A new approach to predicting mortality in dialysis patients using sociodemographic features based on artificial intelligence.

One of the main problems that affect patients in dialysis therapy who are on the waiting list to receive a kidney transplant is predicting their survival time if they do not receive a transplant. This paper proposes a new approach to survival prediction based on artificial intelligence techniques combined with statistical methods to study the association between sociodemographic factors and patient survival on the waiting list if they do not receive a kidney transplant. This new approach consists of a first stage that uses the clustering techniques that are best suited to the data structure (K-Means, Mini Batch K-Means, Agglomerative Clustering and K-Modes) used to identify the risk profile of dialysis patients. Later, a new method called False Clustering Discovery Reduction is performed to determine the minimum number of populations to be studied, and whose mortality risk is statistically differentiable. This approach was applied to the OPTN medical dataset (n = 44,663). The procedure started from 11 initial clusters obtained with the Agglomerative technique, and was reduced to eight final risk populations, for which their Kaplan-Meier survival curves were provided. With this result, it is possible to make predictions regarding the survival time of a new patient who enters the waiting list if the sociodemographic profile of the patient is known. To do so, the predictive algorithm XGBoost is used, which allows the cluster to which it belongs to be predicted and the corresponding Kaplan-Meier curve to be associated with it. This prediction process is achieved with an overall Multi-class AUC of 99.08 %.

Validación y reproducibilidad del cuestionario COPD-PS para la tamización de la EPOC: Bogotá, Colombia / Validation and reproducibility of the COPD-PS questionnaire for the screening of COPD: Bogotá, Colombia

Resumen Introducción: La enfermedad pulmonar obstructiva crónica es una afección con alta prevalencia a nivel mundial. Prevenible y tra table, pero con niveles de sub-diagnóstico muy altos. Es imperioso la utilización de herramientas de tamización; de fácil aplicación, interpretación y validadas en diferentes poblaciones, que ayudan no solo al clínico a la sospecha diagnostica, sino también al paciente a tomar conciencia sobre su enfermedad. Se busca validar el cuestionario COPD-Population Screener Questionnaire (COPD- PS) en una población colombiana. Materiales y métodos: Se realizó un estudio de cohorte prospectivo. Los participantes debían ser mayores de 40 años, tener una espirometría de buena calidad y haber realizado el cuestionario COPD-PS en dos oportunidades. La EPOC fue definida como un VEF1/ CVF < 0,7 y el antecedente de exposición a cigarrillo. Se realizó un análisis de reproducibilidad y validez. Resultado: De un total de 2199 sujetos potenciales, 1662 ingresaron al análisis final; la prevalencia de la EPOC en el estudio fue de 21,1%. Con el punto de corte de cuatro del cuestionario COPD-PS la sensibilidad fue del 77,2% y la especificidad de 46,3% con un área bajo la curva de características operativas del receptor de: 0,66(IC95%:0,63-0,69) (p < 0,01). Se obtuvo un coeficiente de correlación intraclase de 0,817(IC95%:0,79-0,84) y un coeficiente kappa de: 0,45(IC95%:0,31-0,59) (p < 0,01). Conclusión: El cuestionario COPD-PS es una herramienta con alta sensibilidad y buena reproducibilidad para la tamización de la EPOC, y podría ser una herramienta que oriente a la toma de espirometría en la búsqueda de sujetos no diagnosticados con esta patología.

Validation and reproducibility of the COPD-PS questionnaire for the screening of COPD: Bogotá, Colombia

Abstract Introduction: Chronic obstructive pulmonary disease is a condition with high prevalence worldwide. It is preventable and treatable, but with very high levels of underdiagnosis. The use of screening tools is imperative. These tools are easily applied, interpreted, and validated in different populations and help not only the clinician to confirm the diagnostic suspicion, but also the patients to become aware of their disease. The objective is to validate the COPD-Population Screener Questionnaire (COPD-PS) in one Colombian population. Materials and Methods: A prospective cohort study was carried out. Participants had to be older than 40 years, show a good quality spirometry, and have completed the COPD-PS questionnaire twice. COPD was defined as FEV1/FVC < 0.7 and with a history of exposure to tobacco smoke. A reproducibility and validation analysis has been conducted. Result: Out of a total of 2.199 potential subjects, 1.662 entered the final analysis; the prevalence of COPD in the study was 21.1%. With the COPD-PS questionnaire cut-off point of four, the sensitivity was 77.2% and the specificity was 46.3%, with an area under the receiver operating characteristic curve of: 0.66 (95% CI: 0.63-0.69) (p<0.01). An intraclass correlation coefficient of 0.817 (95% CI: 0.79-0.84) and a kappa coefficient of: 0.45 (95% CI: 0.31-0.59) (p<0.01) were obtained. Conclusion: The COPD-PS questionnaire is a tool with high sensitivity and good reproducibility for the screening of COPD, and could suggest the use of a spirometry in subjects not diagnosed with this disease.

