Influence of 16S rRNA target region on the outcome of microbiome studies in soil and saliva samples.

Next generation sequencing methods are widely used in evaluating the structure and functioning of microbial communities, especially those centered on 16S rRNA subunit. Since Illumina Miseq, the most used sequencing platform, does not allow the full sequencing of 16S rRNA gene, this study aims to evaluate whether the choice of different target regions might affect the outcome of microbiome studies regarding soil and saliva samples. V1V3, V3V4, V4V5 and V6V8 domains were studied, finding that while some regions showed differences in the detection of certain bacterial taxa and in the calculation of alpha diversity, especially in soil samples, the overall effect did not compromise the differentiation of any sample type in terms of taxonomic analysis at the genus level. 16S rRNA target regions did affect the detection of specific bacteria related to soil quality and development, and microbial genera used as health biomarkers in saliva. V1V3 region showed the closest similarity to internal sequencing control mock community B, suggesting it might be the most preferable choice regarding data reliability.

Short-term effects of hyaluronic acid on the subgingival microbiome in peri-implantitis: A randomized controlled clinical trial.

BACKGROUND: The aim of our study was to evaluate the effects of a hyaluronic acid (HA) gel at 45 days on the microbiome of implants with peri-implantitis with at least 1 year of loading. METHODS: A randomized controlled trial was conducted in peri-implantitis patients. Swabs containing the samples were collected both at baseline and after 45 days of treatment. 16S rRNA sequencing techniques were used to investigate the effect of HA gel on the subgingival microbiome. RESULTS: One hundred and eight samples of 54 patients were analyzed at baseline and after follow-up at 45 days. Three strata with different microbial composition were obtained in the samples at baseline, representing three main microbial consortia associated with peri-implantitis. Stratum 1 did not show any difference for any variable after treatment with HA, whereas in stratum 2, Streptococcus, Veillonella, Rothia, and Granulicatella did decrease (P < 0.05). Similarly, Prevotella and Campylobacter (P < 0.05) decreased in stratum 3 after treatment with HA. Microbial diversity was found to be decreased in stratum 3 (P < 0.05) after treatment with HA compared with the control group, in which an increase was found (P < 0.05). CONCLUSIONS: HA reduced the relative abundance of peri-implantitis-related microorganisms, especially the early colonizing bacteria, suggesting a specific action during the first stages in the development of the disease. HA did not alter relative abundances of non-oral genera. The use of HA in advanced stages of peri-implantitis resulted in a decrease in microbial alpha diversity, suggesting a protective action of the peri-implant site against bacteria colonization.

Alta prevalencia de deficiencia de vitamina D en mujeres posmenopáusicas de una consulta reumatológica en Madrid. Evaluación de dos pautas de prescripción de vitamina D / High prevalence of vitamin D deficiency in postmenopausal women in a outpatient rheumatological clinic from Madrid area (Spain). Evaluation of two forms of vitamin D prescription

Fundamento: Se ha descrito una elevada frecuencia de deficiencia de vitamina D en la población senil en Europa, pero hay poca información sobre la prevalencia de deficiencia de esta vitamina en la población posmenopáusica en países mediterráneos. El objetivo de este estudio ha sido valorar su prevalencia en mujeres posmenopáusicas procedentes de una consulta reumatológica y evaluar la vitamina D durante un año tras dos pautas de tratamiento. Pacientes y métodos: Se valoró el 25(OH)D3 (calcidiol) sérico en 171 mujeres posmenopáusicas (111 con osteoporosis y 60 sin ella) procedentes de una consulta de reumatología en Madrid. Un grupo seleccionado de 83 mujeres con concentraciones de calcidiol inferiores a 10 ng/ml fue aleatorizado en dos grupos: al grupo I se le prescribieron 800 U/día de vitamina D3 y 1 g/día de calcio, y al grupo II una dosis de 80.000 U de vitamina D3 en forma de calcidiol, seguida de 800 U/día de vitamina D3 junto a 1 g/día de calcio. El calcidiol se cuantificó por RIA en situación basal y a los 3, 6 y 12 meses de tratamiento. Se establecieron tres puntos de corte: 10, 15 y 20 ng/ml de calcidiol para calcular la prevalencia de deficiencia. Resultados: Los porcentajes de mujeres con deficiencia de vitamina D considerada como calcidiol < 10, < 15 o < 20 ng/ml fueron: el 35,3, el 64,1 y el 87,1 por ciento, respectivamente. Tras el tratamiento el calcidiol en el grupo II fue mayor que en el grupo I a los 3 meses. El porcentaje de mujeres con concentraciones superiores a 10 y 15 ng/ml fue mayor en el grupo II que en el grupo I. Sin embargo, los valores de calcidiol se igualaron a los 6 y 12 meses. Conclusión: Se observa una elevada prevalencia de deficiencia de vitamina D en un grupo de mujeres posmenopáusicas que acudieron a una consulta reumatológica en Madrid. Ambas pautas de administración de vitamina D parecen ser insuficientes para mantener las concentraciones adecuadas de calcidiol sérico. Debería considerarse una pauta de 80.000 U dos veces al año. (AU)

Características clínicas de la artritis familiar en España. estudio de 73 familias / Clinical characteristics of familiar rheumatoid arthritis in Spain. A study of 73 families

Objetivo: Describir las características y la homogeneidad de la enfermedad en familias españolas con más de un caso de artritis reumatoide (AR). Pacientes y métodos: Se ha identificado 73 familias con dos o más hermanos con AR. En el estudio clínico sólo se han considerado 149 hermanos que forman en total 79 parejas (3 familias con 3 hermanos y 70 con 2 hermanos). Se recogieron mediante un cuestionario las características demográficas, clínicas y radiológicas. Resultados: Las características clínicas de la enfermedad fueron similares a la AR esporádica con una gran frecuencia de enfermedad en mujeres (78 por ciento), con factor reumatoide (FR) positivo (86 por ciento), erosiones (89 por ciento) y manifestaciones extrarticulares en el 25 por ciento de los casos. La variable que más influyó en la gravedad de la enfermedad fue el tiempo de evolución. La concordancia entre los hermanos en la edad y año de comienzo, así como en el resto de características clínicas, no fue mayor de lo esperado. Conclusión: Los factores más importantes en el desencadenamiento de la AR parecen ser los ambientales. Las características de la enfermedad familiar en España no parecen ser diferentes de la AR esporádica, existiendo diferencias entre los hermanos que pueden ser debidas a la heterogeneidad genética y ambiental que la han desencadenado y a la diferencia en el tiempo de evolución entre ellos (AU)

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