir futuros brotes de arbovirosis.


Asunto(s)
Aedes , Fiebre Chikungunya , Infección por el Virus Zika , Virus Zika , Animales , Mosquitos Vectores , Fiebre Chikungunya/epidemiología , Colombia
4.
Biomedica ; 42(1): 136-146, 2022 03 01.
Artículo en Inglés, Español | MEDLINE | ID: mdl-35471176

RESUMEN

Introduction: Toxoplasma gondii is a parasite with great zoonotic potential. It can infect a broad range of warm-blooded hosts (including livestock) and causes significant losses in the industry. In humans, it has been described as a pathogen in immunosuppressed people, it affects the fetus development in congenital infections, and is associated with various behavioral disorders in healthy people. Humans can acquire T. gondii by consuming undercooked, contaminated meat. Objective: To determine T. gondii positivity (currently unknown) in meat for human consumption (i.e., beef, chicken, and pork) in the city of Ibague, Colombia. Materials and methods: We used conventional nested PCR and the T. gondii B1 gene sequence as amplification target. We collected samples of meat (N=186) sold in the urban area of Ibagué (62 beef, 62 chicken, and 62 pork samples) and determined the T. gondii positivity percentage for each type of meat. Results: The study found an average of 18.8% positivity for all meat samples, pork having the highest percentage (22.5%; 14/62), followed by beef (19.3%; 12/62) and chicken (14.5%; 9/62). The best-amplified products were sequenced by macrogen and aligned with the B1 gene sequences in GenBank, thereby confirming their identity. Conclusions: This is the first study of T. gondii prevalence in meat for human consumption carried out in the city of Ibagué and the department of Tolima. All three types of meat sampled represent a risk for local human infection


Introducción. Toxoplasma gondii es un parásito con gran potencial zoonótico que puede infectar un amplio rango de huéspedes de sangre caliente, incluidos los animales del sector pecuario, lo que causa pérdidas a la industria. En el humano, es patógeno en personas inmunosuprimidas y afecta el desarrollo del feto en infecciones congénitas. Además, se asocia con diversos trastornos del comportamiento en personas sanas. El humano puede adquirir T. gondii al consumir carnes contaminadas mal cocidas. Objetivo. Determinar la positividad de T. gondii en carnes de consumo humano (res, pollo y cerdo) en Ibagué, Colombia. Materiales y métodos. Se utilizó la PCR convencional anidada y la secuencia del gen B1 de T. gondii como blanco de amplificación. Se tomaron 186 muestras de carne comercializada en la zona urbana de Ibagué (62 de res, 62 de pollo y 62 de cerdo) y se obtuvo el porcentaje de positividad en cada tipo de carne evaluada. Resultados. Se encontró un porcentaje de positividad de 18,8 % en las muestras, siendo la carne de cerdo la del mayor porcentaje (22,5 %; 14/62), seguida por las muestras de carne de res (19,3 %; 12/62) y de pollo (14,5 %; 9/62). Los mejores productos amplificados fueron secuenciados en Macrogen, y alineados con las secuencias del gen B1 depositadas en el GenBank, con lo que se confirmó su identidad. Conclusiones. Este es el primer estudio sobre prevalencia de T. gondii en carnes para consumo humano en Ibagué y el departamento del Tolima. Se demostró que los tres tipos de carne representan un riesgo para la infección en humanos a nivel local.


Asunto(s)
Toxoplasma , Colombia/epidemiología , Toxoplasma/genética
5.
Biomédica (Bogotá) ; 42(1): 136-146, ene.-mar. 2022. tab, graf
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-1374513

RESUMEN

Introducción. Toxoplasma gondii es un parásito con gran potencial zoonótico que puede infectar un amplio rango de huéspedes de sangre caliente, incluidos los animales del sector pecuario, lo que causa pérdidas a la industria. En el humano, es patógeno en personas inmunosuprimidas y afecta el desarrollo del feto en infecciones congénitas. Además, se asocia con diversos trastornos del comportamiento en personas sanas. El humano puede adquirir T. gondii al consumir carnes contaminadas mal cocidas. Objetivo. Determinar la positividad de T. gondii en carnes de consumo humano (res, pollo y cerdo) en Ibagué, Colombia. Materiales y métodos. Se utilizó la PCR convencional anidada y la secuencia del gen B1 de T. gondii como blanco de amplificación. Se tomaron 186 muestras de carne comercializada en la zona urbana de Ibagué (62 de res, 62 de pollo y 62 de cerdo) y se obtuvo el porcentaje de positividad en cada tipo de carne evaluada. Resultados. Se encontró un porcentaje de positividad de 18,8 % en las muestras, siendo la carne de cerdo la del mayor porcentaje (22,5 %; 14/62), seguida por las muestras de carne de res (19,3 %; 12/62) y de pollo (14,5 %; 9/62). Los mejores productos amplificados fueron secuenciados en Macrogen, y alineados con las secuencias del gen B1 depositadas en el GenBank, con lo que se confirmó su identidad. Conclusiones. Este es el primer estudio sobre prevalencia de T. gondii en carnes para consumo humano en Ibagué y el departamento del Tolima. Se demostró que los tres tipos de carne representan un riesgo para la infección en humanos a nivel local.


