Your browser doesn't support javascript.
loading
Mostrar: 20 | 50 | 100
Resultados 1 - 12 de 12
Filtrar
1.
Acta méd. costarric ; 64(1)mar. 2022.
Artigo em Espanhol | LILACS, SaludCR | ID: biblio-1402989

RESUMO

Resumen Objetivo: Describir la asociación de las variantes en los genes que codifican por citocinas participantes en el proceso inflamatorio con la susceptibilidad y la gravedad clínica de las enfermedades. Métodos: Se realizó un estudio documental con revisión de literatura científica encontrada en las siguientes bases de datos: Pubmed, Science Direct, Scopus, Scielo, PLOS, Hinari, Redalyc, Dialnet, Taylor, ProQuest. Se revisaron 84 referencias relacionadas con artículos de investigación, revisiones sistemáticas y metaanálisis con los términos ''variante'', ''variante en un solo nucléotido'', ''polimorfismo de nucleótido único'', ''citocinas proinflamatorias'', ''citocinas antiinflamatorias'', ''interleucinas'', ''factor de necrosis tumoral'', ''susceptibilidad genética'', ''enfermedades'' y ''patologías''. Resultados: La evidencia señala que las variantes en un solo nucleótido se detectan principalmente en regiones promotoras de genes que codifican para citocinas reguladoras de procesos inflamatorios, como son: IL-1, IL-6, IL-8, IL-10, IL-12, IL-17, IL-18, IL-22 y el factor de necrosis tumoral. Conclusiones: La expresión y la producción diferencial de estas citocinas desempeñan un papel relevante en la patogenia y la predisposición a sufrir enfermedades, especialmente metabólicas, malignas, autoinmunes e infecciosas. Se mostró también un efecto diferencial de las variantes según las características étnicas, lo que resulta ser una herramienta eficaz en la medicina preventiva.


Abstract Aim: To describe the association of variations in cytokine genes that participate in the inflammatory process with the susceptibility and clinical severity of diseases. Methods: A documentary study was carried out with a review of the scientific literature of the database: Pubmed, Science Direct, Scopus, Scielo, PLOS, Hinari, Redalyc, Dialnet, Taylor, ProQuest. Eighty-four references were reviewed that included research articles, systematic reviews and meta-analyzes, using the terms ''Variants'', ''Single Nucleotide Variation'', ''Proinflammatory cytokines'', ''Anti-inflammatory cytokines'', ''Interleukins'', ''Tumor Necrosis Factor'', ''genetic susceptibility'', ''diseases'', pathologies''. Results: The evidence indicates that Single Nucleotide Variants are detected mainly in promoter regions of genes that code for cytokines that regulate inflammatory processes such as: IL-1, IL-6, IL-8, IL-10, IL-12, IL -17, IL-18, IL-22 and tumoral necrosis factor. Conclusions: The expression and differential production of these cytokines play a role in the pathogenesis and predisposition to diseases, especially metabolic, malignant, autoimmune, and infectious. A differential effect of variants according to ethnic characteristics is also observed, which turns out to be an effective tool to be used in preventive medicine.


Assuntos
Citocinas/análise , Interleucinas , Linfotoxina-alfa , Polimorfismo de Nucleotídeo Único
2.
Colomb. med ; 48(4): 183-190, Oct.-Dec. 2017. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-890877