Optimization of a Membrane Feeding Assay for Plasmodium vivax Infection in Anopheles albimanus.

INTRODUCTION: Individuals exposed to malaria infections for a long time develop immune responses capable of blocking Plasmodium transmission to mosquito vectors, potentially limiting parasite spreading in nature. Development of a malaria TB vaccine requires a better understanding of the mechanisms and main effectors responsible for transmission blocking (TB) responses. The lack of an in vitro culture system for Plasmodium vivax has been an important drawback for development of a standardized method to assess TB responses to this parasite. This study evaluated host, vector, and parasite factors that may influence Anopheles mosquito infection in order to develop an efficient and reliable assay to assess the TB immunity. METHODS/PRINCIPAL FINDINGS: A total of 94 P. vivax infected patients were enrolled as parasite donors or subjects of direct mosquito feeding in two malaria endemic regions of Colombia (Tierralta, and Buenaventura). Parasite infectiousness was assessed by membrane feeding assay or direct feeding assay using laboratory reared Anopheles mosquitoes. Infection was measured by qPCR and by microscopically examining mosquito midguts at day 7 for the presence of oocysts. Best infectivity was attained in four day old mosquitoes fed at a density of 100 mosquitos/cage. Membrane feeding assays produced statistically significant better infections than direct feeding assays in parasite donors; cytokine profiles showed increased IFN-γ, TNF and IL-1 levels in non-infectious individuals. Mosquito infections and parasite maturation were more reliably assessed by PCR compared to microscopy. CONCLUSIONS: We evaluated mosquito, parasite and host factors that may affect the outcome of parasite transmission as measured by artificial membrane feeding assays. Results have led us to conclude that: 1) optimal mosquito infectivity occurs with mosquitoes four days after emergence at a cage density of 100; 2) mosquito infectivity is best quantified by PCR as it may be underestimated by microscopy; 3) host cellular immune response did not appear to significantly affect mosquito infectivity; and 4) no statistically significant difference was observed in transmission between mosquitoes directly feeding on humans and artificial membrane feeding assays.

Mineral metabolism disorders, vertebral fractures and aortic calcifications in stable kidney transplant recipients: The role of gender (EMITRAL study) / Alteraciones del metabolismo mineral, fracturas vertebrales, y calcificaciones aórticas en receptores estables de trasplante renal: papel del género (estudio EMITRAL)

Antecedentes y objetivos: La relación entre las alteraciones del metabolismo mineral, las fracturas óseas y las calcificaciones vasculares en receptores de un trasplante renal no han sido establecidas. Método: Realizamos un estudio transversal en 727 receptores estables procedentes de 28 centros de trasplante españoles. Se determinaron de manera centralizada los parámetros del metabolismo mineral; también se centralizó la semicuantificación de las fracturas vertebrales y de las calcificaciones de la aorta abdominal. Resultados: La deficiencia de vitamina D (25OHD3 < 15ng/ml) fue más frecuente en mujeres y en los estadios CKD-T I-III (29,6 vs. 44,4%; p=0,003). La relación inversa y significativa observada entre los niveles de 25OHD3 y PTH fue modificada por el género de tal manera que la pendiente fue mayor en las mujeres que en los hombres (p=0,01). Un 15% de los receptores mostró alguna fractura vertebral (VFx) con un grado de deformidad ≥2. Los factores relacionados con la VFx diferían en función del género: en los hombres, la edad (OR: 1,04; IC 95%: 1,01-1,06) y el tratamiento con CsA (OR: 3,2; IC 95: 1,6-6,3); en las mujeres la edad (OR: 1,07; IC 95%: 1,03-1,12) y los niveles de PTH (OR per 100pg/ml increase: 1,27; IC 95%: 1,043-1,542). Las calcificaciones de la aorta abdominal fueron comunes (67,2%) y se relacionaron con los factores de riesgo clásicos, pero no con los parámetros del metabolismo mineral. Conclusiones: La deficiencia de vitamina D es más frecuente en las mujeres receptoras de un trasplante renal y en los estadios más tempranos de la CKD-T, y es un factor que contribuye al desarrollo de hiperparatiroidismo secundario. Las VFx prevalentes están relacionadas con unos niveles más elevados de PTH solamente en las mujeres (AU)