Introduction: Toxoplasma gondii is a parasite with great zoonotic potential. It can infect a broad range of warm-blooded hosts (including livestock) and causes significant losses in the industry. In humans, it has been described as a pathogen in immunosuppressed people, it affects the fetus development in congenital infections, and is associated with various behavioral disorders in healthy people. Humans can acquire T. gondii by consuming undercooked, contaminated meat. Objective: To determine T. gondii positivity (currently unknown) in meat for human consumption (i.e., beef, chicken, and pork) in the city of Ibague, Colombia. Materials and methods: We used conventional nested PCR and the T. gondii B1 gene sequence as amplification target. We collected samples of meat (N=186) sold in the urban area of Ibagué (62 beef, 62 chicken, and 62 pork samples) and determined the T. gondii positivity percentage for each type of meat. Results: The study found an average of 18.8% positivity for all meat samples, pork having the highest percentage (22.5%; 14/62), followed by beef (19.3%; 12/62) and chicken (14.5%; 9/62). The best-amplified products were sequenced by macrogen and aligned with the B1 gene sequences in GenBank, thereby confirming their identity. Conclusions: This is the first study of T. gondii prevalence in meat for human consumption carried out in the city of Ibagué and the department of Tolima. All three types of meat sampled represent a risk for local human infection.


Asunto(s)
Toxoplasma , Toxoplasmosis , Reacción en Cadena de la Polimerasa , Prevalencia , Carne
6.
PLoS Negl Trop Dis ; 15(8): e0009719, 2021 08.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34437557

RESUMEN

We sequenced maxicircles from T. cruzi strains representative of the species evolutionary diversity by using long-read sequencing, which allowed us to uncollapse their repetitive regions, finding that their real lengths range from 35 to 50 kb. T. cruzi maxicircles have a common architecture composed of four regions: coding region (CR), AT-rich region, short (SR) and long repeats (LR). Distribution of genes, both in order and in strand orientation are conserved, being the main differences the presence of deletions affecting genes coding for NADH dehydrogenase subunits, reinforcing biochemical findings that indicate that complex I is not functional in T. cruzi. Moreover, the presence of complete minicircles into maxicircles of some strains lead us to think about the origin of minicircles. Finally, a careful phylogenetic analysis was conducted using coding regions of maxicircles from up to 29 strains, and 1108 single copy nuclear genes from all of the DTUs, clearly establishing that taxonomically T. cruzi is a complex of species composed by group 1 that contains clades A (TcI), B (TcIII) and D (TcIV), and group 2 (1 and 2 do not coincide with groups I and II described decades ago) containing clade C (TcII), being all hybrid strains of the BC type. Three variants of maxicircles exist in T. cruzi: a, b and c, in correspondence with clades A, B, and C from mitochondrial phylogenies. While A and C carry maxicircles a and c respectively, both clades B and D carry b maxicircle variant; hybrid strains also carry the b- variant. We then propose a new nomenclature that is self-descriptive and makes use of both the phylogenetic relationships and the maxicircle variants present in T. cruzi.


Asunto(s)
Evolución Molecular , Trypanosoma cruzi/genética , Enfermedad de Chagas/parasitología , Variación Genética , Genoma de Protozoos , Humanos , NADH Deshidrogenasa/genética , Filogenia , Proteínas Protozoarias/genética , Trypanosoma cruzi/clasificación , Trypanosoma cruzi/aislamiento & purificación
7.
Mem Inst Oswaldo Cruz ; 116: e200528, 2021.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33656141

RESUMEN

Panstrongylus geniculatus (Latreille, 1811) is the triatomine with the largest geographic distribution in Latin America. It has been reported in 18 countries from southern Mexico to northern Argentina, including the Caribbean islands. Although most reports indicate that P. geniculatus has wild habitats, this species has intrusive habits regarding human dwellings mainly located in intermediate deforested areas. It is attracted by artificial light from urban and rural buildings, raising the risk of transmission of Trypanosoma cruzi. Despite the wide body of published information on P. geniculatus, many knowledge gaps exist about its biology and epidemiological potential. For this reason, we analysed the literature for P. geniculatus in Scopus, PubMed, Scielo, Google Scholar and the BibTriv3.0 databases to update existing knowledge and provide better information on its geographic distribution, life cycle, genetic diversity, evidence of intrusion and domiciliation, vector-related circulating discrete taxonomic units, possible role in oral T. cruzi transmission, and the effect of climate change on its biology and epidemiology.


Asunto(s)
Enfermedad de Chagas/transmisión , Insectos Vectores/parasitología , Panstrongylus/genética , Panstrongylus/parasitología , Triatoma/parasitología , Trypanosoma cruzi , Animales , Biología , Ecología , Genes de Insecto , Variación Genética/genética , Genotipo , Geografía , Humanos , Insectos Vectores/genética , América Latina , Panstrongylus/fisiología , Filogenia , Trypanosoma cruzi/aislamiento & purificación
8.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 116: e200528, 2021. tab, graf
Artículo en Inglés | LILACS | ID: biblio-1154881

RESUMEN

Panstrongylus geniculatus (Latreille, 1811) is the triatomine with the largest geographic distribution in Latin America. It has been reported in 18 countries from southern Mexico to northern Argentina, including the Caribbean islands. Although most reports indicate that P. geniculatus has wild habitats, this species has intrusive habits regarding human dwellings mainly located in intermediate deforested areas. It is attracted by artificial light from urban and rural buildings, raising the risk of transmission of Trypanosoma cruzi. Despite the wide body of published information on P. geniculatus, many knowledge gaps exist about its biology and epidemiological potential. For this reason, we analysed the literature for P. geniculatus in Scopus, PubMed, Scielo, Google Scholar and the BibTriv3.0 databases to update existing knowledge and provide better information on its geographic distribution, life cycle, genetic diversity, evidence of intrusion and domiciliation, vector-related circulating discrete taxonomic units, possible role in oral T. cruzi transmission, and the effect of climate change on its biology and epidemiology.