RESUMO

Abstract Introduction: The extensive use of antibiotics has led to the emergence of multi-resistant strains in some species of the genus Acinetobacter. Objective: To investigate the molecular characteristics of multidrug-resistant of Acinetobacter ssp. strains isolated from 52 patients collected between March 2009 and July 2010 in medical intensive care units in Cali - Colombia. Methods: The susceptibility to various classes of antibiotics was determined by disc diffusion method, and the determination of the genomic species was carried out using amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) and by sequencing of the 16s rDNA gene. Also, the genes of beta-lactamases as well as, integrases IntI1 and IntI2 were analyzed by PCR method. Results: The phenotypic identification showed that the isolates belong mainly to A. calcoaceticus- A. baumannii complex. All of them were multi-resistant to almost the whole antibiotics except to tigecycline and sulperazon, and they were grouped into five (I to V) different antibiotypes, being the antibiotype I the most common (50.0%). The percent of beta-lactamases detected was: blaTEM (17.3%), blaCTX-M (9.6%), blaVIM (21.2%), blaIMP (7.7%), blaOXA-58 (21.2%), and blaOXA-51 (21.2%). The phylogenetic tree analysis showed that the isolates were clustering to A. baumannii (74.1%), A. nosocomialis (11.1%) and A. calcoaceticus (7.4 %). Besides, the integron class 1 and class 2 were detected in 23.1% and 17.3% respectively. Conclusion: The isolates were identified to species A. baumanii mainly, and they were multiresistant. The resistance to beta-lactams may be by for presence of beta-lactamases in the majority of the isolates.


Resumen Introducción: El uso extensivo de antibióticos ha llevado a la emergencia de cepas multirresistentes en algunas especies del género Acinetobacter. Objetivo: Investigar las características moleculares de resistencia a múltiples fármacos de cepas aisladas de Acinetobacter spp. colectadas entre marzo de 2009 y julio de 2010 en 52 pacientes de unidades de cuidados intensivos en Cali - Colombia. Métodos: La susceptibilidad a diversas clases de antibióticos se determinó mediante el método de difusión de disco, y la determinación de la especie genómica se llevó a cabo usando un análisis de restricción de ADN ribosómico amplificado (ARDRA) y mediante la secuenciación del gen 16s de ADNr. Además, se analizaron por el método de PCR los genes de las beta-lactamasas, como también, las integrasas IntI1 e IntI2. Resultados: La identificación fenotípica mostró que los aislamientos pertenecen principalmente al complejo A. calcoaceticus - A. baumannii. Todos ellos eran multirresistentes a casi todos los antibióticos excepto tigeciclina y sulperazón, y se agruparon en cinco (I a V) antibitipos diferentes, siendo el antibiotipo I el más común (50%). El porcentaje de betalactamasas detectadas fue: blaTEM (17,3%), blaCTX-M (9,6%), blaVIM (21,2%), blaIMP (7,7%), blaOXA-58 (21,2%), blaOXA- 51 (21.2%). El análisis del árbol filogenético mostró que los aislados se agrupaban en A. baumannii (74.1%), A. nosocomialis (11.1%) y A. calcoaceticus (7.4%). Además, el integrón clase 1 y clase 2 se detectaron en 23.1% y 17.3% respectivamente. Conclusión: los aislamientos se identificaron principalmente como la especie A. baumanii, y fueron multirresistentes. La resistencia a los betalactámicos puede deberse a la presencia de betalactamasas en la mayoría de los aislamientos.


Assuntos
Humanos , Acinetobacter/efeitos dos fármacos , beta-Lactamases/genética , Infecções por Acinetobacter/tratamento farmacológico , Antibacterianos/farmacologia , Acinetobacter/classificação , Acinetobacter/genética , Infecções por Acinetobacter/microbiologia , Infecções por Acinetobacter/epidemiologia , DNA Bacteriano/genética , DNA Ribossômico/genética , Reação em Cadeia da Polimerase/métodos , Colômbia , Farmacorresistência Bacteriana Múltipla , Testes de Sensibilidade a Antimicrobianos por Disco-Difusão , Unidades de Terapia Intensiva
3.
Colomb Med (Cali) ; 48(4): 183-190, 2017 Dec 30.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29662260

