Genomic characterisation of Campylobacter jejuni Cj26: A high-level ciprofloxacin/erythromycin-resistant strain isolated from a poultry carcass in southern Brazil.

OBJECTIVES: The draft genome sequence of Campylobacter jejuni (Cj26) was analysed to investigate genetic mechanisms of antimicrobial resistance, virulence-associated genes, and phylogenetic context. METHODS: Antimicrobial resistance was assessed by agar dilution and disk diffusion. Cj26 was sequenced using NovaSeq 6000 technology. The genome was assembled and annotated. Resistance genes and chromosomal mutations were analysed using the Center for Genomic Epidemiology services, and the multilocus sequence type, SVR-flaA, and porA were determined. The virulome was determined using the Virulence Factor Database. Plasmid detection and assembly were performed using Unicycler v0.5.0 software. To infer the core genome phylogeny, prokka v1.14.5 was employed in conjunction with IQtree v2.0.3. RESULTS: The Cj26 strain showed a high level of resistance to ciprofloxacin (32 µg/mL) and erythromycin (>128 µg/mL) and resistance to tetracycline and ampicillin. Multilocus sequence typing revealed that the strain belonged to sequence type 353. The substitutions Tre-86-Ile in gyrA and A2075G in 23s RNA were detected, along with the genes tetO, aph(3')-III, ant(6)-Ia, and blaOXA 460. A consistent relationship among accessory and core genes was identified. When compared to other sequence type 353 genomes from Brazil, Cj26 clustered with strains that had more antimicrobial resistance genes than the other clusters. CONCLUSION: This report provides insight into the antimicrobial resistance determinants found in a C. jejuni strain and offers a valuable resource for further studies on Campylobacter genomics and antimicrobial resistance.

SVR-flaA typing of erythromycin- and ciprofloxacin-resistant Campylobacter jejuni strains isolated from poultry slaughterhouses in southern Brazil.

The emergence of fluoroquinolone and macrolide resistance in C. jejuni, a recognized zoonotic pathogen, has increased worldwide. This study aimed to investigate phenotypic resistance to ciprofloxacin and erythromycin, the molecular mechanisms involved, and the strain of C. jejuni isolated from broiler carcasses. Eighty C. jejuni isolates from broiler carcasses in southern Brazil were investigated for their susceptibility to ciprofloxacin and erythromycin at minimal inhibitory concentrations. Mismatch amplification mutation assay-polymerase chain reaction (MAMA-PCR) was performed to detect substitutions of Thr-86-Ile, A2074C, and A2075G of domain V in the 23S rRNA. The presence of ermB gene and CmeABC operon were investigated by PCR. DNA sequencing was used to detect substitutions in the L4 and L22 proteins of the erythromycin-resistant strains. The Short Variable Region (SVR) of flaA was used to type all the strains resistant to both antimicrobials. Ciprofloxacin and erythromycin resistance were detected in 81.25% and 30.00% of the strains, respectively, and minimal inhibitory concentration values ranged from ≤ 0.125 to 64 µg/mL for ciprofloxacin and 0.5 to > 128 µg/mL for erythromycin. The Thr-86-Ile mutation in gyrA was observed in 100% of the ciprofloxacin-resistant strains. Mutations in both the A2074C and A2075G positions of 23S rRNA were observed in 62.5% of the erythromycin-resistant strains, while 37.5% had only the mutation A2075G. None of the strains harbored CmeABC operon, and ermB was not detected. Using DNA sequencing, the amino acid substitution T177S was detected in L4, and substitutions I65V, A103V, and S109A were detected in L22. Twelve flaA-SVR alleles were identified among the strains, with the most common SVR-flaA allele, type 287, covering 31.03% of ciprofloxacin- and erythromycin-resistant isolates. The present study revealed a high incidence and high levels of resistance to ciprofloxacin and erythromycin, as well as broad molecular diversity in C. jejuni isolates from broiler carcasses.

Ring test in milk samples preserved with Bronopol® / Teste do anel em amostras de leite conservadas com Bronopol ®

ABSTRACT: This study evaluated if the milk ring test (MRT) used to the brucellosis diagnostic at dairy herd level can be done in milk samples with conservative (Bronopol®) collected to the somatic cell count (SCC) that is used to mastitis monitoring. It were analyzed 38 bulk tank milk samples (BTMS) from 19 dairy herds artisanal cheese producers and 36 BTMS from a brucellosis free dairy herd, used as negative control (NC) and positive control (PC), when was added serum from vaccinated animals. The milk samples were collected in two different bottles (with or without Bronopol®). All the 38 BTMS from artisanal cheese producers (samples with and without Bronopol®) were non-reagent to MRT, as all NC. All PC were reagent to MRT, without interference of Bronopol®. Results showed that the milk sample used to SCC presented the proportion of agreement of results in all milk samples (100%), that is, false positive and false negative results were not observed. Results indicated that Bronopol® did not interfere with the color in the time of MRT reading suggesting that the same milk samples could be used to monitoring mastitis and brucellosis.

