Partial Correlation Between Phenotypic and Genotypic Antimicrobial Resistance of Salmonella enterica Serovar Enteritidis Strains from Brazil.

Whole-genome sequencing analyses have provided important data and information on the repertoire of resistance genes in several bacterial species. This study examined to what extent the antimicrobial resistance genes found in a set of whole-genome-sequenced Salmonella Enteritidis strains from Brazil correlated with the phenotypic antimicrobial resistance possibly related to these genes. The genotypic resistance data from the strains studied were compared with publicly available data from strains isolated in other countries. The genotypic resistance profiles were accessed on the NCBI Pathogen Detection website, and the phenotypic resistance profiles were determined by the disk diffusion technique according to the Clinical and Laboratory Standards Institute guidelines. Fourteen of the 256 sequenced strains presented antimicrobial resistance genes, with the highest prevalence of resistance genes to aminoglycosides-with 16 genes detected in seven strains-not only in Brazilian strains but also in the strains from other parts of the world. The strongest correlation between phenotypic and genotypic resistance was found for tetracycline (75%). The genotypic and phenotypic profiles of the S. Enteritidis strains studied only partially matched, and they diverged in some antimicrobial classes more strongly than in other classes. The advances on whole-genome sequencing analyses associated with a better understanding of the correlation between phenotypic and genotypic resistance data may improve this powerful tool for antimicrobial resistance prediction.

Comparison of four molecular methods to type Salmonella Enteritidis strains.

This study compared the pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), enterobacterial repetitive intergenic consensus-PCR (ERIC-PCR), multilocus variable-number of tanden-repeat analysis (MLVA), and multilocus sequence typing (MLST) methods for typing 188 Salmonella Enteritidis strains from different sources isolated over a 24-year period in Brazil. PFGE and ERIC-PCR were more efficient than MLVA for subtyping the strains. However, MLVA provided additional epidemiological information for those strains. In addition, MLST showed the Brazilian strains as belonging to the main clonal complex of S. Enteritidis, CC11, and provided the first report of two new STs in the S. enterica database but could not properly subtype the strains. Our results showed that the use of PFGE or ERIC-PCR together with MLVA is suitable to efficiently subtype S. Enteritidis strains and provide important epidemiological information.

Quantificação de Salmonella spp. e avaliação dos dizeres de rotulagem de carcaças de frango congeladas comercializadas no Estado de São Paulo / Quantification of Salmonella spp. and evaluation of label information of frozen chicken carcasses on retail sale in the State of São Paulo

Mundialmente, não existem medidas efetivas de controle na produção primária que possam garantir a eliminação da Salmonella em carnes de aves cruas, sendo estes produtos os principais veiculadores do patógeno ao homem. Devido às limitações tecnológicas, a Agência Nacional de Vigilância Sanitária (Anvisa) excluiu a obrigatoriedade da pesquisa de Salmonella em carnes in natura de aves e instituiu a Resolução RDC n° 13, de 02/01/01, que faz referência à exigência de dizeres na rotulagem, visando a instruir o consumidor sobre o uso, o preparo e a conservação adequada destes produtos. Os objetivos do trabalho foram avaliar a presença e quantificação de Salmonella spp. e avaliar os dizeres de rotulagem de carcaças congeladas de frango comercializadas no Estado de São Paulo, no período de setembro/2004 a junho/2006. Foram analisados 72 lotes, totalizando 360 unidades amostrais, de 26 diferentes marcas. A presença de Salmonella foi verificada em 13,9% das amostras e a quantificação variou de <0,03 a 2,3x103 NMP/g, reforçando a importância da aplicação da RDC n° 13/01 para prevenção da ocorrência de surtos associados a esse patógeno. Quanto à rotulagem, 60% das amostras estavam em desacordo com a Resolução e 79% com a Instrução Normativa n° 22/05, Lei n° 10.674/03 e Portaria n° 1.004/98, mostrando a necessidade da adequação dos dizeres de rotulagem destes produtos visando à proteção da saúde dos consumidores.

Distribution of virulence profiles related to new toxins and putative adhesins in Shiga toxin-producing Escherichia coli isolated from diverse sources in Brazil.