RESUMO

INTRODUCTION: The extensive use of antibiotics has led to the emergence of multi-resistant strains in some species of the genus Acinetobacter. OBJECTIVE: To investigate the molecular characteristics of multidrug-resistant of Acinetobacter ssp. strains isolated from 52 patients collected between March 2009 and July 2010 in medical intensive care units in Cali - Colombia. METHODS: The susceptibility to various classes of antibiotics was determined by disc diffusion method, and the determination of the genomic species was carried out using amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) and by sequencing of the 16s rDNA gene. Also, the genes of beta-lactamases as well as, integrases IntI1 and IntI2 were analyzed by PCR method. RESULTS: The phenotypic identification showed that the isolates belong mainly to A. calcoaceticus- A. baumannii complex. All of them were multi-resistant to almost the whole antibiotics except to tigecycline and sulperazon, and they were grouped into five (I to V) different antibiotypes, being the antibiotype I the most common (50.0%). The percent of beta-lactamases detected was: blaTEM (17.3%), blaCTX-M (9.6%), blaVIM (21.2%), blaIMP (7.7%), blaOXA-58 (21.2%), and blaOXA-51 (21.2%). The phylogenetic tree analysis showed that the isolates were clustering to A. baumannii (74.1%), A. nosocomialis (11.1%) and A. calcoaceticus (7.4 %). Besides, the integron class 1 and class 2 were detected in 23.1% and 17.3% respectively. CONCLUSION: The isolates were identified to species A. baumanii mainly, and they were multiresistant. The resistance to beta-lactams may be by for presence of beta-lactamases in the majority of the isolates.


INTRODUCCIÓN: El uso extensivo de antibióticos ha llevado a la emergencia de cepas multirresistentes en algunas especies del género Acinetobacter. OBJETIVO: Investigar las características moleculares de resistencia a múltiples fármacos de cepas aisladas de Acinetobacter spp. colectadas entre marzo de 2009 y julio de 2010 en 52 pacientes de unidades de cuidados intensivos en Cali - Colombia. MÉTODOS: La susceptibilidad a diversas clases de antibióticos se determinó mediante el método de difusión de disco, y la determinación de la especie genómica se llevó a cabo usando un análisis de restricción de ADN ribosómico amplificado (ARDRA) y mediante la secuenciación del gen 16s de ADNr. Además, se analizaron por el método de PCR los genes de las beta-lactamasas, como también, las integrasas IntI1 e IntI2. RESULTADOS: La identificación fenotípica mostró que los aislamientos pertenecen principalmente al complejo A. calcoaceticus - A. baumannii. Todos ellos eran multirresistentes a casi todos los antibióticos excepto tigeciclina y sulperazón, y se agruparon en cinco (I a V) antibitipos diferentes, siendo el antibiotipo I el más común (50%). El porcentaje de betalactamasas detectadas fue: blaTEM (17,3%), blaCTX-M (9,6%), blaVIM (21,2%), blaIMP (7,7%), blaOXA-58 (21,2%), blaOXA- 51 (21.2%). El análisis del árbol filogenético mostró que los aislados se agrupaban en A. baumannii (74.1%), A. nosocomialis (11.1%) y A. calcoaceticus (7.4%). Además, el integrón clase 1 y clase 2 se detectaron en 23.1% y 17.3% respectivamente. CONCLUSIÓN: los aislamientos se identificaron principalmente como la especie A. baumanii, y fueron multirresistentes. La resistencia a los betalactámicos puede deberse a la presencia de betalactamasas en la mayoría de los aislamientos.


Assuntos
Infecções por Acinetobacter/tratamento farmacológico , Acinetobacter/efeitos dos fármacos , Antibacterianos/farmacologia , beta-Lactamases/genética , Acinetobacter/classificação , Acinetobacter/genética , Infecções por Acinetobacter/epidemiologia , Infecções por Acinetobacter/microbiologia , Colômbia , DNA Bacteriano/genética , DNA Ribossômico/genética , Testes de Sensibilidade a Antimicrobianos por Disco-Difusão , Farmacorresistência Bacteriana Múltipla , Humanos , Unidades de Terapia Intensiva , Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
4.
J Alloys Compd ; 653: 255-259, 2015.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26681838

RESUMO

TiO2 thin film based, chemiresistive sensors for NO2 gas which operate at room temperature under ultraviolet (UV) illumination have been demonstrated in this work. The rf-sputter deposited and post-annealed TiO2 thin films have been characterized by atomic force microscopy, X-ray photoelectron spectroscopy, and X-ray diffraction to obtain surface morphology, chemical state, and crystal structure, respectively. UV-vis absorption spectroscopy and Tauc plots show the optical properties of the TiO2 films. Under UV illumination, the NO2 sensing performance of the TiO2 films shows a reversible change in resistance at room-temperature. The observed change in electrical resistivity can be explained by the modulation of surface-adsorbed oxygen. This work is the first demonstration of a facile TiO2 sensor for NO2 analyte that operates at room-temperature under UV illumination.