RESUMO: O objetivo deste estudo foi avaliar se o teste do anel do leite (TAL), utilizado para o diagnóstico da brucelose em nível de rebanho leiteiro, pode ser realizado em amostras de leite com conservador (Bronopol®) coletado para contagem de células somáticas (CCS) que é utilizado para monitoramento de mastite. Foram analisadas 38 amostras de leite de tanques de expansão (ALTE) de 19 rebanhos leiteiros produtores de queijo artesanal e 36 ALTE de rebanho leiteiro livre de brucelose, utilizadas como controle negativo (CN) e controle positivo (CP), quando foi adicionado soro de animais vacinados. As amostras de leite foram coletadas em dois frascos diferentes (com e sem Bronopol®). Todos as 38 ALTE de produtores artesanais de queijo (amostras com e sem Bronopol®) foram não reagentes ao TAL, como todos os CN. Todos os CP foram reagentes ao TAL, sem interferência do Bronopol®. Os resultados mostraram que a amostra de leite utilizada para CCS apresentaram a proporção de concordância dos resultados em todas as amostras de leite (100%), ou seja, não foram observados resultados falso-positivos e falso-negativos. Os resultados indicam que o Bronopol® não interferiu na cor no momento da leitura do TAL, sugerindo que as mesmas amostras de leite poderiam ser usadas para monitorar mastite e brucelose.

Ring test in milk samples preserved with Bronopol® / Teste do anel em amostras de leite conservadas com Bronopol®

This study evaluated if the milk ring test (MRT) used to the brucellosis diagnostic at dairy herd level can be done in milk samples with conservative (Bronopol®) collected to the somatic cell count (SCC) that is used to mastitis monitoring. It were analyzed 38 bulk tank milk samples (BTMS) from 19 dairy herds artisanal cheese producers and 36 BTMS from a brucellosis free dairy herd, used as negative control (NC) and positive control (PC), when was added serum from vaccinated animals. The milk samples were collected in two different bottles (with or without Bronopol®). All the 38 BTMS from artisanal cheese producers (samples with and without Bronopol®) were non-reagent to MRT, as all NC. All PC were reagent to MRT, without interference of Bronopol®. Results showed that the milk sample used to SCC presented the proportion of agreement of results in all milk samples (100%), that is, false positive and false negative results were not observed. Results indicated that Bronopol® did not interfere with the color in the time of MRT reading suggesting that the same milk samples could be used to monitoring mastitis and brucellosis.

O objetivo deste estudo foi avaliar se o teste do anel do leite (TAL), utilizado para o diagnóstico da brucelose em nível de rebanho leiteiro, pode ser realizado em amostras de leite com conservador (Bronopol®) coletado para contagem de células somáticas (CCS) que é utilizado para monitoramento de mastite. Foram analisadas 38 amostras de leite de tanques de expansão (ALTE) de 19 rebanhos leiteiros produtores de queijo artesanal e 36 ALTE de rebanho leiteiro livre de brucelose, utilizadas como controle negativo (CN) e controle positivo (CP), quando foi adicionado soro de animais vacinados. As amostras de leite foram coletadas em dois frascos diferentes (com e sem Bronopol®). Todos as 38 ALTE de produtores artesanais de queijo (amostras com e sem Bronopol®) foram não reagentes ao TAL, como todos os CN. Todos os CP foram reagentes ao TAL, sem interferência do Bronopol®. Os resultados mostraram que a amostra de leite utilizada para CCS apresentaram a proporção de concordância dos resultados em todas as amostras de leite (100%), ou seja, não foram observados resultados falso-positivos e falso-negativos. Os resultados indicam que o Bronopol® não interferiu na cor no momento da leitura do TAL, sugerindo que as mesmas amostras de leite poderiam ser usadas para monitorar mastite e brucelose.

Molecular markers associated with antimicrobial resistance and genotypes of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli isolated from broiler and swine flocks in southeast Brazil.

This study aimed to identify molecular markers associated with antimicrobial resistance and genotype isolates of Campylobacter spp. from broiler and swine flocks due to its importance to one-health. C. jejuni (n=27) and C. coli (n = 35) strains were screened for the antimicrobial genetic markers C257T in gyrA, A2074C and A2075G in 23S rRNA, CmeABC, ermB, tetO and blaOXA61 by PCR. Fifteen strains had SVR-flaA and porA genes sequenced to evaluate their genetic diversity. Among C. jejuni strains 62.96% had C257T mutation and only one strain had A2075G mutation. CmeA, cmeB, cmeC, tetO and blaOXA61 were detected respectively in 92.59%, 100%, 100%, 85.19%, 85.19% of the strains. All C. coli had C257T mutation; 48.75% had A2075G and cmeA, cmeB, cmeC, tetO, blaOXA61 were detected in 8.57%, 94.29%, 91.43%, 91.43%, 80%, respectively. Twelve porA and SVR-flaA alleles were detected, with a Simpson index of diversity value of 0.962.

Virulence-Associated Genes and Antimicrobial Resistance of Aeromonas hydrophila Isolates from Animal, Food, and Human Sources in Brazil.

