Frequency, distribution and determinants of Helicobacter pylori infection in adults and adolescents with gastric symptoms: cross-sectional epidemiological inquiry in district Haripur, Pakistan / Frequência, distribuição e determinantes da infecção por Helicobacter pylori em adultos e adolescentes com sintomas gástricos: inquérito epidemiológico transversal no distrito de Haripur, Paquistão

Helicobacter pylori (HP) is a vital element in the etiology of peptic ulcers and gastric cancer. This research aimed to determine the frequency, distribution, and determinants of HP infection in adults and adolescents with gastric symptoms in district Haripur, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan. This cross-sectional study was performed from June 2018 to June 2020 at the Medical Laboratory Technology Department, The University of Haripur, Pakistan. Presence of HP was a research variable, while sex, age groups, education status, overcrowding, dining habits, milk intake, drinking water source and animal contact were grouping variables. Immuno-chromatographic technique (ICT) was used to for serological detection of HP antibodies. All variables were represented by frequency and percentage with 95%CI. Prevalence of HP and its distribution by eight socio-demographic variables was testified by the chi-square goodness-of-fit test while association was testified by chi-square test of association. Out of total 1160 cases, 557 (48%) were positive for HP. Population prevalence was higher in men, in the age group 20-40 years, illiterate, family size ≤ 10 persons, taking restaurant food, using tetra pack, using municipal water, and having animal contact. The observed prevalence of HP was similar to its expected prevalence in the population. The observed distribution of HP in the sample was different from its expected distribution in population by eight socio-demographic variables. Presence of HP was associated with all eight socio-demographic variables besides age groups.

Helicobacter pylori (HP) é um elemento vital na etiologia de úlceras pépticas e câncer gástrico. Esta pesquisa teve como objetivo determinar a frequência, distribuição e determinantes da infecção por HP em adultos e adolescentes com sintomas gástricos no distrito de Haripur, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Este estudo transversal foi realizado de junho de 2018 a junho de 2020 no Departamento de Tecnologia de Laboratórios Médicos da Universidade de Haripur, Paquistão. A presença de HP foi uma variável de pesquisa, enquanto sexo, faixas etárias, escolaridade, superlotação, hábitos alimentares, ingestão de leite, fonte de água potável e contato com animais foram variáveis ​​de agrupamento. A técnica imunocromatográfica (TIC) foi utilizada para a detecção sorológica de anticorpos para HP. Todas as variáveis ​​foram representadas por frequência e percentual com IC 95%. A prevalência de HP e sua distribuição por oito variáveis ​​sociodemográficas foi comprovada pelo teste de ajuste do qui-quadrado, enquanto a associação foi verificada pelo teste de associação do qui-quadrado. Do total de 1.160 casos, 557 (48%) foram positivos para HP. A prevalência populacional foi maior em homens, na faixa etária de 20 a 40 anos, analfabetos, família ≤ 10 pessoas, consumindo comida de restaurante, usando tetra pack, usando água municipal e tendo contato com animais. A prevalência observada de HP foi semelhante à sua prevalência esperada na população. A distribuição observada de HP na amostra foi diferente de sua distribuição esperada na população por oito variáveis ​​sociodemográficas. A presença de HP foi associada a todas as oito variáveis ​​sociodemográficas além das faixas etárias.

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.(AU)

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.(AU)

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely SARS-CoV-2 is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the SARS-CoV-2 although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among SARS-CoV-2 and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that SARS-CoV-2 has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente SARS-CoV-2, foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o SARS-CoV-2, embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre SARS-CoV-2 e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que SARS-CoV-2 tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Frequency, distribution and determinants of Helicobacter pylori infection in adults and adolescents with gastric symptoms: cross-sectional epidemiological inquiry in district Haripur, Pakistan.

Helicobacter pylori (HP) is a vital element in the etiology of peptic ulcers and gastric cancer. This research aimed to determine the frequency, distribution, and determinants of HP infection in adults and adolescents with gastric symptoms in district Haripur, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan. This cross-sectional study was performed from June 2018 to June 2020 at the Medical Laboratory Technology Department, The University of Haripur, Pakistan. Presence of HP was a research variable, while sex, age groups, education status, overcrowding, dining habits, milk intake, drinking water source and animal contact were grouping variables. Immuno-chromatographic technique (ICT) was used to for serological detection of HP antibodies. All variables were represented by frequency and percentage with 95%CI. Prevalence of HP and its distribution by eight socio-demographic variables was testified by the chi-square goodness-of-fit test while association was testified by chi-square test of association. Out of total 1160 cases, 557 (48%) were positive for HP. Population prevalence was higher in men, in the age group 20-40 years, illiterate, family size ≤ 10 persons, taking restaurant food, using tetra pack, using municipal water, and having animal contact. The observed prevalence of HP was similar to its expected prevalence in the population. The observed distribution of HP in the sample was different from its expected distribution in population by eight socio-demographic variables. Presence of HP was associated with all eight socio-demographic variables besides age groups.