The distribution of virulence markers related to cytolethal distending toxin-V (CDT-V), subtilase cytotoxin (SubAB), the enterohemorrhagic Escherichia coli factor for adherence (Efa1), the adhesin similar to IrgA (Iha), the long polar fimbriae (LpfO113), the autoagglutinating adhesin (Saa), and the protein required for full expression of adherence of O157:H7 Sakai strain (ToxB) was investigated in 121 Shiga toxin-producing E. coli (STEC) strains isolated in Brazil. STEC strains were isolated from human infections (n=49), cattle (n=68) and ground meat samples (n=4). Overall, the lpfA(O113), iha, efa1, saa, and toxB sequences were observed in 89.2%, 87.6%, 47.1%, 43%, and 13.2% of the strains, respectively. The genes efa1 (96.6%) and toxB (27%) were only identified among eae-positive strains, while saa (83.8%), cdt-V (12.9%), and subAB (48.4%) just occurred in eae-negative STEC strains. STEC strains harboring cdt-V and subAB were for the first time described in the South American subcontinent. In addition, the simultaneous presence of cdt-V and subAB has not been previously reported, nor the presence of subAB in STEC O77, O79, O105, O174, and O178 serogroups. A diversity of virulence profiles was observed among the STEC strains studied. The most prevalent profile observed among eae-positive STEC strains mainly isolated from humans was eae efa1 iha lpfA(O113), whereas iha lpfA(O113) saa ehxA subAB prevailed among eae-negative STEC strains, mostly isolated from cattle and foods.

[Evaluation of the contamination of lettuce crops after the establishment of the monitoring system in Ribeirão Preto, SP]. / Avaliação da contaminação de hortas produtoras de verduras após a implantação do sistema de fiscalização em Ribeirão Preto, SP.

This study evaluated the microbiological and parasitological contamination of 88 market gardens producing green vegetables, of which 47 had been investigated previously. The contamination rate was 38.3% in the market gardens previously evaluated and 43.9% in the new market gardens. Food safety requires a continuous and efficient sanitary surveillance system for market gardens.

Avaliação da contaminação de hortas produtoras de verduras após a implantação do sistema de fiscalização em Ribeirão Preto, SP / Evaluation of the contamination of lettuce crops after the establishment of the monitoring system in Ribeirao Preto, SP

O estudo avaliou a contaminação microbiológica e parasitológica de 88 hortas produtoras de verduras, das quais 47 haviam sido investigadas anteriormente. A taxa de contaminação foi de 38,3 por cento nas hortas previamente investigadas e de 43,9 por cento nas novas hortas. A segurança alimentar requer um contínuo e eficiente sistema de vigilância sanitária das hortas.

This study evaluated the microbiological and parasitological contamination of 88 market gardens producing green vegetables, of which 47 had been investigated previously. The contamination rate was 38.3 percent in the market gardens previously evaluated and 43.9 percent in the new market gardens. Food safety requires a continuous and efficient sanitary surveillance system for market gardens.

[Analysis of the vegetable productive chain in Ribeirão Preto, SP]. / Análise da cadeia de produção de verduras em Ribeirão Preto, SP.

With the aim of assessing the cumulative risk of lettuce contamination, 45 production chains were investigated. The presence of thermotolerant coliforms, Salmonella and/or parasites was detected in 69% of these, in all steps of the production chain. Quality control in all steps of the lettuce production process should be intensified.

Análise da cadeia de producão de verduras em Ribeirão Preto, SP / Analysis of the vegele productive chain in Ribeirão Preto, SP

Com o objetivo de avaliar o risco cumulativo de contaminacão de hortalicas, investigou-se 45 cadeias produtoras. Foi detectada a presenca de coliformes a 45ºC, Salmonella e/ou parasitas em 69 por cento delas, em todas as etapas de producão. Ressalta-se a necessidade de se intensificar o controle de qualidade ao longo da cadeia produtiva.