Aeromonads are natural inhabitants of aquatic environments and may be associated with various human or animal diseases. Its pathogenicity is complex and multifactorial and is associated with many virulence factors. In this study, 110 selected Aeromonas hydrophila isolates isolated from food, animals, and human clinical material from 2010 to 2015 were analyzed. Antimicrobial susceptibility testing was performed by the disk diffusion method, and polymerase chain reaction was conducted to investigate the virulence genes hemolysin (hlyA), cytotoxic enterotoxin (act), heat-labile cytotonic enterotoxin (alt), aerolysin (aerA), and DNase-nuclease (exu). At least 92.7% of the isolates had one of the investigated virulence genes. Twenty different virulence profiles among the isolates were recognized, and the five investigated virulence genes were observed in four isolates. Human source isolates showed greater diversity than food and animal sources. Antimicrobial resistance was observed in 46.4% of the isolates, and multidrug resistance was detected in 3.6% of the isolates. Among the 120 isolates, 45% were resistant to cefoxitin; 23.5% to nalidixic acid; 16.6% to tetracycline; 13.7% to cefotaxime and imipenem; 11.8% to ceftazidime; 5.9% to amikacin, gentamicin, and sulfamethoxazole-trimethoprim; and 3.9% to ciprofloxacin and nitrofurantoin. Overall, the findings of our study indicated the presence of virulence genes and that antimicrobial resistance in A. hydrophila isolates in this study is compatible with potentially pathogenic bacteria. This information will allow us to recognize the potential risk through circulating isolates in animal health and public health and the spread through the food chain offering subsidies for appropriate sanitary actions.

Atividade bactericida e bacteriostática da casca do pequi (Caryocar brasiliense) em bactérias deteriorantes e patogênicas isoladas de alimentos / Bactericidal and bacteriostatic activity of pequi (Caryocar brasiliense) against deteriorant and pathogenic bacteria from foods

O pequi é uma fruta nativa do Cerrado brasileiro que apresenta elevado teor de compostos antioxidantes e pode apresentar ação antimicrobiana. Dessa forma, objetivou-se com o presente trabalho avaliar a atividade bacteriostática e bactericida do extrato da casca do pequi. Das cepas estudadas 5 são padrões cedidos pela FIOCRUZ e 5 são bactérias de alta resistência a antimicrobianos isoladas de carne e frango. Foi determinada a concentração inibitória mínima (CIM) e concentração bactericida mínima do extrato da casca do pequi. O extrato da casca do pequi apresenta atividade antimicrobiana frente a bactérias patogênicas e deteriorantes. C. jejuni e C. colisão as mais sensíveis. S. aureus apresentou tolerância. E. coli O157:H7 e E. coli são menos sensíveis. O resíduo do pequi é uma potencial e importante fonte de antimicrobianos naturais.

Atividade bactericida e bacteriostática da casca do pequi (Caryocar brasiliense) em bactérias deteriorantes e patogênicas isoladas de alimentos / Bactericidal and bacteriostatic activity of pequi (Caryocar brasiliense) against deteriorant and pathogenic bacteria from foods

O pequi é uma fruta nativa do Cerrado brasileiro que apresenta elevado teor de compostos antioxidantes e pode apresentar ação antimicrobiana. Dessa forma, objetivou-se com o presente trabalho avaliar a atividade bacteriostática e bactericida do extrato da casca do pequi. Das cepas estudadas 5 são padrões cedidos pela FIOCRUZ e 5 são bactérias de alta resistência a antimicrobianos isoladas de carne e frango. Foi determinada a concentração inibitória mínima (CIM) e concentração bactericida mínima do extrato da casca do pequi. O extrato da casca do pequi apresenta atividade antimicrobiana frente a bactérias patogênicas e deteriorantes. C. jejuni e C. colisão as mais sensíveis. S. aureus apresentou tolerância. E. coli O157:H7 e E. coli são menos sensíveis. O resíduo do pequi é uma potencial e importante fonte de antimicrobianos naturais.(AU)

A time series analysis of bulk tank somatic cell counts of dairy herds located in Brazil and the United States / Uma análise de séries temporais de contagem de células somáticas de tanque de rebanhos leiteiros localizados no Brasil e nos Estados Unidos

Bulk tank somatic cell counts (BTSCC) is widely used to monitore the mammary gland health at the herd and regional level. The BTSCC time series from specific regions or countries can be used to compare the mammary gland health and estimate the trend of subclinical mastitis at the regional level. Three time series of BTSCC from dairy herds located in the USA and the Southeastern Brazil were evaluated from 1995 to 2014. Descriptive statistics and a linear regression model were used to evaluate the data of the BTSCC time series. The mean of annual geometric mean of BTSCC (AGM) and the percentage of dairy herds with a BTSCC greater than 400,000 cells mL-1 (%>400) were significantly different (P 0.05) according to the countries and the times series. Linear regression model used for the USA time series was statistically significant for AGM and the %>400 (P 0.05). The first and second USA time series presented an increasing and decreasing trend for AGM and the %>400, respectively. The linear regression model for the Brazil time series was not significant (P>0.05) for both dependent variables (AGM and %>400). The Brazil time series showed no increasing or decreasing trend for the AGM and %>400. Consequently, approximately 40 to 50% of the dairy herds from southeastern Brazil will not achieve the regulatory limits for BTSCC over the next years.

Contagens de células somáticas de tanque (BTSCC) são amplamente utilizadas para monitorar a saúde da glândula mamária em níveis regional e de rebanho. Séries temporais de BTSCC, de regiões ou países específicos, podem ser usadas para comparar a saúde da glândula mamária e estimar a tendência de mastite subclínica em nível regional. Três séries temporais de BTSCC de rebanhos leiteiros, localizados nos EUA e na região sudeste do Brasil, foram avaliadas de 1995 a 2014. A estatística descritiva e modelos de regressão linear foram usados para avaliar as informações das séries temporais de BTSCC. A média anual geométrica de BTSCC (AGM) e a porcentagem de rebanhos com BTSCC, maior que 400.000 células mL-1 (%>400), foram significantemente diferentes (P 0,05) de acordo com os países e as séries temporais analisadas. O modelo de regressão linear usado para as séries temporais dos EUA foram estatisticamente significantes para AGM e %>400 (P 0,05). A primeira e a segunda séries temporais dos EUA apresentaram uma tendência de aumento e diminuição, tanto para AGM quanto para %>400, respectivamente. O modelo de regressão linear para as séries temporais do Brasil não foi significante (P>0,05) para ambas as variáveis dependentes (AGM e %>400). As séries temporais do Brasil não apresentaram tendência de aumento ou diminuição para AGM e %>400. Consequentemente, aproximadamente, 40 a 50% dos rebanhos leiteiros do sudeste do Brasil não alcançarão os limites regulatórios para BTSCC ao longo dos próximos anos.