Background and objectives: The relationship between mineral metabolism disorders, bone fractures and vascular calcifications in kidney transplant recipients has not been established. Method: We performed a cross-sectional study in 727 stable recipients from 28 Spanish transplant clinics. Mineral metabolism parameters, the semi-quantification of vertebral fractures and abdominal aortic calcifications were determined centrally. Results: Vitamin D deficiency (25OHD3 < 15 ng/ml) was more common in female recipients at CKD-T stages I–III (29.6% vs 44.4%; p=0.003). The inverse and significant correlation between 25OHD3 and PTH was gender-specific and women exhibited a steeper slope than men (p=0.01). Vertebral fractures (VFx) with deformity grade ≥2 were observed in 15% of recipients. Factors related to VFx differed by gender; in males, age (OR 1.04; 95% CI 1.01-1.06) and CsA treatment (OR: 3.2; 95% CI: 1.6-6.3); in females, age (OR 1.07; 95% CI: 1.03-1.12) and PTH levels (OR per 100 pg/ml increase: 1.27; 95% CI: 1.043-1.542). Abdominal aortic calcifications were common (67.2%) and related to classical risk factors but not to mineral metabolism parameters. Conclusions: Vitamin D deficiency is more common among female kidney transplant recipients at earlier CKD-T stages, and it contributes to secondary hyperparathyroidism. Prevalent vertebral fractures are only related to high serum PTH levels in female recipients (AU)

Obtención, purificación y caracterización de igg policlonal de conejo anti-lipoproteína (a) humana / Obtainment, purification and characterization of Polyclonal IgG of rabbit human anti-lipoprotein (a

Las altas concentraciones séricas de Lp(a), una lipoproteína similar a la lipoproteína de baja densidad (LDL), se asocian a afecciones coronarias, cerebrovasculares y periféricas derivadas de la ateroesclerosis. A esta lipoproteína se le atribuyen propiedades trombogénicas y efectos inhibitorios sobre los mecanismos fibrinolíticos. Diferentes métodos han sido utilizados para la cuantificación sérica de la Lp(a), dentro de estos se destacan los métodos inmunoenzimáticos (ELISA). En este trabajo se describe el proceso de obtención, purificación y caracterización de uno de los reactivos biológicos necesarios para el montaje de un sistema inmunoenzimático ELISA que cuantifique Lp(a) en suero humano. Este reactivo es un suero policlonal hiperinmune como fuente de IgG policlonal de conejo anti-Lp(a) humana. Utilizando Lp(a) humana comercial, se inmunizaron dos conejos hembras según esquema de inmunización propuesto, se lograrontítulos de anticuerpos anti-Lp(a) humana en los dos animales. Con la utilización de métodos no cromatográficos (precipitación por salado) y métodos cromatográficos (Gel filtración e intercambio iónico)se purificó la IgG policlonal de conejo anti-Lp(a) humana. A esta IgG purificada se le determinó el grado depureza (SDS-PAGE) y la actividad biológica (inmunodifusión doble). La biomolécula purificada mostró el grado de pureza necesario para los fines en que será utilizada, así como reconoció el antígeno empleado en lainmunización(AU)

Obtención, purificación y caracterización de igg policlonal de conejo anti-lipoproteína (a) humana / Obtainment, purification and characterization of Polyclonal IgG of rabbit human anti-lipoprotein (a

Las altas concentraciones séricas de Lp(a), una lipoproteína similar a la lipoproteína de baja densidad (LDL), se asocian a afecciones coronarias, cerebrovasculares y periféricas derivadas de la ateroesclerosis. A esta lipoproteína se le atribuyen propiedades trombogénicas y efectos inhibitorios sobre los mecanismos fibrinolíticos. Diferentes métodos han sido utilizados para la cuantificación sérica de la Lp(a), dentro de estos se destacan los métodos inmunoenzimáticos (ELISA). En este trabajo se describe el proceso de obtención, purificación y caracterización de uno de los reactivos biológicos necesarios para el montaje de un sistema inmunoenzimático ELISA que cuantifique Lp(a) en suero humano. Este reactivo es un suero policlonal hiperinmune como fuente de IgG policlonal de conejo anti-Lp(a) humana. Utilizando Lp(a) humana comercial, se inmunizaron dos conejos hembras según esquema de inmunización propuesto, se lograrontítulos de anticuerpos anti-Lp(a) humana en los dos animales. Con la utilización de métodos no cromatográficos (precipitación por salado) y métodos cromatográficos (Gel filtración e intercambio iónico)se purificó la IgG policlonal de conejo anti-Lp(a) humana. A esta IgG purificada se le determinó el grado depureza (SDS-PAGE) y la actividad biológica (inmunodifusión doble). La biomolécula purificada mostró el grado de pureza necesario para los fines en que será utilizada, así como reconoció el antígeno empleado en lainmunización