5.
An. Fac. Med. (Perú) ; 76(1): 21-26, ene.-mar. 2015. tab
Artigo em Espanhol | LILACS, LIPECS | ID: lil-780433

RESUMO

Identificar patrones de resistencia en los aislamientos de A. baumannii obtenidos en una unidad de cuidados intensivos de Cali, Colombia. Diseño: Estudio descriptivo, prospectivo de corte transversal. Institución: Clínica Universitaria Rafael Uribe Uribe, Cali, Colombia. Materiales: Los aislamientos se obtuvieron de cultivos de muestras de sangre, heridas quirúrgicas, secreción nasal, orina, secreción uretral y puntas de catéter. Intervenciones: Se recolectaron 52 aislamientos durante los años 2009 y 2010. Mediante el análisis del antibiograma se identificaron patrones de resistencia (antibiotipos), se realizó antibiograma cuantitativo y se construyó un cladograma basado en el agrupamiento por el método de promedios aritméticos de grupos apareados no ponderados (conocido en inglés como UPGMA). Principales medidas de resultados: Medida de la concentración mínima inhibitoria (CMI) y el coeficiente de similitud generado por las distancias de los diámetros de los halos de inhibición entre dos aislamientos (antibiograma cuantitativo). Resultados: Se identificaron 5 antibiotipos; el 50 por ciento de los aislamientos se agruparon en el antibiotipo 1, con resistencia a todos los antibióticos y sensibilidad a tigeciclina y sulperazona; el antibiotipo 4 agrupó los aislamientos con resistencia a todos los antibióticos (19,3 por ciento). En el antibiograma cuantitativo se identificaron dos clados con 5 y 47 aislamientos, respectivamente. Conclusiones: Los aislamientos de Acinetobacter baumannii tuvieron pocas diferencias fenotípicas y es probable que presenten alguna de las ß-lactamasas tipo OXA...


To identify patterns of resistance in A. baumannii isolates obtained from an intensive care unit in Cali, Colombia. Design: Prospective cross-sectional descriptive study. Institution: Clínica Universitaria Rafael Uribe Uribe, Cali, Colombia. Materials: Isolates were obtained from cultures of blood, surgical wounds, nasal secretion, urine, urethral discharge and catheter tip samples. Interventions: Fifty-two isolates were collected between 2009 and 2010. Antibiogram analysis was done to identify resistance patterns (antibiotypes), a quantitative susceptibility testing was conducted, and a cladogram based on unweighted pair group method average (UPGMA) was constructed. Main outcome measures: Minimum inhibitory concentration (MIC) and similarity coefficient generated by diameters distances between two isolated inhibition zones (quantitative antibiogram). Results: Five antibiotypes were identified; 50 per cent of isolates were grouped in antibiotype 1, were resistant to all antibiotics, and susceptible to tigecycline and sulperazone; antibiotype 4 grouped isolates resistant to all antibiotics (19.3 per cent). In the quantitative antibiogram two clades with 5 and 47 isolates were identified respectively. Conclusions: Acinetobacter baumannii isolates showed few phenotypic differences and probably present some of ß-lactamases OXA type...


Assuntos
Humanos , Acinetobacter baumannii/isolamento & purificação , Resistência Microbiana a Medicamentos , Testes de Sensibilidade Microbiana , Estudos Prospectivos , Estudos Transversais
6.
PLoS One ; 9(6): e100596, 2014.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-24979038