Ecological impacts of climate change on the snow leopard (Panthera unica) in South Asia / Impactos ecológicos da mudança climática no leopardo-da-neve (Panthera uncia) no sul da Ásia

Snow leopard (Panthera unica) is a felid which lives in the highly rugged areas of alpine regions in different mountain ranges of South and Central Asia. This solitary animal needs large spaces for its ranges but due to climate change and relatively faster rate of global warming in South Asian mountain ranges, its habitat is going to shrink and fragment by tree-line shifts and change in hydrology of the area. Vegetative modification of montane flora and competition with domestic goats will create its prey's population to decline along with a chance of a direct conflict and competition with the common leopard. Common leopard being more adaptable, grouped, and larger in size can be a significant stressor for a smaller and solitary snow leopard. Habitat would shrink, and snow leopard can possibly move upslope or northward to central Asian ranges and their predicted migratory patterns are unknown.(AU)

O leopardo-das-neves (Panthera uncia) é um felídeo que vive nas áreas altamente acidentadas das regiões alpinas, em diferentes cadeias de montanhas do sul e do centro da Ásia. A revisão atual tem o objetivo de abordar a questão da possível perda de hábitat do leopardo da neve em razão da interferência humana nas montanhas do sul e do centro da Ásia. Esse animal solitário precisa de grandes espaços para suas faixas, mas, devido às mudanças climáticas e à taxa relativamente mais rápida de aquecimento global nas cadeias montanhosas do sul da Ásia, seu hábitat vai encolher e fragmentar-se por mudanças nas linhas de árvores e na hidrologia da área. Este artigo teve o objetivo de rever vários estudos sobre os impactos das mudanças climáticas em um futuro próximo e distante sobre os hábitats do leopardo-da-neve. O estudo revelou que a modificação vegetativa da flora da montanha e a competição com cabras domésticas poderiam ocasionar na diminuição da população de suas presas, com a chance de um conflito direto e competição com leopardo comum. Leopardo comum sendo mais adaptável, agrupado e maior em tamanho pode ser um estressor significativo para um leopardo-da-neve menor e solitário. Conclusão: devido ao encolhimento do hábitat, o leopardo-da-neve pode, possivelmente, mover-se para cima ou para o norte, para faixas da Ásia Central com padrões migratórios não previstos.(AU)

Ecological impacts of climate change on the snow leopard (Panthera unica) in South Asia / Impactos ecológicos da mudança climática no leopardo-da-neve (Panthera uncia) no sul da Ásia

Snow leopard (Panthera unica) is a felid which lives in the highly rugged areas of alpine regions in different mountain ranges of South and Central Asia. This solitary animal needs large spaces for its ranges but due to climate change and relatively faster rate of global warming in South Asian mountain ranges, its habitat is going to shrink and fragment by tree-line shifts and change in hydrology of the area. Vegetative modification of montane flora and competition with domestic goats will create its prey's population to decline along with a chance of a direct conflict and competition with the common leopard. Common leopard being more adaptable, grouped, and larger in size can be a significant stressor for a smaller and solitary snow leopard. Habitat would shrink, and snow leopard can possibly move upslope or northward to central Asian ranges and their predicted migratory patterns are unknown.

O leopardo-das-neves (Panthera uncia) é um felídeo que vive nas áreas altamente acidentadas das regiões alpinas, em diferentes cadeias de montanhas do sul e do centro da Ásia. A revisão atual tem o objetivo de abordar a questão da possível perda de hábitat do leopardo da neve em razão da interferência humana nas montanhas do sul e do centro da Ásia. Esse animal solitário precisa de grandes espaços para suas faixas, mas, devido às mudanças climáticas e à taxa relativamente mais rápida de aquecimento global nas cadeias montanhosas do sul da Ásia, seu hábitat vai encolher e fragmentar-se por mudanças nas linhas de árvores e na hidrologia da área. Este artigo teve o objetivo de rever vários estudos sobre os impactos das mudanças climáticas em um futuro próximo e distante sobre os hábitats do leopardo-da-neve. O estudo revelou que a modificação vegetativa da flora da montanha e a competição com cabras domésticas poderiam ocasionar na diminuição da população de suas presas, com a chance de um conflito direto e competição com leopardo comum. Leopardo comum sendo mais adaptável, agrupado e maior em tamanho pode ser um estressor significativo para um leopardo-da-neve menor e solitário. Conclusão: devido ao encolhimento do hábitat, o leopardo-da-neve pode, possivelmente, mover-se para cima ou para o norte, para faixas da Ásia Central com padrões migratórios não previstos.

