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Structure ; 19(2): 265-76, 2011 Feb 09.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-21300294

RESUMO

PKA holoenzymes containing two catalytic (C) subunits and a regulatory (R) subunit dimer are activated cooperatively by cAMP. While cooperativity involves the two tandem cAMP binding domains in each R-subunit, additional cooperativity is associated with the tetramer. Of critical importance is the flexible linker in R that contains an inhibitor site (IS). While the IS becomes ordered in the R:C heterodimer, the overall conformation of the tetramer is mediated largely by the N-Linker that connects the D/D domain to the IS. To understand how the N-Linker contributes to assembly of tetrameric holoenzymes, we engineered a monomeric RIα that contains most of the N-Linker, RIα(73-244), and crystallized a holoenzyme complex. Part of the N-linker is now ordered by interactions with a symmetry-related dimer. This complex of two symmetry-related dimers forms a tetramer that reveals novel mechanisms for allosteric regulation and has many features associated with full-length holoenzyme. A model of the tetrameric holoenzyme, based on this structure, is consistent with previous small angle X-ray and neutron scattering data, and is validated with new SAXS data and with an RIα mutation localized to a novel interface unique to the tetramer.


Assuntos
Subunidade RIalfa da Proteína Quinase Dependente de AMP Cíclico/metabolismo , AMP Cíclico/metabolismo , Holoenzimas/metabolismo , Subunidades Proteicas/metabolismo , Regulação Alostérica , Sequência de Aminoácidos , Animais , Domínio Catalítico , Subunidade RIalfa da Proteína Quinase Dependente de AMP Cíclico/química , Subunidade RIalfa da Proteína Quinase Dependente de AMP Cíclico/genética , Ativação Enzimática , Expressão Gênica , Holoenzimas/química , Holoenzimas/genética , Humanos , Cinética , Modelos Moleculares , Dados de Sequência Molecular , Mutação , Ligação Proteica , Conformação Proteica , Multimerização Proteica , Subunidades Proteicas/química , Subunidades Proteicas/genética , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/genética , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Espalhamento a Baixo Ângulo , Homologia de Sequência de Aminoácidos , Difração de Raios X
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