RESUMO

Loop mediated isothermal amplification (LAMP) is a highly efficient, selective and rapid DNA amplification technique for genetic screening of pathogens. However, despite its popularity, there is yet no mathematical model to quantify the outcome and no well-defined metric for comparing results that are available. LAMP is intrinsically complex and involves multiple pathways for gene replication, making fundamental modelling nearly intractable. To circumvent this difficulty, an alternate, empirical model is introduced that will allow one to extract a set of parameters from the concentration versus time curves. A simple recipe to deduce the time to positive, Tp--a parameter analogous to the threshold cycling time in polymerase chain reaction (PCR), is also provided. These parameters can be regarded as objective and unambiguous indicators of LAMP amplification. The model is exemplified on Escherichia coli strains by using the two gene fragments responsible for vero-toxin (VT) production and tested against VT-producing (O157 and O45) and non-VT producing (DH5 alpha) strains. Selective amplification of appropriate target sequences was made using well established LAMP primers and protocols, and the concentrations of the amplicons were measured using a Qubit 2.0 fluorometer at specific intervals of time. The data is fitted to a generalized logistic function. Apart from providing precise screening indicators, representing the data with a small set of numbers offers significant advantages. It facilitates comparisons of LAMP reactions independently of the sampling technique. It also eliminates subjectivity in interpretation, simplifies data analysis, and allows easy data archival, retrieval and statistical analysis for large sample populations. To our knowledge this work represents a first attempt to quantitatively model LAMP and offer a standard method that could pave the way towards high throughput automated screening.


Assuntos
DNA Bacteriano/genética , Escherichia coli O157/genética , Escherichia coli/genética , Modelos Estatísticos , Técnicas de Amplificação de Ácido Nucleico/métodos , Toxinas Shiga/genética , Calibragem , Primers do DNA/química , Escherichia coli/metabolismo , Escherichia coli O157/metabolismo , Técnicas de Amplificação de Ácido Nucleico/instrumentação , Reprodutibilidade dos Testes , Sensibilidade e Especificidade , Toxinas Shiga/biossíntese
7.
Biomedica ; 34 Suppl 1: 101-7, 2014 Apr.
Artigo em Espanhol | MEDLINE | ID: mdl-24968041

RESUMO

INTRODUCTION: Phenotypic characterization of the Acinetobacter genus bacteria through biochemical and microscopic tests is possible. Studies have shown that the isolates from health-care associated infections show high resistance to first-line antibiotics. OBJECTIVE: To describe the resistance patterns of the A. baumannii isolates obtained in a health care institution, the phenotypic characteristics of the isolates, and the possible resistance mechanisms. MATERIALS AND METHODS: A descriptive cross-sectional study was conducted with 28 reports of samples taken from patients hospitalized with infection by A. baumannii . Susceptibility testing for ceftazidime, cefepime, meropenem, amikacin, and ciprofloxacin was performed with the Vitek ™ automated system and the susceptible, intermediate, and resistant classification was based on the protocol established by the Clinical and Laboratory Standards Institute for 2007. RESULTS: The highest percentage of isolates corresponded to males (53.6 %), to the infectology ward (28.5 %), and to the month of September (21.4 %); the most frequent sample site were endotracheal secretions (53.6 %). From the profile patterns for susceptibility to antibiotics used, 13 phylotypes were obtained. CONCLUSION: Acinetobacter baumannii is a pathogen resistant to multiple antimicrobial agents involved in outbreaks of health-care associated infections. The resistance profile patterns allow inferring that the possible resistance mechanisms present in the majority of the isolates are: Production of extended-spectrum b -lactamases, antibiotic modifying enzymes, and target site modification.


Assuntos
Infecções por Acinetobacter/microbiologia , Acinetobacter baumannii/isolamento & purificação , Infecção Hospitalar/microbiologia , Farmacorresistência Bacteriana Múltipla , Hospitais Urbanos/estatística & dados numéricos , Centros de Atenção Terciária/estatística & dados numéricos , Infecções por Acinetobacter/epidemiologia , Acinetobacter baumannii/efeitos dos fármacos , Acinetobacter baumannii/genética , Adulto , Criança , Colômbia/epidemiologia , Infecção Hospitalar/epidemiologia , Estudos Transversais , Feminino , Departamentos Hospitalares/estatística & dados numéricos , Hospitais Universitários/estatística & dados numéricos , Humanos , Infectologia , Unidades de Terapia Intensiva/estatística & dados numéricos , Medicina Interna , Masculino , Pediatria , Fenótipo , Complicações Pós-Operatórias/epidemiologia , Complicações Pós-Operatórias/microbiologia , Estações do Ano
8.
Biomédica (Bogotá) ; 34(supl.1): 101-107, abr. 2014.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-712426

