Caracterização molecular de uma progênie de tangerineira 'Clementina Fina' e 'Montenegrina'

Citrus have a very complex taxonomy, especially considering the number of species included in genus Citrus and related genera. What is classified as a species may have originated by interespecific hybridization and preserved through nucellar embryony. This research aimed to characterize a population of hybrid tangerines, originated from the cross of 'Clementina Fina' (Citrus clementina Hort. ex Tan.) as female and 'Montenegrina' (Citrus deliciosa Ten.) as male parents, using microsatellite molecular makers. With 12 pairs of primers it was possible to differentiate 93 of the studied accessions and to group F1 individuals nearer to the male or to the female parent. The primers PIC (Polymorphism Information Content) ranged from 0.27 to 0.65. All the analyzed progeny between 'Clementina Fina' and 'Montenegrina' is hybrid, where SSR were efficient in identifying hybrids more similar to the genitors, showing genetic variability among plants of the studied population.

Os citros apresentam uma taxonomia muito complexa, principalmente com relação ao número de espécies que constituem o gênero Citrus e os gêneros afins. Genótipos classificados como espécies podem ter sido originados por hibridação interespecífica e preservados por meio da embrionia nucelar. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar uma população de tangerineiras híbridas oriundas do cruzamento das tangerineiras 'Clementina Fina' (Citrus clementina Hort. ex Tan.), genitor feminino, e 'Montenegrina' (Citrus deliciosa Ten.), genitor masculino, utilizando marcadores do tipo microssatélites (SSR). Com 12 pares de primers, foi possível diferenciar 93 acessos do estudo e agrupar a F1 em indivíduos mais próximos do genitor feminino e do genitor masculino. O PIC (Conteúdo de Informação de Polimorfismo) dos primers variou de 0,27 a 0,65. Toda a progênie do cruzamento entre 'Clementina Fina' e 'Montenegrina' analisada neste estudo é híbrida, e os SSRs foram eficientes para identificar híbridos com maior similaridade genética em relação aos genitores, mostrando a existência de variabilidade genética entre as plantas da população estudada.

Caracterização molecular de uma progênie de tangerineira 'Clementina Fina' e 'Montenegrina'

Citrus have a very complex taxonomy, especially considering the number of species included in genus Citrus and related genera. What is classified as a species may have originated by interespecific hybridization and preserved through nucellar embryony. This research aimed to characterize a population of hybrid tangerines, originated from the cross of 'Clementina Fina' (Citrus clementina Hort. ex Tan.) as female and 'Montenegrina' (Citrus deliciosa Ten.) as male parents, using microsatellite molecular makers. With 12 pairs of primers it was possible to differentiate 93 of the studied accessions and to group F1 individuals nearer to the male or to the female parent. The primers PIC (Polymorphism Information Content) ranged from 0.27 to 0.65. All the analyzed progeny between 'Clementina Fina' and 'Montenegrina' is hybrid, where SSR were efficient in identifying hybrids more similar to the genitors, showing genetic variability among plants of the studied population.

Os citros apresentam uma taxonomia muito complexa, principalmente com relação ao número de espécies que constituem o gênero Citrus e os gêneros afins. Genótipos classificados como espécies podem ter sido originados por hibridação interespecífica e preservados por meio da embrionia nucelar. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar uma população de tangerineiras híbridas oriundas do cruzamento das tangerineiras 'Clementina Fina' (Citrus clementina Hort. ex Tan.), genitor feminino, e 'Montenegrina' (Citrus deliciosa Ten.), genitor masculino, utilizando marcadores do tipo microssatélites (SSR). Com 12 pares de primers, foi possível diferenciar 93 acessos do estudo e agrupar a F1 em indivíduos mais próximos do genitor feminino e do genitor masculino. O PIC (Conteúdo de Informação de Polimorfismo) dos primers variou de 0,27 a 0,65. Toda a progênie do cruzamento entre 'Clementina Fina' e 'Montenegrina' analisada neste estudo é híbrida, e os SSRs foram eficientes para identificar híbridos com maior similaridade genética em relação aos genitores, mostrando a existência de variabilidade genética entre as plantas da população estudada.

