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Nucleic Acids Res ; 45(20): 11891-11907, 2017 Nov 16.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28981840

RESUMO

RNase III enzymes cleave double stranded (ds)RNA. This is an essential step for regulating the processing of mRNA, rRNA, snoRNA and other small RNAs, including siRNA and miRNA. Arabidopsis thaliana encodes nine RNase III: four DICER-LIKE (DCL) and five RNASE THREE LIKE (RTL). To better understand the molecular functions of RNase III in plants we developed a biochemical assay using RTL1 as a model. We show that RTL1 does not degrade dsRNA randomly, but recognizes specific duplex sequences to direct accurate cleavage. Furthermore, we demonstrate that RNase III and dsRNA binding domains (dsRBD) are both required for dsRNA cleavage. Interestingly, the four DCL and the three RTL that carry dsRBD share a conserved cysteine (C230 in Arabidopsis RTL1) in their dsRBD. C230 is essential for RTL1 and DCL1 activities and is subjected to post-transcriptional modification. Indeed, under oxidizing conditions, glutathionylation of C230 inhibits RTL1 cleavage activity in a reversible manner involving glutaredoxins. We conclude that the redox state of the dsRBD ensures a fine-tune regulation of dsRNA processing by plant RNase III.


Assuntos
Proteínas de Arabidopsis/metabolismo , Cisteína/metabolismo , RNA de Cadeia Dupla/metabolismo , RNA de Plantas/metabolismo , Proteínas Repressoras/metabolismo , Regiões 3' não Traduzidas/genética , Sequência de Aminoácidos , Arabidopsis/genética , Arabidopsis/metabolismo , Proteínas de Arabidopsis/química , Proteínas de Arabidopsis/genética , Sequência de Bases , Cisteína/genética , Glutationa/metabolismo , Modelos Moleculares , Conformação de Ácido Nucleico , Oxirredução , Domínios Proteicos , Clivagem do RNA , RNA de Cadeia Dupla/química , RNA de Cadeia Dupla/genética , RNA de Plantas/química , RNA de Plantas/genética , RNA Interferente Pequeno/genética , RNA Interferente Pequeno/metabolismo , Motivos de Ligação ao RNA/genética , Proteínas Repressoras/química , Proteínas Repressoras/genética , Ribonuclease III/genética , Ribonuclease III/metabolismo , Homologia de Sequência do Ácido Nucleico
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