The Emergence of Carbapenem- and Colistin-Resistant Enterobacteria in Senegal.

Antibiotic resistance is a public health problem. The emergence of carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) infections is a concern, particularly in Senegal. (1) Methods: Between January 2019 and July 2022, 240 isolates of enterobacteria resistant to third-generation cephalosporins and imipenem from biological samples from Fann Hospital (Dakar) and Hôpital Paix (Ziguinchor) were selected. The isolates were identified by MALDI-TOF mass spectrometry, and susceptibility tests were performed by the disk diffusion method. Antibiotic-resistance genes for class A beta-lactamases, carbapenemases, and plasmid resistance to colistin resistance (mcr-1-8) were screened by RT-PCR. (2) Results: The 240 enterobacteria were composed of: Escherichia coli (60.83%), Klebsiella pneumoniae (21.67%), Enterobacter cloacae (13.75%), Citrobacter freundii (2.08%), Serratia marcescens (0.83%), Klebsiella aerogenes (0.42%), and Proteus mirabilis (0.42%). Class A beta-lactamase genes were found in 229 isolates (70.41% blaTEM, 37.5% blaSHV, 83.75% blaCTX-A, and 0.42% blaCTX-B). The carbapenemase genes blaOXA-48 and blaNDM were found in 25 isolates, including 14 isolates with blaOXA-48, 13 isolates with blaNDM, and 2 isolates with both genes simultaneously. The mcr-8 gene was found in one isolate of E. cloacae. (3) Conclusions: The epidemiology of antibiotic-resistance genes in enterobacteria in Senegal shows the emergence of CPEs. This phenomenon is worrying, and rigorous surveillance is necessary to avoid further spread.

Caractérisation phénotypique des bétalactamases de souches d'enterobacteries multi résistantes isolées de divers produits pathologiques

Introduction: Les entérobactéries constituent les principales causes d'infections bactériennes.Ce sont des Bactéries Multi- résistantes (BMR)fréquentes par production de BLSE(Bêtalactamases à spectre élargi).Ceci constitue un problème de santé publique majeur car cette résistance est à l'origine d'une impasse thérapeutique et conduit à une prescriptiond'antibiotiques à large spectre (carbapénèmes). Notre étude prospective allant du 01 janvier au 31 décembre 2017 a porté sur 50 souches d'entérobactéries isolées au laboratoire et a pour but de caractériser les types de bêtalactamases.Méthodologie : Les souches ont été ré-isolées d'abord sur milieu Mueller Hinton, ensuite identifiées par la morphologie et les caractères biochimiques des entérobactéries. Les méthodes suivantes ont été réalisées pour la mise en évidence des classes de BLSE. - Méthode de rapprochement des disques (synergie entre un disque Amoxicilline + Acide clavulanique (AMC) et les disques de Céphalosporine de 3ieme (C3G) : BLSE de classe A. - Méthode de Dongeun Yong et al. utilisant l'EDTA (Ethylène Diamine Tétra-acétique) 0,5 M, PH 7 (Inhibition du zinc présent sur le site actif de l'enzyme par l'EDTA): BLSE de classe B. Résultat : Les souches d'entérobactéries étaient réparties ainsi : Enterobacter spp : 40%, Escherichia coli : 32%, Klebsiella pneumoniae : 24% et Klebsiella oxytoca : 4%. Cinquante-six pour cent 56% des souches produisaient une BLSE de classe A (image « bouchon de champagne ») et 14% une BLSE de classe B avec restauration de l'activité de l'imipenème après association de l'EDTA. Enterobacter spp était la souche la plus représentée avec 12 souches sécrétrices d'une BLSE de classe A et 5 souches de classe B, suivie d'E. coli avec 08 souches sécrétrices d'une BLSE de classe A et 01 souche de classe B. K. pneumoniae et K. oxytoca comptaient respectivement 06 et 02 souches sécrétrices de BLSE de classe A. Conclusion : L'acquisition par les entérobactéries et la transmission de résistance, par production de BLSE de classe A ou B est un problème majeur de santé publique causant une véritable impasse thérapeutique. Aujourd'hui, la prévalence de la résistance par production de Métallo-bêtalactamase (MBL) est faible comparée à celle de BLSE de classe A. Ainsi, des stratégies de diagnostic et de maîtrise de la diffusion doivent être appliquées rigoureusement