Ecological impacts of climate change on the snow leopard (Panthera unica) in South Asia

Abstract Snow leopard (Panthera unica) is a felid which lives in the highly rugged areas of alpine regions in different mountain ranges of South and Central Asia. This solitary animal needs large spaces for its ranges but due to climate change and relatively faster rate of global warming in South Asian mountain ranges, its habitat is going to shrink and fragment by tree-line shifts and change in hydrology of the area. Vegetative modification of montane flora and competition with domestic goats will create its preys population to decline along with a chance of a direct conflict and competition with the common leopard. Common leopard being more adaptable, grouped, and larger in size can be a significant stressor for a smaller and solitary snow leopard. Habitat would shrink, and snow leopard can possibly move upslope or northward to central Asian ranges and their predicted migratory patterns are unknown.

Resumo O leopardo-das-neves (Panthera uncia) é um felídeo que vive nas áreas altamente acidentadas das regiões alpinas, em diferentes cadeias de montanhas do sul e do centro da Ásia. A revisão atual tem o objetivo de abordar a questão da possível perda de hábitat do leopardo da neve em razão da interferência humana nas montanhas do sul e do centro da Ásia. Esse animal solitário precisa de grandes espaços para suas faixas, mas, devido às mudanças climáticas e à taxa relativamente mais rápida de aquecimento global nas cadeias montanhosas do sul da Ásia, seu hábitat vai encolher e fragmentar-se por mudanças nas linhas de árvores e na hidrologia da área. Este artigo teve o objetivo de rever vários estudos sobre os impactos das mudanças climáticas em um futuro próximo e distante sobre os hábitats do leopardo-da-neve. O estudo revelou que a modificação vegetativa da flora da montanha e a competição com cabras domésticas poderiam ocasionar na diminuição da população de suas presas, com a chance de um conflito direto e competição com leopardo comum. Leopardo comum sendo mais adaptável, agrupado e maior em tamanho pode ser um estressor significativo para um leopardo-da-neve menor e solitário. Conclusão: devido ao encolhimento do hábitat, o leopardo-da-neve pode, possivelmente, mover-se para cima ou para o norte, para faixas da Ásia Central com padrões migratórios não previstos.

Ecological impacts of climate change on the snow leopard (Panthera unica) in South Asia / Impactos ecológicos da mudança climática no leopardo-da-neve (Panthera uncia) no sul da Ásia

Snow leopard (Panthera unica) is a felid which lives in the highly rugged areas of alpine regions in different mountain ranges of South and Central Asia. This solitary animal needs large spaces for its ranges but due to climate change and relatively faster rate of global warming in South Asian mountain ranges, its habitat is going to shrink and fragment by tree-line shifts and change in hydrology of the area. Vegetative modification of montane flora and competition with domestic goats will create its prey's population to decline along with a chance of a direct conflict and competition with the common leopard. Common leopard being more adaptable, grouped, and larger in size can be a significant stressor for a smaller and solitary snow leopard. Habitat would shrink, and snow leopard can possibly move upslope or northward to central Asian ranges and their predicted migratory patterns are unknown.

O leopardo-das-neves (Panthera uncia) é um felídeo que vive nas áreas altamente acidentadas das regiões alpinas, em diferentes cadeias de montanhas do sul e do centro da Ásia. A revisão atual tem o objetivo de abordar a questão da possível perda de hábitat do leopardo da neve em razão da interferência humana nas montanhas do sul e do centro da Ásia. Esse animal solitário precisa de grandes espaços para suas faixas, mas, devido às mudanças climáticas e à taxa relativamente mais rápida de aquecimento global nas cadeias montanhosas do sul da Ásia, seu hábitat vai encolher e fragmentar-se por mudanças nas linhas de árvores e na hidrologia da área. Este artigo teve o objetivo de rever vários estudos sobre os impactos das mudanças climáticas em um futuro próximo e distante sobre os hábitats do leopardo-da-neve. O estudo revelou que a modificação vegetativa da flora da montanha e a competição com cabras domésticas poderiam ocasionar na diminuição da população de suas presas, com a chance de um conflito direto e competição com leopardo comum. Leopardo comum sendo mais adaptável, agrupado e maior em tamanho pode ser um estressor significativo para um leopardo-da-neve menor e solitário. Conclusão: devido ao encolhimento do hábitat, o leopardo-da-neve pode, possivelmente, mover-se para cima ou para o norte, para faixas da Ásia Central com padrões migratórios não previstos.

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2).

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Ecological impacts of climate change on the snow leopard (Panthera unica) in South Asia.