RESUMO

Introducción. La caracterización fenotípica de las bacterias del género Acinetobacter mediante pruebas bioquímicas y microscópicas es posible. Varios estudios han demostrado que los aislamientos provenientes de infecciones asociadas a la atención en salud presentan una elevada resistencia a los antibióticos de primera elección. Objetivo. Describir los patrones de resistencia de los aislamientos de Acinetobacter baumannii obtenidos en una institución de salud, así como sus características fenotípicas y los posibles mecanismos de resistencia. Materiales y métodos. Se realizó un estudio descriptivo de corte transversal con 28 informes de muestras tomadas a pacientes hospitalizados con infección por A. baumannii . Las pruebas de sensibilidad para ceftazidime, cefepime, meropenem, amikacina y ciprofloxacina se realizaron con el sistema automatizado Vitek ® y la clasificación de sensible, intermedia y resistente se hizo con base en el protocolo establecido por el Clinical and Laboratory Standards Institute para el año 2007. Resultados. El mayor porcentaje de aislamientos correspondió al sexo masculino (53,6 %), a la sala de infectología (28,5 %) y al mes de septiembre (21,4 %); el tipo de muestra más frecuente fue el de secreción endotraqueal (53,6 %). A partir de los patrones de los perfiles de sensibilidad a los antibióticos empleados se obtuvieron 13 filotipos. Conclusión. Acinetobacter baumannii es un agente patógeno resistente a múltiples antimicrobianos, involucrado en brotes de infecciones asociadas a la atención en salud. Los patrones de los perfiles de resistencia permiten inferir que los posibles mecanismos de resistencia presentes en la mayoría de los aislamientos son la producción de betalactamasas de espectro extendido, las enzimas modificadoras del antibiótico y la modificación del sitio diana.


Introduction: Phenotypic characterization of the Acinetobacter genus bacteria through biochemical and microscopic tests is possible. Studies have shown that the isolates from health-care associated infections show high resistance to first-line antibiotics. Objective: To describe the resistance patterns of the A. baumannii isolates obtained in a health care institution, the phenotypic characteristics of the isolates, and the possible resistance mechanisms. Materials and methods: A descriptive cross-sectional study was conducted with 28 reports of samples taken from patients hospitalized with infection by A. baumannii . Susceptibility testing for ceftazidime, cefepime, meropenem, amikacin, and ciprofloxacin was performed with the Vitek ™ automated system and the susceptible, intermediate, and resistant classification was based on the protocol established by the Clinical and Laboratory Standards Institute for 2007. Results: The highest percentage of isolates corresponded to males (53.6 %), to the infectology ward (28.5 %), and to the month of September (21.4 %); the most frequent sample site were endotracheal secretions (53.6 %). From the profile patterns for susceptibility to antibiotics used, 13 phylotypes were obtained. Conclusion: Acinetobacter baumannii is a pathogen resistant to multiple antimicrobial agents involved in outbreaks of health-care associated infections. The resistance profile patterns allow inferring that the possible resistance mechanisms present in the majority of the isolates are: Production of extended-spectrum b -lactamases, antibiotic modifying enzymes, and target site modification.


Assuntos
Adulto , Criança , Feminino , Humanos , Masculino , Infecções por Acinetobacter/microbiologia , Acinetobacter baumannii/isolamento & purificação , Infecção Hospitalar/microbiologia , Farmacorresistência Bacteriana Múltipla , Hospitais Urbanos/estatística & dados numéricos , Centros de Atenção Terciária/estatística & dados numéricos , Infecções por Acinetobacter/epidemiologia , Acinetobacter baumannii/efeitos dos fármacos , Acinetobacter baumannii/genética , Estudos Transversais , Colômbia/epidemiologia , Infecção Hospitalar/epidemiologia , Departamentos Hospitalares/estatística & dados numéricos , Hospitais Universitários/estatística & dados numéricos , Infectologia , Medicina Interna , Unidades de Terapia Intensiva/estatística & dados numéricos , Pediatria , Fenótipo , Complicações Pós-Operatórias/epidemiologia , Complicações Pós-Operatórias/microbiologia , Estações do Ano
9.
PLoS One ; 8(4): e58870, 2013.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-23593123