Asunto(s)
Humanos , Animales , Panstrongylus/genética , Panstrongylus/parasitología , Triatoma/parasitología , Trypanosoma cruzi/aislamiento & purificación , Enfermedad de Chagas/transmisión , Insectos Vectores/parasitología , Panstrongylus/fisiología , Filogenia , Variación Genética/genética , Biología , Genes de Insecto , Ecología , Genotipo , Geografía , Insectos Vectores/genética , América Latina
9.
Biomedica ; 40(2): 404-411, 2020 06 15.
Artículo en Inglés, Español | MEDLINE | ID: mdl-32673466

RESUMEN

Introduction: Rhodnius (Hemiptera: Reduviidae: Triatominae) species are made up of haematophagous insect vectors for Trypanosoma cruzi (Chagas' disease aetiological agent) and T. rangeli, an infective parasite that is not pathogenic for vertebrate hosts. The study of their salivary protein diversity enables the obtention of characteristic one-dimensional electrophoretic profiles of some triatomine species; however, few reports have dealt with Rhodnius species salivary proteins electrophoretic patterns. Objective: To compare R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, R. prolixus, and R. robustus' salivary proteins one-dimensional electrophoretic profiles. Materials and methods: SDS-PAGE was used for obtaining electrophoretic profiles of saliva from the species under study. The unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) was used for constructing a phenogram. Results: Electrophoretic profiles of soluble saliva had protein bands ranging from 15 to 45 kDa, thereby enabling the five species studied to be differentiated. The phenogram revealed two main groups, one formed by the Pictipes and Prolixus cis-Andean groups and another consisting of the Pallescens trans-Andean group. Conclusion: Differences were revealed regarding R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, R. prolixus, and R. robustus electrophoretic profiles of salivary proteins; their variability facilitated constructing a phenogram which was taxonomically congruent with the groups from the genus Rhodnius.


Introducción. Las especies Rhodnius (Hemiptera: Reduviidae: Triatominae) están conformadas por insectos hematófagos vectores de Trypanosoma cruzi, agente etiológico de la enfermedad de Chagas, y T. rangeli, parásito infectivo pero no patógeno para el vertebrado. El estudio de la diversidad proteica de la saliva de estos insectos permite la obtención de perfiles electroforéticos unidimensionales característicos de algunas especies de triatominos. Sin embargo, el reporte de los patrones electroforéticos de proteínas salivales de las especies de Rhodnius ha sido escaso. Objetivo. Hacer un análisis comparativo de los perfiles electroforéticos unidimensionales de las proteínas salivales de R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, R. prolixus y R. robustus. Materiales y métodos. Se obtuvieron los perfiles electroforéticos de la saliva de las especies en estudio mediante electroforesis en gel de poliacrilamida con dodecilsulfatosódico (Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis, SDS-PAGE) y se construyó un fenograma mediante el método UPGMA (Unweighted Pair Group Method Using Arithmetic Averages). Resultados. Los perfiles electroforéticos de las proteínas solubles de saliva presentaron bandas en un rango de masa aproximado de 15 a 45 kDa, los cuales permitieron diferenciar las cinco especies estudiadas. El fenograma reveló la existencia de dos grupos principales: uno conformado por los grupos cisandinos Pictipes y Prolixus y otro constituido por el grupo transandino Pallescens. Conclusiones. Existen diferencias en los perfiles electroforéticos de las proteínas salivales entre R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, R. prolixus y R. robustus, cuya variabilidad permitió construir un fenograma congruente con los grupos del género Rhodnius.


Asunto(s)
Distribución Animal , Proteínas de Insectos/análisis , Insectos Vectores/clasificación , Rhodnius/clasificación , Proteínas y Péptidos Salivales/análisis , Animales , Colombia , Electroforesis en Gel de Poliacrilamida , Variación Genética , Proteínas de Insectos/aislamiento & purificación , Insectos Vectores/química , Peso Molecular , Filogenia , Rhodnius/química , Proteínas y Péptidos Salivales/aislamiento & purificación , Especificidad de la Especie , Trypanosoma cruzi
10.
Biomédica (Bogotá) ; 40(2): 404-411, abr.-jun. 2020. tab, graf
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-1124234