Snow leopard (Panthera unica) is a felid which lives in the highly rugged areas of alpine regions in different mountain ranges of South and Central Asia. This solitary animal needs large spaces for its ranges but due to climate change and relatively faster rate of global warming in South Asian mountain ranges, its habitat is going to shrink and fragment by tree-line shifts and change in hydrology of the area. Vegetative modification of montane flora and competition with domestic goats will create its prey's population to decline along with a chance of a direct conflict and competition with the common leopard. Common leopard being more adaptable, grouped, and larger in size can be a significant stressor for a smaller and solitary snow leopard. Habitat would shrink, and snow leopard can possibly move upslope or northward to central Asian ranges and their predicted migratory patterns are unknown.

Evaluation of ecto and endo parasitic fauna of Schizothorax plagiostomus inhabitants of river Swat, Khyber PakhtunKhwa, Pakistan / Avaliação da fauna ecto e endoparasitária de Schizothorax plagiostomus habitantes do rio Swat, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

Fish is consumed as a rich and cheaper source of white meat and proteins all over the world. Fish farming is the leading source of income generation throughout the world. The present research study was conducted with aims to investigate the ecto and endo parasitic fauna of S. plagiostomus (snow trout) in River Swat. A total of 96 fish samples were collected on monthly basis from July-2018 to February-2019, from upper, middle and lower reaches. Fish samples were collected with the help of cast net, hand net and fishing rods. Local fishermen and experts help were also sought out for fish collection. 61 out of 96 fishes were found infected by helminth parasites. The total prevalence and intensity of 63.54% and 2.90 was observed respectively during data analysis. Highest monthly prevalence of 83.33% was recorded during July and August, while lowest prevalence of 33.33% was noted during February. Five species of helminths parasites were detected from S. plagiostomus, of which two were trematodes (Rhabdochona shizothoracis and Rhabdochona species), one species of Monogenia (Diplozoon paraddoxum), one species of Cestodes (Nippotaenia species), and one species of Acanthocephalan (Neoechynorhynchus devdevi). Highest parasite wise prevalence, intensity and relative density of 21.87%, 4.09 and 0.895 was noted for R. schizothoracis while the lowest prevalence, intensity and relative density of 4.16%, 1.25 and 0.052 was noted for N. devdevi. Highest infection of 76.08% was observed in adults host while lowest, 40% infestation rate was observed in young fish samples. 73.68% prevalence was observed in female hosts while only 56.90% prevalence was observed in male individuals. Higher infection (83.33%) was noticed during summer season, while lowest infection (44.44%) was observed during winter season. Similarly 71.79% fishes were found infected that were collected from lower reaches of the River Swat than the fish samples collected from upper reaches (52%).(AU)

O peixe é consumido mundialmente por ser uma fonte rica e barata de carne branca e proteínas. A piscicultura é a principal fonte de geração de renda em todo o mundo. O presente estudo foi conduzido com o objetivo de investigar a fauna ecto e endoparasitária de S. plagiostomus (truta da neve) no rio Swat. Foram coletadas mensalmente 96 amostras de peixes, no período de julho de 2018 a fevereiro de 2019, nos trechos alto, médio e baixo com auxílio de redes de arrasto, redes de mão e varas de pesca. Pescadores locais e especialistas também ajudaram na coleta de peixes. Dos 96 peixes encontrados, 61 estavam infectados por parasitas helmintos. A prevalência de 63,54% e a intensidade total de 2,90 foram observadas durante a análise dos dados. A maior prevalência mensal de 83,33% foi registrada nos meses de julho e agosto, enquanto a menor, de 33,33%, em fevereiro. Cinco espécies de parasitas helmintos foram detectadas de S. plagiostomus, dos quais dois eram trematódeos (espécies Rhabdochona shizothoracis e Rhabdochona), uma espécie de monogenia (Diplozoon paradoxum), uma espécie de cestóideos (espécie Nippotaenia) e uma espécie de acantocéfalo (Neoechynorhynchus devdevi). As maiores prevalências de parasitas (21,87%), intensidade (4,09) e densidade relativa (0,895) foram observadas em R. schizothoracis, enquanto as menores prevalências de parasitas (4,16%), intensidade (1,25) e densidade relativa (0,052), em N. devdevi. A infecção mais alta (76,08%) foi constatada em adultos hospedeiros, ao passo que a taxa de infestação mais baixa (40%) foi encontrada em amostras de peixes jovens. A prevalência de 73,68% foi verificada em hospedeiros do sexo feminino, enquanto a de 56,90%, em indivíduos do sexo masculino. Maior infecção (83,33%) foi observada durante a temporada de verão, e a menor infecção (44,44%), durante o inverno. Da mesma forma, 71,79% dos peixes encontrados infectados foram coletados no trecho baixo do rio Swat, enquanto 52%, no trecho alto.(AU)

Assessment of ecto and endo parasites of Schizothorax plagiostomus inhabiting river Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan / Avaliação de ecto e endoparasitas de Schizothorax plagiostomus habitantes do rio Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