A time series analysis of bulk tank somatic cell counts of dairy herds located in Brazil and the United States / Uma análise de séries temporais de contagem de células somáticas de tanque de rebanhos leiteiros localizados no Brasil e nos Estados Unidos

Bulk tank somatic cell counts (BTSCC) is widely used to monitore the mammary gland health at the herd and regional level. The BTSCC time series from specific regions or countries can be used to compare the mammary gland health and estimate the trend of subclinical mastitis at the regional level. Three time series of BTSCC from dairy herds located in the USA and the Southeastern Brazil were evaluated from 1995 to 2014. Descriptive statistics and a linear regression model were used to evaluate the data of the BTSCC time series. The mean of annual geometric mean of BTSCC (AGM) and the percentage of dairy herds with a BTSCC greater than 400,000 cells mL-1 (%>400) were significantly different (P 0.05) according to the countries and the times series. Linear regression model used for the USA time series was statistically significant for AGM and the %>400 (P 0.05). The first and second USA time series presented an increasing and decreasing trend for AGM and the %>400, respectively. The linear regression model for the Brazil time series was not significant (P>0.05) for both dependent variables (AGM and %>400). The Brazil time series showed no increasing or decreasing trend for the AGM and %>400. Consequently, approximately 40 to 50% of the dairy herds from southeastern Brazil will not achieve the regulatory limits for BTSCC over the next years.(AU)

Contagens de células somáticas de tanque (BTSCC) são amplamente utilizadas para monitorar a saúde da glândula mamária em níveis regional e de rebanho. Séries temporais de BTSCC, de regiões ou países específicos, podem ser usadas para comparar a saúde da glândula mamária e estimar a tendência de mastite subclínica em nível regional. Três séries temporais de BTSCC de rebanhos leiteiros, localizados nos EUA e na região sudeste do Brasil, foram avaliadas de 1995 a 2014. A estatística descritiva e modelos de regressão linear foram usados para avaliar as informações das séries temporais de BTSCC. A média anual geométrica de BTSCC (AGM) e a porcentagem de rebanhos com BTSCC, maior que 400.000 células mL-1 (%>400), foram significantemente diferentes (P 0,05) de acordo com os países e as séries temporais analisadas. O modelo de regressão linear usado para as séries temporais dos EUA foram estatisticamente significantes para AGM e %>400 (P 0,05). A primeira e a segunda séries temporais dos EUA apresentaram uma tendência de aumento e diminuição, tanto para AGM quanto para %>400, respectivamente. O modelo de regressão linear para as séries temporais do Brasil não foi significante (P>0,05) para ambas as variáveis dependentes (AGM e %>400). As séries temporais do Brasil não apresentaram tendência de aumento ou diminuição para AGM e %>400. Consequentemente, aproximadamente, 40 a 50% dos rebanhos leiteiros do sudeste do Brasil não alcançarão os limites regulatórios para BTSCC ao longo dos próximos anos.(AU)

A time series analysis of bulk tank somatic cell counts of dairy herds located in Brazil and the United States / Uma análise de séries temporais de contagem de células somáticas de tanque de rebanhos leiteiros localizados no Brasil e nos Estados Unidos

ABSTRACT: Bulk tank somatic cell counts (BTSCC) is widely used to monitore the mammary gland health at the herd and regional level. The BTSCC time series from specific regions or countries can be used to compare the mammary gland health and estimate the trend of subclinical mastitis at the regional level. Three time series of BTSCC from dairy herds located in the USA and the Southeastern Brazil were evaluated from 1995 to 2014. Descriptive statistics and a linear regression model were used to evaluate the data of the BTSCC time series. The mean of annual geometric mean of BTSCC (AGM) and the percentage of dairy herds with a BTSCC greater than 400,000 cells mL-1 (%>400) were significantly different (P<0.05) according to the countries and the times series. Linear regression model used for the USA time series was statistically significant for AGM and the %>400 (P<0.05). The first and second USA time series presented an increasing and decreasing trend for AGM and the %>400, respectively. The linear regression model for the Brazil time series was not significant (P>0.05) for both dependent variables (AGM and %>400). The Brazil time series showed no increasing or decreasing trend for the AGM and %>400. Consequently, approximately 40 to 50% of the dairy herds from southeastern Brazil will not achieve the regulatory limits for BTSCC over the next years.