RESUMEN

Introducción. Las especies Rhodnius (Hemiptera: Reduviidae: Triatominae) están conformadas por insectos hematófagos vectores de Trypanosoma cruzi, agente etiológico de la enfermedad de Chagas, y T. rangeli, parásito infectivo pero no patógeno para el vertebrado. El estudio de la diversidad proteica de la saliva de estos insectos permite la obtención de perfiles electroforéticos unidimensionales característicos de algunas especies de triatominos. Sin embargo, el reporte de los patrones electroforéticos de proteínas salivales de las especies de Rhodnius ha sido escaso. Objetivo. Hacer un análisis comparativo de los perfiles electroforéticos unidimensionales de las proteínas salivales de R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, R. prolixus y R. robustus. Materiales y métodos. Se obtuvieron los perfiles electroforéticos de la saliva de las especies en estudio mediante electroforesis en gel de poliacrilamida con dodecilsulfato sódico (Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis, SDS-PAGE) y se construyó un fenograma mediante el método UPGMA (Unweighted Pair Group Method Using Arithmetic Averages). Resultados. Los perfiles electroforéticos de las proteínas solubles de saliva presentaron bandas en un rango de masa aproximado de 15 a 45 kDa, los cuales permitieron diferenciar las cinco especies estudiadas. El fenograma reveló la existencia de dos grupos principales: uno conformado por los grupos cisandinos Pictipes y Prolixus y otro constituido por el grupo transandino Pallescens. Conclusiones. Existen diferencias en los perfiles electroforéticos de las proteínas salivales entre R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, R. prolixus y R. robustus, cuya variabilidad permitió construir un fenograma congruente con los grupos del género Rhodnius.


Introduction: Rhodnius (Hemiptera: Reduviidae: Triatominae) species are made up of haematophagous insect vectors for Trypanosoma cruzi (Chagas' disease aetiological agent) and T. rangeli, an infective parasite that is not pathogenic for vertebrate hosts. The study of their salivary protein diversity enables the obtention of characteristic one-dimensional electrophoretic profiles of some triatomine species; however, few reports have dealt with Rhodnius species salivary proteins electrophoretic patterns. Objective: To compare R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, R. prolixus, and R. robustus' salivary proteins one-dimensional electrophoretic profiles. Materials and methods: SDS-PAGE was used for obtaining electrophoretic profiles of saliva from the species under study. The unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) was used for constructing a phenogram. Results: Electrophoretic profiles of soluble saliva had protein bands ranging from 15 to 45 kDa, thereby enabling the five species studied to be differentiated. The phenogram revealed two main groups, one formed by the Pictipes and Prolixus cis-Andean groups and another consisting of the Pallescens trans-Andean group. Conclusion: Differences were revealed regarding R. colombiensis, R. pallescens, R. pictipes, R. prolixus, and R. robustus electrophoretic profiles of salivary proteins; their variability facilitated constructing a phenogram which was taxonomically congruent with the groups from the genus Rhodnius.


Asunto(s)
Rhodnius , Proteínas y Péptidos Salivales , Electroforesis en Gel de Poliacrilamida
11.
Parasite Epidemiol Control ; 9: e00132, 2020 May.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31956703

RESUMEN

Blastocystis spp. has become one of the protozoans arousing the greatest scientific interest because of the controversy surrounding its biology; it is currently considered one of the most prevalent organisms in humans and animals worldwide. Such prevalence increases, especially in tropical countries where infection rates are high, highlighting the need to conduct studies focused on understanding this protozoan's biology. Interestingly, molecular tools are emerging as the best option for diagnosing this infection. This study was thus aimed at conventional PCR molecular detection and characterisation of Blastocystis spp. in human faecal samples from Ibagué, Colombia, using primers targeting the small subunit ribosomal ribonucleic acid (rRNA) gene. One hundred human faecal samples with confirmed Blastocystis spp. were studied, revealing the following subtype genetic diversity: ST1 50%, ST2 33% and ST3 17%. The results contributed to the limited information available regarding Blastocystis spp. in Colombia and created a reference point for further studies in the region.

12.
Psicol. pesq ; 13(1): 22-32, jan.-abr. 2019.
Artículo en Español | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1012844

RESUMEN

Se realizó una investigación cualitativa con enfoque hermenéutico en la cual se entrevistaron 15 profesionales sanitarios que trabajan en servicios de Atención Primaria en Salud o en centros especializados de atención a personas que usan alcohol y otras drogas en Medellín y su área metropolitana, con el objetivo de comprender las actitudes estigmatizantes hacia dicha población. Se concluye que los juicios morales y las conductas negativas de los profesionales hacia estos sujetos, derivadas de la escasa formación y entrenamiento en el tema; sumado a las debilidades propias del sistema de salud colombiano para brindar una atención integral, se convierten en importantes barreras para acceder a los servicios de promoción, prevención, tratamiento y rehabilitación.


Qualitative research with a hermeneutic approach. We interviewed 15 health professionals who work in Primary Health Care services or specialized centers for the care of people who use alcohol and other drugs in Medellin and its metropolitan area, with the aim of understanding stigmatizing attitudes towards this population. It is concluded that the moral judgments and the negative behaviors of the professionals towards these subjects, derived from the lack formation and training in this area; added to the weaknesses of the Colombian health system to provide comprehensive care, becomes in an important barrier to access the services of promotion, prevention, treatment and rehabilitation.