RESUMO

Peptide nucleic acids (PNAs) have gained much interest as molecular recognition tools in biology, medicine and chemistry. This is due to high hybridization efficiency to complimentary oligonucleotides and stability of the duplexes with RNA or DNA. We have synthesized 15/16-mer PNA probes to detect the HER2 mRNA. The performance of these probes to detect the HER2 target was evaluated by fluorescence imaging and fluorescence bead assays. The PNA probes have sufficiently discriminated between the wild type HER2 target and the mutant target with single base mismatches. Furthermore, the probes exhibited excellent linear concentration dependence between 0.4 to 400 fmol for the target gene. The results demonstrate potential application of PNAs as diagnostic probes with high specificity for quantitative measurements of amplifications or over-expressions of oncogenes.


Assuntos
Genes erbB-2 , Sondas Moleculares , Ácidos Nucleicos Peptídicos/química , Sequência de Bases , Primers do DNA , Humanos , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Propriedades de Superfície
10.
Biosens Bioelectron ; 32(1): 69-75, 2012 Feb 15.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-22206785

RESUMO

An electronic platform to detect very small amounts of genomic DNA from bacteria without the need for PCR amplification and molecular labeling is described. The system uses carbon nanotube field-effect transistor (FET) arrays whose electrical properties are affected by minute electrical charges localized on their active regions. Two pathogenic strains of E. coli are used to evaluate the detection properties of the transistor arrays. Described herein are the results for detection of synthetic oligomers, unpurified and highly purified genomic DNA at various concentrations and their comparison against non-specific binding. In particular, the capture of genomic DNA of E. coli O157:H7 by a specific oligonucleotide probe coated onto the transistor array results in a significant shift in the threshold (gate-source) voltage (V(th)). By contrast the signal under the same procedure using a different strain, E. coli O45 that is non-complementary to the probe remained nearly constant. This work highlights the detection sensitivity and efficacy of this biosensor without stringent requirement for DNA sample preparation.


Assuntos
Técnicas Biossensoriais/instrumentação , DNA Bacteriano/genética , Escherichia coli O157/genética , Escherichia coli O157/isolamento & purificação , Nanotubos de Carbono/química , Sequência de Bases , Técnicas Biossensoriais/economia , Técnicas Biossensoriais/métodos , DNA Bacteriano/análise , Desenho de Equipamento , Fatores de Tempo , Transistores Eletrônicos
11.
Colomb. med ; 42(1): 117-125, ene.-mar. 2011.
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-585763

RESUMO

Nosocomial infections are a major challenge for public health because of the high rates of morbidity and mortality generated. It was considered that the excessive or inappropriate use of antibiotics triggers the emergence of resistant strains. Among the clinically important bacteria that most commonly cause nososcomial infections, Gram positive multiresistant pathogens stand out such as methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and vancomycin-resistant Enterococcus spp (VRE), and the Gram negative strains of Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas spp. and Acinetobacter baumannii producing expanded spectrum b-lactamases (ESbL). This review describes the behavior of the main bacterial pathogens resistant to antibiotics that cause infections in Europe, United States, and Latin America, emphasizing studies of molecular epidemiology on a global scale, including the major epidemiological studies in Colombia. The genetic structure of S. aureus and Enterococcus spp strains shows a clonal characteristic favored by the predominance of a small number of clones with the capacity to spread globally, due probably to cross-infection. However, the introduction of MRSA strains from the community encourages genetic diversity, tending to establish a genetic polyclonal endemic structure in places like the United States. In Gram negative bacteria, the high genetic diversity among isolates, mainly in Latin American countries, indicates that the polyclonal spread is influenced by horizontal transfer of plasmids, by excessive exposure to antibiotics, and prolonged hospital stays. In Colombia, there is information on nosocomial resistant pathogens, but molecular epidemiological information is still scarce.


