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Mol Biosyst ; 9(6): 1351-9, 2013 Jun.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-23467670

RESUMO

A genome-wide screen of a yeast non-essential gene-deletion library was used to identify sick phenotypes due to oxygen deprivation. The screen provided a manageable list of 384 potentially novel as well as known oxygen responding (anoxia-survival) genes. The gene-deletion mutants were further assayed for sensitivity to ferrozine and cobalt to obtain a subset of 34 oxygen-responsive candidate genes including the known hypoxic gene activator, MGA2. With each mutant in this subset a plasmid based ß-galactosidase assay was performed using the anoxic-inducible promoter from OLE1 gene, and 17 gene deletions were identified that inhibit induction under anaerobic conditions. Genetic interaction analysis for one of these mutants, the RNase-encoding POP2 gene, revealed synthetic sick interactions with a number of genes involved in oxygen sensing and response. Knockdown experiments for CNOT8, human homolog of POP2, reduced cell survival under low oxygen condition suggesting a similar function in human cells.


Assuntos
Saccharomyces cerevisiae/genética , Saccharomyces cerevisiae/metabolismo , Hipóxia Celular , Linhagem Celular , Sobrevivência Celular/genética , Cobalto/farmacologia , Ácidos Graxos Dessaturases/genética , Ferrozina/farmacologia , Deleção de Genes , Perfilação da Expressão Gênica , Regulação Fúngica da Expressão Gênica , Humanos , Quelantes de Ferro/metabolismo , Proteínas de Membrana/genética , Oxigênio/metabolismo , Regiões Promotoras Genéticas , Ribonucleases/genética , Proteínas de Saccharomyces cerevisiae/genética , Estearoil-CoA Dessaturase , Oligoelementos/metabolismo , Fatores de Transcrição/genética , Ativação Transcricional , beta-Galactosidase/genética
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