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Stem Cell Reports ; 16(9): 2118-2127, 2021 09 14.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34358451

RESUMO

Human neurons engineered from induced pluripotent stem cells (iPSCs) through neurogenin 2 (NGN2) overexpression are widely used to study neuronal differentiation mechanisms and to model neurological diseases. However, the differentiation paths and heterogeneity of emerged neurons have not been fully explored. Here, we used single-cell transcriptomics to dissect the cell states that emerge during NGN2 overexpression across a time course from pluripotency to neuron functional maturation. We find a substantial molecular heterogeneity in the neuron types generated, with at least two populations that express genes associated with neurons of the peripheral nervous system. Neuron heterogeneity is observed across multiple iPSC clones and lines from different individuals. We find that neuron fate acquisition is sensitive to NGN2 expression level and the duration of NGN2-forced expression. Our data reveal that NGN2 dosage can regulate neuron fate acquisition, and that NGN2-iN heterogeneity can confound results that are sensitive to neuron type.


Assuntos
Fatores de Transcrição Hélice-Alça-Hélice Básicos/genética , Diferenciação Celular/genética , Células-Tronco Pluripotentes Induzidas/citologia , Células-Tronco Pluripotentes Induzidas/metabolismo , Proteínas do Tecido Nervoso/genética , Neurogênese/genética , Neurônios/citologia , Neurônios/metabolismo , Animais , Fatores de Transcrição Hélice-Alça-Hélice Básicos/metabolismo , Linhagem Celular , Células Cultivadas , Biologia Computacional/métodos , Perfilação da Expressão Gênica , Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento , Humanos , Camundongos , Proteínas do Tecido Nervoso/metabolismo , RNA-Seq , Transcriptoma
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