RESUMO: Contagens de células somáticas de tanque (BTSCC) são amplamente utilizadas para monitorar a saúde da glândula mamária em níveis regional e de rebanho. Séries temporais de BTSCC, de regiões ou países específicos, podem ser usadas para comparar a saúde da glândula mamária e estimar a tendência de mastite subclínica em nível regional. Três séries temporais de BTSCC de rebanhos leiteiros, localizados nos EUA e na região sudeste do Brasil, foram avaliadas de 1995 a 2014. A estatística descritiva e modelos de regressão linear foram usados para avaliar as informações das séries temporais de BTSCC. A média anual geométrica de BTSCC (AGM) e a porcentagem de rebanhos com BTSCC, maior que 400.000 células mL-1 (%>400), foram significantemente diferentes (P<0,05) de acordo com os países e as séries temporais analisadas. O modelo de regressão linear usado para as séries temporais dos EUA foram estatisticamente significantes para AGM e %>400 (P<0,05). A primeira e a segunda séries temporais dos EUA apresentaram uma tendência de aumento e diminuição, tanto para AGM quanto para %>400, respectivamente. O modelo de regressão linear para as séries temporais do Brasil não foi significante (P>0,05) para ambas as variáveis dependentes (AGM e %>400). As séries temporais do Brasil não apresentaram tendência de aumento ou diminuição para AGM e %>400. Consequentemente, aproximadamente, 40 a 50% dos rebanhos leiteiros do sudeste do Brasil não alcançarão os limites regulatórios para BTSCC ao longo dos próximos anos.

Detection of fluoroquinolone resistance by mutation ingyrA gene of Campylobacterspp. isolates from broiler and laying (Gallus gallus domesticus) hens,from Rio de Janeiro State, Brazil / Detecção de resistência às fluoroquinolonas através da mutação no gene gyrA em Campylobacter spp. isolados de frangos de corte e galinhas (Gallus gallus domesticus) poedeiras, no Estado do Rio de Janeiro, Brasil

Poultry are considered to be the main reservoir of Campylobacterspp. bacteria, an important pathogen for humans. Many studies have reported a rapid selection of fluoroquinolone-resistant strains following the widespread use of these antimicrobials in poultry production and human medicine. The main mechanism of fluoroquinolone resistance in Campylobacteris a mutation in the Quinolone Resistance Determinant Region (QRDR) in the gyrA gene, which codes for the subunit of the enzyme DNA gyrase, the target for fluoroquinolone. The aim of this study was to investigate the mutation in QRDR in the gyrA gene of Campylobacterstrains previously isolated from broiler carcasses and feces of laying hens. Thirty-eight strains of C. jejuniand 19 C. colistrains (n=57), previously characterized as resistant to ciprofloxacin and enrofloxacin by the disk diffusion method and minimum inhibitory concentration (MIC), were selected. For detection of the mutation, a fragment of 454pb QRDR in the gyrA gene was used for direct sequencing. All strains presented the QRDR mutation in the gyrA gene at codon 86 (Thr-86-Ile), which confers resistance to fluoroquinolones. Other known silent mutations were observed. This genotypic characterization of fluoroquinolone resistance inCampylobacterstrains has confirmed the prior phenotypic detection of the resistance. The Thr-86-Ile mutation was observed in all samples confirming that this is the predominant mutation in enrofloxacin and ciprofloxacin resistant strains of C. jejuniand C. coli.

As aves são consideradas o principal reservatório deCampylobacterspp., um importante patógeno para humanos e muitos estudos têm relatado uma rápida seleção de cepas resistentes às fluoroquinolonas após o uso destes antimicrobianos na produção avícola e na medicina humana. O principal mecanismo de resistência às fluoroquinolonas em Campylobacterconsiste na mutação na Região Determinantes de Resistência às Quinolonas (RDRQ) do gene gyrA, que codifica para a subunidade A da enzima DNA girase, alvo das fluoroquinolonas. O objetivo deste estudo foi investigar a mutação na RDRQ do gene gyrA em cepas de Campylobacterpreviamente isolados de carcaças de frangos de corte e fezes de galinhas poedeiras. Foram selecionadas 38 cepas de C. jejunie 19 cepas de C. coli(n=57), previamente caracterizadas como resistentes à ciprofloxacina e enrofloxacina, pelo método da difusão em disco e pela determinação da concentração inibitória mínima. Para detecção da mutação, foi utilizado sequenciamento direto de um fragmento de 454pb da RDRQ do gene gyrA gerado por PCR. Todas as cepas apresentaram a mutação na RDRQ do gene gyrA no códon 86 (Tre-86-Ile), que confere resistência às fluoroquinolonas e outras mutações silenciosas foram observadas. A caracterização genotípica da resistência às fluoroquinolonas em Campylobacterconfirmou a prévia detecção fenotípica dessa resistência e a mutação Tre-86-Ile foi observada na totalidade das amostras, comprovando ser esta a mutação predominante em cepas de C. jejunie C. coliresistentes à enrofloxacina e ciprofloxacina.