Diseño y validación de un sistema inmunoenzimático elisa para cuantificar lipoproteína a en suero humano / Design and validation of an inmunoenzymatic system ELISA that quantifies lipoprotein a in human serum

La lipoproteína (a) es considerada un factor de riesgo cardiovascular. Elevadas concentraciones en sangre de esta lipoproteína están asociadas con un incremento de la incidencia y severidad de la ateroesclerosis. La evaluación del riesgo cardiovascular relacionada con la Lp(a) se realiza sobre la base de las concentraciones plasmáticas de dicha lipoproteína. Las concentraciones séricas de esta lipoproteína se miden a través de diferentes métodos, pero los ensayos inmunoenzimáticos ELISA son los de mayor aplicación en esta finalidad. En nuestra investigación se describe el diseño y la validación de un sistema ELISA indirecto tipo sándwich que utiliza anticuerpos poligonales anti-Lp(a) humana. La validación del sistema se realizó según los parámetros propuestos por el Europeun Committee for Clinical Laboratory Standard y se aplicaron los siguientes parámetros: curva de calibración, imprecisión (within-rum y between-rum), sensibilidad, especificidad y determinación de Lp(a) en suero de pacientes(AU)

Diseño y validación de un sistema inmunoenzimático elisa para cuantificar lipoproteína a en suero humano / Design and validation of an inmunoenzymatic system ELISA that quantifies lipoprotein a in human serum

La lipoproteína (a) es considerada un factor de riesgo cardiovascular. Elevadas concentraciones en sangre de esta lipoproteína están asociadas con un incremento de la incidencia y severidad de la ateroesclerosis. La evaluación del riesgo cardiovascular relacionada con la Lp(a) se realiza sobre la base de las concentraciones plasmáticas de dicha lipoproteína. Las concentraciones séricas de esta lipoproteína se miden a través de diferentes métodos, pero los ensayos inmunoenzimáticos ELISA son los de mayor aplicación en esta finalidad. En nuestra investigación se describe el diseño y la validación de un sistema ELISA indirecto tipo sándwich que utiliza anticuerpos poligonales anti-Lp(a) humana. La validación del sistema se realizó según los parámetros propuestos por el Europeun Committee for Clinical Laboratory Standard y se aplicaron los siguientes parámetros: curva de calibración, imprecisión (within-rum y between-rum), sensibilidad, especificidad y determinación de Lp(a) en suero de pacientes

Transplant strategies for diabetic renal patients.

The strict control of glycaemia in the diabetic patient prevents severe long-term complications of diabetes. The most effective physiological method to control glycaemia in the type 1 diabetes patient is pancreas or pancreatic islet transplant. However, these types of transplants require chronic immunosuppressant treatment that leads to short and long term complications and are reserved for type 1 diabetic patients with life threatening complications (frequent unexplained ketoacidosis or hypoglycaemias). With regards to type 1 diabetics with end-stage nephropathy, simultaneous pancreas-kidney transplant has excellent results and makes it possible for the patient to be insulin and dialysis free. If vascular complications, especially coronary disease, make it impossible to perform a simultaneous pancreas-kidney transplant, kidney transplant alone will be indicated and, in the future, the patient may have access to the transplant of pancreatic islets when the technique is perfected. Type 1 diabetic patients who receive a living or cadaver kidney transplant, and later a pancreatic transplant show excellent results. Type 2 diabetics, in whom pancreas transplant is not indicated, as they do not have a total deficit of insulin, can have access to a kidney transplant if they reach end-stage nephropathy in spite of their more advanced age, as long as their vascular disease allows it. Transplant of cadaver islets is beginning to provide good results, thanks to new immunosuppressant protocols. This procedure does not require surgery, the islets being implanted into the liver by infusion through the vena porta. Obtaining islets from embryonic or adult tissue stem cells, although in an experimental phase, could be a reality in the near future.