Caracterização molecular de uma progênie de tangerineira 'Clementina Fina' e 'Montenegrina'

Citrus have a very complex taxonomy, especially considering the number of species included in genus Citrus and related genera. What is classified as a species may have originated by interespecific hybridization and preserved through nucellar embryony. This research aimed to characterize a population of hybrid tangerines, originated from the cross of 'Clementina Fina' (Citrus clementina Hort. ex Tan.) as female and 'Montenegrina' (Citrus deliciosa Ten.) as male parents, using microsatellite molecular makers. With 12 pairs of primers it was possible to differentiate 93 of the studied accessions and to group F1 individuals nearer to the male or to the female parent. The primers PIC (Polymorphism Information Content) ranged from 0.27 to 0.65. All the analyzed progeny between 'Clementina Fina' and 'Montenegrina' is hybrid, where SSR were efficient in identifying hybrids more similar to the genitors, showing genetic variability among plants of the studied population.

Os citros apresentam uma taxonomia muito complexa, principalmente com relação ao número de espécies que constituem o gênero Citrus e os gêneros afins. Genótipos classificados como espécies podem ter sido originados por hibridação interespecífica e preservados por meio da embrionia nucelar. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar uma população de tangerineiras híbridas oriundas do cruzamento das tangerineiras 'Clementina Fina' (Citrus clementina Hort. ex Tan.), genitor feminino, e 'Montenegrina' (Citrus deliciosa Ten.), genitor masculino, utilizando marcadores do tipo microssatélites (SSR). Com 12 pares de primers, foi possível diferenciar 93 acessos do estudo e agrupar a F1 em indivíduos mais próximos do genitor feminino e do genitor masculino. O PIC (Conteúdo de Informação de Polimorfismo) dos primers variou de 0,27 a 0,65. Toda a progênie do cruzamento entre 'Clementina Fina' e 'Montenegrina' analisada neste estudo é híbrida, e os SSRs foram eficientes para identificar híbridos com maior similaridade genética em relação aos genitores, mostrando a existência de variabilidade genética entre as plantas da população estudada.

Genetic divergence among hybrids of 'Cravo' mandarin with 'Pêra' sweet orange

Molecular markers have been used as tools in breading programs of sexual hybridation, allowing the genetic characterization of a large number of genotypes. The RADP markers are the most used since the employed techniques are simple and of low cost. To evaluate the genetic divergence among F1 hybrids of 'Cravo' mandarin (Citrus reticulata Blanco) and 'Pêra' sweet orange (C. sinensis (L.) Osbeck), this study analyses the variability and similarity of the hybrids among themselves and with their parents. Random Amplified Polimorfic DNA marker analysis, with 102 primers, were applied to a population composed of 94 hybrids and their parents. Multivariate genetic divergence analysis of the principal components and Tocher grouping were carried out only considering the polymorphic fragments. Genetic distances were calculated by the arithmetic complement of the Jaccard index. Bidimensional dispersion graphs among hybrid and parent distances and of the divergence analysis by principal components were constructed. High genetic similarity among Cravo and Pêra varieties and their hybrids was verified, showing a casual distribution from the hybrids in relation to the parents, but in intermediary positions. The principal component analysis showed little applicability in the study of hybrid genetic divergence. The hybrids and parents were classified in groups based on the genetic similarity, using the Tocher optimization method.

Os marcadores moleculares têm sido utilizados como ferramentas em programas de melhoramento por hibridação sexual, permitindo a caracterização genética de grande número de genótipos. Os marcadores moleculares RAPD são os mais utilizados pois as técnicas empregadas são simples e de baixo custo. Avaliou-se a divergência genética entre híbridos F1 de tangerina 'Cravo' (Citrus reticulata Blanco) com laranja 'Pêra' (C. sinensis (L.) Osbeck) e estudou-se a variabilidade e a similaridade desses materiais entre si e em relação aos parentais. Reações RAPD, com 102 primers, foram realizadas em uma população de 94 híbridos e nos parentais. As análises multivariadas de divergência genética de componentes principais e agrupamento de Tocher foram realizadas, considerando-se, somente, os fragmentos polimórficos. As distâncias genéticas foram obtidas por meio do complemento aritmético do índice de Jaccard. Gráficos bidimensionais de dispersão das distâncias dos híbridos e parentais e da análise de divergência por meio de componentes principais foram construídos. Verificou-se elevada similaridade genética entre as variedades Cravo e Pêra e seus híbridos, demonstrando uma distribuição praticamente aleatória dos híbridos em relação aos parentais, porém em posições intermediárias. A análise de componentes principais apresentou aplicabilidade reduzida no estudo da divergência genética dos híbridos. O método de otimização de Tocher possibilitou a classificação dos híbridos e parentais em função de sua similaridade genética.