Detection of fluoroquinolone resistance by mutation in gyrA gene of Campylobacter spp. isolates from broiler and laying (Gallus gallus domesticus) hens,from Rio de Janeiro state, Brazil / Detecção de resistência às fluoroquinolonas através da mutação no gene gyrA em Campylobacter spp. isolados de frangos de corte e galinhas (Gallus gallus domesticus) poedeiras, no estado do Rio de Janeiro, Brasil

As aves são consideradas o principal reservatório de Campylobacter spp., um importante patógeno para humanos e muitos estudos têm relatado uma rápida seleção de cepas resistentes às fluoroquinolonas após o uso destes antimicrobianos na produção avícola e na medicina humana. O principal mecanismo de resistência às fluoroquinolonas em Campylobacter consiste na mutação na Região Determinantes de Resistência às Quinolonas (RDRQ) do gene gyrA, que codifica para a subunidade A da enzima DNA girase, alvo das fluoroquinolonas. O objetivo deste estudo foi investigar a mutação na RDRQ do gene gyrA em cepas de Campylobacter previamente isolados de carcaças de frangos de corte e fezes de galinhas poedeiras. Foram selecionadas 38 cepas de C. jejuni e 19 cepas de C. coli (n=57), previamente caracterizadas como resistentes à ciprofloxacina e enrofloxacina, pelo método da difusão em disco e pela determinação da concentração inibitória mínima. Para detecção da mutação, foi utilizado sequenciamento direto de um fragmento de 454pb da RDRQ do gene gyrA gerado por PCR. Todas as cepas apresentaram a mutação na RDRQ do gene gyrA no códon 86 (Tre-86-Ile), que confere resistência às fluoroquinolonas e outras mutações silenciosas foram observadas. A caracterização genotípica da resistência às fluoroquinolonas em Campylobacter confirmou a prévia detecção fenotípica dessa resistência e a mutação Tre-86-Ile foi observada na totalidade das amostras, comprovando ser esta a mutação predominante em cepas de C. jejuni e C. coli resistentes à enrofloxacina e ciprofloxacina.(AU)

Poultry are considered to be the main reservoir of Campylobacter spp. bacteria, an important pathogen for humans. Many studies have reported a rapid selection of fluoroquinolone-resistant strains following the widespread use of these antimicrobials in poultry production and human medicine. The main mechanism of fluoroquinolone resistance in Campylobacter is a mutation in the Quinolone Resistance Determinant Region (QRDR) in the gyrA gene, which codes for the subunit of the enzyme DNA gyrase, the target for fluoroquinolone. The aim of this study was to investigate the mutation in QRDR in the gyrA gene of Campylobacter strains previously isolated from broiler carcasses and feces of laying hens. Thirty-eight strains of C. jejuni and 19 C. coli strains (n=57), previously characterized as resistant to ciprofloxacin and enrofloxacin by the disk diffusion method and minimum inhibitory concentration (MIC), were selected. For detection of the mutation, a fragment of 454pb QRDR in the gyrA gene was used for direct sequencing. All strains presented the QRDR mutation in the gyrA gene at codon 86 (Thr-86-Ile), which confers resistance to fluoroquinolones. Other known silent mutations were observed. This genotypic characterization of fluoroquinolone resistance in Campylobacter strains has confirmed the prior phenotypic detection of the resistance. The Thr-86-Ile mutation was observed in all samples confirming that this is the predominant mutation in enrofloxacin and ciprofloxacin resistant strains of C. jejuni and C. coli.(AU)

Pré-resfriamento na redução de coliformes em carcaças de frango de corte / Immersion chilling in fecal coliforms count reduction on broiler carcasses

O objetivo deste trabalho foi comparar a análise individual (plano de duas classes) e a análise por lotes (plano de três classes), priorizado pelo plano amostragem oficial da ANVISA, na influência do pré-resfriamento de carcaças de frangos de corte na redução da contaminação por coliformes termotolerantes. Foram analisadas 240 carcaças de frangos de corte, sendo coletadas 120 amostras antes e 120 após a etapa de pré-resfriamento, para quantificação de coliformes termotolerantes pela técnica de contagem em placas. As médias das contagens obtidas das carcaças coletadas antes e após o pré-resfriamento foram diferentes, com uma redução média de 0,99log10 UFC g-1 de coliformes termotolerantes. Na interpretação dos resultados obtidos antes do pré-resfriamento pela análise individual, 16,7% (20/120) das carcaças foram classificadas como inaceitáveis, enquanto, pela análise por lotes, foram 37,5% (45/120). Houve associação entre a aceitabilidade dos lotes e a passagem pelo chiller com um valor de Odds Ratio de 35,48. Ficou demonstrada a importância da utilização do plano de análise por lotes e da etapa de pré-resfriamento no processo de produção, sendo decisivos para a aceitação dos lotes de carcaças de aves para comercialização pelos parâmetros vigentes na legislação nacional.

The objective of this study was to assess the influence of immersion chilling on broiler carcasses contamination by fecal coliforms counting in a poultry slaughterhouse under Federal Sanitary Inspection by individual and three class plan interpretation of the results. Two hundred and forty broiler carcasses, being collected 120 before and 120 after passage thought chillers, were analyzed for coliform counting by plate count technique. The averages of the counts obtained from all carcasses collected before and after immersion chilling were different, with an average reduction of 0.99log10 CFU g-1 of fecal coliforms. Regarding individual results (two class plan) before chilling, 16.7% (20/120) of the carcasses were classified as unacceptable, against 37.5% (45/120) regarding lots results (three class plan). There was a strong association between the acceptability of lots and immersion chilling with an Odds Ratio value of 35.48. It was demonstrated the importance of the official sampling plan and immersion chilling in the production process, being decisive for the acceptance of the chicken carcass lots by the national legislation standards.