Fish provides main source of high quality protein to more than one billion people in the world. Fish parasites directly affect the productivity of fish and indirectly on human health. This research was aimed to assess the helminth parasites in Schizothorax plagiostomus (the snow trout) from river Panjkora, KP, Pakistan. A total of 88 fish samples (n= 88) were collected from the upper, middle and lower regions of the river through cast nets, hand nets and hooks. All the collected fish samples were examined in the Parasitology Laboratory, Department of Zoology, University of Malakand for helminth parasites during July 2018 to February 2019.Among these fishes nematodes, trematodes, cestodes and acanthocephalan were isolated and identified. Overall prevalence of the fish parasites was 60.22% (53/88). The intensity of the parasite was observed from 1.7% to 4.61%. Highest prevalence was reported in summer season 86.36% while lowest in the winter season 36.36%. This study shows that summer season affects the fish business and result in poor quality fish meat with risk of zoonotic diseases. Adults were highly infected 82.25% while no infection was found in juvenile specimens. Female fish samples had higher prevalence 68.22% than males 48.22%. Fishes of the lower reaches had highest prevalence 60.22% than the upper reaches 40.0%. Fish samples with maximum length and weight were highly 76.92% infected than small sized fish with low body weight. Present study addresses that Rhabdochona schizothoracis in the intestine and Diplozoon paradoxum in gills of snow trout fish has a long term relationship and call as a natural infection in cyprinids and it is zoonotic threat to human.(AU)

O peixe é a principal fonte de proteína de alta qualidade para mais de um bilhão de pessoas no mundo. Contudo, parasitas afetam diretamente a produtividade de peixes e, indiretamente, a saúde humana. Esta pesquisa teve como objetivo avaliar os parasitas helmintos em Schizothorax plagiostomus (truta da neve) do rio Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Foram coletadas 88 amostras de peixes (n = 88) dos trechos alto, médio e baixo do rio por meio de redes de arrasto, redes de mão e varas de pesca. Todas as amostras de peixes coletadas foram examinadas no Laboratório de Parasitologia do Departamento de Zoologia, da Universidade de Malakand, quanto a parasitas helmintos durante o período de julho de 2018 a fevereiro de 2019. Entre esses peixes, nematódeos, trematódeos, cestóideos e acantocéfalos foram isolados e identificados. A prevalência geral de parasitas de peixes foi de 60,22% (53/88). A intensidade do parasita foi observada de 1,7 a 4,61%. A maior prevalência (86,36%) foi relatada no verão, enquanto a menor (36,36%), no inverno. Este estudo mostra que a temporada de verão afeta o ramo da pesca e resulta em carne de baixa qualidade, com risco de doenças zoonóticas. Os adultos foram altamente infectados (82,25%), enquanto nenhuma infecção foi encontrada em jovens. As amostras de peixes do sexo feminino apresentaram maior prevalência (68,22%) do que as do sexo masculino (48,22%). Os peixes coletados no trecho baixo do rio tiveram maior prevalência (60,22%) do que os do trecho alto (40%). Amostras de peixes com comprimento e peso máximos foram altamente infectadas (76,92%) do que peixes de pequeno porte e baixo peso corporal. O presente estudo aborda que Rhabdochona schizothoracis no intestino e Diplozoon paradoxum em brânquias de peixes de truta da neve possuem uma estreita relação que causa uma infecção natural em ciprinídeos, sendo uma ameaça zoonótica ao ser humano.(AU)

Assessment of ecto and endo parasites of Schizothorax plagiostomus inhabiting river Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan / Avaliação de ecto e endoparasitas de Schizothorax plagiostomus habitantes do rio Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

Abstract Fish provides main source of high quality protein to more than one billion people in the world. Fish parasites directly affect the productivity of fish and indirectly on human health. This research was aimed to assess the helminth parasites in Schizothorax plagiostomus (the snow trout) from river Panjkora, KP, Pakistan. A total of 88 fish samples (n= 88) were collected from the upper, middle and lower regions of the river through cast nets, hand nets and hooks. All the collected fish samples were examined in the Parasitology Laboratory, Department of Zoology, University of Malakand for helminth parasites during July 2018 to February 2019.Among these fishes nematodes, trematodes, cestodes and acanthocephalan were isolated and identified. Overall prevalence of the fish parasites was 60.22% (53/88). The intensity of the parasite was observed from 1.7% to 4.61%. Highest prevalence was reported in summer season 86.36% while lowest in the winter season 36.36%. This study shows that summer season affects the fish business and result in poor quality fish meat with risk of zoonotic diseases. Adults were highly infected 82.25% while no infection was found in juvenile specimens. Female fish samples had higher prevalence 68.22% than males 48.22%. Fishes of the lower reaches had highest prevalence 60.22% than the upper reaches 40.0%. Fish samples with maximum length and weight were highly 76.92% infected than small sized fish with low body weight. Present study addresses that Rhabdochona schizothoracis in the intestine and Diplozoon paradoxum in gills of snow trout fish has a long term relationship and call as a natural infection in cyprinids and it is zoonotic threat to human.