13.
Psicol. pesq ; 13(1): 33-41, jan.-abr. 2019.
Artículo en Español | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1012845

RESUMEN

Para este artículo se destacan las relaciones sociales y las prácticas cotidianas de 16 personas habitantes de calle que fueron entrevistadas en Medellín, Colombia, previo a un ejercicio de observación y aplicando la etnografía como modalidad a través de la cual se describieron y analizaron los resultados. Se identifica que la población habitante de calle se ha consolidado como un grupo que ha adoptado unas dinámicas sociales que los caracterizan y diferencian de otros grupos poblacionales en lo relacionado con prácticas de sobrevivencia y el modo de relacionarse con el contexto que les rodea, pese a que algunas de ellas son también extrapolables a un contexto social más amplio. Finalmente, el consumo de sustancias psicoactivas es transversal a las prácticas y relaciones de estos participantes.


For this article we highlight the social relationships and daily practices of 16 street people who were interviewed in Medellin, Colombia, prior to an observation exercise and applying ethnography as a modality through which the results were described and analyzed. It is identified that the street population has consolidated as a group that has adopted social dynamics that characterize them and differentiate them from other population groups in relation to survival practices and how to relate to the context surrounding them, despite that some of them are also extrapolated to a broader social context. Finally, the consumption of psychoactive substances is transversal to the practices and relationships of these participants.

14.
Rev. cienc. salud (Bogotá) ; 16(3): 534-549, ene.-abr. 2018.
Artículo en Español | LILACS, COLNAL | ID: biblio-985430

RESUMEN

Resumen Introducción: se describen las buenas prácticas de prevención, distinguidas de esta manera por 13 programas de prevención de drogas en Colombia. La identificación de buenas prácticas se ha extendido en el campo de las drogas para ayudar a mejorar los procesos, la toma de decisiones, encontrar metodologías exitosas y, en general, mejorar el saber hacer en los programas de drogas. Para la investigación se realizó un estudio cualitativo, hermenêutico, con alcance descriptivo, a partir de un proceso de realización de entrevistas a coordinadores y operadores de dichos programas, información que se sometió a un análisis de categorías previas y emergentes. Desarrollo: los resultados mostraron que algunas de las buenas prácticas descritas en la literatura especializada eran implementadas por los programas consultados, aunque no todas las necesarias para mostrar resultados eficaces y comprobables, especialmente en la generación de evidencia. Conclusiones: de forma aislada, dichas prácticas no tienen la suficiente fuerza; pero, si fueran adoptadas en su conjunto redundarían en una mejora de la prevención de drogas en Colombia.


Abstract Introduction: There is a description of good practices in drug prevention, acknowledged as such by 13 drug prevention programs in Colombia. The identification of good practices has been widened in the field of drugs in order to improve processes, decision making, finding successful methodologies and in general improving the know-how processes in drug programs. A qualitative study was carried out under a descriptive hermeneutic approach based on the information gathered through interviews with program coordinators and staff; the information was analyzed and categorized. Development: The results showed that the programs that were consulted used some of the good practices that were described in the specialized literature, even though not all were necessary to show efficient results, especially in generating evidences. Conclusions: When isolated, such practices are not enough, if they are adopted as a whole they would improve drug prevention processes in Colombia.


Resumo Introdução: descrevem-se as boas práticas de prevenção distinguidas desta maneira por 13 programas de prevenção de drogas na Colômbia. A identificação de boas práticas se tem estendido no campo das drogas para ajudar a melhorar os processos, a tomada de decisões, encontrar metodologias bem-sucedi-das e em geral melhorar o saber fazer nos programas de drogas. Para a pesquisa se realizou um estudo qualitativo, hermenêutico, com alcance descritivo, a partir de um processo de realização de entrevistas a coordenadores e operadores de ditos programas, informação que se submeteu a uma análise de categorias prêvias e emergentes. Desenvolvimento: os resultados mostraram que algumas das boas práticas descritas na literatura especializada eram implementadas pelos programas consultados, ainda que não todas as necessárias para mostrar resultados eficazes e comprováveis, especialmente na geração de evidência. Conclusões: de forma isolada ditas práticas não têm a suficiente força; mas se fossem adotadas em seu conjunto redundariam em uma melhora da prevenção de drogas na Colômbia.


Asunto(s)
Humanos , Trastornos Relacionados con Sustancias , Prevención Primaria , Colombia , Planificación en Salud , Promoción de la Salud
15.
Biomedica ; 37(0): 167-179, 2017 Mar 29.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29161488

RESUMEN

INTRODUCTION: Trypanosoma cruzi has been divided by international consensus into six discrete typing units (DTU): TcI, TcII, TcIII, TcIV, TcV y TcVI. The factors determining the dynamics of T. cruzi genotypes vector transmission of Chagas' disease in the different geographical regions of Perú are still unknown. OBJECTIVE: To detect and type T. cruzi DTUs from the faeces of seven species of triatomines (Panstrongylus chinai, P. geniculatus, P. herreri, Rhodnius robustus, R. pictipes, Triatoma carrioni and T. infestans) captured in eight departments from different natural regions of Perú. MATERIALS AND METHODS: We examined 197 insects for detecting trypanosomes. DNA was extracted from each insect intestinal contents and PCR amplification of kDNA, SL-IR, 24Sα rRNA and 18Sα RNA was performed for detecting T. cruzi DTUs. RESULTS: Five T. rangeli and 113 T. cruzi infections were detected; 95 of the latter were identified as TcI (two in P. chinai, one in P. geniculatus, 68 in P. herreri, four in R. pictipes, seven in R. robustus, one in T. carrioni, 12 in T. infestans), five as TcII (four in P. herreri, one in T. infestans), four as TcIII (three in P. herreri, one in R. robustus) and four TcIV infections in P. herreri. CONCLUSIONS: This is the first study which has attempted a large-scale characterization of T. cruzi found in the intestine of epidemiologically important vectors in Perú, thus providing basic information that will facilitate a better understanding of the dynamics of T. cruzi vector transmission in Perú.