Investigação de Campylobacter fetus e Tritrichomonas foetus na mucosa prepucial de touros da região do Médio Paraíba, RJ / Campylobacter fetus and Tritrichomonas foetus investigation in prepucial mucous of bulls from Médio Paraíba/RJ region, Brazil

Trinta e nove touros provenientes de propriedades de pecuária leiteira (n=9) e de pecuária de corte (n=30), situadas na região do Médio Paraíba, Rio de Janeiro (RJ), foram investigados para a presença de Campylobacter fetus e Tritrichomonas foetus. Para a pesquisa de Campylobacter, amostras de esmegma foram coletadas e submetidas à técnica de cultivo e isolamento e amostras de lavado prepucial ao teste de Imunofluorescência Direta (IFD). Para a pesquisa de Tritrichomonas, foi utilizada a técnica de exame direto a partir de lavado prepucial. Foi observada a presença de C. fetus em 14 amostras (35,9%), por meio da IFD, e o isolamento de C. fetus, subespécie venerealis, foi obtido a partir de quatro amostras (10,3%). T. foetus não foi identificado nas amostras investigadas. A alta freqüência de C. fetus observada nos animais investigados sugere a presença da campilobacteriose na região do Médio Paraíba, em rebanhos com problemas reprodutivos.

Thirty nine breeding bulls from dairy farms (n=9) and beef farms (n=30) located in Médio Paraíba region at Rio de Janeiro - Brazil state were investigated for the presence of Campylobacter fetus and Tritrichomonas foetus. For Campylobacter investigation, smegma samples were examined by culture and prepucial washings were examined by direct immunofluorescence technique (DIF). The prepucial washings were also examined for Tritrichomonas foetus presence by direct examination. C. fetus was identified in 14 samples (35.9%) by DIF technique and C. fetus subspecies venerealis was isolated from four samples (10.3%). T. foetus was not detected in bull samples. The high frequency of C. fetus observed in bull samples suggests the occurrence of Campylobacteriosis among herds which have reproductive problems at the Médio Paraíba region.

Investigação de Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. e Pseudomonas spp. no trato intestinal de avestruzes (Struthio camelus) criados no estado do Rio de Janeiro, Brasil / Investigation of Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. and Pseudomonas spp. in ostriches (Struthio camelus) intestine from Rio de Janeiro State, Brazil

Na estrutiocultura, pesquisas relacionadas com a prevalência de micro-organismos patogênicos para esses animais e de importância em saúde pública ainda são escassas. O objetivo deste trabalho foi investigar a presença de Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. e Pseudomonas spp. a partir de 60 amostras de suabes cloacais, provenientes de quatro criatórios de avestruzes e avaliar o perfil de susceptibilidade destes micro-organismos frente aos antimicrobianos. Os micro-organismos dos gêneros Salmonella, Listeria e Campylobacter não foram encontrados nas amostras analisadas. Pseudomonas aeruginosa foi isolado a partir de 17 amostras (28,3,%), provenientes de animais de diferentes faixas etárias, oriundos dos quatro criatórios investigados. Adicionalmente, Escherichia coli foi isolado de 57 amostras (95%), Klebsiella spp., de cinco amostras (8,33%), Proteus mirabilis, Proteus vulgaris e Enterobacter spp. de uma amostra (1,66%). Das 17 cepas de P. aeruginosa submetidas ao teste de susceptibilidade aos antimicrobianos, todas (100%) apresentaram sensibilidade à Amicacina e à Ciprofloxacina e todas (100%) foram resistentes ao Sulfametoxazol/Trimetoprim e à Tetraciclina. Foram encontrados cinco perfis diferentes de resistência aos antimicrobianos, indicando uma variação da resistência entre as cepas de Pseudomonas isoladas, inclusive em animais do mesmo criatório e mantidos no mesmo piquete.

There has been limited research on the prevalence of ostrich intestinal pathogens and on the role of these animals as foodborne pathogens source. This study was conducted to estimate the frequence of Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. and Pseudomonas spp. from intestinal swabs of ostriches and to investigate the antibiotic resistance of the isolates. Sixty samples collected from four ostrich farms were examined. Salmonella, Listeria and Campylobacter were not isolated from the samples investigated and Pseudomonas aeruginosa was isolated from 17 (28.3%) samples. Additionally, Escherichia coli was isolated from 57 samples, (95%), Klebsiella spp. from five (8.33%), and Proteus mirabilis, Proteus vulgaris and Enterobacter spp. from one sample (1,66%). All Pseudomonas isolates were susceptible to Amicacin and Ciprofloxacin, and all of them (100%) were resistant to Trimethoprin/Sulfametox and to Tetracicline. Five antimicrobial resistance profiles were found, showing a resistance diversity among the Pseudomonas isolates, even in the same farm and raised at the same pen.

Investigação de Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. e Pseudomonas spp. no trato intestinal de avestruzes (Struthio camelus) criados no estado do Rio de Janeiro, Brasil / Investigation of Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. and Pseudomonas spp. in ostriches (Struthio camelus) intestine from Rio de Janeiro State, Brazil

