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Nat Chem Biol ; 12(12): 1097-1104, 2016 Dec.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27775716

RESUMO

Proteins of the bromodomain and extraterminal (BET) family, in particular bromodomain-containing protein 4 (BRD4), are of great interest as biological targets. BET proteins contain two separate bromodomains, and existing inhibitors bind to them monovalently. Here we describe the discovery and characterization of probe compound biBET, capable of engaging both bromodomains simultaneously in a bivalent, in cis binding mode. The evidence provided here was obtained in a variety of biophysical and cellular experiments. The bivalent binding results in very high cellular potency for BRD4 binding and pharmacological responses such as disruption of BRD4-mediator complex subunit 1 foci with an EC50 of 100 pM. These compounds will be of considerable utility as BET/BRD4 chemical probes. This work illustrates a novel concept in ligand design-simultaneous targeting of two separate domains with a drug-like small molecule-providing precedent for a potentially more effective paradigm for developing ligands for other multi-domain proteins.


Assuntos
Proteínas Nucleares/antagonistas & inibidores , Proteínas Nucleares/química , Domínios Proteicos/efeitos dos fármacos , Bibliotecas de Moléculas Pequenas/farmacologia , Fatores de Transcrição/antagonistas & inibidores , Fatores de Transcrição/química , Apoptose/efeitos dos fármacos , Proteínas de Ciclo Celular , Linhagem Celular Tumoral , Proliferação de Células/efeitos dos fármacos , Cristalografia por Raios X , Relação Dose-Resposta a Droga , Humanos , Ligantes , Modelos Moleculares , Estrutura Molecular , Proteínas Nucleares/metabolismo , Bibliotecas de Moléculas Pequenas/química , Relação Estrutura-Atividade , Especificidade por Substrato , Fatores de Transcrição/metabolismo
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