Nested pool testing strategy for the diagnosis of infectious diseases.

The progress of the SARS-CoV-2 pandemic requires the design of large-scale, cost-effective testing programs. Pooling samples provides a solution if the tests are sensitive enough. In this regard, the use of the gold standard, RT-qPCR, raises some concerns. Recently, droplet digital PCR (ddPCR) was shown to be 10-100 times more sensitive than RT-qPCR, making it more suitable for pooling. Furthermore, ddPCR quantifies the RNA content directly, a feature that, as we show, can be used to identify nonviable samples in pools. Cost-effective strategies require the definition of efficient deconvolution and re-testing procedures. In this paper we analyze the practical implementation of an efficient hierarchical pooling strategy for which we have recently derived the optimal, determining the best ways to proceed when there are impediments for the use of the absolute optimum or when multiple pools are tested simultaneously and there are restrictions on the throughput time. We also show how the ddPCR RNA quantification and the nested nature of the strategy can be combined to perform self-consistency tests for a better identification of infected individuals and nonviable samples. The studies are useful to those considering pool testing for the identification of infected individuals.

Roughening and inclination of competition interfaces.

We study the competition interface between two clusters growing over a random vacant sector of the plane in a simple setup which allows us to perform formal computations and obtain analytical solutions. We demonstrate that a phase transition occurs for the asymptotic inclination of this interface when the final macroscopic shape goes from curved to noncurved. In the first case it is random while in the second one it is deterministic. We also show that the flat case (stationary growth) is a critical point for the fluctuations: for curved and flat final profiles the fluctuations are in the Kardar-Parisi-Zhang (KPZ) scale (2/3); for noncurve final profile the fluctuations are in the same scale of the fluctuations of the initial conditions, which in our model are Gaussian (1/2).

Angiografía por resonancia magnética con gadolinio versus angiografía convencional en diagnóstico de vasculopatía de miembros inferiores / Gadolinium enhanced magnetic resonance angiography versus conventional angiography for lower extremity arterial disease diagnostic

Evaluar la utilidad y la efectividad de la angiorresonancia magnética con gadolinio (ARM) como método diagnóstico en la patología vascular de miembros inferiores, comparada con la angiografía convencional (ANG). Métodos: Se evaluaron 156 segmentos vasculares (16 pacientes) con ARM, con un resonador Magnetovisión de 1.5 Tesla. En 5 ± 4 días se realizó ANG. Los segmentos arteriales de dividieron en: 28 ilíacos, 32 femorales, 24 tibiales anteriores, 24 tibiales posteriores, 24 peroneos y 24 troncos tibioperoneos. Las lesiones se dividieron en: oclusión total, lesiones mayor igual 70 por ciento y < 70 por ciento de la luz del vaso. Resultados: Ilíacas: con ANG, 4 oclusiones, 8 lesiones mayor menor 70 por ciento y 16 < 70 por ciento. ARM, 4 oclusiones, 11 lesiones mayor igual 70 por ciento y 13 < 70 por ciento (sensibilidad 100 por ciento, especificidad 84,2 por ciento, valor predictivo positivo (VPP) 80 por ciento). Femorales: 9 oclusiones, 6 lesiones mayor igual 70 por ciento y 17 < 70 por ciento por ANG. Con ARM: 9 oclusiones, 7 lesiones mayor igual 70 por ciento y 16 < 70 por ciento (sensibilidad 100 por ciento, especificidad 94,4 por ciento, VPP 93,7 por ciento). Tibiales posteriores por ANG: 11 oclusiones, 2 lesiones mayor igual 70 por ciento y 11 < 70 por ciento. Con ARM: 10 oclusiones, 2 lesiones mayor igual 70 por ciento y 12 < 70 por ciento (sensibilidad 92,8 por ciento, especificidad y VPP 100 por ciento). Tibial anterior: 11 oclusiones, 4 lesiones mayor igual 70 por ciento y 9 < 70 por ciento con ANG. Con ARM: 10 oclusiones, 5 lesiones mayor igual 70 por ciento y 9 < 70 por ciento (sensibilidad, especificidad, VPP 100 por ciento). Peroneos: 7 oclusiones, 2 lesiones mayor igual 70 por ciento y 15 < 70 por ciento con ANG. Ocho oclusiones, 2 lesiones mayor igual 70 por ciento y 14 < 70 por ciento por ARM (sensibilidad 100 por ciento, especificidad 93,7 por ciento, VPP 90 por ciento). Tronco tibioperoneo: 3 oclusiones, 1 lesión mayor menor 70 por ciento y 20 < 70 por ciento ANG versus 3 oclusiones, 1 lesión mayor igual 70 por ciento y 20 < por ARM (sensibilidad, especificidad y VPP 100 por ciento). Conclusiones: La ARM constituye un método seguro y preciso para la detección y la cuantificación de la patología vascular de los miembros inferiores.