Asunto(s)
ADN Protozoario/genética , Insectos Vectores/clasificación , Triatominae/parasitología , Trypanosoma cruzi/clasificación , Distribución Animal , Animales , Enfermedad de Chagas/epidemiología , Enfermedad de Chagas/transmisión , Preescolar , ADN Protozoario/análisis , Heces/parasitología , Genotipo , Geografía Médica , Vivienda , Humanos , Insectos Vectores/genética , Perú , Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa , Ribotipificación , Especificidad de la Especie , Triatominae/crecimiento & desarrollo , Trypanosoma cruzi/genética
16.
Biomédica (Bogotá) ; 37(supl.2): 167-179, jul.-set. 2017. tab, graf
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-888535

RESUMEN

Resumen Introducción. Trypanosoma cruzi se ha dividido en seis unidades taxonómicas discretas (Discreet Typing Units, DTU) denominadas TcI, TcII, TcIII, TcIV, TcV y TcVI. Aún se desconocen los factores determinantes de la dinámica de la transmisión vectorial de los genotipos de T. cruzi en las diferentes regiones geográficas de distribución de la enfermedad de Chagas en Perú. Objetivo. Detectar y tipificar las unidades taxonómicas discretas de T. cruzi en las heces de siete especies de triatominos (Panstrongylus chinai, P. geniculatus, P. herreri, Rhodnius robustus, R. pictipes, Triatoma carrioni y T. infestans), capturados en ocho departamentos de diferentes regiones naturales de Perú. Materiales y métodos. Se examinaron 197 insectos para la detección de tripanosomas. Se extrajo el ADN del contenido intestinal de cada insecto y se amplificó mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) de los genes kDNA, SL-IR, 24Sa rRNA y 18Sa RNA para detectar las DTU de T. cruzi. Resultados. Se detectaron cinco infecciones con T. rangeli y 113 con T. cruzi. De estas últimas, fue posible identificar 95 de TcI (dos en P. chinai, una en P. geniculatus, 68 en P. herreri, cuatro en R. pictipes, siete en R. robustus, una en T. carrioni, y 12 en T. infestans); cinco de TcII (cuatro en P. herreri, una en T. infestans); cuatro de TcIII (tres en P. herreri, una en R. robustus) y cuatro infecciones de TcIV en P. herreri. Conclusión. Este es el primer trabajo de caracterización a gran escala de T. cruzi en el intestino de vectores de importancia epidemiológica en Perú, orientado a generar información básica que permita entender la dinámica de la transmisión vectorial de T. cruzi en esta región del continente.


Abstract Introduction: Trypanosoma cruzi has been divided by international consensus into six discrete typing units (DTU): TcI, TcII, TcIII, TcIV, TcV y TcVI. The factors determining the dynamics of T. cruzi genotypes vector transmission of Chagas' disease in the different geographical regions of Perú are still unknown. Objective: To detect and type T. cruzi DTUs from the faeces of seven species of triatomines (Panstrongylus chinai, P. geniculatus, P. herreri, Rhodnius robustus, R. pictipes, Triatoma carrioni and T. infestans) captured in eight departments from different natural regions of Perú. Materials and methods: We examined 197 insects for detecting trypanosomes. DNA was extracted from each insect intestinal contents and PCR amplification of kDNA, SL-IR, 24Sa rRNA and 18Sa RNAwas performed for detecting T. cruzi DTUs. Results: Five T. rangeli and 113 T. cruzi infections were detected; 95 of the latter were identified as TcI (two in P. chinai, one in P. geniculatus, 68 in P. herreri, four in R. pictipes, seven in R. robustus, one in T. carrioni, 12 in T. infestans), five as TcII (four in P. herreri, one in T. infestans), four as TcIII (three in P. herreri, one in R. robustus) and four TcIV infections in P. herreri. Conclusions: This is the first study which has attempted a large-scale characterization of T. cruzi found in the intestine of epidemiologically important vectors in Perú, thus providing basic information that will facilitate a better understanding of the dynamics of T. cruzi vector transmission in Perú.