Genetic divergence among hybrids of 'Cravo' mandarin with 'Pêra' sweet orange

Molecular markers have been used as tools in breading programs of sexual hybridation, allowing the genetic characterization of a large number of genotypes. The RADP markers are the most used since the employed techniques are simple and of low cost. To evaluate the genetic divergence among F1 hybrids of 'Cravo' mandarin (Citrus reticulata Blanco) and 'Pêra' sweet orange (C. sinensis (L.) Osbeck), this study analyses the variability and similarity of the hybrids among themselves and with their parents. Random Amplified Polimorfic DNA marker analysis, with 102 primers, were applied to a population composed of 94 hybrids and their parents. Multivariate genetic divergence analysis of the principal components and Tocher grouping were carried out only considering the polymorphic fragments. Genetic distances were calculated by the arithmetic complement of the Jaccard index. Bidimensional dispersion graphs among hybrid and parent distances and of the divergence analysis by principal components were constructed. High genetic similarity among Cravo and Pêra varieties and their hybrids was verified, showing a casual distribution from the hybrids in relation to the parents, but in intermediary positions. The principal component analysis showed little applicability in the study of hybrid genetic divergence. The hybrids and parents were classified in groups based on the genetic similarity, using the Tocher optimization method.

Os marcadores moleculares têm sido utilizados como ferramentas em programas de melhoramento por hibridação sexual, permitindo a caracterização genética de grande número de genótipos. Os marcadores moleculares RAPD são os mais utilizados pois as técnicas empregadas são simples e de baixo custo. Avaliou-se a divergência genética entre híbridos F1 de tangerina 'Cravo' (Citrus reticulata Blanco) com laranja 'Pêra' (C. sinensis (L.) Osbeck) e estudou-se a variabilidade e a similaridade desses materiais entre si e em relação aos parentais. Reações RAPD, com 102 primers, foram realizadas em uma população de 94 híbridos e nos parentais. As análises multivariadas de divergência genética de componentes principais e agrupamento de Tocher foram realizadas, considerando-se, somente, os fragmentos polimórficos. As distâncias genéticas foram obtidas por meio do complemento aritmético do índice de Jaccard. Gráficos bidimensionais de dispersão das distâncias dos híbridos e parentais e da análise de divergência por meio de componentes principais foram construídos. Verificou-se elevada similaridade genética entre as variedades Cravo e Pêra e seus híbridos, demonstrando uma distribuição praticamente aleatória dos híbridos em relação aos parentais, porém em posições intermediárias. A análise de componentes principais apresentou aplicabilidade reduzida no estudo da divergência genética dos híbridos. O método de otimização de Tocher possibilitou a classificação dos híbridos e parentais em função de sua similaridade genética.

Caracterização de genótipos de Citrus spp. através de marcadores RAPD

In citrus improvement programs the characterization of the available genetic resources is of great importance, mainly concerning biological characteristics of the culture, as the heterozigosity, nucellar the embriony and long reproductive cycle. Favored by nucellar embriony interespecific and intergeneric hybridizations and genotypes preservation happen easily. RAPDs markers were used to analyze 15 Citrus spp., four sweet orange (C. sinensis Osbeck), (C. medica, C. grandis e C. latifolia), four mandarins (C. reticulata Blanco, C. nobilis Loureiro, C. sunki Loureiro e C. deliciosa Tenore), a sour orange (C. aurantium L.), a grapefruit (C. paradisi Marcf.), a pummelo (C. grandis Osbeck), a cidra (C. medica L.), a lime (C. latifolia) and two hybrids (Citrus clementina T. x (C. tangerina T. x C. paradisi Macf.)). Genetic similarities of 15 Citrus genotypes obtained with twelve random primers, indicated a minimum similarity degree of 0.81 (simple matching) among the mandarins. Lower similarity degrees were obtained among less related Citrus species (C. medica, C. grandis e C. latifolia). The four varieties of sweet oranges (C. sinensis Osbeck) could not be differentiated by RAPD markers, showing maximum similarity.

