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EMBO J ; 26(7): 1984-94, 2007 Apr 04.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-17363899

RESUMO

Tailed bacteriophages and herpesviruses load their capsids with DNA through a tunnel formed by the portal protein assembly. Here we describe the X-ray structure of the bacteriophage SPP1 portal protein in its isolated 13-subunit form and the pseudoatomic structure of a 12-subunit assembly. The first defines the DNA-interacting segments (tunnel loops) that pack tightly against each other forming the most constricted part of the tunnel; the second shows that the functional dodecameric state must induce variability in the loop positions. Structural observations together with geometrical constraints dictate that in the portal-DNA complex, the loops form an undulating belt that fits and tightly embraces the helical DNA, suggesting that DNA translocation is accompanied by a 'mexican wave' of positional and conformational changes propagating sequentially along this belt.


Assuntos
DNA Viral/metabolismo , Proteínas Virais/química , Proteínas Virais/metabolismo , Sequência de Aminoácidos , Transporte Biológico , Cristalografia por Raios X , DNA Viral/química , Evolução Molecular , Modelos Moleculares , Dados de Sequência Molecular , Mutação , Conformação de Ácido Nucleico , Estrutura Secundária de Proteína , Subunidades Proteicas/química , Subunidades Proteicas/metabolismo , Rotação , Eletricidade Estática , Proteínas Virais/ultraestrutura , Montagem de Vírus
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