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Bioorg Chem ; 36(3): 141-7, 2008 Jun.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-18394675

RESUMO

The amino acids involved in substrate (cAMP) binding to human platelet cGMP-inhibited cAMP phosphodiesterase (PDE3A) are identified. Less is known about the inhibitor (cGMP) binding site. We have now synthesized a nonhydrolyzable reactive cGMP analog, Rp-guanosine-3',5'-cyclic-S-(4-bromo-2, 3-dioxobutyl)monophosphorothioate (Rp-cGMPS-BDB). Rp-cGMPS-BDB irreversibly inactivates PDE3A (K(I)=43.4+/-7.2muM and k(cart)=0.007+/-0.0006 min(-1)). The effectiveness of protectants in decreasing the rate of inactivation by Rp-cGMPS-BDB is: Rp-cGMPS (K(d)=72 microM)>Sp-cGMPS (124), Sp-cAMPS (182)>GMP (1517), Rp-cAMPS (3762), AMP (4370 microM). NAD(+), neither a substrate nor an inhibitor of PDE3A, does not protect. Nonhydrolyzable cGMP analogs exhibit greater affinity than the cAMP analogs. These results indicate that Rp-cGMPS-BDB targets favorably the cGMP binding site consistent with a docking model of PDE3A-Rp-cGMPS-BDB active site. We conclude that Rp-cGMPS-BDB is an effective active site-directed affinity label for PDE3A with potential for other cGMP-dependent enzymes.


Assuntos
Marcadores de Afinidade/química , GMP Cíclico/análogos & derivados , Inibidores Enzimáticos/química , Inibidores da Fosfodiesterase 3 , Marcadores de Afinidade/síntese química , Sítios de Ligação , Plaquetas , Nucleotídeo Cíclico Fosfodiesterase do Tipo 3 , Inibidores Enzimáticos/síntese química , Inibidores Enzimáticos/farmacologia , Humanos , Ligação Proteica
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