Resumo O peixe é a principal fonte de proteína de alta qualidade para mais de um bilhão de pessoas no mundo. Contudo, parasitas afetam diretamente a produtividade de peixes e, indiretamente, a saúde humana. Esta pesquisa teve como objetivo avaliar os parasitas helmintos em Schizothorax plagiostomus (truta da neve) do rio Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Foram coletadas 88 amostras de peixes (n = 88) dos trechos alto, médio e baixo do rio por meio de redes de arrasto, redes de mão e varas de pesca. Todas as amostras de peixes coletadas foram examinadas no Laboratório de Parasitologia do Departamento de Zoologia, da Universidade de Malakand, quanto a parasitas helmintos durante o período de julho de 2018 a fevereiro de 2019. Entre esses peixes, nematódeos, trematódeos, cestóideos e acantocéfalos foram isolados e identificados. A prevalência geral de parasitas de peixes foi de 60,22% (53/88). A intensidade do parasita foi observada de 1,7 a 4,61%. A maior prevalência (86,36%) foi relatada no verão, enquanto a menor (36,36%), no inverno. Este estudo mostra que a temporada de verão afeta o ramo da pesca e resulta em carne de baixa qualidade, com risco de doenças zoonóticas. Os adultos foram altamente infectados (82,25%), enquanto nenhuma infecção foi encontrada em jovens. As amostras de peixes do sexo feminino apresentaram maior prevalência (68,22%) do que as do sexo masculino (48,22%). Os peixes coletados no trecho baixo do rio tiveram maior prevalência (60,22%) do que os do trecho alto (40%). Amostras de peixes com comprimento e peso máximos foram altamente infectadas (76,92%) do que peixes de pequeno porte e baixo peso corporal. O presente estudo aborda que Rhabdochona schizothoracis no intestino e Diplozoon paradoxum em brânquias de peixes de truta da neve possuem uma estreita relação que causa uma infecção natural em ciprinídeos, sendo uma ameaça zoonótica ao ser humano.

Evaluation of ecto and endo parasitic fauna of Schizothorax plagiostomus inhabitants of river Swat, Khyber PakhtunKhwa, Pakistan / Avaliação da fauna ecto e endoparasitária de Schizothorax plagiostomus habitantes do rio Swat, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

Abstract Fish is consumed as a rich and cheaper source of white meat and proteins all over the world. Fish farming is the leading source of income generation throughout the world. The present research study was conducted with aims to investigate the ecto and endo parasitic fauna of S. plagiostomus (snow trout) in River Swat. A total of 96 fish samples were collected on monthly basis from July-2018 to February-2019, from upper, middle and lower reaches. Fish samples were collected with the help of cast net, hand net and fishing rods. Local fishermen and experts help were also sought out for fish collection. 61 out of 96 fishes were found infected by helminth parasites. The total prevalence and intensity of 63.54% and 2.90 was observed respectively during data analysis. Highest monthly prevalence of 83.33% was recorded during July and August, while lowest prevalence of 33.33% was noted during February. Five species of helminths parasites were detected from S. plagiostomus, of which two were trematodes (Rhabdochona shizothoracis and Rhabdochona species), one species of Monogenia (Diplozoon paraddoxum), one species of Cestodes (Nippotaenia species), and one species of Acanthocephalan (Neoechynorhynchus devdevi). Highest parasite wise prevalence, intensity and relative density of 21.87%, 4.09 and 0.895 was noted for R. schizothoracis while the lowest prevalence, intensity and relative density of 4.16%, 1.25 and 0.052 was noted for N. devdevi. Highest infection of 76.08% was observed in adults host while lowest, 40% infestation rate was observed in young fish samples. 73.68% prevalence was observed in female hosts while only 56.90% prevalence was observed in male individuals. Higher infection (83.33%) was noticed during summer season, while lowest infection (44.44%) was observed during winter season. Similarly 71.79% fishes were found infected that were collected from lower reaches of the River Swat than the fish samples collected from upper reaches (52%).