Las infecciones nosocomiales constituyen un gran desafío para la salud pública por las altas tasas de morbilidad y mortalidad que generan. Se ha considerado que el uso inapropiado o excesivo de antibióticos desencadena la aparición de cepas resistentes. Entre las bacterias de importancia clínica que con mayor frecuencia causan infecciones nososcomiales, se destacan los patógenos Gram positivos multiresistentes como Staphylococcus aureus con resistencia a meticilina (SARM) y Enterococcus spp. resistentes a vancomicina (ERV). En los Gram negativos, hay resistencia sobre todo con las cepas de Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas spp. y Acinetobacter baumannii productoras de b-lactamasas de espectro extendido (BLEEs, en inglés: ESbL expanded spectrum b-lactamases). Esta revisión tiene como finalidad realizar una decripción del estado de la resistencia bacteriana a los antibióticos en los principales patógenos que causan infecciones nosocomiales en países de Europa, Estados Unidos y de Latinoamérica, destacando los estudios de epidemiología molecular a escala global e incluyendo los principales estudios epidemiológicos realizados en Colombia. La estructura genética de las cepas de Staphylococus aureus y Enterococcus spp. evidencia una característica clonal favorecida por el predominio de un número pequeño de clones con capacidad de diseminarse en forma global, debida probablemente a infecciones cruzadas. Sin embargo, la introducción de cepas SARM desde la comunidad está favoreciendo la diversidad genética, tendiendo a establecerse una estructura genética policlonal en lugares endémicos como los Estados Unidos. En Colombia se dispone de información sobre los patógenos nosocomiales resistentes, pero la información epidemiológica molecular aún es escasa.


Assuntos
Infecção Hospitalar , Farmacorresistência Bacteriana , Epidemiologia , Variação Genética , Epidemiologia Molecular , Antibacterianos
12.
NOVA publ. cient ; 8(14): 148-162, jul.-dic. 2010.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: lil-613094

RESUMO

Acinetobacter baumanni causa frecuentemente infecciones intrahospitalarias y actualmente se ha relacionado con el desarrollo de infecciones severas adquiridas en la comunidad. La capacidad de colonizar diversos hábitats y la versatilidad en su metabolismo ha influido en el incremento del número de infecciones nosocomiales, siendo responsable del desarrollo de enfermedades como: sepsis, neumonías y meningitis. Estas infecciones aparecen en forma de brotes, dominados por clones epidémicos con multirresistencia a los antibióticos que causan altas tasas de morbilidad y mortalidad. Las Unidades de Cuidados Intensivos son las más afectadas por el uso masivo de antibióticos que ocasiona la aparición de cepas multirresistentes. Es importante estudiar los mecanismos de patogénesis y la resistencia a los antibióticos, como factores directos que determinan el problema de salud. Por otra parte, las islas de patogenecidad que corresponde a material genético exógeno que ha sido integrado al genoma de la bacteria, explicaría en gran medida el carácter patogénico de la bacteria. Estas transportan genes que confieren multirresistencia a los antibióticos y son responsables directos de llevar genes involucrados en mecanismos patogénicos como son: el sistema de captación de hierro, el sistema para la formación de biopelículas en superficies abióticas, el mecanismo de formación de la proteína de membrana externa 38 y los sistemas de secreción de proteínas tipo IV, que han sido demostrados como responsables directos de la patogénesis de diversos patógenos. En este artículo se revisa la situación actual de la incidencia de las infecciones nosocomiales causadas por A. baumannii multirresistente a los antibióticos, los principales mecanismos de resistencia a fármacos y la asociación de ésta con los mecanismos de patogenicidad. El conocimiento de los elementos involucrados en la patogénesis de A. baumannii permitirá establecer los mecanismos que lleven a controlar su diseminación.


Assuntos
Acinetobacter baumannii , Epidemiologia Molecular , Resistência Microbiana a Medicamentos , Infecção Hospitalar , Ilhas Genômicas
SELEÇÃO DE REFERÊNCIAS
DETALHE DA PESQUISA
...