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1.
PLoS One ; 1: e115, 2006 Dec 27.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-17205119

RESUMO

BACKGROUND: Aeromonas sp. can now be considered relatively common enteropathogens due to the increase of diseases in humans. Aeromonas culicicola is a gram negative rod-shaped bacterium isolated for the first time from the mosquito mid-gut, but subsequently detected in other insects and waters also. Our previous study discovered that A. culicicola harbors three plasmids, which we designated as pAc3249A, pAc3249B and pAc3249C. We investigated and report here the existence and genetic organization of a Conjugal Type IV Secretion System (TFSS) in pAc3249A. METHODOLOGY/PRINCIPLE FINDING: The complete operon is 11,061 bp in length and has G+C content of 47.20% code for 12 ORFs. The gene order and orientation were similar to those found in other bacteria with some differences. We have designated this system as AcTra for Aeromonas culicicola transfer system. BLAST results of ORFs and phylogenetic analysis showed significant similarity towards the respective proteins of the IncI2 plasmid R721 of E. coli. Other bioinformatics studies have been performed to predict conserved motifs/domains, signal peptides, transmembrane helices, etc. of the ORFs. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: BLAST results of ORFs and phylogenetic analysis showed significant similarity towards the respective proteins of the IncI2 plasmid R721 of E. coli.


Assuntos
Aeromonas/genética , Conjugação Genética , Aeromonas/isolamento & purificação , Aeromonas/patogenicidade , Aeromonas/fisiologia , Animais , Proteínas de Bactérias/genética , Proteínas de Bactérias/fisiologia , Composição de Bases , Conjugação Genética/fisiologia , Escherichia coli/genética , Proteínas de Fímbrias/genética , Proteínas de Fímbrias/fisiologia , Infecções por Bactérias Gram-Negativas/etiologia , Humanos , Nucleosídeo-Trifosfatase/genética , Nucleosídeo-Trifosfatase/fisiologia , Fases de Leitura Aberta , Óperon , Filogenia , Plasmídeos/genética , Especificidade da Espécie
2.
Microbiol Immunol ; 49(10): 909-14, 2005.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-16237268

RESUMO

The polymorphism of the 18S rRNA gene in Wuchereria bancrofti microfilariae (mf) collected from three different zones in India was analyzed by polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP). The RFLPs of the amplified products obtained after digestion with restriction enzymes Ssp I, Msp I and Hha I showed no difference in the banding patterns among the mf isolates from different endemic zones. Further the sequencing of PCR products did not show any difference in the nucleotide sequence either. The phylogenetic analysis of the sequences of W. bancrofti mf isolates from different endemic zones has shown branching with the earlier reported sequences of W. bancrofti and its close relative Brugia malayi.


Assuntos
DNA Ribossômico/genética , Genes de RNAr , Polimorfismo Genético , RNA Ribossômico 18S/genética , Wuchereria bancrofti/genética , Animais , Brugia Malayi/genética , DNA/metabolismo , Desoxirribonuclease HpaII/metabolismo , Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II/metabolismo , Doenças Endêmicas , Filariose/parasitologia , Genes de Helmintos , Humanos , Índia , Epidemiologia Molecular , Dados de Sequência Molecular , Filogenia , Reação em Cadeia da Polimerase , Polimorfismo de Fragmento de Restrição , Análise de Sequência de DNA , Homologia de Sequência do Ácido Nucleico , Wuchereria bancrofti/isolamento & purificação
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