Asunto(s)
Animales , Preescolar , Humanos , Trypanosoma cruzi/clasificación , ADN Protozoario/genética , Triatominae/parasitología , Insectos Vectores/clasificación , Perú , Especificidad de la Especie , Trypanosoma cruzi/genética , ADN Protozoario/análisis , Triatominae/crecimiento & desarrollo , Enfermedad de Chagas/transmisión , Enfermedad de Chagas/epidemiología , Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa , Ribotipificación , Heces/parasitología , Distribución Animal , Geografía Médica , Genotipo , Vivienda , Insectos Vectores/genética
17.
Hacia promoc. salud ; 22(1): 43-55, Junio 21, 2017.
Artículo en Español | LILACS | ID: biblio-953777

RESUMEN

OBJETIVO: Interpretar el proceso de regulación del uso de marihuana con fines medicinales. MATERIALES Y MÉTODOS: Cualitativo con enfoque hermenéutico, utiliza la técnica de entrevista, se aplicó a 15 expertos en octubre de 2015. Se hizo triangulación: expertos, artículos científicos e investigadores. Se realizó interpretación a partir de sistema categorial y de apoyo de programa Atlas. Ti. RESULTADOS: El debate sobre la regulación de la marihuana con fines terapéuticos se continúa dando en el mundo, en especial en relación a los beneficios para la salud. Con el uso de algunos cannabinoides ya existen evidencias, pero expertos consultados reconocen que no son suficientes; en estos casos se recomienda más investigación. Los expertos de diversas disciplinas entrevistados respaldan el argumento que con la prohibición poco se ha conseguido y que los enfoques de salud pública traen una apertura científica no represiva a la situación, situando el debate en los posibles beneficios que puede traer para el tratamiento de algunas enfermedades. Estos procesos regulatorios deben considerar un control sobre la producción, fabricación, exportación, distribución, comercio y uso del cannabis con fines médicos e investigativos; proceso distinto al de la legalización del consumo con fines recreativos. CONCLUSIÓN: Para el caso colombiano, la regulación del cannabis con fines medicinales hasta hace unos meses era solo una discusión con posiciones radicalizadas a favor y en contra. Hoy es una realidad en términos de legislación pues fue aprobada por decreto, pero con escaso debate y acción pedagógica de lo que implica la ley para población.


OBJECTIVE: To understand the process of regulating the use of marijuana for medicinal purposes.MATERIALS AND METHODS: Hermeneutical method with qualitative approach, using the interview technique, applied to fifteen experts in October 2015. Interpretation was performed from categorical system and support of Atlas.ti bar program. RESULTS: The debate on the regulation of marijuana for therapeutic purposes continuous sweeping the globe, particularly in relation to health benefits. With the use of some cannabinoids there is some evidence, but experts consulted recognize that they are not sufficient in these cases: further investigation is recommended. The interviewed experts from different disciplines support the arguments that the ban imposed over marijuana little has achieved and that public health approaches bring a non-repressive scientific openness to the situation, placing the debate on the potential benefits it can bring for the treatment of some diseases. These regulatory processes must consider control over the production, manufacture, export, distribution, sale and use of cannabis for medical and research purposes, other than the legalization of recreational use process. CONCLUSION: For the Colombian case, the regulation of cannabis for medicinal purposes, until a few months ago was just an argument with radicalized positions for and against. Today it is reality as it was approved by decree on which progress in terms of legislation is being done, but with little debate, research and information to the population.


OBJETIVO: Interpretar o processo de regulação do uso de maconha com fins medicinais. MATERIAIS E MÉTODOS: Qualitativo com enfoque hermenêutico utiliza a técnica de entrevista, se aplicou a 15 expertos em outubro de 2015. Fez-se triangulação: expertos, artigos científicos e investigadores. Realizou-se interpretação a partir de sistema categorial e de apoio de programa Atlas. Ti. RESULTADOS: O debate sobre a regulação da maconha com fins terapêuticos se continua dando no mundo, em especial em relação aos benefícios para a saúde. Com o uso de alguns canabinoides já existem evidencias, mas expertos consultados reconhecem que não são suficientes; nestes casos se recomenda mais pesquisa. Os expertos de diversas disciplinas entrevistados sustentam o argumento que com a proibição pouco se tem conseguido e que os enfoques de saúde pública trazem uma apertura científica não repressiva à situação, situando o debate nos possíveis benefícios que pode trazer para o tratamento de algumas doenças. Estes processos regulatórios devem considerar um controle sobre a produção, fabricação, exportação, distribuição, comercialização e uso do cannabis com fins médicos de pesquisa; processo distinto ao da legalização do consumo com fins recreativos. CONCLUSÃO: Para o caso colombiano, a regulação do cannabis com fins medicinais até faz uns meses era só uma discutição com posições radicalizadas a favor e em contra. Hoje é uma realidade em termos de legislação, pois foi aprovada por decreto, mas com escasso debate e ação pedagógica do que implica a lei para povoação.


Asunto(s)
Humanos , Masculino , Plantas Medicinales , Cannabinoides , Cannabis , Fumar Marihuana , Legislación de Medicamentos
18.
Int J Parasitol ; 45(4): 225-35, 2015 Mar.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25592964