Valoración del nivel de conocimiento y habilidades con que ingresan los estudiantes a la carrera de medicina

La enseñanza actual a todos los niveles está encaminada a fomentar el desarrollo de habilidades, hábitos y capacidades en los estudiantes para formar el profesional que requiere la sociedad actual. Con el presente trabajo se hace un estudio para conocer las habilidades teóricas y los conocimientos que tienen los estudiantes que ingresan en la carrera de medicina en el curso 1996-1997 en las asignaturas de Química y Biología por ser de las asignaturas de la enseñanza precedente las afines a la Bioquímica. Se realizó una prueba diagnóstica de estas asignaturas a una muestra escogida al azar de los estudiantes para explorar un grupo de habilidades lógicas necesarias para el desarrollo de la disciplina Bioquímica también se tuvo en cuenta las calificaciones obtenidas en los exámenes de ingreso de estas asignaturas a la Educación Superior. El análisis estadístico se realizó por pruebas paramétricas y no paramétricas. Los resultados muestran que los contenidos que mejor dominan los estudiantes son aquellos en los que se requiere eminentemente habilidades a nivel reproductivo. De aquí se puede inferir que durante la enseñanza precedente se trabaja poco en el desarrollo de las habilidades a nivel productivo y creativo.

Currently, teaching at all levels is aimed at promoting the development of skills, habits and capabilities in the students in order to prepare the professionals required by today’s society. The present paper conducts a study to find out the theoretical skills and knowledge of the students, who started their medical studies in the academic year 1996-1997, in Chemistry and Biology because these two subjects from the previous educational levels were the ones related with Biochemistry. A diagnostic test in these two subjects was applied to a randomly selected sample of students so as to explore a group of required logical skills necessary for the development of this discipline. Also the marks that the students got in these subjects in the University entrance exam were taken into consideration. The statistical analysis comprised parametric and non-parametric tests. The results showed that the students had good command of those contents in which skills at reproductive level were particularly required. It may be inferred from this that the previous education system did not adequately develop skills at productive and creative levels.

Reacción en cadena de la polimerasa: revisión bibliográfica / Chain reaction of Polymerase

La Reacción en Cadena de la Polimerasa es una novedad técnica que permite la síntesis "in vitro" de millones de copias de un segmento específico del ADN. Su alta especificidad y sensibilidad han hecho de esta sencilla, pero ingeniosa metodología una herramienta que ha evolucionado el análisis y la manipulación del material genético. Actualmente la aplicación de artículos científicos donde se refiere la utilización de esta técnica es exponencial, por ello se hace esta revisión con el objetivo de informar al lector sobre los principios de este procedimiento, los requerimientos de laboratorio para su realización, sus posibles aplicaciones y sus ventajas. Para ello se revisaron 46 documentos. Una poderosa herramienta de investigación ha surgido, su aplicación en diferentes campos del conocimiento científico sitúan a la Reacción en Cadenas de la Polimerasa como el factor fundamental que explica el actual desarrollo alcanzado en el análisis y manipulación del material genético en animales y plantas(AU)

Estrés oxidativo, disfunción endotelial y aterosclerosis / Oxidative stress, endotelial disfunction and atherosclerosis

Esta revisión bibliográfica se realizó con el objetivo de discutir los principales mecanismos bioquímicos que vinculan el estrés oxidativo con la disfunción endotelial, además de ver como esta última a su vez se relaciona con la etiopatogenia de la aterosclerosis. Puede decirse que en los últimos años ha quedado demostrado que la disfunción endotelial es tal vez el elemento más importante entre aquellos que participan en el inicio y desarrollo de la aterosclerosis(AU)

Radicales libres y antioxidantes: realidades y perspectivas: revision bibliografica / Free radicals and antioxidants: realities and perspectives: bibliographical review

Entre los mecanismos moleculares que pueden producir lesión y muerte celular el más estudiado en los años recientes es el producido por los radicales liberados en las reacciones de oxidación mediadas por el oxígeno. La producción de radicales libres del oxígeno constituye un proceso normal, considerándose que el 5 por ciento del oxígeno que penetra en la célula es transformado en uno de los siguientes radicales: ión superóxido, peróxido de hidrógeno o radical hidróxilo. El efecto deletéreo de estos radicales sobre las membranas biológicas y el ADN, es evitado por la existencia de mecanismos moleculares de defensa como son: la enzima SOD, Glutation Peroxidasa y Catalasa, o Vitaminas como la C, A, E y el Selenio. Los desbalances entre la generación de radicales libres y la capacidad antioxidante del organismo genera un estado que se conoce como Estres Oxidativo Celular el cual es responsable de los daños celulares y tisulares asociados a diversos estados patológicos. En la presente revisión se analizan los mecanismos por los cuales actúan los diferentes antioxidantes, la relación entre el Estrés Oxidativo y algunas enfermedades degenerativas. Se describen algunas experiencias sobre la posibilidad de utilizar antioxidantes en el tratamiento de estas dolencias y la importancia de la nutrición como vía para prevenir los efectos de los radicales libres para el organismo(AU)