Caractérisation phénotypique des betalactamases de souches d'entérobactéries multirésistantes isolées de divers produits pathologiques

Introduction : Les entérobactéries constituent les principales causes d'infections bactériennes. Ce sont des Bactéries Multirésistantes (BMR) fréquentes par production de BLSE (Bêtalactamases à spectre élargi). Ceci constitue un problème de santé publique majeur car cette résistance est à l'origine d'une impasse thérapeutique et conduit à une prescription d'antibiotiques à large spectre (carbapénèmes).Notre étude prospective allant du 01 janvier au 31 décembre 2017 a porté sur 50 souches d'entérobactériesisolées au laboratoire et a pour but de caractériser les types de bêtalactamases. Méthodologie : Les souches ont été ré-isolées d'abord sur milieu Mueller Hinton, ensuite identifiées par la morphologie et les caractères biochimiques des entérobactéries. Les méthodes suivantes ont été réalisées pour la mise en évidence des classes de BLSE. - Méthode de rapprochement des disques (synergie entre un disque Amoxicilline + Acide clavulanique (AMC) et les disques de Céphalosporine de 3ieme (C3G) : BLSE de classe A. - Méthode de Dongeun Yong et al. utilisant l'EDTA (Ethylène Diamine Tétra-acétique) 0,5 M, PH 7 (Inhibition du zinc présent sur le site actif de l'enzyme par l'EDTA): BLSE de classe B. Résultat : Les souches d'entérobactéries étaient réparties ainsi : Enterobacter spp : 40%, Escherichia coli : 32%, Klebsiella pneumoniae : 24% et Klebsiella oxytoca : 4%. Cinquante-six pour cent 56% des souches produisaient une BLSE de classe A (image « bouchon de champagne ») et 14% une BLSE de classe B avec restauration de l'activité de l'imipenème après association de l'EDTA. Enterobacter spp était la souche la plus représentée avec 12 souches sécrétrices d'une BLSE de classe A et 5 souches de classe B, suivie d'E. coli avec 08 souches sécrétrices d'une BLSE de classe A et 01 souche de classe B. K. pneumoniae et K. oxytoca comptaient respectivement 06 et 02 souches sécrétrices de BLSE de classe A. Conclusion : L'acquisition par les entérobactéries et la transmission de résistance, par production de BLSE de classe A ou B est un problème majeur de santé publique causant une véritable impasse thérapeutique. Aujourd'hui, la prévalence de la résistance par production de Métallo-bêtalactamase (MBL) est faible comparée à celle de BLSE de classe A. Ainsi, des stratégies de diagnostic et de maîtrise de la diffusion doivent être appliquées rigoureusement

First Description of the Extended Spectrum-Beta-Lactamase Gene blaCTX-M-109 in Salmonella Grumpensis Strains Isolated from Neonatal Nosocomial Infections in Dakar, Senegal.

Nosocomial infections are very common in African hospitals, particularly in neonatal units. These infections are most often caused by bacteria such as Escherichia coli, Klebsiella spp and Staphylococcus spp. Salmonella strains are rarely involved in nosocomial infections. Here, we report the first description of S. Grumpensis in neonatal infections in Senegal. Seventeen Salmonella strains were isolated from hospitalized infants' stool samples. The following resistance phenotype was described in strains: AMXRTICRCFR FOXRCFXRCTXRCAZRIMPSATMRNARNORRCIPRTMRGMRTERSXTR. All isolates were susceptible to imipenem, 15 out of 17 produced an extended spectrum ß-lactamase (ESBL). blaOXA-1, blaSHV-1, blaTEM-1, blaCTX-M1 genes were detected in strains 8, 13, 5 and 8, respectively. blaCTX-M1 sequencing revealed the presence of blaCTX-M-109. Thirteen of the 17 Salmonella Grumpensis strains were analyzed by PFGE. These 13 isolates belonged to a single pulsotype and were genotypically identical. This is the first report of neonatal S. Grumpensis infections in Senegal, and the first report of blaCTX-M-109 in the genus Salmonella.