Assuntos
Cromossomos Humanos/genética , Cromossomos/genética , Pan troglodytes/genética , Substituição de Aminoácidos , Animais , Sequência de Bases , DNA/genética , Evolução Molecular , Expressão Gênica , Genoma , Genoma Humano , Humanos , Dados de Sequência Molecular , Regiões Promotoras Genéticas , Proteínas/genética , Receptor de Interferon alfa e beta , Receptores de Interferon/genética , Homologia de Sequência do Ácido Nucleico , Especificidade da EspécieRESUMO
We converted the small homodimeric four-helix bundle repressor of primer protein (Rop) into a monomeric four-helix bundle by introduction of connecting loops. Both left- and right-handed four-helix bundles were produced. The left-handed bundles were more stable and were used to introduce biologically interesting peptides in one of the loops.
Assuntos
Proteínas de Bactérias/química , Proteínas de Ligação a RNA/química , Sequência de Aminoácidos , Cromatografia em Gel , Escherichia coli/metabolismo , Modelos Moleculares , Dados de Sequência Molecular , Peptídeos/química , Conformação Proteica , Dobramento de Proteína , Estrutura Secundária de ProteínaRESUMO
Listeria monocytogenes is a food-borne pathogen with a high mortality rate that has also emerged as a paradigm for intracellular parasitism. We present and compare the genome sequences of L. monocytogenes (2,944,528 base pairs) and a nonpathogenic species, L. innocua (3,011,209 base pairs). We found a large number of predicted genes encoding surface and secreted proteins, transporters, and transcriptional regulators, consistent with the ability of both species to adapt to diverse environments. The presence of 270 L. monocytogenes and 149 L. innocua strain-specific genes (clustered in 100 and 63 islets, respectively) suggests that virulence in Listeria results from multiple gene acquisition and deletion events.
Assuntos
Proteínas de Bactérias/genética , Genoma Bacteriano , Listeria monocytogenes/genética , Listeria/genética , Adaptação Fisiológica , Motivos de Aminoácidos , Bacillus subtilis/genética , Proteínas de Bactérias/química , Proteínas de Bactérias/fisiologia , Composição de Bases , Proteínas de Transporte/química , Proteínas de Transporte/genética , Cromossomos Bacterianos/genética , DNA Bacteriano/química , DNA Bacteriano/genética , Transferência Genética Horizontal , Genes Bacterianos , Genômica , Listeria/química , Listeria/fisiologia , Listeria monocytogenes/química , Listeria monocytogenes/patogenicidade , Listeria monocytogenes/fisiologia , Proteínas de Membrana/química , Proteínas de Membrana/genética , Análise de Sequência de DNA , Staphylococcus aureus/genética , Fatores de Transcrição/química , Fatores de Transcrição/genética , Virulência/genéticaRESUMO
We have sequenced a region containing 32.5 kb of the right arm of chromosome IV of Saccharomyces cerevisiae. Twenty open reading frames (ORFs) greater than 100 amino acids could be identified in this region. Six ORFs correspond to known yeast genes, including DOA4, UBC5 and UBC3, the gene products of which are involved in ubiquitin metabolism. UBC5 is preceded by the two tRNA genes tRNA-Arg2 and tRNA-Asp. Six genes were discovered with homologies to non-yeast genes or with homologies to other yeast ORFs. One of these could be identified as ribosomal protein gene RPS13. The putative function of eight ORFs remains unclear because comparison to different DNA or protein databases revealed no significant patterns. The sequence from cosmid 2F21 was obtained entirely by a combined subcloning and walking primer strategy, and has been deposited in the EMBL data library under Accession Number X84162.