Angiografía por resonancia magnética con gadolinio versus angiografía convencional en diagnóstico de vasculopatía de miembros inferiores / Gadolinium enhanced magnetic resonance angiography versus conventional angiography for lower extremity arterial disease diagnostic

Evaluar la utilidad y la efectividad de la angiorresonancia magnética con gadolinio (ARM) como método diagnóstico en la patología vascular de miembros inferiores, comparada con la angiografía convencional (ANG). Métodos: Se evaluaron 156 segmentos vasculares (16 pacientes) con ARM, con un resonador Magnetovisión de 1.5 Tesla. En 5 ± 4 días se realizó ANG. Los segmentos arteriales de dividieron en: 28 ilíacos, 32 femorales, 24 tibiales anteriores, 24 tibiales posteriores, 24 peroneos y 24 troncos tibioperoneos. Las lesiones se dividieron en: oclusión total, lesiones mayor igual 70 por ciento y < 70 por ciento de la luz del vaso. Resultados: Ilíacas: con ANG, 4 oclusiones, 8 lesiones mayor menor 70 por ciento y 16 < 70 por ciento. ARM, 4 oclusiones, 11 lesiones mayor igual 70 por ciento y 13 < 70 por ciento (sensibilidad 100 por ciento, especificidad 84,2 por ciento, valor predictivo positivo (VPP) 80 por ciento). Femorales: 9 oclusiones, 6 lesiones mayor igual 70 por ciento y 17 < 70 por ciento por ANG. Con ARM: 9 oclusiones, 7 lesiones mayor igual 70 por ciento y 16 < 70 por ciento (sensibilidad 100 por ciento, especificidad 94,4 por ciento, VPP 93,7 por ciento). Tibiales posteriores por ANG: 11 oclusiones, 2 lesiones mayor igual 70 por ciento y 11 < 70 por ciento. Con ARM: 10 oclusiones, 2 lesiones mayor igual 70 por ciento y 12 < 70 por ciento (sensibilidad 92,8 por ciento, especificidad y VPP 100 por ciento). Tibial anterior: 11 oclusiones, 4 lesiones mayor igual 70 por ciento y 9 < 70 por ciento con ANG. Con ARM: 10 oclusiones, 5 lesiones mayor igual 70 por ciento y 9 < 70 por ciento (sensibilidad, especificidad, VPP 100 por ciento). Peroneos: 7 oclusiones, 2 lesiones mayor igual 70 por ciento y 15 < 70 por ciento con ANG. Ocho oclusiones, 2 lesiones mayor igual 70 por ciento y 14 < 70 por ciento por ARM (sensibilidad 100 por ciento, especificidad 93,7 por ciento, VPP 90 por ciento). Tronco tibioperoneo: 3 oclusiones, 1 lesión mayor menor 70 por ciento y 20 < 70 por ciento ANG versus 3 oclusiones, 1 lesión mayor igual 70 por ciento y 20 < por ARM (sensibilidad, especificidad y VPP 100 por ciento). Conclusiones: La ARM constituye un método seguro y preciso para la detección y la cuantificación de la patología vascular de los miembros inferiores. (AU)