Resumo O peixe é consumido mundialmente por ser uma fonte rica e barata de carne branca e proteínas. A piscicultura é a principal fonte de geração de renda em todo o mundo. O presente estudo foi conduzido com o objetivo de investigar a fauna ecto e endoparasitária de S. plagiostomus (truta da neve) no rio Swat. Foram coletadas mensalmente 96 amostras de peixes, no período de julho de 2018 a fevereiro de 2019, nos trechos alto, médio e baixo com auxílio de redes de arrasto, redes de mão e varas de pesca. Pescadores locais e especialistas também ajudaram na coleta de peixes. Dos 96 peixes encontrados, 61 estavam infectados por parasitas helmintos. A prevalência de 63,54% e a intensidade total de 2,90 foram observadas durante a análise dos dados. A maior prevalência mensal de 83,33% foi registrada nos meses de julho e agosto, enquanto a menor, de 33,33%, em fevereiro. Cinco espécies de parasitas helmintos foram detectadas de S. plagiostomus, dos quais dois eram trematódeos (espécies Rhabdochona shizothoracis e Rhabdochona), uma espécie de monogenia (Diplozoon paradoxum), uma espécie de cestóideos (espécie Nippotaenia) e uma espécie de acantocéfalo (Neoechynorhynchus devdevi). As maiores prevalências de parasitas (21,87%), intensidade (4,09) e densidade relativa (0,895) foram observadas em R. schizothoracis, enquanto as menores prevalências de parasitas (4,16%), intensidade (1,25) e densidade relativa (0,052), em N. devdevi. A infecção mais alta (76,08%) foi constatada em adultos hospedeiros, ao passo que a taxa de infestação mais baixa (40%) foi encontrada em amostras de peixes jovens. A prevalência de 73,68% foi verificada em hospedeiros do sexo feminino, enquanto a de 56,90%, em indivíduos do sexo masculino. Maior infecção (83,33%) foi observada durante a temporada de verão, e a menor infecção (44,44%), durante o inverno. Da mesma forma, 71,79% dos peixes encontrados infectados foram coletados no trecho baixo do rio Swat, enquanto 52%, no trecho alto.

Assessment of ecto and endo parasites of Schizothorax plagiostomus inhabiting river Panjkora, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan.

Fish provides main source of high quality protein to more than one billion people in the world. Fish parasites directly affect the productivity of fish and indirectly on human health. This research was aimed to assess the helminth parasites in Schizothorax plagiostomus (the snow trout) from river Panjkora, KP, Pakistan. A total of 88 fish samples (n= 88) were collected from the upper, middle and lower regions of the river through cast nets, hand nets and hooks. All the collected fish samples were examined in the Parasitology Laboratory, Department of Zoology, University of Malakand for helminth parasites during July 2018 to February 2019.Among these fishes nematodes, trematodes, cestodes and acanthocephalan were isolated and identified. Overall prevalence of the fish parasites was 60.22% (53/88). The intensity of the parasite was observed from 1.7% to 4.61%. Highest prevalence was reported in summer season 86.36% while lowest in the winter season 36.36%. This study shows that summer season affects the fish business and result in poor quality fish meat with risk of zoonotic diseases. Adults were highly infected 82.25% while no infection was found in juvenile specimens. Female fish samples had higher prevalence 68.22% than males 48.22%. Fishes of the lower reaches had highest prevalence 60.22% than the upper reaches 40.0%. Fish samples with maximum length and weight were highly 76.92% infected than small sized fish with low body weight. Present study addresses that Rhabdochona schizothoracis in the intestine and Diplozoon paradoxum in gills of snow trout fish has a long term relationship and call as a natural infection in cyprinids and it is zoonotic threat to human.

Evaluation of ecto and endo parasitic fauna of Schizothorax plagiostomus inhabitants of river Swat, Khyber PakhtunKhwa, Pakistan.

Fish is consumed as a rich and cheaper source of white meat and proteins all over the world. Fish farming is the leading source of income generation throughout the world. The present research study was conducted with aims to investigate the ecto and endo parasitic fauna of S. plagiostomus (snow trout) in River Swat. A total of 96 fish samples were collected on monthly basis from July-2018 to February-2019, from upper, middle and lower reaches. Fish samples were collected with the help of cast net, hand net and fishing rods. Local fishermen and experts help were also sought out for fish collection. 61 out of 96 fishes were found infected by helminth parasites. The total prevalence and intensity of 63.54% and 2.90 was observed respectively during data analysis. Highest monthly prevalence of 83.33% was recorded during July and August, while lowest prevalence of 33.33% was noted during February. Five species of helminths parasites were detected from S. plagiostomus, of which two were trematodes (Rhabdochona shizothoracis and Rhabdochona species), one species of Monogenia (Diplozoon paraddoxum), one species of Cestodes (Nippotaenia species), and one species of Acanthocephalan (Neoechynorhynchus devdevi). Highest parasite wise prevalence, intensity and relative density of 21.87%, 4.09 and 0.895 was noted for R. schizothoracis while the lowest prevalence, intensity and relative density of 4.16%, 1.25 and 0.052 was noted for N. devdevi. Highest infection of 76.08% was observed in adults host while lowest, 40% infestation rate was observed in young fish samples. 73.68% prevalence was observed in female hosts while only 56.90% prevalence was observed in male individuals. Higher infection (83.33%) was noticed during summer season, while lowest infection (44.44%) was observed during winter season. Similarly 71.79% fishes were found infected that were collected from lower reaches of the River Swat than the fish samples collected from upper reaches (52%).

