Multiple introductions followed by ongoing community spread of SARS-CoV-2 at one of the largest metropolitan areas in the Northeast of Brazil

The emergence of SARS-CoV-2 in the human population has caused a huge pandemic that is still unfolding in many countries around the world. Multiple epicenters of the pandemic have emerged since the first pneumonia cases in Wuhan, first in Italy followed by the USA and Brazil. Up to now, Brazil is the second most affected country, however, genomic sequences of SARS-CoV-2 strains circulating in the country are restricted to some highly impacted states. Although the Pernambuco state, located in the Northeast Region, is the sixth most affected brazilian state and the second considering lethality rate, there is a lack of high quality genomic sequences from the strains circulating in this region. Here, we sequenced 38 strains of SARS-CoV-2 from patients presenting Covid-19 symptoms. Phylogenetic reconstructions revealed that three lineages were circulating in the state and 36 samples belong to B1.1 lineage. We detected two introductions from European countries and five clades, corroborating the community spread of the virus between different municipalities of the state. Finally, we detected that all except one strain showed the D614G spike protein amino acid change that may impact virus infectivity in human cells. Our study brought new light to the spread of SARS-CoV-2 strains in one of the most heavily impacted states of Brazil.

Desenvolvimento de um sistema de garantia da qualidade para os produtos químicos e meios de cultura utilizados em um departamento da FIOCRUZ-PE: uma proposta de gestão e a elaboração de um software / Development of a quality assurance system for chemicals and culture media used in a department of the FIOCRUZ-PE: a proposal management and development of a software

Este trabalho teve como objetivo criar um plano de gerenciamento e controle da qualidade dos produtos químicos e meios de cultura utilizados nas pesquisas do Departamento de Microbiologia do Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, a FIOCRUZ-PE. Para isto foi realizado um estudo qualitativo prospectivo, que permitiu preparar um plano de ação para o processo de implantação de um sistema de garantia da qualidade dos insumos utilizados em um laboratório de pesquisas, analisando a viabilidade e os impactos deste processo, sob vários aspectos. O projeto teve a participação do pessoal envolvido nas pesquisas em andamento no Departamento (servidores e colaboradores: alunos). Os participantes foram recrutados através de e-mails ficando dessa maneira registradas as solicitações e as respostas obtidas. Para o trabalho foram selecionados alguns produtos químicos e meios de cultura utilizados; escolhidos e padronizados protocolos para pré-teste dos produtos; registrados problemas técnicos e organizacionais detectados e estabelecidos potenciais indicadores da qualidade. Esses dados subsidiaram o desenvolvimento de um sistema de informação, para gerenciamento da qualidade, como ferramenta para registro, rastreabilidade e avaliação de indicadores através de um software. Este software foi desenvolvido em colaboração com o serviço de informática (SEINFO), e nomeado GGQ (Gestão e Garantia da Qualidade) e já está operante e disponível na página eletrônica da FIOCRUZ-PE. O programa da garantia da qualidade resultante desse trabalho mostrou, através dos números, um panorama das atividades e as medidas a serem tomadas para melhoria e controle, em relação aos itens analisados. Com base nesses resultados pode-se constatar que o Departamento dispõe de uma ferramenta gerencial da qualidade dos produtos químicos e dos componentes dos meios de cultura, capaz de controlar e gerar indicadores da qualidade. Esta ferramenta também poderá fornecer subsídios para aquisição de insumos adequados aos trabalhos.