Em programas de melhoramento de citros, a caracterização adequada dos recursos genéticos disponíveis é de grande importância, principalmente devido às características biológicas da cultura, como a heterozigosidade, a embrionia nucelar e o longo ciclo reprodutivo. A facilidade com que ocorrem hibridações (interespecíficas e intergenéricas) e a embrionia nucelar favoreceram a formação e a preservação de novas combinações, classificadas como espécies. Neste estudo, marcadores RAPDs foram utilizados para analisar 15 acessos de Citrus spp., sendo quatro variedades de laranjeiras doce (C. sinensis Osbeck), quatro tangerineiras (C. reticulata Blanco, C. nobilis Loureiro, C. sunki Loureiro e C. deliciosa Tenore), uma laranjeira azeda (C. aurantium L.), um pomeleiro (C. paradisi Macf.), uma torangeira (C. grandis Osbeck), uma cidreira (C. medica L.), uma limeira ácida (C. latifolia) e dois híbridos (Citrus clementina T. x (C. tangerina T. x C. paradisi Macf.)). Doze sequências iniciadoras aleatórias foram utilizadas para estudar os 15 genótipos, encontrando-se um grau de similaridade mínimio de 0,81 ("Simple Matching") entre as tangerineiras. Os menores graus de similaridade foram encontrados entre as espécies de Citrus menos aparentadas (C. medica, C. grandis e C. latifolia). As quatro cultivares de laranjeiras doces não puderam ser diferenciadas pelos marcadores RAPD utilizados, apresentando similaridade máxima.

Caracterização de genótipos de Citrus spp. através de marcadores RAPD

In citrus improvement programs the characterization of the available genetic resources is of great importance, mainly concerning biological characteristics of the culture, as the heterozigosity, nucellar the embriony and long reproductive cycle. Favored by nucellar embriony interespecific and intergeneric hybridizations and genotypes preservation happen easily. RAPDs markers were used to analyze 15 Citrus spp., four sweet orange (C. sinensis Osbeck), (C. medica, C. grandis e C. latifolia), four mandarins (C. reticulata Blanco, C. nobilis Loureiro, C. sunki Loureiro e C. deliciosa Tenore), a sour orange (C. aurantium L.), a grapefruit (C. paradisi Marcf.), a pummelo (C. grandis Osbeck), a cidra (C. medica L.), a lime (C. latifolia) and two hybrids (Citrus clementina T. x (C. tangerina T. x C. paradisi Macf.)). Genetic similarities of 15 Citrus genotypes obtained with twelve random primers, indicated a minimum similarity degree of 0.81 (simple matching) among the mandarins. Lower similarity degrees were obtained among less related Citrus species (C. medica, C. grandis e C. latifolia). The four varieties of sweet oranges (C. sinensis Osbeck) could not be differentiated by RAPD markers, showing maximum similarity.

Em programas de melhoramento de citros, a caracterização adequada dos recursos genéticos disponíveis é de grande importância, principalmente devido às características biológicas da cultura, como a heterozigosidade, a embrionia nucelar e o longo ciclo reprodutivo. A facilidade com que ocorrem hibridações (interespecíficas e intergenéricas) e a embrionia nucelar favoreceram a formação e a preservação de novas combinações, classificadas como espécies. Neste estudo, marcadores RAPDs foram utilizados para analisar 15 acessos de Citrus spp., sendo quatro variedades de laranjeiras doce (C. sinensis Osbeck), quatro tangerineiras (C. reticulata Blanco, C. nobilis Loureiro, C. sunki Loureiro e C. deliciosa Tenore), uma laranjeira azeda (C. aurantium L.), um pomeleiro (C. paradisi Macf.), uma torangeira (C. grandis Osbeck), uma cidreira (C. medica L.), uma limeira ácida (C. latifolia) e dois híbridos (Citrus clementina T. x (C. tangerina T. x C. paradisi Macf.)). Doze sequências iniciadoras aleatórias foram utilizadas para estudar os 15 genótipos, encontrando-se um grau de similaridade mínimio de 0,81 ("Simple Matching") entre as tangerineiras. Os menores graus de similaridade foram encontrados entre as espécies de Citrus menos aparentadas (C. medica, C. grandis e C. latifolia). As quatro cultivares de laranjeiras doces não puderam ser diferenciadas pelos marcadores RAPD utilizados, apresentando similaridade máxima.