Radiotherapy in adult low-grade glioma: nationwide trends in treatment and outcomes.

BACKGROUND: Management of WHO grade II gliomas (LGG) can include a combination of observation, surgery, radiotherapy (RT), and chemotherapy; however, optimal management remains unclear in regards to RT. OBJECTIVE: The current study seeks to investigate the usage of RT in LGG and its effect on survival outcomes. METHODS: Patients with diagnosis codes specific for LGG were queried from the National Cancer Database (NCDB) during the years 2004-2016. Kaplan-Meier curves with log-rank testing, univariate and multivariate Cox regression analysis, and comparisons of estimated 3- and 7-year survival were performed to investigate the effect of RT on overall survival. RESULTS: 19,382 patients with LGG were identified with histologically confirmed disease. Kaplan-Meier testing demonstrated RT impacted survival in patients undergoing biopsy or no surgery (p < 0.0001), no chemotherapy (p < 0.0001), and in regimens with early RT (p < 0.0001) and high-dose RT (p < 0.0001). Cox multivariate regression demonstrated RT and age less than 40 (HR 0.93, 95% CI 0.89-0.97, p = 0.001), no chemotherapy (HR 0.82, 95% CI 0.77-0.87, p < 0.001), and astrocytoma histology (HR 0.72, 95% CI 0.66-0.79, p < 0.001) were associated with improved survival. 3-year survival of RT versus non-RT groups showed increased survival rates for age less than 40 years (+ 5.7%, p < 0.0001), no surgery or biopsy (+ 8.1%, p < 0.0001), no chemotherapy (+ 10.3%, p < 0.0001), mixed glioma (+ 6.7%, p < 0.0001), astrocytoma (+ 7.1%, p < 0.0001), and in regimens with early RT (+ 7.6%, p < 0.0001) and high-dose RT (+ 4.7%, p < 0.0001). CONCLUSION: This nationwide analysis of LGG patients found that RT was associated with improved survival outcomes in patients less than 40 years of age, with histology subtypes of astrocytoma and mixed glioma, undergoing biopsy or no surgery, and in regimens with early RT and high-dose RT.

Assessment and incidence of fish associated bacterial pathogens at hatcheries of Azad Kashmir, Pakistan / Avaliação e incidência de patógenos bacterianos associados a peixes em incubadoras da Caxemira de Azad, Paquistão

Abstract Fish is the most indispensable source of proteins for individuals and have high nutritional value. On the other hand, the fish culturing raised issues of fish health due to close contact between the aquatic environment and the fish pathogens. So, the aim of the current study was to identify the bacterial pathogens and screen the injured Rainbow trout rearing in different trout hatcheries run under fisheries department of the government of Azad Jammu and Kashmir, Pakistan. Seven bacterial pathogens such as Shigella flexneri, Enterobacter amnigenus, Salmonella Typhimurium, Serratia odorifera, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pyogenes, and Bacillus cereus were isolated and identified. Results revealed that the injury of fish specimens was due to overcrowding. Instead of rainbow coloration, specimens have darker black in color. The water of ponds was not clean and clear and such conditions was because of the greater quantity of feed thrown in the water. It was concluded that poor hygienic water condition and overloading allowed the opportunistic bacterial contaminations to succeed which cause a serious threat to hatcheries.

Resumo O peixe é a fonte mais indispensável de proteínas para os indivíduos e tem alto valor nutricional. Por outro lado, a cultura dos peixes levantou questões sobre a saúde dos peixes devido ao próximo contato entre o ambiente aquático e os agentes patogênicos desses peixes. Assim, o objetivo do presente estudo foi identificar os patógenos bacterianos e rastrear a criação da truta arco-íris que apresentou lesões em diferentes incubadoras de trutas, com supervisão do departamento de pesca do governo de Azad Jammu e Caxemira, Paquistão. Sete patógenos bacterianos foram isolados e identificados, tais como: Shigella flexneri, Enterobacter amnigenus, Salmonella typhimurium, Serratia odorifera, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pyogenes e Bacillus cereus. Os resultados revelaram que a lesão de espécimes de peixes foi devido à superlotação. Em vez da coloração do arco-íris, os espécimes tiveram uma coloração preta mais escura. A água das lagoas não era limpa e nem clara, e tais condições ocorreram devido a maior quantidade de alimento lançada na água. Concluiu-se que a precária condição higiênica da água e também a sobrecarga permitiram que as contaminações bacterianas oportunistas fossem bem-sucedidas, causando séria ameaça às incubadoras.