Na estrutiocultura, pesquisas relacionadas com a prevalência de micro-organismos patogênicos para esses animais e de importância em saúde pública ainda são escassas. O objetivo deste trabalho foi investigar a presença de Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. e Pseudomonas spp. a partir de 60 amostras de suabes cloacais, provenientes de quatro criatórios de avestruzes e avaliar o perfil de susceptibilidade destes micro-organismos frente aos antimicrobianos. Os micro-organismos dos gêneros Salmonella, Listeria e Campylobacter não foram encontrados nas amostras analisadas. Pseudomonas aeruginosa foi isolado a partir de 17 amostras (28,3,%), provenientes de animais de diferentes faixas etárias, oriundos dos quatro criatórios investigados. Adicionalmente, Escherichia coli foi isolado de 57 amostras (95%), Klebsiella spp., de cinco amostras (8,33%), Proteus mirabilis, Proteus vulgaris e Enterobacter spp. de uma amostra (1,66%). Das 17 cepas de P. aeruginosa submetidas ao teste de susceptibilidade aos antimicrobianos, todas (100%) apresentaram sensibilidade à Amicacina e à Ciprofloxacina e todas (100%) foram resistentes ao Sulfametoxazol/Trimetoprim e à Tetraciclina. Foram encontrados cinco perfis diferentes de resistência aos antimicrobianos, indicando uma variação da resistência entre as cepas de Pseudomonas isoladas, inclusive em animais do mesmo criatório e mantidos no mesmo piquete.(AU)

There has been limited research on the prevalence of ostrich intestinal pathogens and on the role of these animals as foodborne pathogens source. This study was conducted to estimate the frequence of Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. and Pseudomonas spp. from intestinal swabs of ostriches and to investigate the antibiotic resistance of the isolates. Sixty samples collected from four ostrich farms were examined. Salmonella, Listeria and Campylobacter were not isolated from the samples investigated and Pseudomonas aeruginosa was isolated from 17 (28.3%) samples. Additionally, Escherichia coli was isolated from 57 samples, (95%), Klebsiella spp. from five (8.33%), and Proteus mirabilis, Proteus vulgaris and Enterobacter spp. from one sample (1,66%). All Pseudomonas isolates were susceptible to Amicacin and Ciprofloxacin, and all of them (100%) were resistant to Trimethoprin/Sulfametox and to Tetracicline. Five antimicrobial resistance profiles were found, showing a resistance diversity among the Pseudomonas isolates, even in the same farm and raised at the same pen.(AU)

Inquérito sorológico da brucelose canina através da utilização de antígeno externo e interno de Brucella canis e Brucella ovis / Serodiagnosis of canine brucellosis using external and internal antigens of Brucella canis and Brucella ovis

O objetivo desse estudo foi investigar a ocorrência da brucelose canina na cidade do Rio de Janeiro utilizando-se a técnica deimunodifusão em gel de agarose.Antígenos externo e interno de Brucella canis e Brucella ovis foram previamente preparadose um antígeno comercial usado para diagnóstico da brucelose canina foi também utilizado.Amostras de soro de 316 cãescoletadas aleatoriamente foram examinadas.Oito amostras (2,53 por cento) foram positivas no teste utilizando-se antígeno externo deB. canis e B. ovis e sete amostras (2,2 por cento) foram confirmadas com o antígeno comercial.Três amostras (0,95 por cento) foram positivaspara todos os antígenos testados. Antígenos externo e interno devem ser usados nos testes sorológicos para diagnóstico dabrucelose canina para detecção precoce e obtenção de resultados mais precisos, respectivamente.

The present study was designed to carry out a serologic investigation of canine brucellosis by using agar gel immunodiffusiontest in the Rio de Janeiro city. External and internal antigens of B. canis and B. ovis were previously prepared and a commercialkit used for canine brucellosis diagnosis, was also employed. Random samples of 316 dogs were examined. Eight samples (2,53 percent) were positive by using external antigen of B. canis and B. ovis. Seven samples (2,2 percent) were positive using the commercialantigen also, and three samples (0,95 percent) were positive for all the antigens employed. External and internal antigens must beused for early detection and accurate results, respectively.

Brucelose canina: obtenção de antígenos e avaliação pela técnica de imunodifusão em gel de sacarose / Canine Brucellosis: antigen obtention and evaluation by Agar Gel Immunodiffusion

Cães com brucelose causada por arucella canis apresentam poucos sinais importantes de doença sistêmica e nenhum deles especifico para brucelose. Devido às limitações dos procedimentos bacteriológicos, casos suspeitos devem ser avaliados sorologicamente. O objetivo deste estudo foi avaliar a utilização de antigenos externos e internos de arucella canis e de arucella ovis, pelo teste de imunodifusão em gel de agarose (IOGA). Antigenos externos e internos foram extraidos por solução salina tamponada e fosfatada (PBS) a quente a partir das cepas RM 6/66 de arucella canis e REO 198 de arucella ovis cultivadas em Ágar e Caldo Tripticase soja (Meio de Castaneda). Os antigenos externos foram obtidos após centrifugação e concentração do sobrenadante por ultrafiltração. Simultaneamente os sedimentos foram submetidos ao ultra-som e centrifugados sendo a porção sobrenadante considerado o extrato cru sonicado de a. canis e de a. ovis (antigeno interno). Soro hiperimune anti a. canis e anti a. ovis foram obtidos por inoculação intraperitoneal em coelhos (a. canis e a. ovis ), em cadela (a. canis) e em ovelha (a. ovis ) sendo utilizados como controles positivos na avaliação diagnóstica. Para referenciar os antigenos produzidos utilizou-se, ainda, soros de cães provenientes de um canil comercial localizado no Rio de Janeiro, RJ, suspeito de infecção brucélica pela ocorrência de abortos e natimortos. Houve resposta sorológica aos antigenos obtidos e a enfermidade foi confirmada por isolamento do agente etiológico, a partir de hemoculturas, em três animais do canil. Concluiu¬se que os antigenos externos apresentaram melhor resposta em animais experimentalmente inoculados e em naturalmente infectados, mas a confirmação deve ser feita com o antigeno sonicado