RESUMEN

Assessment of the genetic variability and population structure of Trypanosoma rangeli, a non-pathogenic American trypanosome, was carried out through microsatellite and single-nucleotide polymorphism analyses. Two approaches were used for microsatellite typing: data mining in expressed sequence tag /open reading frame expressed sequence tags libraries and PCR-based Isolation of Microsatellite Arrays from genomic libraries. All microsatellites found were evaluated for their abundance, frequency and usefulness as markers. Genotyping of T. rangeli strains and clones was performed for 18 loci amplified by PCR from expressed sequence tag/open reading frame expressed sequence tags libraries. The presence of single-nucleotide polymorphisms in the nuclear, multi-copy, spliced leader gene was assessed in 18 T. rangeli strains, and the results show that T. rangeli has a predominantly clonal population structure, allowing a robust phylogenetic analysis. Microsatellite typing revealed a subdivision of the KP1(-) genetic group, which may be influenced by geographical location and/or by the co-evolution of parasite and vectors occurring within the same geographical areas. The hypothesis of parasite-vector co-evolution was corroborated by single-nucleotide polymorphism analysis of the spliced leader gene. Taken together, the results suggest three T. rangeli groups: (i) the T. rangeli Amazonian group; (ii) the T. rangeli KP1(-) group; and (iii) the T. rangeli KP1(+) group. The latter two groups possibly evolved from the Amazonian group to produce KP1(+) and KP1(-) strains.


Asunto(s)
Evolución Molecular , Variación Genética , Trypanosoma rangeli/clasificación , Trypanosoma rangeli/genética , Análisis por Conglomerados , ADN Protozoario/química , ADN Protozoario/genética , Etiquetas de Secuencia Expresada , Genotipo , Repeticiones de Microsatélite , Datos de Secuencia Molecular , Filogenia , Polimorfismo de Nucleótido Simple , Análisis de Secuencia de ADN
19.
Biomedica ; 34(4): 631-41, 2014.
Artículo en Español | MEDLINE | ID: mdl-25504253

RESUMEN

Many cases of infection caused by the oral transmission of Trypanosoma cruzi have been reported during the last decade. These have been due to the contamination of food by faeces from sylvatic triatomines or by leakage from reservoirs in areas where domiciliated vectors have been controlled or where there has been no prior background of domiciliation. The United Nations Food and Agriculture Organization (FAO) and the World Health Organization (WHO) have used epidemiological, clinical and socioeconomic criteria for ranking parasites transmitted by the contamination of food in different areas of the world; T. cruzi was placed tenth in importance amongst a group of 24 parasites in such ranking. Environmental changes such as deforestation and global warming have affected ecotopes and the behaviour of T. cruzi vectors and reservoirs so that these have become displaced to new areas, thereby leading to such new transmission scenario caused by the contamination of food, which requires evaluation in Colombia. The current review deals with the oral transmission of Chagas' disease, emphasising studies aimed at identifying the pertinent risk factors, the triatomine species involved, the physiopathology of oral infection, the parasite's genotypes implicated in this type of transmission in Colombia and other Latin American regions, as well as the need for ongoing epidemiological surveillance and control policies.


Asunto(s)
Enfermedad de Chagas/transmisión , Heces/parasitología , Parasitología de Alimentos , Frutas/parasitología , Insectos Vectores/parasitología , Carne/parasitología , Rhodnius/parasitología , Trypanosoma cruzi/aislamiento & purificación , Verduras/parasitología , Animales , Animales Salvajes/parasitología , Armadillos/parasitología , Bebidas/parasitología , Donantes de Sangre , Enfermedad de Chagas/congénito , Enfermedad de Chagas/epidemiología , Enfermedad de Chagas/parasitología , Colombia , Reservorios de Enfermedades/parasitología , Femenino , Mucosa Gástrica/parasitología , Genotipo , Vivienda , Humanos , Mucosa Bucal/parasitología , Parasitemia/parasitología , Parasitemia/transmisión , Péptido Hidrolasas/fisiología , Embarazo , Complicaciones Infecciosas del Embarazo/parasitología , Proteínas Protozoarias/química , Proteínas Protozoarias/fisiología , Factores de Riesgo , Reacción a la Transfusión , Trypanosoma cruzi/genética , Trypanosoma cruzi/patogenicidad , Trypanosoma cruzi/fisiología , Glicoproteínas Variantes de Superficie de Trypanosoma/química , Glicoproteínas Variantes de Superficie de Trypanosoma/fisiología
20.
Rev Lat Am Enfermagem ; 22(5): 739-46, 2014 Oct.
Artículo en Inglés, Portugués, Español | MEDLINE | ID: mdl-25493668

RESUMEN

OBJECTIVES: The aim of this study was to analyze alcohol consumption by university students and psychosocial problems related. METHOD: Descriptive correlational study that included 396 university students. The "Alcohol Use Disorders Identification Test"--(AUDIT)--and an "ad hoc" questionnaire were used as instruments to assess the associated problems. RESULTS: Of the total sample, 88.6% drank, 20.5% had harmful consumption and 14.9% were at risk of dependence according to AUDIT. The study showed important results related to harmful alcohol consumption and dependence, with damage to the academic performance, social relationships, psychological status and sexual condition. CONCLUSIONS: Complications caused by problematic alcohol consumption by university students, which is high in this group due to the high prevalence of their alcohol consumption, highlights the importance of promoting programs to prevent the abuse and dependence of this substance in universities.


Asunto(s)
Consumo de Alcohol en la Universidad , Consumo de Bebidas Alcohólicas/efectos adversos , Adolescente , Adulto , Consumo de Bebidas Alcohólicas/epidemiología , Estudios Transversales , Femenino , Humanos , Masculino , Persona de Mediana Edad , Adulto Joven
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