Avaliaçäo da qualidade físico-química e microbiológica do leite pasteurizado proveniente de mini e micro-usinas de beneficiamento da regiäo de Ribeiräo Preto/SP / Physicochemical and microbiological quality evaluation of the pasteurized milk processed by mini and microprocessing lants of the area of Ribeiräo Preto, State of Säo Paulo - Brazil

Foram analisadas, de 1995 a 1998, 390 amostras de leite (123 tipo C, 86 tipo B, e 181 tipo Integral) provenientes de dezesseis mini e micro-usinas da regiäo de Ribeiräo Preto/SP. Dentre essas usinas, dez foram submetidas a um estudo longitudinal, ou seja, as amostras de leite foram analisadas durante 4 anos, sendo que cada ano correspdeu a um período. Os estabelecimentos foram fiscalizados por um médico veterinário do Serviço de Inspeçäo de Säo Paulo que, mediante os resultados das análises de leite, orientava os responsáveis pelas usinas. Dentre o total de amostras estudadas, observou-se que estavam em desacordo com os padröes físico-químicos e microbiológicos, estabelecidos pela legislaçäo em vigor, 15,5 por cento e 32,5 por cento do tipo C; 37,2 por cento e 32,6 por cento do leite tipo B e 30,9 por cento e 31,0 por cento do tipo Integral, respectivamente. Na avaliaçäo das dez mini e micro-usinas estudadas durante os 4 anos observou-se, quanto a qualidade microbiológica, que o leite tipo B apresentou uma melhora a partir do terceiro período de estudo; o de tipo Integral também no terceiro período e depois manteve níveis um pouco mais altos no decorrer do estudo. Os dados mostraram que a fiscalizaçäo e orientaçäo resultaram em uma maior adequaçäo nas condiçöes higiênico-sanitárias do leite. O mesmo näo foi observado em relaçäo às características físico-químicas. (AU)

The objective of this research was to investigate the physicochemical and microbiological quality of pasteurized milk processed by mini and microprocessing plants of the area of Ribeirão Preto, State of São Paulo, Brazil. The total of 390 samples of pasteurized milk types C,B and whole were analyzed for their physicochemical and microbiological conditions. Ten of this mini and microprocessing plants were submmited a longitudinal study, and their milk samples were analized during four years. These factories were supervised by a veterinary of the Agricultural Secretary of São Paulo State who guided each responsible for factory about the results of the milk analises. The microbiological analysis showed that 32.5% of 123 samples of type C milk, 32.6% of 86 samples of type B milk and 31.0% of 181 samples of whole milk did not comply with the legal standards established by the Brasilian legislation. By the physicochemical analysis 15.5%, 37.2% e 30.9%, respectively, did not comply with legal standards in Brazil. Salmonella were negative in all samples. The evaluation of ten mini and microprocessing plants showed that the microbiological quality of the type B milk has a improved in the last two years, the type C milk showed an improvement only in the second year of the study and the type whole milk showed a significant improvement in the third period of study. The results of this study showed that the inspection and guidance resulted in improvement of the sanitary-hygienic quality of these products. (AU)

Fiscalizaçäo de hortas produtoras de verduras do município de Ribeiräo Preto, SP / Monitoring of lettuce crops of Ribeiräo Preto, SP, Brazil

O consumo de verduras cruas desempenha importante papel na transmissäo de várias doenças infecciosas pela freqüente prática de irrigaçäo de hortas com água contaminada. O objetivo deste estudo é a avaliaçäo das condiçöes higiênico-sanitárias de todas as hortas produtoras de verduras de Ribeiräo Preto, SP com implantaçäo de um sistema de fiscalizaçäo. A análise laboratorial de 129 hortas revelou irregularidades em 20,1 por cento delas, destacando-se elevada concentraçäo de coliformes fecais em 17 por cento, presença de Salmonella em 3,1 por cento e de vários enteroparasitas (Ascaris sp, Ancylostomidae, Strongyloides sp, Hymenolepis nana e Giardia sp) em 13,1 por cento. A repetiçäo da análise das hortas irregulares determinou a interdiçäo definitiva de uma delas; todas as demais foram aprovadas, comprovando a eficácia do sistema de fiscalizaçäo, particularmente com a implantaçäo, inédita no país, do cerificado de vistoria sanitária